Molekulární analýza vzorků od pacientů s difuzním vnitřním Pontinovým gliomem a gliomem mozkového kmene
19. srpna 2024 aktualizováno: Javad Nazarian, Children's National Research Institute
Účelem této studie je prospektivně shromáždit vzorky od dětských pacientů s difuzním vnitřním pontinním gliomem nebo gliomem mozkového kmene, buď během terapie nebo při pitvě, za účelem charakterizace molekulárních abnormalit tohoto nádoru.
Přehled studie
Postavení
Nábor
Detailní popis
Difúzní vnitřní pontinní gliom vysokého stupně (DIPG) tvoří přibližně 80 % nádorů mozkového kmene u dětí a 10 % nádorů mozku u dětí a je nejsmrtelnější formou gliomů mozkového kmene u dětí.
V současné době neexistuje účinná terapie k léčbě těchto nádorů.
Předpokládáme, že tento nádor vykazuje jedinečné molekulární abnormality vedoucí ke změněné expresi RNA a proteinů.
Cílem této studie je shromáždit vzorky od dětských pacientů s difuzním vnitřním pontinním gliomem včetně séra, mozkomíšního moku, moči, mozkového nádoru a další konstituční tkáně během terapie a/nebo při pitvě.
Naším cílem je studovat tuto tkáň, abychom charakterizovali genetické abnormality, které vedou k tvorbě nádorů, abychom identifikovali klíčové molekuly jako biomarkery, na které se můžeme zaměřit při navrhování a testování nových a účinnějších léčebných postupů.
Typ studie
Pozorovací
Zápis (Odhadovaný)
100
Kontakty a umístění
Tato část poskytuje kontaktní údaje pro ty, kteří studii provádějí, a informace o tom, kde se tato studie provádí.
Studijní kontakt
- Jméno: Javad Nazarian, PhD
- Telefonní číslo: 202-476-6022
- E-mail: JNazarian@cnmc.org
Studijní záloha kontaktů
- Jméno: Caroline Kopsidas, BS
- Telefonní číslo: 240-393-3359
- E-mail: ckopsidas@childrensnational.org
Studijní místa
-
-
District of Columbia
-
Washington, District of Columbia, Spojené státy, 20010
- Nábor
- Children's National Medical Center
-
Dílčí vyšetřovatel:
- Roger Packer, MD
-
Vrchní vyšetřovatel:
- Javad Nazarian, PhD
-
Dílčí vyšetřovatel:
- Suresh Magge, MD
-
Dílčí vyšetřovatel:
- Amanda L Muhs, MD
-
-
Kritéria účasti
Výzkumníci hledají lidi, kteří odpovídají určitému popisu, kterému se říká kritéria způsobilosti. Některé příklady těchto kritérií jsou celkový zdravotní stav osoby nebo předchozí léčba.
Kritéria způsobilosti
Věk způsobilý ke studiu
Ne starší než 21 let (Dítě, Dospělý)
Přijímá zdravé dobrovolníky
Ne
Metoda odběru vzorků
Vzorek nepravděpodobnosti
Studijní populace
Vzorek komunity
Popis
Kritéria pro zařazení:
- Pacienti jakéhokoli věku s klinickou a radiologickou diagnózou difuzního vnitřního pontinního gliomu
- Pacienti s jinými gliomy vysokého stupně pocházející z mozkového kmene
- Pacienti s fokálními gliomy (WHO stupeň I/II) mozkového kmene
Kritéria vyloučení:
- Pacienti s jakýmkoli typem infiltrativního gliomu nízkého stupně (WHO stupeň I a II) nebo vysokého stupně gliomu (WHO stupeň III a IV) pocházejícího mimo mozkový kmen
- Pacienti s primárními nádory mozkového kmene s jinými histologickými diagnózami (např. PNET)
Studijní plán
Tato část poskytuje podrobnosti o studijním plánu, včetně toho, jak je studie navržena a co studie měří.
Jak je studie koncipována?
Detaily designu
- Observační modely: Kohorta
- Časové perspektivy: Budoucí
Kohorty a intervence
Skupina / kohorta |
|---|
|
Vzorky pacientů
Čerstvě zmrazené a fixované vzorky nádorů, odpovídající vzorky normální mozkové tkáně, vzorky mozkomíšního moku, moči a séra od pacientů postižených difuzním vnitřním pontinním gliomem nebo gliomem mozkového kmene
|
Co je měření studie?
