Diffuusia sisäistä Pontine-glioomaa ja aivorungon glioomaa sairastavien potilaiden näytteiden molekyylianalyysi
maanantai 19. elokuuta 2024 päivittänyt: Javad Nazarian, Children's National Research Institute
Tämän tutkimuksen tarkoituksena on kerätä näytteitä lapsipotilailta, joilla on diffuusi sisäinen pontinegliooma tai aivorungon gliooma joko hoidon aikana tai ruumiinavauksen yhteydessä, jotta voidaan karakterisoida tämän kasvaimen molekyylipoikkeavuuksia.
Tutkimuksen yleiskatsaus
Tila
Rekrytointi
Yksityiskohtainen kuvaus
Korkealaatuinen diffuusi sisäinen pontinegliooma (DIPG) muodostaa noin 80 % lasten aivorungon kasvaimista ja 10 % lasten aivokasvaimista, ja se on tappavin aivorungon glioomien muoto lapsilla.
Tällä hetkellä ei ole tehokasta hoitoa näiden kasvainten hoitoon.
Oletamme, että tällä kasvaimella on ainutlaatuisia molekyylipoikkeavuuksia, jotka johtavat muuttuneeseen RNA- ja proteiiniekspressioon.
Tämän tutkimuksen tavoitteena on kerätä näytteitä lapsipotilailta, joilla on diffuusi sisäinen pontinegliooma, mukaan lukien seerumi, aivo-selkäydinneste, virtsa, aivokasvain ja muu peruskudos, hoidon ja/tai ruumiinavauksen aikana.
Tavoitteenamme on tutkia tätä kudosta luonnehtiaksemme kasvainten muodostumiseen johtavia geneettisiä poikkeavuuksia, jotta voimme tunnistaa keskeiset molekyylit biomarkkereiksi, joita voimme kohdistaa uusien ja tehokkaampien hoitojen suunnitteluun ja testaamiseen.
Opintotyyppi
Havainnollistava
Ilmoittautuminen (Arvioitu)
100
Yhteystiedot ja paikat
Tässä osiossa on tutkimuksen suorittajien yhteystiedot ja tiedot siitä, missä tämä tutkimus suoritetaan.
Opiskeluyhteys
- Nimi: Javad Nazarian, PhD
- Puhelinnumero: 202-476-6022
- Sähköposti: JNazarian@cnmc.org
Tutki yhteystietojen varmuuskopiointi
- Nimi: Caroline Kopsidas, BS
- Puhelinnumero: 240-393-3359
- Sähköposti: ckopsidas@childrensnational.org
Opiskelupaikat
-
-
District of Columbia
-
Washington, District of Columbia, Yhdysvallat, 20010
- Rekrytointi
- Children's National Medical Center
-
Alatutkija:
- Roger Packer, MD
-
Päätutkija:
- Javad Nazarian, PhD
-
Alatutkija:
- Suresh Magge, MD
-
Alatutkija:
- Amanda L Muhs, MD
-
-
Osallistumiskriteerit
Tutkijat etsivät ihmisiä, jotka sopivat tiettyyn kuvaukseen, jota kutsutaan kelpoisuuskriteereiksi. Joitakin esimerkkejä näistä kriteereistä ovat henkilön yleinen terveydentila tai aiemmat hoidot.
Kelpoisuusvaatimukset
Opintokelpoiset iät
Ei vanhempi kuin 21 vuotta (Lapsi, Aikuinen)
Hyväksyy terveitä vapaaehtoisia
Ei
Näytteenottomenetelmä
Ei-todennäköisyysnäyte
Tutkimusväestö
Yhteisön näyte
Kuvaus
Sisällyttämiskriteerit:
- Kaiken ikäiset potilaat, joilla on kliininen ja radiologinen diffuusi sisäinen pontinegliooma
- Potilaat, joilla on muita korkealaatuisia aivorungosta peräisin olevia glioomia
- Potilaat, joilla on aivorungon fokaalinen gliooma (WHO-aste I/II).
Poissulkemiskriteerit:
- Potilaat, joilla on minkä tahansa tyyppinen infiltratiivinen matala-asteinen (WHO-aste I ja II) tai korkea-asteinen gliooma (WHO-aste III ja IV), joka on peräisin aivorungon ulkopuolelta
- Potilaat, joilla on primaarisia aivorungon kasvaimia, joilla on muita histologisia diagnooseja (esim.
