Tato stránka byla automaticky přeložena a přesnost překladu není zaručena. Podívejte se prosím na anglická verze pro zdrojový text.

Bern studie lidských organoidů ke studiu interakce hostitel-mikrobi (humorg)

5. prosince 2024 aktualizováno: Insel Gruppe AG, University Hospital Bern

Vytvoření linií lidských organoidů jako nástroje k disekci molekulárních cest interakcí hostitel-mikrobiota

Lidské tělo obývá komplexní konsorcium různých mikrobů, které společně tvoří mikrobiotu. Prakticky každý povrch lidského těla je kolonizován odlišnou mikrobiotou, která tvoří komplexní společenství. Rostoucí počet výsledků výzkumu naznačuje, že změny v mikrobiotě mohou mít obrovské účinky na zdraví jejího hostitele.

Většina studií zkoumajících mikroflóru byla provedena na zvířatech, protože mnoho intervencí a vyšetřování nelze z etických důvodů provádět na lidech. To vyvolává otázku, zda jsou poznatky z experimentálních studií translační a mohou být přínosem pro pacienty. To je zvláště patrné při pokusu o rozbor molekulárních mechanismů zapojených do této vyladěné souhry mezi živinami, mikrobiotou a jejím hostitelem.

Založením lidských organoidních kultur z tlustého a tenkého střeva, které mohou být vystaveny mikrobům a/nebo mikrobiálním produktům s následnou transkriptomickou, epigenetickou a imunologickou analýzou, se výzkumníci snaží získat nálezy s vysokým translačním potenciálem s novými poznatky o komplexní interakci mikrobiota, hostitel a jeho imunitní systém.

Přehled studie

Postavení

Nábor

Podmínky

Detailní popis

Data získaná od účastníků budou zaznamenávána do databáze Redcap pro zajištění kvalitního záznamu dat
Zakládání lidských organoidních kultur je standardizováno publikovanými protokoly (Pleguezuelos-Manzano et al. 2020)

Typ studie

Pozorovací

Zápis (Odhadovaný)

100

Kontakty a umístění

Tato část poskytuje kontaktní údaje pro ty, kteří studii provádějí, a informace o tom, kde se tato studie provádí.

Studijní kontakt

Jméno: Stephanie Ganal-Vonarburg, Prof. Dr.
Telefonní číslo: +41 31 632 59 00
E-mail: bauchzentrum@insel.ch

Studijní záloha kontaktů

Jméno: Sandro Christensen
Telefonní číslo: +41 31 684 16 47
E-mail: sandro.christensen@unibe.ch

Studijní místa

Švýcarsko
- - Bern, Švýcarsko, 3010
    - Nábor
    - Inselspital, University Hospital Bern
    - Kontakt:
      
      Bauchzentrum
      
      Telefonní číslo: +41 31 632 59 00
      
      E-mail: bauchzentrum@insel.ch
    - Vrchní vyšetřovatel:
      
      Stephanie Ganal-Vonarburg, Prof
    - Dílčí vyšetřovatel:
      
      Sandro Christensen, MD

Kritéria účasti

Výzkumníci hledají lidi, kteří odpovídají určitému popisu, kterému se říká kritéria způsobilosti. Některé příklady těchto kritérií jsou celkový zdravotní stav osoby nebo předchozí léčba.

Kritéria způsobilosti

Věk způsobilý ke studiu

18 let až 80 let (Dospělý, Starší dospělý)

Přijímá zdravé dobrovolníky

Metoda odběru vzorků

Vzorek nepravděpodobnosti

Studijní populace

Pacienti podstupující rutinní ileokolonoskopii bez známek zánětu, dysplazie nebo neoplazie v histologii
Pacienti podstupující rutinní gastroduodenoskopii bez známek zánětu, dysplazie nebo neoplazie v histologii

Popis

Kritéria pro zařazení:

Podepsaný informovaný souhlas
Indikace pro horní nebo dolní endoskopický výkon
Schopnost porozumět a dodržovat studijní postupy a porozumět informovanému souhlasu
Věk 18-80 let
Negativní výsledek těhotenského testu před zařazením žen do studie (test bude proveden před zápisem)
BMI mezi 18,5 a 30 kg/m2

Kritéria vyloučení:

