Tämä sivu käännettiin automaattisesti, eikä käännösten tarkkuutta voida taata. Katso englanninkielinen versio lähdetekstiä varten.

Bernin ihmisen organoiditutkimus isäntä-mikrobivuorovaikutuksen tutkimiseksi (humorg)

torstai 5. joulukuuta 2024 päivittänyt: Insel Gruppe AG, University Hospital Bern

Ihmisen organoidilinjojen perustaminen työkaluksi isäntä-mikrobiotan vuorovaikutusten molekyylipolkujen erottamiseen

Ihmiskeho asuu monimutkaisessa konsortiossa eri mikrobeja, jotka yhdessä muodostavat mikrobiston. Lähes jokaisella ihmiskehon pinnalla on erillinen mikrobisto, joka muodostaa monimutkaisia yhteisöjä. Yhä useammat tutkimustulokset osoittavat, että mikrobiotan muutoksilla voi olla suuria vaikutuksia sen isännän terveyteen.

Suurin osa mikrobiotaa tutkivista tutkimuksista tehtiin eläimillä, koska monia interventioita ja tutkimuksia ei voida tehdä ihmisillä eettisistä syistä. Tämä herättää kysymyksen, ovatko kokeellisten tutkimusten tulokset translatiivisia ja voivatko ne hyödyttää potilaita. Tämä tulee erityisen ilmeiseksi, kun yritetään eritellä molekyylimekanismeja, jotka liittyvät tähän ravinteiden, mikrobiston ja sen isännän hienosäädettyyn vuorovaikutukseen.

Perustamalla paksu- ja ohutsuolesta ihmisen organoidiviljelmiä, jotka voidaan altistaa mikrobeille ja/tai mikrobituotteille myöhemmän transkriptomisen, epigeneettisen ja immunologisen analyysin avulla, tutkijat pyrkivät tuottamaan löydöksiä, joilla on suuri translaatiopotentiaali ja jotka tarjoavat uusia näkemyksiä mikrobien monimutkaisesta vuorovaikutuksesta. mikrobiota, isäntä ja sen immuunijärjestelmä.

Tutkimuksen yleiskatsaus

Tila

Rekrytointi

Ehdot

Yksityiskohtainen kuvaus

Osallistujilta saadut tiedot tallennetaan Redcap-tietokantaan laadukkaan tiedon tallennuksen varmistamiseksi
Ihmisen organoidiviljelmien perustaminen on standardoitu julkaistujen protokollien mukaan (Pleguezuelos-Manzano et al. 2020)

Opintotyyppi

Havainnollistava

Ilmoittautuminen (Arvioitu)

100

Yhteystiedot ja paikat

Tässä osiossa on tutkimuksen suorittajien yhteystiedot ja tiedot siitä, missä tämä tutkimus suoritetaan.

Opiskeluyhteys

Nimi: Stephanie Ganal-Vonarburg, Prof. Dr.
Puhelinnumero: +41 31 632 59 00
Sähköposti: bauchzentrum@insel.ch

Tutki yhteystietojen varmuuskopiointi

Nimi: Sandro Christensen
Puhelinnumero: +41 31 684 16 47
Sähköposti: sandro.christensen@unibe.ch

Opiskelupaikat

Sveitsi
- - Bern, Sveitsi, 3010
    - Rekrytointi
    - Inselspital, University Hospital Bern
    - Ottaa yhteyttä:
      
      Bauchzentrum
      
      Puhelinnumero: +41 31 632 59 00
      
      Sähköposti: bauchzentrum@insel.ch
    - Päätutkija:
      
      Stephanie Ganal-Vonarburg, Prof
    - Alatutkija:
      
      Sandro Christensen, MD

Osallistumiskriteerit

Tutkijat etsivät ihmisiä, jotka sopivat tiettyyn kuvaukseen, jota kutsutaan kelpoisuuskriteereiksi. Joitakin esimerkkejä näistä kriteereistä ovat henkilön yleinen terveydentila tai aiemmat hoidot.

