Molekulární biosenzory pro detekci rakoviny močového měchýře
1. dubna 2021 aktualizováno: University of California, Irvine
Elektrofágové a kolorimetrické aptamerové senzory pro klinický staging a monitorování rakoviny močového měchýře
Tento projekt se zaměřuje na vývoj specifických a citlivých detektorů signatur založených na biomarkerech spojených s diagnostikovaným a recidivujícím karcinomem močového měchýře.
Přehled studie
Postavení
Nábor
Podmínky
Detailní popis
Cílem tohoto výzkumu je objevit močové biomarkery, které se liší od rakoviny močového měchýře, a zároveň vyvinout molekulární senzory, které dokážou detekovat močové anomálie. Aplikací in vitro selekčních technik budou obě entity (objevování biomarkerů a vývoj senzorů) prováděny současně.
Všichni pacienti s diagnózou karcinomu močového měchýře podstupující transuretrální resekci tumoru močového měchýře (TURBT), pacienti pod dohledem pro karcinom močového měchýře a pacienti s mikroskopickou a viditelnou (hrubou) hematurií budou pozváni k účasti ve studii. Pacienti podstoupí standardní hodnocení péče, jak bylo popsáno dříve (zobrazení horních močových cest, cystoureteroskopie a vyšetření moči s analýzou moči, kultivace a cytologie).
Vzorky moči (10 ml) pro studii budou odebrány před počáteční cystoskopií a/nebo TURBT. Vzorek bude označen čárovým kódem a sledován softwarem UC Irvine Health. Kódování čárového kódu zajistí, že identita pacienta a jeho/její klinický výsledek nebudou k dispozici výzkumníkům pro zaslepenou studii.
Pacienti zapojení do této studie poskytnou svou moč pouze pro základní vědecký výzkum; nad rámec toho bude pacientům poskytována standardní péče. Pokud jde o odebranou moč, bude použita jako médium pro produkci fágů a aptamerů in vitro způsobem. Generované molekulární sondy budou použity k hodnocení a objasnění biomarkerů přítomných u jedinců s rakovinou močového měchýře.
100 pacientů, kteří jsou sledováni na rakovinu močového měchýře, bude experimentální skupinou pro testování přístupu elektrofágů a aptamerů ke sledování biomarkerů rakoviny močového měchýře. Navíc 100 pacientů léčených pro hematurii poskytne negativní kontrolu, která poskytne data z testování biomarkerů u pacientů léčených pro jiná onemocnění.
Typ studie
Pozorovací
Zápis (Očekávaný)
230
Kontakty a umístění
Tato část poskytuje kontaktní údaje pro ty, kteří studii provádějí, a informace o tom, kde se tato studie provádí.
Studijní kontakt
- Jméno: Victor B Huynh, BS
- Telefonní číslo: 714-456-8176
- E-mail: vbhuynh@uci.edu
Studijní místa
-
-
California
-
Orange, California, Spojené státy, 92840
- Nábor
- University of California Irvine
-
Kontakt:
- Victor Huynh, BS
- Telefonní číslo: 714-456-8176
- E-mail: vbhuynh@uci.edu
-
-
Kritéria účasti
Výzkumníci hledají lidi, kteří odpovídají určitému popisu, kterému se říká kritéria způsobilosti. Některé příklady těchto kritérií jsou celkový zdravotní stav osoby nebo předchozí léčba.
Kritéria způsobilosti
Věk způsobilý ke studiu
18 let a starší (Dospělý, Starší dospělý)
Přijímá zdravé dobrovolníky
Ne
Pohlaví způsobilá ke studiu
Všechno
Metoda odběru vzorků
Vzorek nepravděpodobnosti
Studijní populace
Účastníci budou rekrutováni na University of California, Irvine Medical Center Douglas Hospital.