Primární výstupní opatření
Měření výsledku |
Popis opatření |
Časové okno |
|---|---|---|
|
Vzorce exprese RNA v celém genomu ve vzorcích nádorů, normální tkáni mozkového kmene a mozkomíšním moku pomocí profilování genové exprese Affymetrix
Časové okno: 5 let
|
Odebrané nádorové a normální vzorky budou potenciálně použity pro profilování vzoru exprese v celém genomu RNA.
|
5 let
|
|
Validace výsledků celogenomové analýzy
Časové okno: 5 let
|
Molekulární analýza provedená na odebraných vzorcích bude ověřena sekvenováním celého genomu.
|
5 let
|
|
Proteomické profilování nádoru, normální tkáně mozkového kmene a mozkomíšního moku
Časové okno: 5 let
|
Pro získání úplné charakterizace odebraných vzorků bude provedeno proteomické profilování na shromážděných nádorových a normálních vzorcích.
|
5 let
|
|
Vzorce exprese proteinu, jak byly hodnoceny imunohistochemií a Western blotem, ve srovnání s normální tkání mozkového kmene
Časové okno: 5 let
|
Odebrané vzorky nádoru a normální vzorky budou mít imunochemii a western blot porovnané pro posouzení variace exprese proteinu.
|
5 let
|
|
Genomová analýza vzorků nádorů a normální tkáně mozkového kmene
Časové okno: 5 let
|
Pro získání úplné charakterizace odebraných vzorků bude provedeno sekvenování celého genomu na shromážděných nádorových a normálních vzorcích.
|
5 let
|
|
In vitro a in vivo molekulární analýza odebraných vzorků
Časové okno: 5 let
|
Odebrané vzorky budou potenciálně použity pro in vitro analýzu a vytvoření zvířecích modelů tohoto nádoru.
|
5 let
|
Sekundární výstupní opatření
Měření výsledku |
Popis opatření |
Časové okno |
|---|---|---|
|
Posuďte aspekty spojené s pořízením vzorku, včetně potenciálních výhod a nevýhod
Časové okno: 5 let
|
Ve snaze pokračovat v čerpání znalostí z odebraných vzorků budou průběžně zpřístupňovány potenciální výhody a nevýhody získávání vzorků.
|
5 let
|
Spolupracovníci a vyšetřovatelé
Zde najdete lidi a organizace zapojené do této studie.
Vyšetřovatelé
- Vrchní vyšetřovatel: Javad Nazarian, PhD, Children's National Research Institute
Publikace a užitečné odkazy
Osoba odpovědná za zadávání informací o studiu tyto publikace poskytuje dobrovolně. Mohou se týkat čehokoli, co souvisí se studiem.
Obecné publikace
- Becher OJ, Hambardzumyan D, Walker TR, Helmy K, Nazarian J, Albrecht S, Hiner RL, Gall S, Huse JT, Jabado N, MacDonald TJ, Holland EC. Preclinical evaluation of radiation and perifosine in a genetically and histologically accurate model of brainstem glioma. Cancer Res. 2010 Mar 15;70(6):2548-57. doi: 10.1158/0008-5472.CAN-09-2503. Epub 2010 Mar 2.
- Panditharatna E, Yaeger K, Kilburn LB, Packer RJ, Nazarian J. Clinicopathology of diffuse intrinsic pontine glioma and its redefined genomic and epigenomic landscape. Cancer Genet. 2015 Jul-Aug;208(7-8):367-73. doi: 10.1016/j.cancergen.2015.04.008. Epub 2015 May 1.
- Yadavilli S, Scafidi J, Becher OJ, Saratsis AM, Hiner RL, Kambhampati M, Mariarita S, MacDonald TJ, Codispoti KE, Magge SN, Jaiswal JK, Packer RJ, Nazarian J. The emerging role of NG2 in pediatric diffuse intrinsic pontine glioma. Oncotarget. 2015 May 20;6(14):12141-55. doi: 10.18632/oncotarget.3716.
- Kambhampati M, Perez JP, Yadavilli S, Saratsis AM, Hill AD, Ho CY, Panditharatna E, Markel M, Packer RJ, Nazarian J. A standardized autopsy procurement allows for the comprehensive study of DIPG biology. Oncotarget. 2015 May 20;6(14):12740-7. doi: 10.18632/oncotarget.3374.
- Kambhampati M, Panditharatna E, Yadavilli S, Saoud K, Lee S, Eze A, Almira-Suarez MI, Hancock L, Bonner ER, Gittens J, Stampar M, Gaonkar K, Resnick AC, Kline C, Ho CY, Waanders AJ, Georgescu MM, Rance NE, Kim Y, Johnson C, Rood BR, Kilburn LB, Hwang EI, Mueller S, Packer RJ, Bornhorst M, Nazarian J. Harmonization of postmortem donations for pediatric brain tumors and molecular characterization of diffuse midline gliomas. Sci Rep. 2020 Jul 2;10(1):10954. doi: 10.1038/s41598-020-67764-2.
- Ballester LY, Wang Z, Shandilya S, Miettinen M, Burger PC, Eberhart CG, Rodriguez FJ, Raabe E, Nazarian J, Warren K, Quezado MM. Morphologic characteristics and immunohistochemical profile of diffuse intrinsic pontine gliomas. Am J Surg Pathol. 2013 Sep;37(9):1357-64. doi: 10.1097/PAS.0b013e318294e817.
- Saratsis AM, Yadavilli S, Magge S, Rood BR, Perez J, Hill DA, Hwang E, Kilburn L, Packer RJ, Nazarian J. Insights into pediatric diffuse intrinsic pontine glioma through proteomic analysis of cerebrospinal fluid. Neuro Oncol. 2012 May;14(5):547-60. doi: 10.1093/neuonc/nos067. Epub 2012 Apr 5.
