Studium detekce fekálních bakterií v časném screeningu a diagnostice GC

Provedli jsme rozsáhlou multicentrickou retrospektivní studii případ-kontrola. Přibližně celkem 1080 dobrovolníků ve věku 40-75 let ve třech nezávislých kohortách, objevové kohortě, validační kohortě 1, validační kohortě 2, bude rekrutováno z 10 nemocnic po celé Číně. Mezi nimi bylo 530 subjektů v kohortě objevů i validační kohortě 1 ze Shanghai Jiao Tong University School of Medicine Renji Hospital od srpna do prosince 2018. Přibližně 550 účastníků bude zařazeno do validační kohorty 2 z devíti nemocnic v Číně. Každá kohorta rekrutuje jak pacienty s diagnózou GC (skupina GC), tak jedince s diagnostikovanou GC (skupina GC) podle pohlaví, věku a indexu tělesné hmotnosti (BMI) se zdravou kontrolou (HC). chronická gastritida histopatologicky). Zařazení jedinci byli buď asymptomatičtí, kteří podstupovali screening horní části GI endoskopie, nebo šli na GI kliniku s trávicími příznaky. Subjektům ve skupině HC se provádí kolonoskopie během 0,5 roku před nebo po horní endoskopii. Sbíráme biopsie žaludeční tkáně a vzorky stolice od pacientů s rakovinou žaludku a zdravých kontrol. Nejprve v kohortě objevů, která přijme 20 subjektů, bude odebráno 13 párů rakovinných i nerakovinných žaludečních tkání a předoperační výkaly ve skupině GC. 7 subjektů poskytuje své párové slizniční biopsie a stolice ve skupině HC před vyšetřením. Sekvenování genu 16S ribozomální RNA bude použito k selekci synergicky odlišných druhů bakterií a také ke zjištění rozdílu ve složení a diverzity mikrobů ze vzorků tkání a stolice mezi GC a HC skupinou. Za druhé, validační kohorta 1 zahrnující celkem 510 subjektů (294 pacientů s GC a 216 jedinců s HC), 217 předoperačních vzorků stolice a 141 čerstvých tkání (rakovinné a nerakovinné tkáně) ze skupiny GC a 127 vzorků stolice a 124 biopsií žaludku budou shromažďovány. Kvantitativní PCR (qPCR) bude použita k ověření výsledků vysoce výkonného sekvenování v kohortě objevů v jediném centru. Mezi nimi 35 objektů ve skupině HC a 64 pacientů ve skupině GC poskytne své spárované tkáně a výkaly. Za třetí, do ověřovací kohorty 2 zapíšeme dobrovolníky z různých geografických oblastí, abychom potvrdili naše výsledky. Bude odebráno 550 vzorků stolice pro další ověření přesnosti, citlivosti a specifičnosti hraniční hodnoty analyzované z validační kohorty 1. Všechny výsledky laboratorních testů včetně nádorových markerů CEA, CA199, CA724 byly získány z elektronického dotazovacího systému. Stádia GC budou hodnocena systémem TNM podle AJCC verze 4.2017 na základě chirurgických záznamů, histopatologie a rentgenových snímků (např. PET-CT, abdominální zesílené CT). Všechny subjekty podepíší formulář informovaného souhlasu před odběrem vzorků. Protokol této studie byl schválen komisí pro etické hodnocení všech zúčastněných nemocnic.