Analiza molekularna próbek pobranych od pacjentów z rozlanym glejakiem mostka i glejakiem pnia mózgu
19 sierpnia 2024 zaktualizowane przez: Javad Nazarian, Children's National Research Institute
Celem tego badania jest prospektywne zebranie próbek od pacjentów pediatrycznych z rozlanym wewnętrznym glejakiem mostu lub glejakiem pnia mózgu, podczas leczenia lub podczas autopsji, w celu scharakteryzowania nieprawidłowości molekularnych tego guza.
Przegląd badań
Status
Rekrutacyjny
Szczegółowy opis
Rozlany glejak pnia mózgu wysokiego stopnia (DIPG) stanowi około 80% dziecięcych guzów pnia mózgu i 10% dziecięcych guzów mózgu i jest najbardziej śmiertelną postacią glejaków pnia mózgu u dzieci.
Obecnie nie ma skutecznej terapii do leczenia tych nowotworów.
Stawiamy hipotezę, że guz ten wykazuje unikalne nieprawidłowości molekularne prowadzące do zmienionej ekspresji RNA i białek.
Celem tego badania jest pobranie próbek od pacjentów pediatrycznych z rozlanym glejakiem mostu, w tym surowicy, płynu mózgowo-rdzeniowego, moczu, guza mózgu i innych tkanek konstytucyjnych, podczas leczenia i/lub podczas sekcji zwłok.
Naszym celem jest zbadanie tej tkanki w celu scharakteryzowania nieprawidłowości genetycznych, które prowadzą do powstania guza, w celu zidentyfikowania kluczowych cząsteczek jako biomarkerów, które możemy wykorzystać do zaprojektowania i przetestowania nowych i bardziej skutecznych metod leczenia.
Typ studiów
Obserwacyjny
Zapisy (Szacowany)
100
Kontakty i lokalizacje
Ta sekcja zawiera dane kontaktowe osób prowadzących badanie oraz informacje o tym, gdzie badanie jest przeprowadzane.
Kontakt w sprawie studiów
- Nazwa: Javad Nazarian, PhD
- Numer telefonu: 202-476-6022
- E-mail: JNazarian@cnmc.org
Kopia zapasowa kontaktu do badania
- Nazwa: Caroline Kopsidas, BS
- Numer telefonu: 240-393-3359
- E-mail: ckopsidas@childrensnational.org
Lokalizacje studiów
-
-
District of Columbia
-
Washington, District of Columbia, Stany Zjednoczone, 20010
- Rekrutacyjny
- Children's National Medical Center
-
Pod-śledczy:
- Roger Packer, MD
-
Główny śledczy:
- Javad Nazarian, PhD
-
Pod-śledczy:
- Suresh Magge, MD
-
Pod-śledczy:
- Amanda L Muhs, MD
-
-
Kryteria uczestnictwa
Badacze szukają osób, które pasują do określonego opisu, zwanego kryteriami kwalifikacyjnymi. Niektóre przykłady tych kryteriów to ogólny stan zdrowia danej osoby lub wcześniejsze leczenie.
Kryteria kwalifikacji
Wiek uprawniający do nauki
Nie starszy niż 21 lat (Dziecko, Dorosły)
Akceptuje zdrowych ochotników
Nie
Metoda próbkowania
Próbka bez prawdopodobieństwa
Badana populacja
Próbka społeczności
Opis
Kryteria przyjęcia:
- Pacjenci w każdym wieku z klinicznym i radiologicznym rozpoznaniem rozlanego glejaka mostu
- Pacjenci z innymi glejakami o wysokim stopniu złośliwości wywodzącymi się z pnia mózgu
- Pacjenci z glejakami ogniskowymi (stopień I/II wg WHO) pnia mózgu
Kryteria wyłączenia:
- Pacjenci z dowolnym rodzajem glejaka o niskim stopniu naciekania (stopień I i II wg WHO) lub wysokim stopniu złośliwości (stopień III i IV wg WHO) wywodzącym się poza pnia mózgu
- Pacjenci z pierwotnym guzem pnia mózgu z innymi rozpoznaniami histologicznymi (np. PNET)
Plan studiów
Ta sekcja zawiera szczegółowe informacje na temat planu badania, w tym sposób zaprojektowania badania i jego pomiary.