- Ahsan S, Raabe EH, Haffner MC, Vaghasia A, Warren KE, Quezado M, Ballester LY, Nazarian J, Eberhart CG, Rodriguez FJ. Increased 5-hydroxymethylcytosine and decreased 5-methylcytosine are indicators of global epigenetic dysregulation in diffuse intrinsic pontine glioma. Acta Neuropathol Commun. 2014 Jun 3;2:59. doi: 10.1186/2051-5960-2-59.
- Buczkowicz P, Hoeman C, Rakopoulos P, Pajovic S, Letourneau L, Dzamba M, Morrison A, Lewis P, Bouffet E, Bartels U, Zuccaro J, Agnihotri S, Ryall S, Barszczyk M, Chornenkyy Y, Bourgey M, Bourque G, Montpetit A, Cordero F, Castelo-Branco P, Mangerel J, Tabori U, Ho KC, Huang A, Taylor KR, Mackay A, Bendel AE, Nazarian J, Fangusaro JR, Karajannis MA, Zagzag D, Foreman NK, Donson A, Hegert JV, Smith A, Chan J, Lafay-Cousin L, Dunn S, Hukin J, Dunham C, Scheinemann K, Michaud J, Zelcer S, Ramsay D, Cain J, Brennan C, Souweidane MM, Jones C, Allis CD, Brudno M, Becher O, Hawkins C. Genomic analysis of diffuse intrinsic pontine gliomas identifies three molecular subgroups and recurrent activating ACVR1 mutations. Nat Genet. 2014 May;46(5):451-6. doi: 10.1038/ng.2936. Epub 2014 Apr 6.
- Nikbakht H, Panditharatna E, Mikael LG, Li R, Gayden T, Osmond M, Ho CY, Kambhampati M, Hwang EI, Faury D, Siu A, Papillon-Cavanagh S, Bechet D, Ligon KL, Ellezam B, Ingram WJ, Stinson C, Moore AS, Warren KE, Karamchandani J, Packer RJ, Jabado N, Majewski J, Nazarian J. Spatial and temporal homogeneity of driver mutations in diffuse intrinsic pontine glioma. Nat Commun. 2016 Apr 6;7:11185. doi: 10.1038/ncomms11185.
- Saratsis AM, Kambhampati M, Snyder K, Yadavilli S, Devaney JM, Harmon B, Hall J, Raabe EH, An P, Weingart M, Rood BR, Magge SN, MacDonald TJ, Packer RJ, Nazarian J. Comparative multidimensional molecular analyses of pediatric diffuse intrinsic pontine glioma reveals distinct molecular subtypes. Acta Neuropathol. 2014;127(6):881-95. doi: 10.1007/s00401-013-1218-2. Epub 2013 Dec 3. Erratum In: Acta Neuropathol. 2020 Aug;140(2):247. doi: 10.1007/s00401-020-02162-6.
Užitečné odkazy
Termíny studijních záznamů
Tato data sledují průběh záznamů studie a předkládání souhrnných výsledků na ClinicalTrials.gov. Záznamy ze studií a hlášené výsledky jsou před zveřejněním na veřejné webové stránce přezkoumány Národní lékařskou knihovnou (NLM), aby se ujistily, že splňují specifické standardy kontroly kvality.
Hlavní termíny studia
Začátek studia (Aktuální)
1. dubna 2010
Primární dokončení (Odhadovaný)
1. dubna 2025
Dokončení studie (Odhadovaný)
1. dubna 2030
Termíny zápisu do studia
První předloženo
19. dubna 2010
První předloženo, které splnilo kritéria kontroly kvality
19. dubna 2010
První zveřejněno (Odhadovaný)
20. dubna 2010
Aktualizace studijních záznamů
Poslední zveřejněná aktualizace (Aktuální)
20. srpna 2024
Odeslaná poslední aktualizace, která splnila kritéria kontroly kvality
19. srpna 2024
Naposledy ověřeno
1. srpna 2024
Více informací
Termíny související s touto studií
Klíčová slova
Další relevantní podmínky MeSH
- Onemocnění mozku
- Onemocnění centrálního nervového systému
- Nemoci nervového systému
- Novotvary podle histologického typu
- Novotvary
- Novotvary podle místa
- Novotvary, žlázové a epiteliální
- Novotvary, neuroepiteliální
- Neuroektodermální nádory
- Novotvary, zárodečné buňky a embryonální
- Novotvary, nervová tkáň
- Novotvary mozku
- Novotvary centrálního nervového systému
- Novotvary nervového systému
- Novotvary mozkového kmene
- Infratentoriální novotvary
- Gliom
- Difúzní vnitřní pontinský gliom
Další identifikační čísla studie
- DIPG-1
Tyto informace byly beze změn načteny přímo z webu clinicaltrials.gov. Máte-li jakékoli požadavky na změnu, odstranění nebo aktualizaci podrobností studie, kontaktujte prosím register@clinicaltrials.gov. Jakmile bude změna implementována na clinicaltrials.gov, bude automaticky aktualizována i na našem webu .