FMT for avkolonisering av karbapenem-resistente Enterobacteriaceae (FMT-CRE)

Forekomsten av antimikrobiell resistens øker over hele verden. Det er økende bevis på at fysiologisk tarmmikrobiota er et stort reservoar av antibiotikaresistensgener. Sunn tarmmikrobiota er kjent for å forhindre kolonisering av mage-tarmkanalen av patogener, den såkalte mekanismen for koloniseringsresistens, men denne beskyttelsesmekanismen kan endres av terapier som svekker tarmmikrobiota, inkludert antibiotika eller kjemoterapeutika, med påfølgende kolonisering av tarmpatogener. , inkludert multi-medikamentresistente bakterier (MDRB). MDRB-bærere representerer en epidemiologisk trussel mot andre sykehuspasienter og for hele samfunnet, men er også i fare for å utvikle kliniske konsekvenser av denne koloniseringen, inkludert blodbaneinfeksjoner fra disse patogenene. Fekal mikrobiotatransplantasjon (FMT) har vist høy effekt ved utryddelse av tilbakevendende C. difficile-infeksjon, og første bevis tyder på at denne prosedyren kan være nyttig for å utrydde også MDRB, hovedsakelig karbapenem-resistente Enterobacteriaceae.

Nåværende bevis er imidlertid stort sett begrenset til saksrapporter og saksserier, og til en enkelt randomisert studie, som ble stoppet tidlig og ikke trakk klare konklusjoner. I en systematisk gjennomgang av 21 studier og 192 pasienter varierte eradikeringsraten fra 0 % til 100 %, og forfatterne konkluderte med at større, godt utformede randomiserte kontrollerte studier er nødvendig for å utforske denne behandlingen ytterligere.

De utvidede målene med denne studien er:

• For å sammenligne effekten av donor FMT og placebo FMT for å utrydde tarmkolonisering fra CRE
• For å sammenligne effekten av donor FMT og placebo FMT for å forhindre kliniske manifestasjoner av tarmkolonisering fra CRE
• For å undersøke endringer i tarmmikrobiom etter behandlinger

Etterforskerne vil gjennomføre en enkeltsenter placebokontrollert, dobbeltblind randomisert klinisk studie av donor FMT vs placebo FMT i bærere av CRE. Pasienter vil bli rekruttert blant de som henvises til poliklinikken for infeksjonssykdommer ved Fondazione Policlinico Universitario "A. Gemelli". Pasienter med alle inklusjonskriterier og ingen av eksklusjonskriteriene (detaljert i den spesifikke delen av denne nettsiden) vil bli vurdert for denne studien.

Før randomisering vil demografiske data samles inn av infeksjonspersonalet. I tillegg vil pasienter gjenta rektal vattpinne og dyrking av avføring.

I tillegg vil pasienter bli bedt om å gi avføringsprøver som skal samles i en steril, forseglet beholder og oppbevares ved -80 °C for metagenomisk vurdering av tarmmikrobiom og meta-transkriptomvurdering av mikrobiologipersonalet.

Etter baselinevurderinger vil pasienter bli tilfeldig tildelt en av følgende behandlingsarmer:

• Donor FMT (D-FMT)
• Placebo FMT (P-FMT)

Pasienter i begge grupper vil gjennomgå en enkelt FMT-prosedyre ved koloskopi. Hver pasient i donor-FMT-gruppen vil motta avføring fra én enkelt donor. Placebo FMT vil være laget av 250 ml vann. Utvelgelsen av avføringsdonorer vil bli utført av gastroenterologipersonalet i henhold til protokoller som tidligere er anbefalt av internasjonale retningslinjer og i henhold til den nye anbefalingen som ble pålagt av reorganiseringen av fekal mikrobiotatransplantasjon under COVID-19-pandemien (Ianiro et al. - Gut 2020) Oppdraget til Fekale infusater fra friske givere til pasienter vil bli gjort tilfeldig, uten noen spesifikk mottaker-donor-match, da dette ikke er anbefalt av internasjonale retningslinjer. Alle fekale infusater vil bli produsert i den mikrobiologiske enheten på sykehuset vårt. Kun frossen avføring vil bli brukt. Tilberedning av frossen avføring vil følge protokoller fra internasjonale retningslinjer.

Oppfølgingsbesøk vil bli utført av leger fra gastroenterologi og infeksjonsenhet. Alle pasienter vil bli fulgt opp i 3 måneder etter avsluttet behandling. Oppfølgingsbesøk vil bli planlagt i henholdsvis uke 1, uke 2, uke 4 og uke 12 etter avsluttet behandling. Ved hvert besøk vil følgende vurderinger bli utført: 1) rektal vattpinne for MDRB; 2) innsamling av avføringsprøver for avføringskultur; 3) innsamling av avføringsprøver for mikrobiomanalyse; 4) registrering av uønskede hendelser. Uplanlagte oppfølgingsbesøk vil bli tilbudt dersom pasientene ber om det.

Studieresultater er detaljert i den spesifikke delen av denne nettsiden.

Den statistiske analysen vil bli utført både på en intensjon-å-behandling og per protokoll-basis. Forskjeller mellom grupper vil bli vurdert med en to-halet Wilcoxon-rangsumtest for kontinuerlige data og med Fishers eksakte sannsynlighetstest (ved bruk av to-halede P-verdier) for kategoriske data. Forskjeller i herdeprosent vil bli bestemt med Fishers eksakte test (med to-halede P-verdier). For mikrobiomanalyse vil statistiske forskjeller mellom gruppegjennomsnitt beregnes ved hjelp av en to-halet Wilcoxon-Rank Sum Test, gjennom R statistisk programvarepakke (R Core Team, Wien, Østerrike).