Kelpoisuusvaatimukset

Opintokelpoiset iät

18 vuotta - 80 vuotta (Aikuinen, Vanhempi Aikuinen)

Hyväksyy terveitä vapaaehtoisia

Näytteenottomenetelmä

Ei-todennäköisyysnäyte

Tutkimusväestö

Potilaat, joille tehdään rutiininomainen ileokolonoskopia ilman merkkejä tulehduksesta, dysplasiasta tai neoplasiasta histologiassa
Potilaat, joille tehdään rutiini gastroduodenoskopia ilman merkkejä tulehduksesta, dysplasiasta tai neoplasiasta histologiassa

Kuvaus

Sisällyttämiskriteerit:

Allekirjoitettu tietoinen suostumus
Indikaatio ylempään tai alempaan endoskooppiseen toimenpiteeseen
Kyky ymmärtää ja seurata tutkimusmenetelmiä ja ymmärtää tietoisen suostumuksen
Ikä 18-80 vuotta
Negatiivinen raskaustestitulos ennen tutkimukseen osallistuneiden naisten osallistumista tutkimukseen (testi suoritetaan ennen ilmoittautumista)
BMI 18,5-30 kg/m2

Poissulkemiskriteerit:

Sairaus, jonka tiedetään kroonisesti vaikuttavan suolen mikrobiotaan, suoliston epiteeliin tai suolistoon liittyvään immuunijärjestelmään, nimittäin tulehduksellinen suolistosairaus, divertikuliitti, mikroskooppinen paksusuolitulehdus, maksakirroosi, ruoansulatuskanavan pahanlaatuinen kasvain, systeeminen skleroosi, keliakia, yleinen immuunipuutos, diabetes mellitus
Lääkitys immunosuppressantteilla (esim. kortikoidit, biologinen hoito)
Hematologisen häiriön nykyinen diagnoosi (esim. anemia, jonka hemoglobiini on alle 7 g/dl, leukemia) tai mikä tahansa muu ehdoton vasta-aihe veren ottamiseen
Raskaana olevat naiset
Vakava hyytymishäiriö, merkittävä trombosytopenia (<50'000/ul), kaksoisverihiutaleiden esto, oraalinen antikoagulaatio (ASS-hoito on mahdollista)
Tunnettu tai epäilty noudattamatta jättäminen, huumeiden tai alkoholin väärinkäyttö
Kyvyttömyys noudattaa tutkimuksen menettelytapoja esim. osallistujan kieliongelmien, psyykkisten häiriöiden, dementian jne. vuoksi
Aiempi ilmoittautuminen nykyiseen tutkimukseen
Tutkijan, hänen perheenjäsentensä, työntekijöiden ja muiden huollettavien henkilöiden rekisteröinti
Kyvyttömyys tai haluttomuus antaa verinäytteitä ja kudosnäytteitä (biopsia)
Osallistujat, jotka käyttävät oraalista antikoagulanttia tai joilla on verenvuotohäiriöitä, joilla on paljon suurempi verenvuotoriski biopsianäytteiden jälkeen tai jotka ovat vasta-aiheisia endoskooppiseen tutkimukseen
Potilaat, jotka eivät pysty antamaan tietoista suostumusta
Potilaat, jotka ovat olleet antibioottihoidossa viimeisen 4 viikon aikana
Osallistuminen muihin kliinisiin tutkimuksiin, jotka häiritsevät tutkimusmenetelmiä
Potentiaaliset tutkimukseen osallistujat, jotka eivät halua saada tietoa tutkimuksen aikana (esim. endoskopian tai geneettisen analyysin aikana) saaduista satunnaisista tuloksista, jotka ovat tärkeitä heidän terveytensä ja sairauksien ehkäisyn kannalta

Opintosuunnitelma

Tässä osiossa on tietoja tutkimussuunnitelmasta, mukaan lukien kuinka tutkimus on suunniteltu ja mitä tutkimuksella mitataan.

Miten tutkimus on suunniteltu?

Suunnittelun yksityiskohdat

Mitä tutkimuksessa mitataan?