Popis
Kritéria pro zařazení:
- Pacienti ve věku ≥ 18 let
- Pacienti s diagnostikovaným karcinomem močového měchýře, podstupující transuretrální resekci tumoru močového měchýře (TRUBT) nebo pod dohledem (do 2 let) pro recidivující karcinom močového měchýře
- Pacienti s mikroskopickou a makroskopickou hematurií
- Ochotný a schopný souhlasit
Kritéria vyloučení:
- Pacienti do 18 let
- Pacienti, kteří nejsou schopni dát souhlas se studií
- Pacienti s odklonem moči
- Pacienti, kteří nedávno podstoupili perkutánní nebo endoskopické procedury pro onemocnění horních cest, jako jsou kameny nebo jiné stavy
- Pacienti, kteří mají zavedeny ureterální stenty pro obstrukci horních močových cest
- Pacienti s nedávným traumatem v oblasti ledvin, močového měchýře nebo perinea, které může být příčinou hematurie
- Nezletilí budou z této studie vyloučeni, protože zavedení ureterálního stentu se obvykle provádí u dospělých pacientů. Nezletilí jsou navíc léčeni v nemocnici CHOC, nikoli v UCIMC.
- Ženy, které jsou těhotné, jsou z této studie vyloučeny, protože chirurgická léčba se u těhotných žen obvykle neprovádí. Bdělé čekání je preferovaným přístupem pro těhotné ženy. Kromě toho tento výzkum neprospívá přímo těhotné ženě nebo plodu a biomedicínské znalosti lze získat pomocí subjektů, které nejsou těhotné. Proto budou podle federálních předpisů z této studie vyloučeny těhotné ženy.
Studijní plán
Tato část poskytuje podrobnosti o studijním plánu, včetně toho, jak je studie navržena a co studie měří.
Jak je studie koncipována?
Detaily designu
Kohorty a intervence
Skupina / kohorta |
|---|
|
Diagnostikované novotvary močového měchýře
Pacienti, kteří jsou sledováni na rakovinu močového měchýře, budou experimentální skupinou pro testování přístupu elektrofágů a aptamerů ke sledování biomarkerů rakoviny močového měchýře
|
|
Novotvary jiného než močového měchýře
Pacienti léčení pro hematurii poskytnou negativní kontrolu, která poskytne data z testování biomarkerů u pacientů léčených na jiná onemocnění.
|
Co je měření studie?
Primární výstupní opatření
Měření výsledku |
Popis opatření |
Časové okno |
|---|---|---|
|
Močový "otisk prstu" pro novotvary močového měchýře
Časové okno: Čtyři roky
|
Bude syntetizována reprezentativní sekvence z každé třídy vybrané populace a základní vlastnosti pro každou aptamerovou sekvenci, jako je disociační konstanta, spínací výkon, citlivost, selektivita a rozsah detekce, budou měřeny pomocí Försterova systému přenosu rezonanční energie (FRET).
|
Čtyři roky
|
Spolupracovníci a vyšetřovatelé
Zde najdete lidi a organizace zapojené do této studie.
Sponzor
Vyšetřovatelé
- Vrchní vyšetřovatel: Jaime Landman, MD, UC Irvine
Publikace a užitečné odkazy
Osoba odpovědná za zadávání informací o studiu tyto publikace poskytuje dobrovolně. Mohou se týkat čehokoli, co souvisí se studiem.
Obecné publikace
- Hanahan D, Weinberg RA. The hallmarks of cancer. Cell. 2000 Jan 7;100(1):57-70. doi: 10.1016/s0092-8674(00)81683-9. No abstract available.
- Kay, B. K. (1996) Table 15. M13 Stability and Instability, In Phage Display of Peptides and Proteins: A Laboratory Manual (Kay, B. K., Winter, J., McCafferty, J., Ed.), p 337, Academic Press, San Diego.
- Mohan K, Donavan KC, Arter JA, Penner RM, Weiss GA. Sub-nanomolar detection of prostate-specific membrane antigen in synthetic urine by synergistic, dual-ligand phage. J Am Chem Soc. 2013 May 22;135(20):7761-7. doi: 10.1021/ja4028082. Epub 2013 May 13.
