Ta strona została przetłumaczona automatycznie i dokładność tłumaczenia nie jest gwarantowana. Proszę odnieść się do angielska wersja za tekst źródłowy.

Berno Badanie ludzkich organoidów w celu zbadania interakcji gospodarz-drobnoustroj (humorg)

5 grudnia 2024 zaktualizowane przez: Insel Gruppe AG, University Hospital Bern

Ustalenie ludzkich linii organoidalnych jako narzędzia do analizowania ścieżek molekularnych interakcji gospodarz-mikrobiota

Ciało ludzkie zamieszkuje złożone konsorcjum różnych drobnoustrojów, które razem tworzą mikroflorę. Praktycznie każda powierzchnia ludzkiego ciała jest skolonizowana przez odrębną mikroflorę, tworząc złożone społeczności. Coraz więcej wyników badań wskazuje, że zmiany w mikrobiomie mogą mieć ogromny wpływ na zdrowie gospodarza.

Większość badań mikroflory przeprowadzono na zwierzętach, ponieważ wielu interwencji i badań nie można przeprowadzić na ludziach ze względów etycznych. Rodzi to pytanie, czy wyniki badań eksperymentalnych mają translację i mogą przynieść korzyści pacjentom. Staje się to szczególnie widoczne, gdy próbujemy przeanalizować mechanizmy molekularne zaangażowane w tę precyzyjnie dostrojoną interakcję między składnikami odżywczymi, mikrobiomem i gospodarzem.

Zakładając hodowle ludzkich organoidów z jelita grubego i cienkiego, które można wystawić na działanie drobnoustrojów i/lub produktów drobnoustrojów, a następnie przeprowadzić analizę transkryptomiczną, epigenetyczną i immunologiczną, badacze dążą do uzyskania wyników o dużym potencjale translacyjnym, dzięki nowym wglądom w złożoną interakcję między mikroflory, żywiciela i jego układu odpornościowego.

Przegląd badań

Status

Rekrutacyjny

Warunki

Szczegółowy opis

Dane pozyskane od uczestników zostaną zapisane w bazie danych Redcap w celu zapewnienia wysokiej jakości rejestracji danych
Zakładanie kultur ludzkich organoidów jest standaryzowane przez opublikowane protokoły (Pleguezuelos-Manzano i in. 2020)

Typ studiów

Obserwacyjny

Zapisy (Szacowany)

100

Kontakty i lokalizacje

Ta sekcja zawiera dane kontaktowe osób prowadzących badanie oraz informacje o tym, gdzie badanie jest przeprowadzane.

Kontakt w sprawie studiów

Nazwa: Stephanie Ganal-Vonarburg, Prof. Dr.
Numer telefonu: +41 31 632 59 00
E-mail: bauchzentrum@insel.ch

Kopia zapasowa kontaktu do badania

Nazwa: Sandro Christensen
Numer telefonu: +41 31 684 16 47
E-mail: sandro.christensen@unibe.ch

Lokalizacje studiów

Szwajcaria
- - Bern, Szwajcaria, 3010
    - Rekrutacyjny
    - Inselspital, University Hospital Bern
    - Kontakt:
      
      Bauchzentrum
      
      Numer telefonu: +41 31 632 59 00
      
      E-mail: bauchzentrum@insel.ch
    - Główny śledczy:
      
      Stephanie Ganal-Vonarburg, Prof
    - Pod-śledczy:
      
      Sandro Christensen, MD

Kryteria uczestnictwa

Badacze szukają osób, które pasują do określonego opisu, zwanego kryteriami kwalifikacyjnymi. Niektóre przykłady tych kryteriów to ogólny stan zdrowia danej osoby lub wcześniejsze leczenie.

Kryteria kwalifikacji

Wiek uprawniający do nauki

18 lat do 80 lat (Dorosły, Starszy dorosły)

Akceptuje zdrowych ochotników

Nie

Metoda próbkowania

Próbka bez prawdopodobieństwa

Badana populacja

Pacjenci poddawani rutynowej ileo-kolonoskopii bez cech stanu zapalnego, dysplazji lub nowotworu w badaniu histologicznym
Pacjenci poddawani rutynowej gastro-duodenoskopii bez cech stanu zapalnego, dysplazji lub nowotworu w badaniu histologicznym

Opis

Kryteria przyjęcia:

Podpisana świadoma zgoda
Wskazania do zabiegu endoskopowego górnego lub dolnego
Zdolność zrozumienia i przestrzegania procedur badawczych oraz zrozumienia świadomej zgody
Wiek 18-80 lat
Ujemny wynik testu ciążowego przed włączeniem do badania kobiet uczestniczących w badaniu (test zostanie przeprowadzony przed włączeniem do badania)
BMI między 18,5 a 30 kg/m2

Kryteria wyłączenia:

Choroba, o której wiadomo, że przewlekle wpływa na mikroflorę jelitową, nabłonek jelitowy lub układ odpornościowy związany z jelitami, a mianowicie nieswoiste zapalenie jelit, zapalenie uchyłka, mikroskopowe zapalenie jelita grubego, marskość wątroby, nowotwór złośliwy w przewodzie pokarmowym, twardzina układowa, celiakia, pospolity zmienny niedobór odporności, cukrzyca
Leki z lekami immunosupresyjnymi (np. kortykoidy, terapia biologiczna)
Aktualne rozpoznanie zaburzenia hematologicznego (np. niedokrwistość z hemoglobiną <7 g/dl, białaczka) lub inne bezwzględne przeciwwskazania do pobrania krwi
Kobiety w ciąży
Poważne zaburzenia krzepnięcia, istotna małopłytkowość (<50 000/ul), podwójne zahamowanie płytek krwi, doustna antykoagulacja (możliwa terapia ASS)
Znana lub podejrzewana niezgodność, nadużywanie narkotyków lub alkoholu
Niezdolność do przestrzegania procedur badania, np. z powodu problemów językowych, zaburzeń psychicznych, demencji itp. uczestnika
Poprzednia rejestracja do bieżącego badania
Rejestracja badacza, członków jego rodziny, pracowników i innych osób pozostających na utrzymaniu
Niemożność lub niechęć do dostarczenia próbek krwi i próbek tkanek (biopsji)
Uczestnicy przyjmujący doustne leki przeciwzakrzepowe lub ze skazami krwotocznymi, u których występuje znacznie większe ryzyko krwawienia po pobraniu próbek biopsyjnych lub u których badanie endoskopowe jest przeciwwskazane
Pacjenci niezdolni do wyrażenia świadomej zgody
Pacjenci, którzy byli poddawani antybiotykoterapii w ciągu ostatnich 4 tygodni
Uczestnictwo w innym badaniu klinicznym kolidującym z procedurami badawczymi
Potencjalni uczestnicy badania, którzy nie chcą być informowani o przypadkowych wynikach uzyskanych w trakcie badania (np. podczas endoskopii lub analizy genetycznej) istotnych dla ich zdrowia i profilaktyki chorób

Plan studiów

Ta sekcja zawiera szczegółowe informacje na temat planu badania, w tym sposób zaprojektowania badania i jego pomiary.

Jak projektuje się badanie?

Szczegóły projektu

Co mierzy badanie?

Podstawowe miary wyniku

Miara wyniku	Opis środka	Ramy czasowe
Ocena zmian profilu transkryptomicznego komórek nabłonkowych przed i po hodowli organoidów Ramy czasowe: 3 lata	Ocena zmian w profilu transkryptomicznym komórek nabłonka przed i po hodowli organoidów dokonywana jest poprzez sekwencjonowanie RNA i ilościową reakcję łańcuchową polimerazy (qPCR)	3 lata
Ocena zmian w epigenomie komórek nabłonkowych przed i po hodowli organoidów Ramy czasowe: 3 lata	Ocena zmian w epigenomie komórek nabłonka przed i po hodowli organoidów dokonywana jest poprzez sekwencjonowanie wodorosiarczynowe całego genomu i sekwencjonowanie metodą immunoprecypitacji chromatyny	3 lata
Krajobraz transkryptomiczny i epigenomiczny interakcji gospodarz-mikrobiota Ramy czasowe: 3 lata	Określenie wpływu metabolitów pochodzenia mikrobiologicznego na krajobraz transkryptomiczny i epigenomiczny ludzkich organoidów traktowanych odpowiednim metabolitem	3 lata
Interakcja gospodarz-mikrobiota - utrzymanie komórek macierzystych i różnicowanie komórek Ramy czasowe: 3 lata	Określenie wpływu metabolitów pochodzenia mikrobiologicznego na różnicowanie komórek nabłonka i utrzymanie komórek macierzystych	3 lata

Miary wyników drugorzędnych

Miara wyniku	Opis środka	Ramy czasowe
System Transwell 3D do 2D Ramy czasowe: 3 lata	Ustanowienie metody przekształcania hodowli ludzkich organoidów w dwuwymiarowy system trans-dołkowy, który umożliwia badania transportu, charakteryzację integralności nabłonka i inne dalsze analizy	3 lata
Gut-on-a-chip Ramy czasowe: 3 lata	Zastosowanie dwuwymiarowego systemu trans-dołków w konfiguracji typu „jelito na chipie” we współpracy z Centrum Artorga na Uniwersytecie w Bernie	3 lata

Współpracownicy i badacze

Tutaj znajdziesz osoby i organizacje zaangażowane w to badanie.

Sponsor

Insel Gruppe AG, University Hospital Bern

Współpracownicy

University of Bern

Śledczy

Główny śledczy: Stephanie Ganal-Vonarburg, Prof, Inselspital, University Hospital Bern

Publikacje i pomocne linki

Osoba odpowiedzialna za wprowadzenie informacji o badaniu dobrowolnie udostępnia te publikacje. Mogą one dotyczyć wszystkiego, co jest związane z badaniem.

Publikacje ogólne

Pleguezuelos-Manzano C, Puschhof J, van den Brink S, Geurts V, Beumer J, Clevers H. Establishment and Culture of Human Intestinal Organoids Derived from Adult Stem Cells. Curr Protoc Immunol. 2020 Sep;130(1):e106. doi: 10.1002/cpim.106.

Przydatne linki

Pleguezuelos-Manzano C et al. 2020

Daty zapisu na studia

Daty te śledzą postęp w przesyłaniu rekordów badań i podsumowań wyników do ClinicalTrials.gov. Zapisy badań i zgłoszone wyniki są przeglądane przez National Library of Medicine (NLM), aby upewnić się, że spełniają określone standardy kontroli jakości, zanim zostaną opublikowane na publicznej stronie internetowej.

Główne daty studiów

Rozpoczęcie studiów (Rzeczywisty)

31 marca 2022

Zakończenie podstawowe (Szacowany)

30 marca 2025

Ukończenie studiów (Szacowany)

30 marca 2026

Daty rejestracji na studia

Pierwszy przesłany

4 kwietnia 2022

Pierwszy przesłany, który spełnia kryteria kontroli jakości