Integracyjne profilowanie osobistej Omiki w celu monitorowania dynamicznych fenotypów molekularnych podczas suplementacji błonnikiem
Przegląd badań
Status
Status
Warunki
Warunki
Interwencja / Leczenie
Interwencja / Leczenie
Szczegółowy opis
Typ studiów
Typ studiów
Zapisy (Rzeczywisty)
Zapisy
Faza
Faza
- Nie dotyczy
Kontakty i lokalizacje
Lokalizacje studiów
-
-
California
-
Stanford, California, Stany Zjednoczone, 94304
- Stanford University
-
-
Kryteria uczestnictwa
Kryteria kwalifikacji
Kryteria kwalifikacji
Wiek uprawniający do nauki
Akceptuje zdrowych ochotników
Płeć kwalifikująca się do nauki
Opis
Kryteria przyjęcia:
- Dobry ogólny stan zdrowia
Kryteria wyłączenia:
- Poziom cukru we krwi na czczo >126 mg/dl
- Trójglicerydy >400 mg/dL
- Niekontrolowane nadciśnienie
- Choroba naczyniowa
- Przewlekłe stany zapalne
- Choroba głównych narządów
- Intensywne używanie alkoholu
- Ciąża/laktacja
- Przebyta operacja bariatryczna
- Aktywna choroba psychiczna
- Stosowanie leków, o których wiadomo, że wpływają na metabolizm węglowodanów lub lipidów
- Aktywne zaburzenie odżywiania
Plan studiów
Jak projektuje się badanie?
Szczegóły projektu
- Główny cel: Podstawowa nauka
- Przydział: Nie dotyczy
- Model interwencyjny: Zadanie sekwencyjne
- Maskowanie: Pojedynczy
Co mierzy badanie?
Podstawowe miary wyniku
Podstawowe miary wyniku
Miara wyniku |
Opis środka |
Ramy czasowe |
|---|---|---|
|
Mapowanie zmian mikroflory w odpowiedzi na interwencję prebiotyczną
Ramy czasowe: 3 lata
|
Zostanie opracowana szczegółowa mapa drobnoustrojów i zmian ekspresji genów drobnoustrojów podczas interwencji. Złożoność mikroflory w próbkach kału zostanie określona za pomocą sekwencjonowania metagenomicznego strzelby. Nowe drobnoustroje i szlaki genowe zostaną zidentyfikowane przez składanie de novo całych metagenomów kału. |
3 lata
|
|
Zmiany profilu lipidowego w odpowiedzi na interwencję prebiotyczną
Ramy czasowe: 3 lata
|
Analiza zmian profilu lipidowego uczestników interwencji prebiotycznej.
Mierzone lipidy w mg/dl obejmują cholesterol całkowity, cholesterol LDL, cholesterol HDL i trójglicerydy.
|
3 lata
|
Miary wyników drugorzędnych
Miary wyników drugorzędnych
Miara wyniku |
Opis środka |
Ramy czasowe |
|---|---|---|
|
Kompleksowy profil metagenomu podczas interwencji prebiotycznej
Ramy czasowe: 3 lata
|
Określone zostaną zmiany w profilu metagenomu gospodarza (człowieka) podczas interwencji prebiotycznej.
Sekwencje DNA kału są analizowane przy użyciu potoków Humann2 i Metaphlan w celu wygenerowania wartości pokrycia szlaków, obfitości rodzin genów i obfitości taksonów {Franzosa, 2018}.
Są one mapowane do bazy danych Human Microbiome Project w celu wyrównania.
|
3 lata
|
|
Kompleksowy profil transkryptomu podczas interwencji prebiotycznej
Ramy czasowe: 3 lata
|
Określone zostaną zmiany w profilu transkryptomu gospodarza (człowieka) podczas interwencji prebiotycznej.
Odczyty RNA wyizolowanego z próbek PBMC dopasowuje się do hg38 przy użyciu programu Spliced Transcripts Alignment to a Reference (STAR).