Jak projektuje się badanie?
Szczegóły projektu
- Modele obserwacyjne: Kohorta
- Perspektywy czasowe: Spodziewany
Kohorty i interwencje
Grupa / Kohorta |
|---|
|
Próbki pacjentów
Świeżo zamrożone i utrwalone próbki guza, odpowiednie próbki normalnej tkanki mózgowej, próbki płynu mózgowo-rdzeniowego, moczu i surowicy od pacjentów dotkniętych rozlanym glejakiem mostu lub glejakiem pnia mózgu
|
Co mierzy badanie?
Podstawowe miary wyniku
Miara wyniku |
Opis środka |
Ramy czasowe |
|---|---|---|
|
Wzory ekspresji RNA w całym genomie w próbkach guza, normalnej tkance pnia mózgu i płynie mózgowo-rdzeniowym przy użyciu profilowania ekspresji genów Affymetrix
Ramy czasowe: 5 lat
|
Zebrane próbki guzów i prawidłowych próbek zostaną potencjalnie wykorzystane do profilowania wzorców ekspresji całego genomu RNA.
|
5 lat
|
|
Walidacja wyników analizy całego genomu
Ramy czasowe: 5 lat
|
Analiza molekularna przeprowadzona na zebranych próbkach zostanie zweryfikowana poprzez sekwencjonowanie całego genomu.
|
5 lat
|
|
Profilowanie proteomiczne guza, prawidłowej tkanki pnia mózgu i płynu mózgowo-rdzeniowego
Ramy czasowe: 5 lat
|
Aby uzyskać pełną charakterystykę pobranych próbek, profilowanie proteomiczne zostanie przeprowadzone na pobranych próbkach guza i prawidłowych.
|
5 lat
|
|
Wzory ekspresji białek oceniane za pomocą immunohistochemii i western blot w porównaniu z normalną tkanką pnia mózgu
Ramy czasowe: 5 lat
|
Zebrane próbki guza i zdrowych próbek zostaną porównane immunochemicznie i metodą western blot w celu oceny zmienności ekspresji białek.
|
5 lat
|
|
Analiza całego genomu próbek guza i prawidłowej tkanki pnia mózgu
Ramy czasowe: 5 lat
|
Aby uzyskać pełną charakterystykę zebranych próbek, zostanie przeprowadzone sekwencjonowanie całego genomu na pobranych próbkach guza i prawidłowych.
|
5 lat
|
|
Analiza molekularna in vitro i in vivo pobranych próbek
Ramy czasowe: 5 lat
|
Pobrane próbki zostaną potencjalnie wykorzystane do analizy in vitro i stworzenia modeli zwierzęcych tego nowotworu.
|
5 lat
|
Miary wyników drugorzędnych
Miara wyniku |
Opis środka |
Ramy czasowe |
|---|---|---|
|
Oceń aspekty związane z pozyskiwaniem okazów, w tym potencjalne korzyści i wady
Ramy czasowe: 5 lat
|
W celu dalszego czerpania wiedzy z zebranych próbek, będziemy mieć ciągły dostęp do potencjalnych korzyści i wad związanych z pozyskiwaniem próbek.
|
5 lat
|
Współpracownicy i badacze
Tutaj znajdziesz osoby i organizacje zaangażowane w to badanie.
Śledczy
- Główny śledczy: Javad Nazarian, PhD, Children's National Research Institute
Publikacje i pomocne linki
Osoba odpowiedzialna za wprowadzenie informacji o badaniu dobrowolnie udostępnia te publikacje. Mogą one dotyczyć wszystkiego, co jest związane z badaniem.
Publikacje ogólne
- Becher OJ, Hambardzumyan D, Walker TR, Helmy K, Nazarian J, Albrecht S, Hiner RL, Gall S, Huse JT, Jabado N, MacDonald TJ, Holland EC. Preclinical evaluation of radiation and perifosine in a genetically and histologically accurate model of brainstem glioma. Cancer Res. 2010 Mar 15;70(6):2548-57. doi: 10.1158/0008-5472.CAN-09-2503. Epub 2010 Mar 2.