Opintosuunnitelma
Tässä osiossa on tietoja tutkimussuunnitelmasta, mukaan lukien kuinka tutkimus on suunniteltu ja mitä tutkimuksella mitataan.
Miten tutkimus on suunniteltu?
Suunnittelun yksityiskohdat
- Havaintomallit: Kohortti
- Aikanäkymät: Tulevaisuuden
Kohortit ja interventiot
Ryhmä/Kohortti |
|---|
|
Potilasnäytteet
Tuorejäädytetyt ja kiinteät kasvainnäytteet, vastaavat normaalit aivokudosnäytteet, aivo-selkäydinneste, virtsa ja seeruminäytteet potilailta, joilla on diffuusi sisäinen pontinegliooma tai aivorungon gliooma
|
Mitä tutkimuksessa mitataan?
Ensisijaiset tulostoimenpiteet
Tulosmittaus |
Toimenpiteen kuvaus |
Aikaikkuna |
|---|---|---|
|
RNA:n genominlaajuiset ilmentymismallit kasvainnäytteissä, normaalissa aivorunkokudoksessa ja aivo-selkäydinnesteessä käyttämällä Affymetrix-geenin ilmentymisprofilointia
Aikaikkuna: 5 vuotta
|
Kerättyjä kasvain- ja normaaleja näytteitä voidaan mahdollisesti käyttää RNA-genomin laajuiseen ilmentymismallin profilointiin.
|
5 vuotta
|
|
Genomin laajuisen analyysin tulosten validointi
Aikaikkuna: 5 vuotta
|
Kerätyille näytteille tehty molekyylianalyysi validoidaan koko genomin sekvensoinnilla.
|
5 vuotta
|
|
Kasvaimen, normaalin aivorunkokudoksen ja aivo-selkäydinnesteen proteominen profilointi
Aikaikkuna: 5 vuotta
|
Kerättyjen näytteiden täydellisen karakterisoinnin saamiseksi kasvaimelle ja normaaleille näytteille tehdään proteominen profilointi.
|
5 vuotta
|
|
Proteiinin ilmentymismallit arvioituna immunohistokemialla ja Western blotilla verrattuna normaaliin aivorunkokudokseen
Aikaikkuna: 5 vuotta
|
Kerätyistä kasvain- ja normaaleista näytteistä on immunokemia ja Western blot -analyysi verrattuna proteiinin ilmentymisen vaihtelun arvioimiseen.
|
5 vuotta
|
|
Kasvainnäytteiden ja normaalin aivorungon kudoksen genominlaajuinen analyysi
Aikaikkuna: 5 vuotta
|
Kerättyjen näytteiden täydellisen karakterisoinnin saamiseksi koko genomi sekvensoidaan kasvaimelle ja kerätään normaaleja näytteitä.
|
5 vuotta
|
|
Kerättyjen näytteiden molekyylianalyysi in vitro ja in vivo
Aikaikkuna: 5 vuotta
|
Kerättyjä näytteitä voidaan mahdollisesti käyttää tämän kasvaimen in vitro -analyysiin ja eläinmallien luomiseen.
|
5 vuotta
|
Toissijaiset tulostoimenpiteet
Tulosmittaus |
Toimenpiteen kuvaus |
Aikaikkuna |
|---|---|---|
|
Arvioi näytteiden hankintaan liittyviä näkökohtia, mukaan lukien mahdolliset edut ja haitat
Aikaikkuna: 5 vuotta
|
Pyrimme jatkossakin hankkimaan tietoa kerätyistä näytteistä, joten näytteiden hankinnan mahdollisia etuja ja haittoja tarkastellaan jatkuvasti.
|
5 vuotta
|
Yhteistyökumppanit ja tutkijat
Täältä löydät tähän tutkimukseen osallistuvat ihmiset ja organisaatiot.
Tutkijat
- Päätutkija: Javad Nazarian, PhD, Children's National Research Institute
Julkaisuja ja hyödyllisiä linkkejä
Tutkimusta koskevien tietojen syöttämisestä vastaava henkilö toimittaa nämä julkaisut vapaaehtoisesti. Nämä voivat koskea mitä tahansa tutkimukseen liittyvää.
