FMT til afkolonisering af carbapenem-resistente Enterobacteriaceae (FMT-CRE)

Antallet af antimikrobiel resistens er stigende på verdensplan. Der er stigende beviser for, at fysiologisk tarmmikrobiota er et stort reservoir af antibiotikaresistensgener. Sund tarmmikrobiota er kendt for at forhindre kolonisering af mave-tarmkanalen af ​​patogener, den såkaldte mekanisme for koloniseringsresistens, men denne beskyttelsesmekanisme kan ændres af terapier, der forringer tarmmikrobiota, herunder antibiotika eller kemoterapeutika, med deraf følgende kolonisering af tarmpatogener , herunder multi-drug resistente bakterier (MDRB). MDRB-bærere repræsenterer en epidemiologisk trussel mod andre hospitalsindlagte patienter og for hele samfundet, men er også i risiko for at udvikle kliniske konsekvenser af denne kolonisering, herunder blodbaneinfektioner fra disse patogener. Fækal mikrobiotatransplantation (FMT) har vist høj effektivitet i udryddelse af tilbagevendende C. difficile-infektion, og første bevis tyder på, at denne procedure kunne være nyttig til også at udrydde MDRB, hovedsageligt carbapenem-resistente Enterobacteriaceae.

De nuværende beviser er dog for det meste begrænset til sagsrapporter og sagsserier og til et enkelt randomiseret forsøg, som blev stoppet tidligt og ikke dragede klare konklusioner. I en systematisk gennemgang af 21 undersøgelser og 192 patienter varierede udryddelsesraten fra 0 % til 100 %, og forfatterne konkluderede, at større, veldesignede randomiserede kontrollerede forsøg er nødvendige for yderligere at udforske denne terapi.

De udvidede mål med denne undersøgelse er:

• At sammenligne effektiviteten af ​​donor FMT og placebo FMT til at udrydde tarmkolonisering fra CRE
• At sammenligne effektiviteten af ​​donor FMT og placebo FMT til at forhindre kliniske manifestationer af tarmkolonisering fra CRE
• At undersøge ændringer i tarmmikrobiom efter behandlinger

Efterforskerne vil udføre et enkelt-center placebo-kontrolleret, dobbeltblindt randomiseret klinisk forsøg med donor FMT vs placebo FMT i bærere af CRE Patienter vil blive rekrutteret blandt dem, der henvises til infektionssygdommeambulatoriet i Fondazione Policlinico Universitario "A. Gemelli". Patienter med alle inklusionskriterier og ingen af ​​eksklusionskriterierne (detaljeret i det specifikke afsnit på denne hjemmeside) vil blive taget i betragtning til denne undersøgelse.

Inden randomisering vil demografiske data blive indsamlet af infektionsmedicinsk personale. Desuden vil patienter gentage rektal podning og dyrkning af afføring.

Derudover vil patienter blive bedt om at give afføringsprøver, der skal indsamles i en steril, forseglet beholder og opbevares ved -80°C til metagenomisk vurdering af tarmmikrobiom og meta-transkriptomvurdering af mikrobiologipersonalet.

Efter baseline vurderinger vil patienter blive tilfældigt tildelt en af ​​følgende behandlingsarme:

• Donor FMT (D-FMT)
• Placebo FMT (P-FMT)

Patienter i begge grupper vil gennemgå en enkelt FMT-procedure ved koloskopi. Hver patient i donor-FMT-gruppen vil modtage afføring fra én enkelt donor. Placebo FMT vil være lavet af 250 ml vand. Udvælgelsen af ​​afføringsdonorer vil blive udført af det gastroenterologiske personale efter protokoller, der tidligere er anbefalet af internationale retningslinjer og i overensstemmelse med den nye anbefaling, som blev pålagt af reorganiseringen af ​​fækal mikrobiotatransplantation under COVID-19-pandemien (Ianiro et al. - Gut 2020) Opgaven af Fækale infusater fra raske donorer til patienter vil blive foretaget tilfældigt, uden nogen specifik modtager-donor match, da dette ikke anbefales af internationale retningslinjer. Alle fækale infusater vil blive fremstillet i den mikrobiologiske enhed på vores hospital. Der vil kun blive brugt frossen afføring. Tilberedning af frossen fæces vil følge protokoller fra internationale retningslinjer.

Opfølgningsbesøg vil blive foretaget af læger fra gastroenterologien og infektionsafdelingen. Alle patienter vil blive fulgt op i 3 måneder efter endt behandling. Opfølgningsbesøg vil blive planlagt i henholdsvis uge 1, uge ​​2, uge ​​4 og uge 12 efter endt behandling. Ved hvert besøg vil følgende vurderinger blive udført: 1) rektal podning for MDRB; 2) indsamling af afføringsprøver til afføringskultur; 3) indsamling af afføringsprøver til mikrobiomanalyse; 4) registrering af uønskede hændelser. Uplanlagte opfølgningsbesøg vil blive tilbudt, hvis patienterne ønsker det.

Studieresultater er detaljeret i det specifikke afsnit på denne hjemmeside.

Den statistiske analyse vil blive udført både på basis af intention-to-treat og pr-protokol. Forskelle mellem grupper vil blive vurderet med en to-halet Wilcoxon-rangsumtest for kontinuerlige data og med Fishers eksakte sandsynlighedstest (ved hjælp af to-halede P-værdier) for kategoriske data. Forskelle i hærdningsprocenter vil blive bestemt med Fishers eksakte test (med to-halede P-værdier). Til mikrobiomanalyse vil statistiske forskelle mellem gruppemiddelværdier blive beregnet ved hjælp af en to-halet Wilcoxon-Rank Sum Test gennem R statistisk softwarepakke (R Core Team, Wien, Østrig).