FMT para la descolonización de enterobacterias resistentes a carbapenémicos (FMT-CRE)

Las tasas de resistencia a los antimicrobianos están aumentando en todo el mundo. Cada vez hay más pruebas de que la microbiota intestinal fisiológica es un gran reservorio de genes de resistencia a los antibióticos. Se sabe que una microbiota intestinal saludable previene la colonización del tracto gastrointestinal por patógenos, el llamado mecanismo de resistencia a la colonización, pero este mecanismo protector puede verse alterado por terapias que dañan la microbiota intestinal, incluidos antibióticos o quimioterapéuticos, con la consiguiente colonización de patógenos intestinales. , incluidas las bacterias multirresistentes (MDRB). Los portadores de MDRB representan una amenaza epidemiológica para otros pacientes hospitalizados y para toda la comunidad, pero también corren el riesgo de desarrollar consecuencias clínicas de esta colonización, incluidas infecciones del torrente sanguíneo por estos patógenos. El trasplante de microbiota fecal (FMT) ha demostrado una alta eficacia en la erradicación de la infección recurrente por C. difficile, y la evidencia inicial sugiere que este procedimiento podría ser útil para erradicar también MDRB, principalmente enterobacterias resistentes a carbapenem.

Sin embargo, la evidencia actual se limita principalmente a informes de casos y series de casos, y a un único ensayo aleatorio, que se interrumpió antes de tiempo y no llegó a una conclusión clara. En una revisión sistemática de 21 estudios y 192 pacientes, las tasas de erradicación oscilaron entre 0 % y 100 %, y los autores concluyeron que se necesitan ensayos controlados aleatorios más grandes y bien diseñados para explorar más a fondo esta terapia.

Los objetivos ampliados de este estudio son:

• Comparar la eficacia de FMT de donante y FMT de placebo para erradicar la colonización intestinal de CRE
• Comparar la eficacia del FMT de donante y el FMT de placebo en la prevención de manifestaciones clínicas de colonización intestinal por CRE
• Para investigar los cambios en el microbioma intestinal después de los tratamientos

Los investigadores llevarán a cabo un ensayo clínico aleatorizado, doble ciego, controlado con placebo, en un solo centro, de FMT de donante frente a FMT de placebo en portadores de CRE. Los pacientes se reclutarán entre los derivados a la consulta externa de enfermedades infecciosas de la Fondazione Policlinico Universitario "A. Gemelli". Los pacientes con todos los criterios de inclusión y ninguno de los criterios de exclusión (detallados en la sección específica de este sitio web) serán considerados para este estudio.

Antes de la aleatorización, el personal de enfermedades infecciosas recopilará los datos demográficos. Además, los pacientes repetirán el hisopo rectal y el cultivo de heces.

Además, se solicitará a los pacientes que proporcionen muestras de heces para recolectarlas en un recipiente estéril y sellado y almacenarlas a -80 °C para la evaluación metagenómica del microbioma intestinal y la evaluación del metatranscriptoma por parte del personal de microbiología.

Después de las evaluaciones iniciales, los pacientes serán asignados al azar a uno de los siguientes brazos de tratamiento:

• FMT donante (D-FMT)
• Placebo FMT (P-FMT)

Los pacientes de ambos grupos se someterán a un único procedimiento FMT mediante colonoscopia. Cada paciente del grupo FMT de donante recibirá heces de un único donante. Placebo FMT estará hecho de 250 ml de agua. La selección de donantes de heces será realizada por el personal de gastroenterología siguiendo los protocolos previamente recomendados por las guías internacionales y de acuerdo con la nueva recomendación impuesta por la reorganización del trasplante de microbiota fecal durante la pandemia de COVID-19 (Ianiro et al. - Gut 2020) La asignación de Las infusiones fecales de donantes sanos a pacientes se realizarán de forma aleatoria, sin ninguna compatibilidad específica entre receptor y donante, ya que no lo recomiendan las directrices internacionales. Todas las infusiones fecales se fabricarán en la unidad de microbiología de nuestro hospital. Solo se utilizarán heces congeladas. La preparación de heces congeladas seguirá los protocolos de las directrices internacionales.

Las visitas de seguimiento serán realizadas por médicos de la unidad de gastroenterología y enfermedades infecciosas. Todos los pacientes serán seguidos durante 3 meses después del final de los tratamientos. Las visitas de seguimiento se programarán en la semana 1, semana 2, semana 4 y semana 12, después del final de los tratamientos, respectivamente. En cada visita se realizarán las siguientes evaluaciones: 1) hisopado rectal para MDRB; 2) recolección de muestras de heces para cultivo de heces; 3) recolección de muestras de heces para análisis de microbioma; 4) registro de eventos adversos. Se ofrecerán visitas de seguimiento no programadas si los pacientes lo solicitan.

Los resultados del estudio se detallan en la sección específica de este sitio web.

El análisis estadístico se realizará tanto por intención de tratar como por protocolo. Las diferencias entre los grupos se evaluarán con una prueba de suma de rangos de Wilcoxon de dos colas para datos continuos y con la prueba de probabilidad exacta de Fisher (usando valores P de dos colas) para datos categóricos. Las diferencias en los porcentajes de curación se determinarán con la prueba exacta de Fisher (con valores de P de dos colas). Para el análisis del microbioma, las diferencias estadísticas entre las medias de los grupos se calcularán mediante una prueba de suma de rangos de Wilcoxon de dos colas, a través del paquete de software estadístico R (R Core Team, Viena, Austria).