Study to Compare Traditional and Emerging Methods for Structural Variant Analysis in Prenatal, Postnatal, and Hematologic Samples
Multicenter Performance Study Using a Non-CE-marked in Vitro Diagnostic Medical Device (IVD) for the Standardization and Comparative Evaluation of Traditional and Emerging Methods for the Analysis of Structural Variants in Prenatal, Postnatal, and Oncohematological Samples
The study goal is to evaluate an innovative technology, KaryoSolver, which enables molecular karyotype reconstruction, in comparison with reference conventional methods, in terms of:
Presence or absence of clinically detectable structural variants; Type of alteration (aneuploidies, deletions, duplications); Copy number present. KaryoSolver is a software system for reconstructing the molecular karyotype from low-coverage genomic sequencing data using long-read technology.
The expected performance of the device under study is its ability to detect and classify the main clinically detectable structural variants within included samples in a manner consistent with the reference comparators, using a standardizable workflow, competitive turnaround times, and adequate reproducibility.
Обзор исследования
Статус
Статус
Условия
Условия
Подробное описание
In particular, the study contributes to demonstrating the following requirements:
- scientific validity, through the correlation between Karyosolver and the aCGH/SNP array result used as a reference;
- analytical performance, including accuracy, analytical sensitivity, analytical specificity, and reproducibility of the method, evaluated according to the criteria defined by ISO 5725;
- clinical performance, through the evaluation of the test's ability to correctly identify copy number variations (CNVs) or regions of loss of heterozygosity (LOH/ROH) already reported in the samples selected for the study.
Тип исследования
Тип исследования
Регистрация (Оцененный)
Регистрация
Контакты и местонахождение
Контакты исследования
Контакты исследования
- Имя: Giulia Fugazza, Clinical Project Manager
- Номер телефона: +41 (0) 91 224 70 81
- Электронная почта: info@4bases.ch
Места учебы
-
-
-
Florence, Италия, 50134
- Рекрутинг
- SOD Diagnostica Genetica Azienda Osepdaliero-Universitaria Careggi
-
Контакт:
- Elisabetta Pelo, Medical Doctor
- Электронная почта: infogenetica@aou-careggi.toscana.it
-
Главный следователь:
- Elisabetta Pelo
-
Vicenza, Италия, 36100
- Рекрутинг
- UOSD Genetica Medica e Genomica Azienda ULSS8 Berica
-
Контакт:
- Daniela Zuccarello, Medical Doctor
- Номер телефона: +39 0444-753360
- Электронная почта: genetica@aulss8.veneto.it
-
Главный следователь:
- Daniela Zuccarello, Medical Doctor
-
-
Критерии участия
Критерии приемлемости
Критерии приемлемости
Возраст, подходящий для обучения
- Ребенок
- Взрослый
- Пожилой взрослый
Принимает здоровых добровольцев
Полы, имеющие право на обучение
Метод выборки
Исследуемая популяция
The biological samples are residual samples already available at the two participating clinical centers. The samples originate from diagnostic workups that have already been completed and were not collected specifically for this study. In particular, residual samples related to prenatal, postnatal constitutional, and oncohematological diagnostics may be used, in accordance with the criteria set forth in the protocol.
Описание
Inclusion Criteria:
- Prenatal, postnatal, and oncohematological samples.
- Availability of results obtained using at least one reference method.
- Valid informed consent for use in research.
- Sufficient quantity and quality of DNA for analysis.
Exclusion Criteria:
- Absence of valid informed consent.
- Incomplete documentation of reference results.
- Insufficient or degraded DNA.
Учебный план
Как устроено исследование?
Детали дизайна
- Наблюдательные модели: OTHER
- Временные перспективы: RETROSPECTIVE
Что измеряет исследование?
Первичные показатели результатов
Первичные показатели результатов
Мера результата |
Временное ограничение |
|---|---|
|
Overall diagnostic concordance between KaryoSolver and reference methods for the identification of clinically detectable structural variants.
