FMT per la decolonizzazione di Enterobacteriaceae resistenti ai carbapenemi (FMT-CRE)

I tassi di resistenza antimicrobica stanno aumentando in tutto il mondo. Vi sono prove crescenti che il microbiota intestinale fisiologico sia un grande serbatoio di geni di resistenza agli antibiotici. È noto che il microbiota intestinale sano impedisce la colonizzazione del tratto gastrointestinale da parte di agenti patogeni, il cosiddetto meccanismo di resistenza alla colonizzazione, ma questo meccanismo protettivo può essere alterato da terapie che compromettono il microbiota intestinale, inclusi antibiotici o chemioterapici, con conseguente colonizzazione di patogeni intestinali , compresi i batteri multifarmacoresistenti (MDRB). I portatori di MDRB rappresentano una minaccia epidemiologica per altri pazienti ospedalizzati e per l'intera comunità, ma sono anche a rischio di sviluppare conseguenze cliniche di questa colonizzazione, comprese le infezioni del flusso sanguigno da questi agenti patogeni. Il trapianto di microbiota fecale (FMT) ha dimostrato un'elevata efficacia nell'eradicazione dell'infezione ricorrente da C. difficile e le prime prove suggeriscono che questa procedura potrebbe essere utile nell'eradicare anche MDRB, principalmente Enterobacteriaceae resistenti ai carbapenemi.

Tuttavia, le prove attuali sono per lo più limitate a casi clinici e serie di casi e a un singolo studio randomizzato, che è stato interrotto in anticipo e non ha tratto conclusioni chiare. In una revisione sistematica di 21 studi e 192 pazienti, i tassi di eradicazione variavano dallo 0% al 100% e gli autori hanno concluso che sono necessari studi controllati randomizzati più ampi e ben progettati per esplorare ulteriormente questa terapia.

Gli obiettivi estesi di questo studio sono:

• Confrontare l'efficacia dell'FMT del donatore e dell'FMT del placebo nell'eradicare la colonizzazione intestinale da CRE
• Confrontare l'efficacia dell'FMT del donatore e dell'FMT del placebo nella prevenzione delle manifestazioni cliniche della colonizzazione intestinale da CRE
• Studiare i cambiamenti nel microbioma intestinale dopo i trattamenti

I ricercatori condurranno uno studio clinico monocentrico controllato con placebo, randomizzato in doppio cieco di FMT da donatore vs FMT con placebo in portatori di CRE I pazienti saranno reclutati tra quelli riferiti all'ambulatorio di malattie infettive della Fondazione Policlinico Universitario "A. Gemelli". I pazienti con tutti i criteri di inclusione e nessuno dei criteri di esclusione (dettagliati nella sezione specifica di questo sito Web) saranno presi in considerazione per questo studio.

Prima della randomizzazione, i dati demografici saranno raccolti dal personale delle malattie infettive. Inoltre, i pazienti ripeteranno il tampone rettale e la coltura delle feci.

Inoltre, ai pazienti verrà richiesto di fornire campioni di feci da raccogliere in un contenitore sterile e sigillato e conservato a -80 ° C per la valutazione metagenomica del microbioma intestinale e la valutazione del meta-trascrittoma da parte del personale di microbiologia.

Dopo le valutazioni di base, i pazienti verranno assegnati in modo casuale a uno dei seguenti bracci di trattamento:

• Donatore FMT (D-FMT)
• Placebo FMT (P-FMT)

I pazienti di entrambi i gruppi saranno sottoposti a una singola procedura FMT mediante colonscopia. Ogni paziente nel gruppo FMT del donatore riceverà le feci da un singolo donatore. Placebo FMT sarà composto da 250 ml di acqua. La selezione dei donatori di feci sarà effettuata dal personale di gastroenterologia seguendo i protocolli precedentemente raccomandati dalle linee guida internazionali e secondo la nuova raccomandazione imposta dalla riorganizzazione del trapianto di microbiota fecale durante la pandemia di COVID-19 (Ianiro et al. - Gut 2020) L'assegnazione di gli infusi fecali da donatori sani ai pazienti saranno eseguiti in modo casuale, senza alcuna specifica corrispondenza ricevente-donatore, poiché ciò non è raccomandato dalle linee guida internazionali. Tutti gli infusi fecali saranno prodotti nell'unità di microbiologia del nostro ospedale. Verranno utilizzate solo feci congelate. La preparazione delle feci congelate seguirà i protocolli delle linee guida internazionali.

Le visite di follow-up saranno eseguite dai medici della gastroenterologia e dell'unità di malattie infettive. Tutti i pazienti saranno seguiti per 3 mesi dopo la fine dei trattamenti. Le visite di follow-up saranno programmate rispettivamente alla settimana 1, settimana 2, settimana 4 e settimana 12, dopo la fine dei trattamenti. Ad ogni visita verranno eseguiti i seguenti accertamenti: 1) tampone rettale per MDRB; 2) prelievo di campioni fecali per coltura fecale; 3) raccolta di campioni di feci per l'analisi del microbioma; 4) registrazione degli eventi avversi. Visite di follow-up non programmate saranno offerte se richiesto dai pazienti.

I risultati dello studio sono dettagliati nell'apposita sezione di questo sito web.

L'analisi statistica sarà eseguita sia in base all'intenzione di trattare che per protocollo. Le differenze tra i gruppi saranno valutate con un test della somma dei ranghi di Wilcoxon a due code per i dati continui e con il test della probabilità esatta di Fisher (utilizzando i P-value a due code) per i dati categorici. Le differenze nelle percentuali di cura saranno determinate con il test esatto di Fisher (con valori P a due code). Per l'analisi del microbioma, le differenze statistiche tra le medie di gruppo saranno calcolate utilizzando un Wilcoxon-Rank Sum Test a due code, attraverso il pacchetto software statistico R (R Core Team, Vienna, Austria).