Эта страница была переведена автоматически, точность перевода не гарантируется. Пожалуйста, обратитесь к английской версии для исходного текста.

Исследование человеческих органоидов в Берне для изучения взаимодействия хозяина и микроба (humorg)

5 декабря 2024 г. обновлено: Insel Gruppe AG, University Hospital Bern

Создание линий органоидов человека как инструмента для анализа молекулярных путей взаимодействия хозяина и микробиоты

Человеческое тело населяет сложный консорциум различных микробов, которые вместе образуют микробиоту. Практически каждая поверхность человеческого тела заселена отдельной микробиотой, образуя сложные сообщества. Все большее число результатов исследований указывает на то, что изменения в микробиоте могут иметь огромное влияние на здоровье ее хозяина.

Большинство исследований по изучению микробиоты проводилось на животных, так как многие вмешательства и исследования не могут быть выполнены на людях по этическим соображениям. Это поднимает вопрос, являются ли результаты экспериментальных исследований поступательными и могут ли они принести пользу пациентам. Это становится особенно очевидным при попытке проанализировать молекулярные механизмы, участвующие в этом точно настроенном взаимодействии между питательными веществами, микробиотой и ее хозяином.

Создавая органоидные культуры человека из толстой и тонкой кишки, которые могут подвергаться воздействию микробов и / или микробных продуктов, с последующим транскриптомным, эпигенетическим и иммунологическим анализом, исследователи стремятся получить результаты с высоким трансляционным потенциалом с новым пониманием сложного взаимодействия между микроорганизмами. микробиоты, хозяина и его иммунной системы.

Обзор исследования

Статус

Рекрутинг

Условия

Подробное описание

Данные, полученные от участников, будут записаны в базу данных Redcap для обеспечения качественной записи данных.
Создание культур органоидов человека стандартизировано опубликованными протоколами (Pleguezuelos-Manzano et al. 2020)

Тип исследования

Наблюдательный

Регистрация (Оцененный)

100

Контакты и местонахождение

В этом разделе приведены контактные данные лиц, проводящих исследование, и информация о том, где проводится это исследование.

Контакты исследования

Имя: Stephanie Ganal-Vonarburg, Prof. Dr.
Номер телефона: +41 31 632 59 00
Электронная почта: bauchzentrum@insel.ch

Учебное резервное копирование контактов

Имя: Sandro Christensen
Номер телефона: +41 31 684 16 47
Электронная почта: sandro.christensen@unibe.ch

Места учебы

Швейцария
- - Bern, Швейцария, 3010
    - Рекрутинг
    - Inselspital, University Hospital Bern
    - Контакт:
      
      Bauchzentrum
      
      Номер телефона: +41 31 632 59 00
      
      Электронная почта: bauchzentrum@insel.ch
    - Главный следователь:
      
      Stephanie Ganal-Vonarburg, Prof
    - Младший исследователь:
      
      Sandro Christensen, MD

Критерии участия

Исследователи ищут людей, которые соответствуют определенному описанию, называемому критериям приемлемости. Некоторыми примерами этих критериев являются общее состояние здоровья человека или предшествующее лечение.

Критерии приемлемости

Возраст, подходящий для обучения

От 18 лет до 80 лет (Взрослый, Пожилой взрослый)

Принимает здоровых добровольцев

Нет

Метод выборки

Невероятностная выборка

Исследуемая популяция

Пациенты, которым проводится рутинная илеоколоноскопия без признаков воспаления, дисплазии или неоплазии в гистологии
Пациенты, которым проводится рутинная гастродуоденоскопия без признаков воспаления, дисплазии или неоплазии при гистологическом исследовании.

Описание

Критерии включения:

Подписанное информированное согласие
Показания к верхней или нижней эндоскопической процедуре
Способность понимать и следовать процедурам исследования и понимать информированное согласие
Возраст 18-80 лет
Отрицательный результат теста на беременность до включения в исследование женщин-участниц исследования (тест будет проводиться до включения в исследование)
ИМТ от 18,5 до 30 кг/м2

Критерий исключения:

