FMT do dekolonizacji Enterobacteriaceae opornych na karbapenemy (FMT-CRE)

Wskaźniki oporności na środki przeciwdrobnoustrojowe rosną na całym świecie. Istnieje coraz więcej dowodów na to, że fizjologiczna mikroflora jelitowa jest dużym rezerwuarem genów oporności na antybiotyki. Wiadomo, że zdrowa mikroflora jelitowa zapobiega kolonizacji przewodu pokarmowego przez patogeny, co jest tak zwanym mechanizmem oporności na kolonizację, ale ten mechanizm ochronny można zmienić za pomocą terapii, które osłabiają mikroflorę jelitową, w tym antybiotyków lub chemioterapeutyków, co w konsekwencji prowadzi do kolonizacji patogenów jelitowych , w tym bakterii wielolekoopornych (MDRB). Nosiciele MDRB stanowią zagrożenie epidemiologiczne dla innych hospitalizowanych pacjentów i całej społeczności, ale są również narażeni na rozwój klinicznych konsekwencji tej kolonizacji, w tym zakażenia krwi tymi patogenami. Przeszczep mikroflory kałowej (FMT) wykazał wysoką skuteczność w eradykacji nawracających infekcji C. difficile, a wstępne dowody sugerują, że ta procedura może być użyteczna w eradykacji również MDRB, głównie Enterobacteriaceae opornych na karbapenemy.

Jednak obecne dowody ograniczają się głównie do opisów przypadków i serii przypadków oraz do pojedynczego badania z randomizacją, które zostało wcześnie przerwane i nie dało jasnych wniosków. W systematycznym przeglądzie 21 badań i 192 pacjentów wskaźniki eradykacji wahały się od 0% do 100%, a autorzy doszli do wniosku, że potrzebne są większe, dobrze zaprojektowane badania z randomizacją w celu dalszego zbadania tej terapii.

Rozszerzone cele tego badania to:

• Porównanie skuteczności dawcy FMT i placebo FMT w zwalczaniu kolonizacji jelita przez CRE
• Porównanie skuteczności dawcy FMT i placebo FMT w zapobieganiu objawom klinicznym kolonizacji jelita przez CRE
• Aby zbadać zmiany w mikrobiomie jelitowym po leczeniu

Badacze przeprowadzą jednoośrodkowe, kontrolowane placebo, podwójnie ślepe, randomizowane badanie kliniczne dawcy FMT w porównaniu z placebo FMT u nosicieli CRE. Gemelli”. Pacjenci spełniający wszystkie kryteria włączenia i żadne z kryteriów wykluczenia (wyszczególnione w odpowiedniej części tej witryny internetowej) będą brani pod uwagę w tym badaniu.

Przed randomizacją dane demograficzne zostaną zebrane przez personel ds. chorób zakaźnych. Ponadto pacjenci będą powtarzać wymaz z odbytu i posiew kału.

Dodatkowo pacjenci zostaną poproszeni o oddanie próbek kału, które zostaną pobrane do sterylnego, szczelnego pojemnika i przechowywane w temperaturze -80°C w celu oceny metagenomicznej mikrobiomu jelitowego i oceny metatranskryptomu przez personel mikrobiologiczny.

Po ocenie wyjściowej pacjenci zostaną losowo przydzieleni do jednej z następujących grup leczenia:

• Dawca FMT (D-FMT)
• Placebo FMT (P-FMT)

Pacjenci w obu grupach będą poddani pojedynczemu zabiegowi FMT poprzez kolonoskopię. Każdy pacjent z grupy dawcy FMT otrzyma kał od jednego dawcy. Placebo FMT zostanie sporządzone z 250 ml wody. Selekcja dawców kału zostanie przeprowadzona przez personel gastroenterologii zgodnie z protokołami zalecanymi wcześniej przez międzynarodowe wytyczne oraz zgodnie z nową rekomendacją narzuconą przez reorganizację transplantacji mikrobioty kałowej podczas pandemii COVID-19 (Ianiro i wsp. - Gut 2020). infuzje kałowe od zdrowych dawców pacjentom będą wykonywane losowo, bez żadnego konkretnego dopasowania biorca-dawca, ponieważ nie jest to zalecane przez międzynarodowe wytyczne. Wszystkie infuzje kałowe będą produkowane na oddziale mikrobiologii naszego szpitala. Używane będą tylko zamrożone odchody. Przygotowanie zamrożonych odchodów będzie zgodne z protokołami z międzynarodowych wytycznych.

Wizyty kontrolne będą przeprowadzane przez lekarzy z oddziału gastroenterologii i oddziału zakaźnego. Wszyscy pacjenci będą objęci obserwacją przez 3 miesiące po zakończeniu kuracji. Wizyty kontrolne zaplanowano odpowiednio w 1., 2., 4. i 12. tygodniu po zakończeniu leczenia. Podczas każdej wizyty przeprowadzane będą następujące oceny: 1) wymaz z odbytu w kierunku MDRB; 2) pobranie próbek kału do posiewu kału; 3) pobranie próbek kału do analizy mikrobiomu; 4) zapis zdarzeń niepożądanych. Nieplanowane wizyty kontrolne będą oferowane na życzenie pacjentów.

Wyniki badania są szczegółowo opisane w odpowiedniej sekcji tej witryny.

Analiza statystyczna zostanie przeprowadzona zarówno na podstawie zamiaru leczenia, jak i na podstawie protokołu. Różnice między grupami zostaną ocenione za pomocą dwustronnego testu sumy rang Wilcoxona dla danych ciągłych oraz dokładnego testu prawdopodobieństwa Fishera (przy użyciu dwustronnych wartości P) dla danych kategorycznych. Różnice w procentach wyleczenia zostaną określone dokładnym testem Fishera (z dwustronnymi wartościami P). W przypadku analizy mikrobiomu różnice statystyczne między średnimi grup zostaną obliczone przy użyciu dwustronnego testu Wilcoxona-Rank Sum, za pomocą pakietu oprogramowania statystycznego R (R Core Team, Wiedeń, Austria).