Obfitość transkryptu oblicza się przy użyciu RNA-Seq przez maksymalizację oczekiwań (RSEM).
Normalizacja częstotliwości transkrypcji i statystyki parami mierzące różnice w częstotliwości transkrypcji między punktami czasowymi są obliczane przy użyciu pakietu oprogramowania dla R firmy Bioconductor (DESeq2).
|
3 lata
|
|
Kompleksowy profil metabolomu podczas interwencji prebiotycznej
Ramy czasowe: 3 lata
|
Określone zostaną zmiany w profilu metabolomu gospodarza (człowieka) podczas interwencji prebiotycznej.
Metabolity osocza są analizowane w kolumnach spektrometrów masowych (rozdzielanie HILIC i RPLC zarówno w trybie jonizacji dodatniej, jak i ujemnej).
MetID i nasze dane MS/MS są wykorzystywane do identyfikacji 12740 metabolitów z poziomami ufności w zakresie od 1-3, gdzie 1 odpowiada MS/MS, czasowi retencji i m/z ze standardów na naszej platformie, 2 ma MS/MS i m/z pasuje z bazy danych, a 3 pasuje do m/z bazy danych.
|
3 lata
|
|
Kompleksowy profil cytokin podczas interwencji prebiotycznej
Ramy czasowe: 3 lata
|
Określone zostaną zmiany w profilu cytokin gospodarza (ludzkiego) podczas interwencji prebiotycznej.
Cytokiny są profilowane przy użyciu systemu profilowania cytokin Luminex xMAP w Stanford Human Immune Monitoring Center.
Obejmuje to przyłączanie przeciwciał specyficznych dla cytokin do kulek za pomocą cząsteczki wychwytującej.
Cząsteczki fluorescencyjne są przyłączone do cytokin, a fluorescencja jest stosowana jako miara obfitości cytokin.
|
3 lata
|
Współpracownicy i badacze
Sponsor
Sponsor
Daty zapisu na studia
Główne daty studiów
Rozpoczęcie studiów (Rzeczywisty)
Rozpoczęcie studiów
Zakończenie podstawowe (Rzeczywisty)
Zakończenie podstawowe
Ukończenie studiów (Rzeczywisty)
Ukończenie studiów
Daty rejestracji na studia
Pierwszy przesłany
Pierwszy przesłany
Pierwszy przesłany, który spełnia kryteria kontroli jakości
Pierwszy przesłany, który spełnia kryteria kontroli jakości
Pierwszy wysłany (Rzeczywisty)
Pierwszy wysłany
Aktualizacje rekordów badań
Ostatnia wysłana aktualizacja (Rzeczywisty)
Ostatnia wysłana aktualizacja
Ostatnia przesłana aktualizacja, która spełniała kryteria kontroli jakości
Ostatnia przesłana aktualizacja, która spełniała kryteria kontroli jakości
Ostatnia weryfikacja
Ostatnia weryfikacja
Więcej informacji
Terminy związane z tym badaniem
Inne numery identyfikacyjne badania
Inne numery identyfikacyjne badania
- 1636
Plan dla danych uczestnika indywidualnego (IPD)
Planujesz udostępniać dane poszczególnych uczestników (IPD)?
Informacje o lekach i urządzeniach, dokumenty badawcze
Bada produkt leczniczy regulowany przez amerykańską FDA
Bada produkt urządzenia regulowany przez amerykańską FDA
Te informacje zostały pobrane bezpośrednio ze strony internetowej clinicaltrials.gov bez żadnych zmian. Jeśli chcesz zmienić, usunąć lub zaktualizować dane swojego badania, skontaktuj się z register@clinicaltrials.gov. Gdy tylko zmiana zostanie wprowadzona na stronie clinicaltrials.gov, zostanie ona automatycznie zaktualizowana również na naszej stronie internetowej .