Onemocnění, o kterém je známo, že chronicky postihuje střevní mikroflóru, střevní epitel nebo imunitní systém související se střevem, jmenovitě zánětlivé onemocnění střev, divertikulitida, mikroskopická kolitida, cirhóza jater, malignita v trávicím traktu, systémová skleróza, celiakie, běžná variabilní imunodeficience, diabetes mellitus
Léky imunosupresivy (např. kortikoidy, biologická léčba)
Současná diagnóza hematologické poruchy (např. anémie s hemoglobinem <7 g/dl, leukémie) nebo jakákoli jiná absolutní kontraindikace odběru krve
Ženy, které jsou těhotné
Závažná porucha koagulace, relevantní trombocytopenie (<50 000/ul), dvojitá inhibice krevních destiček, perorální antikoagulace (možná je léčba ASS)
Známé nebo podezřelé nedodržování předpisů, zneužívání drog nebo alkoholu
Neschopnost dodržovat postupy studie, např. z důvodu jazykových problémů, psychických poruch, demence apod. účastníka
Předchozí zápis do aktuálního studia
Registrace vyšetřovatele, jeho rodinných příslušníků, zaměstnanců a dalších závislých osob
Neschopnost nebo neochota poskytnout vzorky krve a tkáně (biopsie)
Účastníci užívající perorální antikoagulancia nebo s poruchami krvácivosti, u kterých by po bioptických vzorcích bylo mnohem vyšší riziko krvácení nebo u kterých je endoskopické vyšetření kontraindikováno
Pacienti nemohou dát informovaný souhlas
Pacienti, kteří byli v posledních 4 týdnech léčeni antibiotiky
Účast v jiné klinické studii zasahující do studijních postupů
Potenciální účastníci studie, kteří si nepřejí být informováni o náhodných výsledcích získaných během studie (např. během endoskopie nebo genetické analýzy), které jsou relevantní pro jejich zdraví a prevenci nemocí

Studijní plán

Tato část poskytuje podrobnosti o studijním plánu, včetně toho, jak je studie navržena a co studie měří.

Jak je studie koncipována?

Detaily designu

Co je měření studie?

Primární výstupní opatření

Měření výsledku	Popis opatření	Časové okno
Hodnocení změn transkriptomického profilu epiteliálních buněk před a po kultivaci organoidů Časové okno: 3 roky	Hodnocení změn v transkriptomickém profilu epiteliálních buněk před a po kultivaci organoidů je založeno na sekvenování RNA a kvantitativní polymerázové řetězové reakci (qPCR)	3 roky
Posouzení změn v epigenomu epiteliálních buněk před a po kultivaci organoidů Časové okno: 3 roky	Hodnocení změn v epigenomu epiteliálních buněk před a po kultivaci organoidů je založeno celogenomovým bisulfitovým sekvenováním a chromatinovým imunoprecipitačním sekvenováním	3 roky
Transkriptomická a epigenomická krajina interakce hostitel-mikrobiota Časové okno: 3 roky	Stanovení účinků mikrobiálních metabolitů na transkriptomickou a epigenomickou krajinu lidských organoidů ošetřených příslušným metabolitem	3 roky
Interakce hostitel-mikrobiota - údržba kmenových buněk a diferenciace buněk Časové okno: 3 roky	Stanovení účinků mikrobiálních metabolitů na diferenciaci epiteliálních buněk a udržování kmenových buněk	3 roky

Sekundární výstupní opatření

Měření výsledku	Popis opatření	Časové okno
3D-to-2D systém Transwell Časové okno: 3 roky	Zavedení metody transformace lidské organoidní kultury do 2-rozměrného trans-well systému, který umožňuje transportní studie, charakterizaci integrity epitelu a další následné analýzy	3 roky
Střevo na čipu Časové okno: 3 roky	Aplikace 2-rozměrného trans-well systému na sestavu gut-on-a-chip ve spolupráci s Artorg Center na univerzitě v Bernu	3 roky

Spolupracovníci a vyšetřovatelé

Zde najdete lidi a organizace zapojené do této studie.

Sponzor

Insel Gruppe AG, University Hospital Bern

Spolupracovníci

University of Bern

Vyšetřovatelé

Vrchní vyšetřovatel: Stephanie Ganal-Vonarburg, Prof, Inselspital, University Hospital Bern

Publikace a užitečné odkazy

Osoba odpovědná za zadávání informací o studiu tyto publikace poskytuje dobrovolně. Mohou se týkat čehokoli, co souvisí se studiem.

Obecné publikace

Pleguezuelos-Manzano C, Puschhof J, van den Brink S, Geurts V, Beumer J, Clevers H. Establishment and Culture of Human Intestinal Organoids Derived from Adult Stem Cells. Curr Protoc Immunol. 2020 Sep;130(1):e106. doi: 10.1002/cpim.106.

Užitečné odkazy

Pleguezuelos-Manzano C et al. 2020

Termíny studijních záznamů

Tato data sledují průběh záznamů studie a předkládání souhrnných výsledků na ClinicalTrials.gov. Záznamy ze studií a hlášené výsledky jsou před zveřejněním na veřejné webové stránce přezkoumány Národní lékařskou knihovnou (NLM), aby se ujistily, že splňují specifické standardy kontroly kvality.

Hlavní termíny studia

Začátek studia (Aktuální)

31. března 2022

Primární dokončení (Odhadovaný)

30. března 2025

Dokončení studie (Odhadovaný)

30. března 2026

Termíny zápisu do studia

První předloženo

4. dubna 2022

První předloženo, které splnilo kritéria kontroly kvality