Заболевания, которые, как известно, хронически влияют на микробиоту кишечника, эпителий кишечника или связанную с кишечником иммунную систему, а именно воспалительные заболевания кишечника, дивертикулит, микроскопический колит, цирроз печени, злокачественные новообразования в пищеварительном тракте, системный склероз, глютеновая болезнь, общий вариабельный иммунодефицит, сахарный диабет
Лекарства с иммунодепрессантами (например, кортикоиды, биологическая терапия)
Текущий диагноз гематологического заболевания (например, анемия с гемоглобином <7 г/дл, лейкемия) или любое другое абсолютное противопоказание для забора крови
Беременные женщины
Серьезное нарушение свертывания крови, соответствующая тромбоцитопения (<50 000/мкл), двойное ингибирование тромбоцитов, пероральные антикоагулянты (возможна терапия АСС)
Известное или предполагаемое несоблюдение режима, злоупотребление наркотиками или алкоголем
Неспособность следовать процедурам исследования, например, из-за языковых проблем, психологических расстройств, слабоумия и т. д. участника
Предыдущая регистрация в текущем исследовании
Учет следователя, членов его семьи, сотрудников и иных зависимых лиц
Невозможность или нежелание предоставить образцы крови и ткани (биопсии)
Участники, принимающие пероральные антикоагулянты или страдающие нарушениями свертываемости крови, которые подвергаются гораздо более высокому риску кровотечения после биопсии или которым противопоказано эндоскопическое исследование.
Пациенты, не способные дать информированное согласие
Пациенты, получавшие антибактериальную терапию в течение последних 4 нед.
Участие в другом клиническом исследовании, нарушающем процедуры исследования
Потенциальные участники исследования, которые не хотят быть проинформированы о случайных результатах, полученных в ходе исследования (например, во время эндоскопии или генетического анализа), имеющих значение для их здоровья и профилактики заболеваний.

Учебный план

В этом разделе представлена подробная информация о плане исследования, в том числе о том, как планируется исследование и что оно измеряет.

Как устроено исследование?

Детали дизайна

Что измеряет исследование?

Первичные показатели результатов

Мера результата	Мера Описание	Временное ограничение
Оценка изменений транскриптомного профиля эпителиальных клеток до и после органоидной культуры Временное ограничение: 3 года	Оценка изменений в транскриптомном профиле эпителиальных клеток до и после органоидной культуры устанавливается с помощью РНК-секвенирования и количественной полимеразной цепной реакции (кПЦР).	3 года
Оценка изменений эпигенома эпителиальных клеток до и после органоидной культуры Временное ограничение: 3 года	Оценка изменений в эпигеноме эпителиальных клеток до и после органоидного культивирования устанавливается с помощью полногеномного бисульфитного секвенирования и иммунопреципитационного секвенирования хроматина.	3 года
Транскриптомный и эпигеномный ландшафт взаимодействия хозяин-микробиота Временное ограничение: 3 года	Определение влияния метаболитов микробного происхождения на транскриптомный и эпигеномный ландшафт человеческих органоидов, обработанных соответствующим метаболитом	3 года
Взаимодействие хозяина и микробиоты - поддержание стволовых клеток и дифференцировка клеток Временное ограничение: 3 года	Определение влияния метаболитов микробного происхождения на дифференцировку эпителиальных клеток и поддержание стволовых клеток	3 года

Вторичные показатели результатов

Мера результата	Мера Описание	Временное ограничение
Система 3D-to-2D Transwell Временное ограничение: 3 года	Создание метода преобразования культуры органоидов человека в двухмерную транслуночную систему, которая позволяет проводить исследования транспорта, характеризовать целостность эпителия и проводить другие последующие анализы.	3 года
Кишка на чипе Временное ограничение: 3 года	Применение 2-мерной транслункционной системы к установке «кишка на чипе» в сотрудничестве с Центром Artorg в Бернском университете.	3 года

Соавторы и исследователи

Здесь вы найдете людей и организации, участвующие в этом исследовании.

Спонсор

Insel Gruppe AG, University Hospital Bern

Соавторы

University of Bern

Следователи

Главный следователь: Stephanie Ganal-Vonarburg, Prof, Inselspital, University Hospital Bern

Публикации и полезные ссылки

Лицо, ответственное за внесение сведений об исследовании, добровольно предоставляет эти публикации. Это может быть что угодно, связанное с исследованием.

Общие публикации

Pleguezuelos-Manzano C, Puschhof J, van den Brink S, Geurts V, Beumer J, Clevers H. Establishment and Culture of Human Intestinal Organoids Derived from Adult Stem Cells. Curr Protoc Immunol. 2020 Sep;130(1):e106. doi: 10.1002/cpim.106.

Полезные ссылки

Pleguezuelos-Manzano C et al. 2020

Даты записи исследования

Эти даты отслеживают ход отправки отчетов об исследованиях и сводных результатов на сайт ClinicalTrials.gov. Записи исследований и сообщаемые результаты проверяются Национальной медицинской библиотекой (NLM), чтобы убедиться, что они соответствуют определенным стандартам контроля качества, прежде чем публиковать их на общедоступном веб-сайте.

Изучение основных дат

Начало исследования (Действительный)

31 марта 2022 г.

Первичное завершение (Оцененный)

30 марта 2025 г.

Завершение исследования (Оцененный)

30 марта 2026 г.

Даты регистрации исследования

Первый отправленный

4 апреля 2022 г.

Впервые представлено, что соответствует критериям контроля качества