- Arter JA, Diaz JE, Donavan KC, Yuan T, Penner RM, Weiss GA. Virus-polymer hybrid nanowires tailored to detect prostate-specific membrane antigen. Anal Chem. 2012 Mar 20;84(6):2776-83. doi: 10.1021/ac203143y. Epub 2012 Mar 7.
- Arter JA, Taggart DK, McIntire TM, Penner RM, Weiss GA. Virus-PEDOT nanowires for biosensing. Nano Lett. 2010 Dec 8;10(12):4858-62. doi: 10.1021/nl1025826. Epub 2010 Nov 1.
- Diaz JE, Yang LM, Lamboy JA, Penner RM, Weiss GA. Synthesis of a virus electrode for measurement of prostate specific membrane antigen. Methods Mol Biol. 2009;504:255-74. doi: 10.1007/978-1-60327-569-9_16.
- Donavan KC, Arter JA, Weiss GA, Penner RM. Virus-poly(3,4-ethylenedioxythiophene) biocomposite films. Langmuir. 2012 Aug 28;28(34):12581-7. doi: 10.1021/la302473j. Epub 2012 Aug 16.
- Weiss GA, Penner RM. The Promise of Phage Display: Customized Affinity and Specificity. Anal Chem. 2008 May 1;80(9):3082-3089. doi: 10.1021/ac086009h. No abstract available.
- Yang LM, Diaz JE, McIntire TM, Weiss GA, Penner RM. Direct electrical transduction of antibody binding to a covalent virus layer using electrochemical impedance. Anal Chem. 2008 Aug 1;80(15):5695-705. doi: 10.1021/ac8008109. Epub 2008 Jul 1.
- Yang LM, Tam PY, Murray BJ, McIntire TM, Overstreet CM, Weiss GA, Penner RM. Virus electrodes for universal biodetection. Anal Chem. 2006 May 15;78(10):3265-70. doi: 10.1021/ac052287u.
- Wallace TJ, Torre T, Grob M, Yu J, Avital I, Brucher B, Stojadinovic A, Man YG. Current approaches, challenges and future directions for monitoring treatment response in prostate cancer. J Cancer. 2014 Jan 1;5(1):3-24. doi: 10.7150/jca.7709.
- Romero Otero J, Garcia Gomez B, Campos Juanatey F, Touijer KA. Prostate cancer biomarkers: an update. Urol Oncol. 2014 Apr;32(3):252-60. doi: 10.1016/j.urolonc.2013.09.017. Epub 2014 Feb 1.
- Guan W, Duan X, Reed MA. Highly specific and sensitive non-enzymatic determination of uric acid in serum and urine by extended gate field effect transistor sensors. Biosens Bioelectron. 2014 Jan 15;51:225-31. doi: 10.1016/j.bios.2013.07.061. Epub 2013 Aug 7.
- Yang LM, Diaz JE, McIntire TM, Weiss GA, Penner RM. Covalent virus layer for mass-based biosensing. Anal Chem. 2008 Feb 15;80(4):933-43. doi: 10.1021/ac071470f. Epub 2008 Jan 17.
- Brigati JR, Petrenko VA. Thermostability of landscape phage probes. Anal Bioanal Chem. 2005 Jul;382(6):1346-50. doi: 10.1007/s00216-005-3289-y. Epub 2005 Jun 18.
- Nanduri V, Sorokulova IB, Samoylov AM, Simonian AL, Petrenko VA, Vodyanoy V. Phage as a molecular recognition element in biosensors immobilized by physical adsorption. Biosens Bioelectron. 2007 Jan 15;22(6):986-92. doi: 10.1016/j.bios.2006.03.025. Epub 2006 May 30.
- Zavada J, Zavadova Z, Zat'ovicova M, Hyrsl L, Kawaciuk I. Soluble form of carbonic anhydrase IX (CA IX) in the serum and urine of renal carcinoma patients. Br J Cancer. 2003 Sep 15;89(6):1067-71. doi: 10.1038/sj.bjc.6601264.