- Panditharatna E, Yaeger K, Kilburn LB, Packer RJ, Nazarian J. Clinicopathology of diffuse intrinsic pontine glioma and its redefined genomic and epigenomic landscape. Cancer Genet. 2015 Jul-Aug;208(7-8):367-73. doi: 10.1016/j.cancergen.2015.04.008. Epub 2015 May 1.
- Yadavilli S, Scafidi J, Becher OJ, Saratsis AM, Hiner RL, Kambhampati M, Mariarita S, MacDonald TJ, Codispoti KE, Magge SN, Jaiswal JK, Packer RJ, Nazarian J. The emerging role of NG2 in pediatric diffuse intrinsic pontine glioma. Oncotarget. 2015 May 20;6(14):12141-55. doi: 10.18632/oncotarget.3716.
- Kambhampati M, Perez JP, Yadavilli S, Saratsis AM, Hill AD, Ho CY, Panditharatna E, Markel M, Packer RJ, Nazarian J. A standardized autopsy procurement allows for the comprehensive study of DIPG biology. Oncotarget. 2015 May 20;6(14):12740-7. doi: 10.18632/oncotarget.3374.
- Kambhampati M, Panditharatna E, Yadavilli S, Saoud K, Lee S, Eze A, Almira-Suarez MI, Hancock L, Bonner ER, Gittens J, Stampar M, Gaonkar K, Resnick AC, Kline C, Ho CY, Waanders AJ, Georgescu MM, Rance NE, Kim Y, Johnson C, Rood BR, Kilburn LB, Hwang EI, Mueller S, Packer RJ, Bornhorst M, Nazarian J. Harmonization of postmortem donations for pediatric brain tumors and molecular characterization of diffuse midline gliomas. Sci Rep. 2020 Jul 2;10(1):10954. doi: 10.1038/s41598-020-67764-2.
- Ballester LY, Wang Z, Shandilya S, Miettinen M, Burger PC, Eberhart CG, Rodriguez FJ, Raabe E, Nazarian J, Warren K, Quezado MM. Morphologic characteristics and immunohistochemical profile of diffuse intrinsic pontine gliomas. Am J Surg Pathol. 2013 Sep;37(9):1357-64. doi: 10.1097/PAS.0b013e318294e817.
- Saratsis AM, Yadavilli S, Magge S, Rood BR, Perez J, Hill DA, Hwang E, Kilburn L, Packer RJ, Nazarian J. Insights into pediatric diffuse intrinsic pontine glioma through proteomic analysis of cerebrospinal fluid. Neuro Oncol. 2012 May;14(5):547-60. doi: 10.1093/neuonc/nos067. Epub 2012 Apr 5.
- Ahsan S, Raabe EH, Haffner MC, Vaghasia A, Warren KE, Quezado M, Ballester LY, Nazarian J, Eberhart CG, Rodriguez FJ. Increased 5-hydroxymethylcytosine and decreased 5-methylcytosine are indicators of global epigenetic dysregulation in diffuse intrinsic pontine glioma. Acta Neuropathol Commun. 2014 Jun 3;2:59. doi: 10.1186/2051-5960-2-59.
- Buczkowicz P, Hoeman C, Rakopoulos P, Pajovic S, Letourneau L, Dzamba M, Morrison A, Lewis P, Bouffet E, Bartels U, Zuccaro J, Agnihotri S, Ryall S, Barszczyk M, Chornenkyy Y, Bourgey M, Bourque G, Montpetit A, Cordero F, Castelo-Branco P, Mangerel J, Tabori U, Ho KC, Huang A, Taylor KR, Mackay A, Bendel AE, Nazarian J, Fangusaro JR, Karajannis MA, Zagzag D, Foreman NK, Donson A, Hegert JV, Smith A, Chan J, Lafay-Cousin L, Dunn S, Hukin J, Dunham C, Scheinemann K, Michaud J, Zelcer S, Ramsay D, Cain J, Brennan C, Souweidane MM, Jones C, Allis CD, Brudno M, Becher O, Hawkins C. Genomic analysis of diffuse intrinsic pontine gliomas identifies three molecular subgroups and recurrent activating ACVR1 mutations. Nat Genet. 2014 May;46(5):451-6. doi: 10.1038/ng.2936. Epub 2014 Apr 6.