Временное ограничение: through study completion, an average of 1 year
|
through study completion, an average of 1 year
|
|
Agreement on the presence/absence of clinically relevant chromosomal alterations between KaryoSolver and reference methods
Временное ограничение: through study completion, an average of 1 year
|
through study completion, an average of 1 year
|
|
Agreement by category of identified alteration (aneuploidies, deletions, duplications) between KaryoSolver and reference methods
Временное ограничение: through study completion, an average of 1 year
|
through study completion, an average of 1 year
|
|
Percentage of cases correctly classified by KaryoSolver compared to the reference comparator
Временное ограничение: through study completion, an average of 1 year
|
through study completion, an average of 1 year
|
Вторичные показатели результатов
Вторичные показатели результатов
Мера результата |
Временное ограничение |
|---|---|
|
Intra-run reproducibility of KaryoSolver, assessed as the agreement of results obtained from replicates analyzed in the same session
Временное ограничение: through study completion, an average of 1 year
|
through study completion, an average of 1 year
|
|
Inter-run reproducibility of KaryoSolver, assessed as the agreement of results obtained from replicates analyzed in different sessions
Временное ограничение: through study completion, an average of 1 year
|
through study completion, an average of 1 year
|
|
Average analytical run time per sample with KaryoSolver compared to reference methods
Временное ограничение: through study completion, an average of 1 year
|
through study completion, an average of 1 year
|
|
Average total reporting time/turnaround time with KaryoSolver compared to reference methods.
Временное ограничение: through study completion, an average of 1 year
|
through study completion, an average of 1 year
|
|
Reduction in technical/interpretive workload, assessed in terms of man-hours or the number of manual tasks required
Временное ограничение: through study completion, an average of 1 year
|
through study completion, an average of 1 year
|
|
Average cost per sample analyzed with KaryoSolver compared to reference methods
Временное ограничение: through study completion, an average of 1 year
|
through study completion, an average of 1 year
|
|
Proportion of cases potentially eligible for faster diagnosis using KaryoSolver compared to the standard workflow
Временное ограничение: through study completion, an average of 1 year
|
through study completion, an average of 1 year
|
Соавторы и исследователи
Спонсор
Спонсор
Даты записи исследования
Изучение основных дат
Начало исследования (Действительный)
Начало исследования
Первичное завершение (Оцененный)
Первичное завершение
Завершение исследования (Оцененный)
Завершение исследования
Даты регистрации исследования
Первый отправленный
Первый отправленный
Впервые представлено, что соответствует критериям контроля качества
Впервые представлено, что соответствует критериям контроля качества
Первый опубликованный (Действительный)
Первый опубликованный
Обновления учебных записей
Последнее опубликованное обновление (Действительный)
Последнее опубликованное обновление
Последнее отправленное обновление, отвечающее критериям контроля качества
Последнее отправленное обновление, отвечающее критериям контроля качества
Последняя проверка
Последняя проверка
Дополнительная информация
Термины, связанные с этим исследованием
Ключевые слова
Дополнительные соответствующие термины MeSH
Другие идентификационные номера исследования
Другие идентификационные номера исследования
- KaryoSolver-ONT
Планирование данных отдельных участников (IPD)
Планируете делиться данными об отдельных участниках (IPD)?
Описание плана IPD
IPD will not be shared because this is a non-interventional study which does not produce any health outcomes; it is, in fact, a performance study involving IVDs conducted solely for methodological research purposes, with no results being reported for diagnostic or therapeutic purposes.
Информация о лекарствах и устройствах, исследовательские документы
Изучает лекарственный продукт, регулируемый FDA США.
Изучает продукт устройства, регулируемый Управлением по санитарному надзору за качеством пищевых продуктов и медикаментов США.
Эта информация была получена непосредственно с веб-сайта clinicaltrials.gov без каких-либо изменений. Если у вас есть запросы на изменение, удаление или обновление сведений об исследовании, обращайтесь по адресу register@clinicaltrials.gov. Как только изменение будет реализовано на clinicaltrials.gov, оно будет автоматически обновлено и на нашем веб-сайте. .