- Huang S, Rhee E, Patel H, Park E, Kaswick J. Urinary NMP22 and renal cell carcinoma. Urology. 2000 Feb;55(2):227-30. doi: 10.1016/s0090-4295(99)00401-x.
- Kaya K, Ayan S, Gokce G, Kilicarslan H, Yildiz E, Gultekin EY. Urinary nuclear matrix protein 22 for diagnosis of renal cell carcinoma. Scand J Urol Nephrol. 2005;39(1):25-9. doi: 10.1080/00365590410002500.
- Myers-Irvin JM, Landsittel D, Getzenberg RH. Use of the novel marker BLCA-1 for the detection of bladder cancer. J Urol. 2005 Jul;174(1):64-8. doi: 10.1097/01.ju.0000162022.36772.a4.
- van Rhijn BW, van der Poel HG, van der Kwast TH. Urine markers for bladder cancer surveillance: a systematic review. Eur Urol. 2005 Jun;47(6):736-48. doi: 10.1016/j.eururo.2005.03.014. Epub 2005 Mar 23.
- Majumdar S, Hajduczki A, Mendez AS, Weiss GA. Phage display of functional, full-length human and viral membrane proteins. Bioorg Med Chem Lett. 2008 Nov 15;18(22):5937-40. doi: 10.1016/j.bmcl.2008.07.051. Epub 2008 Jul 17.
- Levin AM, Weiss GA. Optimizing the affinity and specificity of proteins with molecular display. Mol Biosyst. 2006 Jan;2(1):49-57. doi: 10.1039/b511782h. Epub 2005 Nov 8.
- Davis MI, Bennett MJ, Thomas LM, Bjorkman PJ. Crystal structure of prostate-specific membrane antigen, a tumor marker and peptidase. Proc Natl Acad Sci U S A. 2005 Apr 26;102(17):5981-6. doi: 10.1073/pnas.0502101102. Epub 2005 Apr 18.
- Hajduczki A, Majumdar S, Fricke M, Brown IA, Weiss GA. Solubilization of a membrane protein by combinatorial supercharging. ACS Chem Biol. 2011 Apr 15;6(4):301-7. doi: 10.1021/cb1001729. Epub 2011 Jan 14.
- Lunder, M., Bratkovic, T., Anderluh, G., Strukelj, B., and Kreft, S. (2008) Affinity ranking of phage-displayed peptides: Enzyme-linked immunosorbent assay versus surface plasmon resonance, Acta Chimica Slovenica 55, 233-235.
- Murase K, Morrison KL, Tam PY, Stafford RL, Jurnak F, Weiss GA. EF-Tu binding peptides identified, dissected, and affinity optimized by phage display. Chem Biol. 2003 Feb;10(2):161-8. doi: 10.1016/s1074-5521(03)00025-5.
- Weiss GA, Watanabe CK, Zhong A, Goddard A, Sidhu SS. Rapid mapping of protein functional epitopes by combinatorial alanine scanning. Proc Natl Acad Sci U S A. 2000 Aug 1;97(16):8950-4. doi: 10.1073/pnas.160252097.
- Avrantinis SK, Stafford RL, Tian X, Weiss GA. Dissecting the streptavidin-biotin interaction by phage-displayed shotgun scanning. Chembiochem. 2002 Dec 2;3(12):1229-34. doi: 10.1002/1439-7633(20021202)3:123.0.CO;2-X.
- Mohan K, Weiss GA. Dual genetically encoded phage-displayed ligands. Anal Biochem. 2014 May 15;453:1-3. doi: 10.1016/j.ab.2014.02.025. Epub 2014 Mar 4.
- Levin AM, Murase K, Jackson PJ, Flinspach ML, Poulos TL, Weiss GA. Double barrel shotgun scanning of the caveolin-1 scaffolding domain. ACS Chem Biol. 2007 Jul 20;2(7):493-500. doi: 10.1021/cb700055t. Epub 2007 Jun 29.