- Nikbakht H, Panditharatna E, Mikael LG, Li R, Gayden T, Osmond M, Ho CY, Kambhampati M, Hwang EI, Faury D, Siu A, Papillon-Cavanagh S, Bechet D, Ligon KL, Ellezam B, Ingram WJ, Stinson C, Moore AS, Warren KE, Karamchandani J, Packer RJ, Jabado N, Majewski J, Nazarian J. Spatial and temporal homogeneity of driver mutations in diffuse intrinsic pontine glioma. Nat Commun. 2016 Apr 6;7:11185. doi: 10.1038/ncomms11185.
- Saratsis AM, Kambhampati M, Snyder K, Yadavilli S, Devaney JM, Harmon B, Hall J, Raabe EH, An P, Weingart M, Rood BR, Magge SN, MacDonald TJ, Packer RJ, Nazarian J. Comparative multidimensional molecular analyses of pediatric diffuse intrinsic pontine glioma reveals distinct molecular subtypes. Acta Neuropathol. 2014;127(6):881-95. doi: 10.1007/s00401-013-1218-2. Epub 2013 Dec 3. Erratum In: Acta Neuropathol. 2020 Aug;140(2):247. doi: 10.1007/s00401-020-02162-6.
Przydatne linki
Daty zapisu na studia
Daty te śledzą postęp w przesyłaniu rekordów badań i podsumowań wyników do ClinicalTrials.gov. Zapisy badań i zgłoszone wyniki są przeglądane przez National Library of Medicine (NLM), aby upewnić się, że spełniają określone standardy kontroli jakości, zanim zostaną opublikowane na publicznej stronie internetowej.
Główne daty studiów
Rozpoczęcie studiów (Rzeczywisty)
1 kwietnia 2010
Zakończenie podstawowe (Szacowany)
1 kwietnia 2025
Ukończenie studiów (Szacowany)
1 kwietnia 2030
Daty rejestracji na studia
Pierwszy przesłany
19 kwietnia 2010
Pierwszy przesłany, który spełnia kryteria kontroli jakości
19 kwietnia 2010
Pierwszy wysłany (Szacowany)
20 kwietnia 2010
Aktualizacje rekordów badań
Ostatnia wysłana aktualizacja (Rzeczywisty)
20 sierpnia 2024
Ostatnia przesłana aktualizacja, która spełniała kryteria kontroli jakości
19 sierpnia 2024
Ostatnia weryfikacja
1 sierpnia 2024
Więcej informacji
Terminy związane z tym badaniem
Słowa kluczowe
Dodatkowe istotne warunki MeSH
- Choroby mózgu
- Choroby ośrodkowego układu nerwowego
- Choroby Układu Nerwowego
- Nowotwory według typu histologicznego
- Nowotwory
- Nowotwory według lokalizacji
- Nowotwory gruczołowe i nabłonkowe
- Nowotwory neuroepitelialne
- Nowotwory neuroektodermalne
- Nowotwory, komórki rozrodcze i embrionalne
- Nowotwory, tkanka nerwowa
- Nowotwory mózgu
- Nowotwory ośrodkowego układu nerwowego
- Nowotwory Układu Nerwowego
- Nowotwory pnia mózgu
- Nowotwory podnamiotowe
- Glejak
- Rozlany wewnętrzny glejak mostu
Inne numery identyfikacyjne badania
- DIPG-1
Te informacje zostały pobrane bezpośrednio ze strony internetowej clinicaltrials.gov bez żadnych zmian. Jeśli chcesz zmienić, usunąć lub zaktualizować dane swojego badania, skontaktuj się z register@clinicaltrials.gov. Gdy tylko zmiana zostanie wprowadzona na stronie clinicaltrials.gov, zostanie ona automatycznie zaktualizowana również na naszej stronie internetowej .