FMT pro dekolonizaci Enterobacteriaceae rezistentních na karbapenem (FMT-CRE)

Míra antimikrobiální rezistence celosvětově roste. Přibývá důkazů, že fyziologická střevní mikroflóra je velkým rezervoárem genů rezistence vůči antibiotikům. Je známo, že zdravá střevní mikroflóra zabraňuje kolonizaci gastrointestinálního traktu patogeny, tzv. mechanismu kolonizační rezistence, ale tento ochranný mechanismus lze změnit terapiemi, které narušují střevní mikroflóru, včetně antibiotik nebo chemoterapeutik, s následnou kolonizací střevních patogenů. včetně multirezistentních bakterií (MDRB). Nositelé MDRB představují epidemiologickou hrozbu pro ostatní hospitalizované pacienty a pro celou komunitu, ale jsou také ohroženi rozvojem klinických důsledků této kolonizace, včetně infekcí krevního řečiště těmito patogeny. Transplantace fekální mikroflóry (FMT) prokázala vysokou účinnost při eradikaci rekurentní infekce C. difficile a první důkazy naznačují, že tento postup by mohl být užitečný také při eradikaci MDRB, zejména Enterobacteriaceae rezistentních na karbapenem.

Současné důkazy se však většinou omezují na kazuistiky a série případů a na jedinou randomizovanou studii, která byla předčasně zastavena a nepřinesla jasný závěr. V systematickém přehledu 21 studií a 192 pacientů se míra eradikace pohybovala od 0 % do 100 % a autoři došli k závěru, že k dalšímu prozkoumání této terapie jsou zapotřebí větší, dobře navržené randomizované kontrolované studie.

Rozšířené cíle této studie jsou:

• Porovnat účinnost dárcovského FMT a placeba FMT při eradikaci střevní kolonizace z CRE
• Porovnat účinnost dárcovského FMT a placeba FMT v prevenci klinických projevů kolonizace střev z CRE
• Prozkoumat změny ve střevním mikrobiomu po léčbě

Vyšetřovatelé provedou v jednom centru placebem kontrolovanou, dvojitě zaslepenou randomizovanou klinickou studii dárce FMT vs. placebo FMT u přenašečů CRE Pacienti budou rekrutováni z těch, kteří budou odesláni do infekční ambulance Fondazione Policlinico Universitario „A. Gemelli". Do této studie budou zahrnuti pacienti se všemi zařazovacími kritérii a žádným vylučovacím kritériem (podrobně v konkrétní části této webové stránky).

Před randomizací shromáždí personál zabývající se infekčním onemocněním demografická data. Kromě toho budou pacienti opakovat rektální výtěr a kultivaci stolice.

Kromě toho budou pacienti požádáni, aby poskytli vzorky stolice, které budou odebrány do sterilní, uzavřené nádoby a uskladněny při -80 °C pro metagenomické hodnocení střevního mikrobiomu a meta-transkriptomové hodnocení mikrobiologickým personálem.

Po základním hodnocení budou pacienti náhodně rozděleni do jednoho z následujících léčebných ramen:

• Dárce FMT (D-FMT)
• Placebo FMT (P-FMT)

Pacienti v obou skupinách podstoupí jeden FMT výkon kolonoskopií. Každý pacient ve skupině dárců FMT dostane stolici od jednoho dárce. Placebo FMT bude vyrobeno z 250 ml vody. Výběr dárců stolice bude prováděn gastroenterologickým personálem podle protokolů dříve doporučených mezinárodními směrnicemi a podle nového doporučení uloženého reorganizací transplantace fekální mikroflóry během pandemie COVID-19 (Ianiro et al. - Gut 2020) Zadání fekální infuze od zdravých dárců pacientům budou prováděny náhodně, bez jakékoli specifické shody mezi příjemcem a dárcem, protože to mezinárodní směrnice nedoporučují. Všechny fekální infuze budou vyráběny na mikrobiologické jednotce naší nemocnice. Použijí se pouze zmrazené výkaly. Příprava zmrazené stolice se bude řídit protokoly z mezinárodních směrnic.

Následné návštěvy budou provádět lékaři z gastroenterologie a infekčního oddělení. Všichni pacienti budou sledováni po dobu 3 měsíců po ukončení léčby. Následné návštěvy budou naplánovány na 1. týden, 2. týden, 4. týden a 12. týden po ukončení léčby. Při každé návštěvě budou provedena následující hodnocení: 1) rektální výtěr na MDRB; 2) odběr vzorků stolice pro kultivaci stolice; 3) odběr vzorků stolice pro analýzu mikrobiomu; 4) záznam nežádoucích událostí. Na žádost pacientů budou nabídnuty neplánované následné návštěvy.

Výsledky studie jsou podrobně uvedeny ve zvláštní části tohoto webu.

Statistická analýza bude provedena jak na základě záměru léčby, tak na základě protokolu. Rozdíly mezi skupinami budou hodnoceny dvoustranným Wilcoxonovým testem součtu pro spojitá data a Fisherovým přesným pravděpodobnostním testem (s použitím dvoustranných P-hodnot) pro kategorická data. Rozdíly v procentech vytvrzení budou stanoveny pomocí Fisherova exaktního testu (s dvoustrannými hodnotami P). Pro analýzu mikrobiomů budou statistické rozdíly mezi průměry skupin vypočteny pomocí dvoustranného Wilcoxon-Rank Sum Testu prostřednictvím statistického softwarového balíku R (R Core Team, Vídeň, Rakousko).