- Levin AM, Coroneus JG, Cocco MJ, Weiss GA. Exploring the interaction between the protein kinase A catalytic subunit and caveolin-1 scaffolding domain with shotgun scanning, oligomer complementation, NMR, and docking. Protein Sci. 2006 Mar;15(3):478-86. doi: 10.1110/ps.051911706. Epub 2006 Feb 1.
- Nutiu R, Li Y. In vitro selection of structure-switching signaling aptamers. Angew Chem Int Ed Engl. 2005 Feb 4;44(7):1061-1065. doi: 10.1002/anie.200461848. No abstract available.
- Oh SS, Plakos K, Lou X, Xiao Y, Soh HT. In vitro selection of structure-switching, self-reporting aptamers. Proc Natl Acad Sci U S A. 2010 Aug 10;107(32):14053-8. doi: 10.1073/pnas.1009172107. Epub 2010 Jul 26.
- Tuerk C, Gold L. Systematic evolution of ligands by exponential enrichment: RNA ligands to bacteriophage T4 DNA polymerase. Science. 1990 Aug 3;249(4968):505-10. doi: 10.1126/science.2200121.
- Ellington AD, Szostak JW. In vitro selection of RNA molecules that bind specific ligands. Nature. 1990 Aug 30;346(6287):818-22. doi: 10.1038/346818a0.
- Liu J, Cao Z, Lu Y. Functional nucleic acid sensors. Chem Rev. 2009 May;109(5):1948-98. doi: 10.1021/cr030183i. No abstract available.
- Zhao W, Ali MM, Aguirre SD, Brook MA, Li Y. Paper-based bioassays using gold nanoparticle colorimetric probes. Anal Chem. 2008 Nov 15;80(22):8431-7. doi: 10.1021/ac801008q. Epub 2008 Oct 11.
- Wood JB, Szyndler MW, Halpern AR, Cho K, Corn RM. Fabrication of DNA microarrays on polydopamine-modified gold thin films for SPR imaging measurements. Langmuir. 2013 Aug 27;29(34):10868-73. doi: 10.1021/la402425n. Epub 2013 Aug 15.
- Toma M, Loget G, Corn RM. Flexible Teflon nanocone array surfaces with tunable superhydrophobicity for self-cleaning and aqueous droplet patterning. ACS Appl Mater Interfaces. 2014 Jul 23;6(14):11110-7. doi: 10.1021/am500735v. Epub 2014 Apr 1.
Termíny studijních záznamů
Tato data sledují průběh záznamů studie a předkládání souhrnných výsledků na ClinicalTrials.gov. Záznamy ze studií a hlášené výsledky jsou před zveřejněním na veřejné webové stránce přezkoumány Národní lékařskou knihovnou (NLM), aby se ujistily, že splňují specifické standardy kontroly kvality.
Hlavní termíny studia
Začátek studia (Aktuální)
11. června 2015
Primární dokončení (Očekávaný)
1. dubna 2022
Dokončení studie (Očekávaný)
1. dubna 2022
Termíny zápisu do studia
První předloženo
10. června 2015
První předloženo, které splnilo kritéria kontroly kvality
3. listopadu 2016
První zveřejněno (Odhad)
6. listopadu 2016
Aktualizace studijních záznamů
Poslední zveřejněná aktualizace (Aktuální)
2. dubna 2021
Odeslaná poslední aktualizace, která splnila kritéria kontroly kvality
1. dubna 2021
Naposledy ověřeno
1. dubna 2021
Více informací
Termíny související s touto studií
Další relevantní podmínky MeSH
Další identifikační čísla studie
- HS#2014-1758
Tyto informace byly beze změn načteny přímo z webu clinicaltrials.gov. Máte-li jakékoli požadavky na změnu, odstranění nebo aktualizaci podrobností studie, kontaktujte prosím register@clinicaltrials.gov. Jakmile bude změna implementována na clinicaltrials.gov, bude automaticky aktualizována i na našem webu .