FMT karbapeneemille vastustuskykyisten Enterobacteriaceae-bakteerien dekolonisaatioon (FMT-CRE)

Mikrobilääkeresistenssin määrä lisääntyy maailmanlaajuisesti. On yhä enemmän todisteita siitä, että fysiologinen suoliston mikrobiota on suuri antibioottiresistenssigeenien säiliö. Terveen suoliston mikrobiotan tiedetään estävän patogeenien kolonisaatiota maha-suolikanavassa, ns. kolonisaatioresistenssin mekanismia, mutta tätä suojaavaa mekanismia voidaan muuttaa suoliston mikrobiotaa heikentävillä hoidoilla, mukaan lukien antibiootit tai kemoterapeuttiset lääkkeet, minkä seurauksena suoliston patogeenien kolonisaatio. mukaan lukien monilääkeresistentit bakteerit (MDRB). MDRB-kantajat ovat epidemiologinen uhka muille sairaalapotilaille ja koko yhteisölle, mutta niillä on myös riski saada kliiniset seuraukset tästä kolonisaatiosta, mukaan lukien näiden patogeenien aiheuttamat verenkiertoinfektiot. Ulosteen mikrobiotan siirto (FMT) on osoittanut suurta tehoa toistuvan C. difficile -infektion hävittämisessä, ja alustavat todisteet viittaavat siihen, että tämä menettely voisi olla hyödyllinen myös MDRB:n, pääasiassa karbapeneemille resistenttien Enterobacteriaceae-bakteerien, hävittämisessä.

Nykyinen näyttö rajoittuu kuitenkin enimmäkseen tapausraportteihin ja tapaussarjoihin sekä yhteen satunnaistettuun tutkimukseen, joka keskeytettiin aikaisin ja joka ei tehnyt selkeitä johtopäätöksiä. 21 tutkimuksen ja 192 potilaan systemaattisessa katsauksessa hävitysasteet vaihtelivat 0–100 %, ja kirjoittajat päättelivät, että tarvitaan suurempia, hyvin suunniteltuja satunnaistettuja kontrolloituja tutkimuksia tämän hoidon tutkimiseksi edelleen.

Tämän tutkimuksen laajennetut tavoitteet ovat:

• Verrata luovuttajan FMT:n ja lumelääkkeen FMT:n tehokkuutta suoliston kolonisaation hävittämisessä CRE:stä
• Vertaa luovuttajan FMT:n ja lumelääke-FMT:n tehokkuutta CRE:n aiheuttaman suoliston kolonisaation kliinisten ilmenemismuotojen estämisessä
• Suoliston mikrobiomin muutosten tutkiminen hoitojen jälkeen

Tutkijat suorittavat yhden keskuksen lumekontrolloidun, satunnaistetun kaksoissokkotutkimuksen luovuttajan FMT:stä vs. lumelääke FMT:tä CRE:n kantajilla. Potilaat rekrytoidaan Fondazione Policlinico Universitario "A. Gemelli". Tässä tutkimuksessa otetaan huomioon potilaat, joilla on kaikki sisällyttämiskriteerit eikä yksikään poissulkemiskriteeri (tämän verkkosivuston erityisessä osiossa).

Ennen satunnaistamista tartuntatautihenkilöstö kerää väestötietoja. Lisäksi potilaat toistavat peräsuolen vanupuikko- ja ulosteviljelyn.

Lisäksi potilaita pyydetään antamaan ulostenäytteet, jotka kerätään steriiliin, suljettuun astiaan ja säilytetään -80 °C:ssa mikrobiologian henkilöstön suorittamaa suoliston mikrobiomin ja metatranskription metagenomista arviointia varten.

Perustason arvioinnin jälkeen potilaat jaetaan satunnaisesti johonkin seuraavista hoitoryhmistä:

• Donor FMT (D-FMT)
• Placebo FMT (P-FMT)

Molempien ryhmien potilaat läpikäyvät yhden FMT-toimenpiteen kolonoskopialla. Jokainen luovuttaja-FMT-ryhmän potilas saa ulosteet yhdeltä luovuttajalta. Placebo FMT valmistetaan 250 ml:sta vettä. Ulosteenluovuttajien valinnan suorittaa gastroenterologian henkilökunta noudattaen kansainvälisten ohjeiden aiemmin suosittelemia protokollia ja COVID-19-pandemian aikana tapahtuvan ulosteen mikrobiotan uudelleenjärjestelyn määräämän uuden suosituksen mukaisesti (Ianiro et al. - Gut 2020). Ulosteen infusaatiot terveiltä luovuttajilta potilaille tehdään satunnaisesti, ilman erityistä vastaanottaja-luovuttaja-vastaavuutta, koska kansainvälisten ohjeiden mukaan tämä ei ole suositeltavaa. Kaikki ulosteinfusoinnit valmistetaan sairaalamme mikrobiologian yksikössä. Vain jäädytettyjä ulosteita käytetään. Jäädytettyjen ulosteiden valmistuksessa noudatetaan kansainvälisten ohjeiden protokollia.

Seurantakäyntejä tekevät gastroenterologian ja infektiotautiyksikön lääkärit. Kaikkia potilaita seurataan 3 kuukauden ajan hoidon päättymisen jälkeen. Seurantakäynnit ajoitetaan viikolle 1, viikolle 2, viikolle 4 ja viikolle 12 hoitojen päättymisen jälkeen. Jokaisella käynnillä suoritetaan seuraavat arvioinnit: 1) peräsuolen vanupuikko MDRB:tä varten; 2) ulostenäytteiden kerääminen ulosteviljelyä varten; 3) ulostenäytteiden kerääminen mikrobiomianalyysiä varten; 4) tiedot haittatapahtumista. Suunnittelemattomia seurantakäyntejä tarjotaan potilaiden pyynnöstä.

Tutkimustulokset on kuvattu tämän verkkosivuston erityisessä osiossa.

Tilastollinen analyysi suoritetaan sekä hoitoaiko- että protokollakohtaisesti. Ryhmien välisiä eroja arvioidaan kaksisuuntaisella Wilcoxon-rank-summatestillä jatkuville tiedoille ja Fisherin tarkalla todennäköisyystestillä (käyttäen kaksisuuntaisia ​​P-arvoja) kategorisille tiedoille. Erot kovettumisprosenttien välillä määritetään Fisherin tarkalla testillä (kaksisuuntaisilla P-arvoilla). Mikrobiomianalyysiä varten tilastolliset erot ryhmien keskiarvojen välillä lasketaan käyttämällä kaksisuuntaista Wilcoxon-Rank Sum Testiä R-tilastoohjelmistopaketin kautta (R Core Team, Wien, Itävalta).