Study to Compare Traditional and Emerging Methods for Structural Variant Analysis in Prenatal, Postnatal, and Hematologic Samples
Multicenter Performance Study Using a Non-CE-marked in Vitro Diagnostic Medical Device (IVD) for the Standardization and Comparative Evaluation of Traditional and Emerging Methods for the Analysis of Structural Variants in Prenatal, Postnatal, and Oncohematological Samples
The study goal is to evaluate an innovative technology, KaryoSolver, which enables molecular karyotype reconstruction, in comparison with reference conventional methods, in terms of:
Presence or absence of clinically detectable structural variants; Type of alteration (aneuploidies, deletions, duplications); Copy number present. KaryoSolver is a software system for reconstructing the molecular karyotype from low-coverage genomic sequencing data using long-read technology.
The expected performance of the device under study is its ability to detect and classify the main clinically detectable structural variants within included samples in a manner consistent with the reference comparators, using a standardizable workflow, competitive turnaround times, and adequate reproducibility.
Přehled studie
Postavení
Postavení
Podmínky
Podmínky
Detailní popis
In particular, the study contributes to demonstrating the following requirements:
- scientific validity, through the correlation between Karyosolver and the aCGH/SNP array result used as a reference;
- analytical performance, including accuracy, analytical sensitivity, analytical specificity, and reproducibility of the method, evaluated according to the criteria defined by ISO 5725;
- clinical performance, through the evaluation of the test's ability to correctly identify copy number variations (CNVs) or regions of loss of heterozygosity (LOH/ROH) already reported in the samples selected for the study.
Typ studie
Typ studie
Zápis (Odhadovaný)
Zápis
Kontakty a umístění
Studijní kontakt
Studijní kontakt
- Jméno: Giulia Fugazza, Clinical Project Manager
- Telefonní číslo: +41 (0) 91 224 70 81
- E-mail: info@4bases.ch
Studijní místa
-
-
-
Florence, Itálie, 50134
- Nábor
- SOD Diagnostica Genetica Azienda Osepdaliero-Universitaria Careggi
-
Kontakt:
- Elisabetta Pelo, Medical Doctor
- E-mail: infogenetica@aou-careggi.toscana.it
-
Vrchní vyšetřovatel:
- Elisabetta Pelo
-
Vicenza, Itálie, 36100
- Nábor
- UOSD Genetica Medica e Genomica Azienda ULSS8 Berica
-
Kontakt:
- Daniela Zuccarello, Medical Doctor
- Telefonní číslo: +39 0444-753360
- E-mail: genetica@aulss8.veneto.it
-
Vrchní vyšetřovatel:
- Daniela Zuccarello, Medical Doctor
-
-
Kritéria účasti
Kritéria způsobilosti
Kritéria způsobilosti
Věk způsobilý ke studiu
- Dítě
- Dospělý
- Starší dospělý
Přijímá zdravé dobrovolníky
Pohlaví způsobilá ke studiu
Metoda odběru vzorků
Studijní populace
The biological samples are residual samples already available at the two participating clinical centers. The samples originate from diagnostic workups that have already been completed and were not collected specifically for this study. In particular, residual samples related to prenatal, postnatal constitutional, and oncohematological diagnostics may be used, in accordance with the criteria set forth in the protocol.
Popis
Inclusion Criteria:
- Prenatal, postnatal, and oncohematological samples.
- Availability of results obtained using at least one reference method.
- Valid informed consent for use in research.
- Sufficient quantity and quality of DNA for analysis.
Exclusion Criteria:
- Absence of valid informed consent.
- Incomplete documentation of reference results.
- Insufficient or degraded DNA.
Studijní plán
Jak je studie koncipována?
Detaily designu
- Observační modely: OTHER
- Časové perspektivy: RETROSPECTIVE
Co je měření studie?
Primární výstupní opatření
Primární výstupní opatření
Měření výsledku |
Časové okno |
|---|---|
|
Overall diagnostic concordance between KaryoSolver and reference methods for the identification of clinically detectable structural variants.
