FMT для деколонизации устойчивых к карбапенемам энтеробактерий (FMT-CRE)

Показатели устойчивости к противомикробным препаратам растут во всем мире. Появляется все больше доказательств того, что физиологическая микробиота кишечника является большим резервуаром генов устойчивости к антибиотикам. Известно, что здоровая кишечная микробиота предотвращает колонизацию желудочно-кишечного тракта патогенами, так называемый механизм резистентности к колонизации, но этот защитный механизм может быть изменен с помощью терапий, нарушающих кишечную микробиоту, включая антибиотики или химиотерапевтические препараты, с последующей колонизацией кишечных патогенов. , включая бактерии с множественной лекарственной устойчивостью (MDRB). Носители MDRB представляют эпидемиологическую угрозу для других госпитализированных пациентов и всего сообщества, но также подвержены риску развития клинических последствий этой колонизации, включая инфицирование кровотока этими патогенами. Трансплантация фекальной микробиоты (ТФМ) показала высокую эффективность в эрадикации рецидивирующей инфекции C. difficile, и первоначальные данные свидетельствуют о том, что эта процедура может быть полезна также для эрадикации MDRB, в основном резистентных к карбапенемам Enterobacteriaceae.

Однако текущие доказательства в основном ограничиваются сообщениями о случаях и сериями случаев, а также одним рандомизированным исследованием, которое было остановлено досрочно и не сделало четких выводов. В систематическом обзоре 21 исследования и 192 пациентов показатели эрадикации варьировались от 0% до 100%, и авторы пришли к выводу, что для дальнейшего изучения этой терапии необходимы более крупные, хорошо спланированные рандомизированные контролируемые испытания.

Расширенными целями данного исследования являются:

• Сравнить эффективность FMT донора и плацебо FMT в устранении колонизации кишечника CRE.
• Сравнить эффективность ТФМ донора и плацебо в предотвращении клинических проявлений кишечной колонизации CRE.
• Изучить изменения микробиома кишечника после лечения.

Исследователи проведут одноцентровое плацебо-контролируемое двойное слепое рандомизированное клиническое исследование ТФМ доноров и плацебо ТФМ у носителей CRE. Джемелли». Пациенты со всеми критериями включения и ни с одним из критериев исключения (подробно описанные в соответствующем разделе этого веб-сайта) будут рассматриваться для участия в этом исследовании.

Перед рандомизацией сотрудники инфекционного отделения будут собирать демографические данные. Кроме того, пациенты будут повторять ректальный мазок и посев кала.

Кроме того, пациентам будет предложено сдать образцы стула, которые будут собраны в стерильный герметичный контейнер и храниться при температуре -80 ° C для метагеномной оценки кишечного микробиома и оценки мета-транскриптома персоналом-микробиологом.

После исходных оценок пациенты будут случайным образом распределены в одну из следующих групп лечения:

• Донор FMT (D-FMT)
• Плацебо FMT (P-FMT)

Пациенты в обеих группах будут проходить одну процедуру FMT с помощью колоноскопии. Каждый пациент в донорской группе ТФМ получит фекалии от одного донора. Плацебо FMT будет состоять из 250 мл воды. Отбор доноров стула будет осуществляться гастроэнтерологическим персоналом в соответствии с протоколами, ранее рекомендованными международными руководствами, и в соответствии с новыми рекомендациями, налагаемыми реорганизацией трансплантации фекальной микробиоты во время пандемии COVID-19 (Ianiro et al. - Gut 2020). фекальные инфузии от здоровых доноров к пациентам будут проводиться случайным образом, без какого-либо конкретного соответствия реципиента и донора, поскольку это не рекомендуется международными рекомендациями. Все фекальные инфузии будут производиться в микробиологическом отделении нашей больницы. Будут использоваться только замороженные фекалии. Подготовка замороженных фекалий будет соответствовать протоколам международных руководств.

Последующие визиты будут проводить врачи гастроэнтерологического и инфекционного отделения. Все пациенты будут находиться под наблюдением в течение 3 месяцев после окончания лечения. Последующие посещения будут запланированы на 1-й, 2-й, 4-й и 12-й неделе после окончания лечения соответственно. При каждом посещении будут проводиться следующие оценки: 1) ректальный мазок на MDRB; 2) сбор образцов стула для посева; 3) сбор образцов стула для анализа микробиома; 4) запись нежелательных явлений. По желанию пациентов будут предложены внеплановые повторные визиты.

Результаты исследования подробно описаны в соответствующем разделе этого веб-сайта.

Статистический анализ будет проводиться как на основе намерения лечить, так и на основе протокола. Различия между группами будут оцениваться с помощью двустороннего критерия суммы рангов Уилкоксона для непрерывных данных и критерия точной вероятности Фишера (с использованием двусторонних P-значений) для категориальных данных. Различия в процентах излечения будут определяться с помощью точного критерия Фишера (с двусторонними значениями P). Для анализа микробиома статистические различия между средними группами будут рассчитываться с использованием двустороннего критерия суммы рангов Уилкоксона с помощью пакета статистического программного обеспечения R (R Core Team, Вена, Австрия).