Yleiset julkaisut
- Becher OJ, Hambardzumyan D, Walker TR, Helmy K, Nazarian J, Albrecht S, Hiner RL, Gall S, Huse JT, Jabado N, MacDonald TJ, Holland EC. Preclinical evaluation of radiation and perifosine in a genetically and histologically accurate model of brainstem glioma. Cancer Res. 2010 Mar 15;70(6):2548-57. doi: 10.1158/0008-5472.CAN-09-2503. Epub 2010 Mar 2.
- Panditharatna E, Yaeger K, Kilburn LB, Packer RJ, Nazarian J. Clinicopathology of diffuse intrinsic pontine glioma and its redefined genomic and epigenomic landscape. Cancer Genet. 2015 Jul-Aug;208(7-8):367-73. doi: 10.1016/j.cancergen.2015.04.008. Epub 2015 May 1.
- Yadavilli S, Scafidi J, Becher OJ, Saratsis AM, Hiner RL, Kambhampati M, Mariarita S, MacDonald TJ, Codispoti KE, Magge SN, Jaiswal JK, Packer RJ, Nazarian J. The emerging role of NG2 in pediatric diffuse intrinsic pontine glioma. Oncotarget. 2015 May 20;6(14):12141-55. doi: 10.18632/oncotarget.3716.
- Kambhampati M, Perez JP, Yadavilli S, Saratsis AM, Hill AD, Ho CY, Panditharatna E, Markel M, Packer RJ, Nazarian J. A standardized autopsy procurement allows for the comprehensive study of DIPG biology. Oncotarget. 2015 May 20;6(14):12740-7. doi: 10.18632/oncotarget.3374.
- Kambhampati M, Panditharatna E, Yadavilli S, Saoud K, Lee S, Eze A, Almira-Suarez MI, Hancock L, Bonner ER, Gittens J, Stampar M, Gaonkar K, Resnick AC, Kline C, Ho CY, Waanders AJ, Georgescu MM, Rance NE, Kim Y, Johnson C, Rood BR, Kilburn LB, Hwang EI, Mueller S, Packer RJ, Bornhorst M, Nazarian J. Harmonization of postmortem donations for pediatric brain tumors and molecular characterization of diffuse midline gliomas. Sci Rep. 2020 Jul 2;10(1):10954. doi: 10.1038/s41598-020-67764-2.
- Ballester LY, Wang Z, Shandilya S, Miettinen M, Burger PC, Eberhart CG, Rodriguez FJ, Raabe E, Nazarian J, Warren K, Quezado MM. Morphologic characteristics and immunohistochemical profile of diffuse intrinsic pontine gliomas. Am J Surg Pathol. 2013 Sep;37(9):1357-64. doi: 10.1097/PAS.0b013e318294e817.
- Saratsis AM, Yadavilli S, Magge S, Rood BR, Perez J, Hill DA, Hwang E, Kilburn L, Packer RJ, Nazarian J. Insights into pediatric diffuse intrinsic pontine glioma through proteomic analysis of cerebrospinal fluid. Neuro Oncol. 2012 May;14(5):547-60. doi: 10.1093/neuonc/nos067. Epub 2012 Apr 5.
- Ahsan S, Raabe EH, Haffner MC, Vaghasia A, Warren KE, Quezado M, Ballester LY, Nazarian J, Eberhart CG, Rodriguez FJ. Increased 5-hydroxymethylcytosine and decreased 5-methylcytosine are indicators of global epigenetic dysregulation in diffuse intrinsic pontine glioma. Acta Neuropathol Commun. 2014 Jun 3;2:59. doi: 10.1186/2051-5960-2-59.
- Buczkowicz P, Hoeman C, Rakopoulos P, Pajovic S, Letourneau L, Dzamba M, Morrison A, Lewis P, Bouffet E, Bartels U, Zuccaro J, Agnihotri S, Ryall S, Barszczyk M, Chornenkyy Y, Bourgey M, Bourque G, Montpetit A, Cordero F, Castelo-Branco P, Mangerel J, Tabori U, Ho KC, Huang A, Taylor KR, Mackay A, Bendel AE, Nazarian J, Fangusaro JR, Karajannis MA, Zagzag D, Foreman NK, Donson A, Hegert JV, Smith A, Chan J, Lafay-Cousin L, Dunn S, Hukin J, Dunham C, Scheinemann K, Michaud J, Zelcer S, Ramsay D, Cain J, Brennan C, Souweidane MM, Jones C, Allis CD, Brudno M, Becher O, Hawkins C. Genomic analysis of diffuse intrinsic pontine gliomas identifies three molecular subgroups and recurrent activating ACVR1 mutations. Nat Genet. 2014 May;46(5):451-6. doi: 10.1038/ng.2936. Epub 2014 Apr 6.