Časové okno: through study completion, an average of 1 year
|
through study completion, an average of 1 year
|
|
Agreement on the presence/absence of clinically relevant chromosomal alterations between KaryoSolver and reference methods
Časové okno: through study completion, an average of 1 year
|
through study completion, an average of 1 year
|
|
Agreement by category of identified alteration (aneuploidies, deletions, duplications) between KaryoSolver and reference methods
Časové okno: through study completion, an average of 1 year
|
through study completion, an average of 1 year
|
|
Percentage of cases correctly classified by KaryoSolver compared to the reference comparator
Časové okno: through study completion, an average of 1 year
|
through study completion, an average of 1 year
|
Sekundární výstupní opatření
Sekundární výstupní opatření
Měření výsledku |
Časové okno |
|---|---|
|
Intra-run reproducibility of KaryoSolver, assessed as the agreement of results obtained from replicates analyzed in the same session
Časové okno: through study completion, an average of 1 year
|
through study completion, an average of 1 year
|
|
Inter-run reproducibility of KaryoSolver, assessed as the agreement of results obtained from replicates analyzed in different sessions
Časové okno: through study completion, an average of 1 year
|
through study completion, an average of 1 year
|
|
Average analytical run time per sample with KaryoSolver compared to reference methods
Časové okno: through study completion, an average of 1 year
|
through study completion, an average of 1 year
|
|
Average total reporting time/turnaround time with KaryoSolver compared to reference methods.
Časové okno: through study completion, an average of 1 year
|
through study completion, an average of 1 year
|
|
Reduction in technical/interpretive workload, assessed in terms of man-hours or the number of manual tasks required
Časové okno: through study completion, an average of 1 year
|
through study completion, an average of 1 year
|
|
Average cost per sample analyzed with KaryoSolver compared to reference methods
Časové okno: through study completion, an average of 1 year
|
through study completion, an average of 1 year
|
|
Proportion of cases potentially eligible for faster diagnosis using KaryoSolver compared to the standard workflow
Časové okno: through study completion, an average of 1 year
|
through study completion, an average of 1 year
|
Spolupracovníci a vyšetřovatelé
Sponzor
Sponzor
Termíny studijních záznamů
Hlavní termíny studia
Začátek studia (Aktuální)
Začátek studia
Primární dokončení (Odhadovaný)
Primární dokončení
Dokončení studie (Odhadovaný)
Dokončení studie
Termíny zápisu do studia
První předloženo
První předloženo
První předloženo, které splnilo kritéria kontroly kvality
První předloženo, které splnilo kritéria kontroly kvality
První zveřejněno (Aktuální)
První zveřejněno
Aktualizace studijních záznamů
Poslední zveřejněná aktualizace (Aktuální)
Poslední zveřejněná aktualizace
Odeslaná poslední aktualizace, která splnila kritéria kontroly kvality
Odeslaná poslední aktualizace, která splnila kritéria kontroly kvality
Naposledy ověřeno
Naposledy ověřeno
Více informací
Termíny související s touto studií
Klíčová slova
Další relevantní podmínky MeSH
Další identifikační čísla studie
Další identifikační čísla studie
- KaryoSolver-ONT
Plán pro data jednotlivých účastníků (IPD)
Plánujete sdílet data jednotlivých účastníků (IPD)?
Popis plánu IPD
IPD will not be shared because this is a non-interventional study which does not produce any health outcomes; it is, in fact, a performance study involving IVDs conducted solely for methodological research purposes, with no results being reported for diagnostic or therapeutic purposes.
Informace o lécích a zařízeních, studijní dokumenty
Studuje lékový produkt regulovaný americkým FDA
Studuje produkt zařízení regulovaný americkým úřadem FDA
Tyto informace byly beze změn načteny přímo z webu clinicaltrials.gov. Máte-li jakékoli požadavky na změnu, odstranění nebo aktualizaci podrobností studie, kontaktujte prosím register@clinicaltrials.gov. Jakmile bude změna implementována na clinicaltrials.gov, bude automaticky aktualizována i na našem webu .