Integrativ personlig omics-profilering til overvågning af dynamiske molekylære fænotyper under fibertilskud
Studieoversigt
Status
Status
Betingelser
Betingelser
Intervention / Behandling
Intervention / Behandling
Detaljeret beskrivelse
Undersøgelsestype
Undersøgelsestype
Tilmelding (Faktiske)
Tilmelding
Fase
Fase
- Ikke anvendelig
Kontakter og lokationer
Studiesteder
-
-
California
-
Stanford, California, Forenede Stater, 94304
- Stanford University
-
-
Deltagelseskriterier
Berettigelseskriterier
Berettigelseskriterier
Aldre berettiget til at studere
Tager imod sunde frivillige
Køn, der er berettiget til at studere
Beskrivelse
Inklusionskriterier:
- Godt generelt helbred
Ekskluderingskriterier:
- Fastende blodsukker >126 mg/dL
- Triglycerider >400 mg/dL
- Ukontrolleret hypertension
- Karsygdom
- Kroniske betændelsestilstande
- Større organsygdom
- Stort alkoholforbrug
- Graviditet/amning
- Tidligere bariatrisk operation
- Aktiv psykiatrisk sygdom
- Brug af medicin, der vides at påvirke kulhydrat- eller lipidmetabolismen
- Aktiv spiseforstyrrelse
Studieplan
Hvordan er undersøgelsen tilrettelagt?
Design detaljer
- Primært formål: Grundvidenskab
- Tildeling: N/A
- Interventionel model: Sekventiel tildeling
- Maskning: Enkelt
Hvad måler undersøgelsen?
Primære resultatmål
Primære resultatmål
Resultatmål |
Foranstaltningsbeskrivelse |
Tidsramme |
|---|---|---|
|
Kortlægning af mikrobiotaændringer som reaktion på præbiotisk intervention
Tidsramme: 3 år
|
Et detaljeret kort over mikrober og mikrobielle genekspressionsændringer under interventionen vil blive udviklet. Mikrobiotakompleksitet i fækale prøver vil blive bestemt ved metagenomisk sekvensering af haglgevær. Nye mikrober og genveje vil blive identificeret ved de novo-samling af hele fækale metagenomer. |
3 år
|
|
Lipidprofilændringer som reaktion på præbiotisk intervention
Tidsramme: 3 år
|
Analyse af ændringer i lipidprofilen af deltagere på den præbiotiske intervention.
Målte lipider i mg/dL inkluderer totalt kolesterol, LDL-kolesterol, HDL-kolesterol og triglycerider.
|
3 år
|
Sekundære resultatmål
Sekundære resultatmål
Resultatmål |
Foranstaltningsbeskrivelse |
Tidsramme |
|---|---|---|
|
Omfattende metagenomprofil under præbiotisk intervention
Tidsramme: 3 år
|
Ændringer i værtens (humane) metagenomprofil under den præbiotiske intervention vil blive bestemt.
Afførings-DNA-sekvenser analyseres ved hjælp af Humann2- og Metaphlan-pipelines for at generere pathway-dækningsværdier, genfamilie-overflod og taxa-overflod {Franzosa, 2018}.
Disse er kortlagt til Human Microbiome Project-databasen for justering.
|
3 år
|
|
Omfattende transkriptomprofil under præbiotisk intervention
Tidsramme: 3 år
|
Ændringer i værtens (humane) transkriptomprofil under den præbiotiske intervention vil blive bestemt.
RNA isoleret fra PBMC-prøvelæsninger justeres til hg38 ved hjælp af programmet Spliced Transcripts Alignment to a Reference (STAR).
Transkriptabundance beregnes ved hjælp af RNA-Seq ved Expectation Maximization (RSEM).
Normalisering af transkriptionsfrekvens og parvise statistikker, der måler forskelle i transkriptionsfrekvens mellem tidspunkter, beregnes ved hjælp af softwarepakken til R fra Bioconductor (DESeq2).
|
3 år
|
|
Omfattende metabolomprofil under præbiotisk intervention
Tidsramme: 3 år
|
Ændringer i værtens (humane) metabolomprofil under den præbiotiske intervention vil blive bestemt.
Plasmametabolitter køres i massespektrometresøjler (HILIC- og RPLC-separation i både positiv og negativ ioniseringstilstand).
MetID og vores MS/MS-data bruges til at identificere 12740 metabolitter med konfidensniveauer fra 1-3, hvor 1 matcher MS/MS, retentionstid og m/z fra standarder på vores platform, 2 har MS/MS og m/z matcher fra en database, og 3 matcher m/z af en database.
|
3 år
|
|
Omfattende cytokinprofil under præbiotisk intervention
Tidsramme: 3 år
|
Ændringer i værtens (humane) cytokinprofil under den præbiotiske intervention vil blive bestemt.
Cytokiner profileres ved hjælp af et Luminex xMAP cytokinprofileringssystem på Stanford Human Immune Monitoring Center.
Dette involverer at binde antistoffer, der er specifikke for cytokiner, til perler ved hjælp af et indfangningsmolekyle.
De fluorescerende molekyler er knyttet til cytokinerne, og fluorescens bruges som mål for cytokinoverflod.
|
3 år
|
Samarbejdspartnere og efterforskere
Sponsor
Sponsor
Datoer for undersøgelser
Studer store datoer
Studiestart (Faktiske)
Studiestart
Primær færdiggørelse (Faktiske)
Primær færdiggørelse
Studieafslutning (Faktiske)
Studieafslutning
Datoer for studieregistrering
Først indsendt
Først indsendt
Først indsendt, der opfyldte QC-kriterier
Først indsendt, der opfyldte QC-kriterier
Først opslået (Faktiske)
Først opslået
Opdateringer af undersøgelsesjournaler
Sidste opdatering sendt (Faktiske)
Sidste opdatering sendt
Sidste opdatering indsendt, der opfyldte kvalitetskontrolkriterier
Sidste opdatering indsendt, der opfyldte kvalitetskontrolkriterier
Sidst verificeret
Sidst verificeret
Mere information
Begreber relateret til denne undersøgelse
Andre undersøgelses-id-numre
Andre undersøgelses-id-numre
- 1636
Plan for individuelle deltagerdata (IPD)
Planlægger du at dele individuelle deltagerdata (IPD)?
Lægemiddel- og udstyrsoplysninger, undersøgelsesdokumenter
Studerer et amerikansk FDA-reguleret lægemiddelprodukt
Studerer et amerikansk FDA-reguleret enhedsprodukt
Disse oplysninger blev hentet direkte fra webstedet clinicaltrials.gov uden ændringer. Hvis du har nogen anmodninger om at ændre, fjerne eller opdatere dine undersøgelsesoplysninger, bedes du kontakte register@clinicaltrials.gov. Så snart en ændring er implementeret på clinicaltrials.gov, vil denne også blive opdateret automatisk på vores hjemmeside .