- Nikbakht H, Panditharatna E, Mikael LG, Li R, Gayden T, Osmond M, Ho CY, Kambhampati M, Hwang EI, Faury D, Siu A, Papillon-Cavanagh S, Bechet D, Ligon KL, Ellezam B, Ingram WJ, Stinson C, Moore AS, Warren KE, Karamchandani J, Packer RJ, Jabado N, Majewski J, Nazarian J. Spatial and temporal homogeneity of driver mutations in diffuse intrinsic pontine glioma. Nat Commun. 2016 Apr 6;7:11185. doi: 10.1038/ncomms11185.
- Saratsis AM, Kambhampati M, Snyder K, Yadavilli S, Devaney JM, Harmon B, Hall J, Raabe EH, An P, Weingart M, Rood BR, Magge SN, MacDonald TJ, Packer RJ, Nazarian J. Comparative multidimensional molecular analyses of pediatric diffuse intrinsic pontine glioma reveals distinct molecular subtypes. Acta Neuropathol. 2014;127(6):881-95. doi: 10.1007/s00401-013-1218-2. Epub 2013 Dec 3. Erratum In: Acta Neuropathol. 2020 Aug;140(2):247. doi: 10.1007/s00401-020-02162-6.
Hyödyllisiä linkkejä
Opintojen ennätyspäivät
Nämä päivämäärät seuraavat ClinicalTrials.gov-sivustolle lähetettyjen tutkimustietueiden ja yhteenvetojen edistymistä. National Library of Medicine (NLM) tarkistaa tutkimustiedot ja raportoidut tulokset varmistaakseen, että ne täyttävät tietyt laadunvalvontastandardit, ennen kuin ne julkaistaan julkisella verkkosivustolla.
Opi tärkeimmät päivämäärät
Opiskelun aloitus (Todellinen)
Torstai 1. huhtikuuta 2010
Ensisijainen valmistuminen (Arvioitu)
Tiistai 1. huhtikuuta 2025
Opintojen valmistuminen (Arvioitu)
Maanantai 1. huhtikuuta 2030
Opintoihin ilmoittautumispäivät
Ensimmäinen lähetetty
Maanantai 19. huhtikuuta 2010
Ensimmäinen toimitettu, joka täytti QC-kriteerit
Maanantai 19. huhtikuuta 2010
Ensimmäinen Lähetetty (Arvioitu)
Tiistai 20. huhtikuuta 2010
Tutkimustietojen päivitykset
Viimeisin päivitys julkaistu (Todellinen)
Tiistai 20. elokuuta 2024
Viimeisin lähetetty päivitys, joka täytti QC-kriteerit
Maanantai 19. elokuuta 2024
Viimeksi vahvistettu
Torstai 1. elokuuta 2024
Lisää tietoa
Tähän tutkimukseen liittyvät termit
Avainsanat
Muita asiaankuuluvia MeSH-ehtoja
- Aivojen sairaudet
- Keskushermoston sairaudet
- Hermoston sairaudet
- Neoplasmat histologisen tyypin mukaan
- Neoplasmat
- Neoplasmat sivustoittain
- Kasvaimet, rauhas- ja epiteelikasvaimet
- Neoplasmat, neuroepiteliaaliset
- Neuroektodermaaliset kasvaimet
- Neoplasmat, sukusolut ja alkiot
- Kasvaimet, hermokudos
- Aivojen kasvaimet
- Keskushermoston kasvaimet
- Hermoston kasvaimet
- Aivorungon kasvaimet
- Infratentoriaaliset kasvaimet
- Glioma
- Diffuusi sisäinen Pontine Gliooma
Muut tutkimustunnusnumerot
- DIPG-1
Nämä tiedot haettiin suoraan verkkosivustolta clinicaltrials.gov ilman muutoksia. Jos sinulla on pyyntöjä muuttaa, poistaa tai päivittää tutkimustietojasi, ota yhteyttä register@clinicaltrials.gov. Heti kun muutos on otettu käyttöön osoitteessa clinicaltrials.gov, se päivitetään automaattisesti myös verkkosivustollemme .