Ensisijaiset tulostoimenpiteet

Tulosmittaus	Toimenpiteen kuvaus	Aikaikkuna
Epiteelisolujen transkriptomisen profiilin muutosten arviointi ennen ja jälkeen organoidiviljelyn Aikaikkuna: 3 vuotta	Epiteelisolujen transkriptomisen profiilin muutosten arviointi ennen organoidiviljelyä ja sen jälkeen määritetään RNA-sekvensoinnilla ja kvantitatiivisella polymeraasiketjureaktiolla (qPCR)	3 vuotta
Epiteelisolujen epigenomin muutosten arviointi ennen ja jälkeen organoidiviljelyn Aikaikkuna: 3 vuotta	Epiteelisolujen epigenomin muutosten arviointi ennen organoidiviljelyä ja sen jälkeen määritetään koko genomin bisulfiittisekvensoinnilla ja kromatiinin immunosaostussekvensoinnilla	3 vuotta
Isäntä-mikrobiotan vuorovaikutuksen transkriptominen ja epigenominen maisema Aikaikkuna: 3 vuotta	Mikrobiperäisten metaboliittien vaikutusten määrittäminen vastaavalla metaboliitilla käsiteltyjen ihmisen organoidien transkriptomiseen ja epigenomiseen maisemaan	3 vuotta
Isännän ja mikrobiston vuorovaikutus – kantasolujen ylläpito ja solujen erilaistuminen Aikaikkuna: 3 vuotta	Mikrobiperäisten metaboliittien vaikutusten määrittäminen epiteelisolujen erilaistumiseen ja kantasolujen ylläpitoon	3 vuotta

Toissijaiset tulostoimenpiteet

Tulosmittaus	Toimenpiteen kuvaus	Aikaikkuna
3D-to-2D Transwell-järjestelmä Aikaikkuna: 3 vuotta	Luodaan menetelmä ihmisen organoidiviljelmän muuntamiseksi 2-ulotteiseksi trans-kuoppajärjestelmäksi, joka mahdollistaa kuljetustutkimukset, epiteelin eheyden karakterisoinnin ja muut alavirran analyysit	3 vuotta
Suolaa sirulla Aikaikkuna: 3 vuotta	2-ulotteisen trans-well-järjestelmän soveltaminen gut-on-a-chip -järjestelmään yhteistyössä Bernin yliopiston Artorg-keskuksen kanssa	3 vuotta

Yhteistyökumppanit ja tutkijat

Täältä löydät tähän tutkimukseen osallistuvat ihmiset ja organisaatiot.

Sponsori

Insel Gruppe AG, University Hospital Bern

Yhteistyökumppanit

University of Bern

Tutkijat

Päätutkija: Stephanie Ganal-Vonarburg, Prof, Inselspital, University Hospital Bern

Julkaisuja ja hyödyllisiä linkkejä

Tutkimusta koskevien tietojen syöttämisestä vastaava henkilö toimittaa nämä julkaisut vapaaehtoisesti. Nämä voivat koskea mitä tahansa tutkimukseen liittyvää.

Yleiset julkaisut

Pleguezuelos-Manzano C, Puschhof J, van den Brink S, Geurts V, Beumer J, Clevers H. Establishment and Culture of Human Intestinal Organoids Derived from Adult Stem Cells. Curr Protoc Immunol. 2020 Sep;130(1):e106. doi: 10.1002/cpim.106.

Hyödyllisiä linkkejä

Pleguezuelos-Manzano C et al. 2020

Opintojen ennätyspäivät

Nämä päivämäärät seuraavat ClinicalTrials.gov-sivustolle lähetettyjen tutkimustietueiden ja yhteenvetojen edistymistä. National Library of Medicine (NLM) tarkistaa tutkimustiedot ja raportoidut tulokset varmistaakseen, että ne täyttävät tietyt laadunvalvontastandardit, ennen kuin ne julkaistaan julkisella verkkosivustolla.

Opi tärkeimmät päivämäärät

Opiskelun aloitus (Todellinen)

Torstai 31. maaliskuuta 2022

Ensisijainen valmistuminen (Arvioitu)

Sunnuntai 30. maaliskuuta 2025

Opintojen valmistuminen (Arvioitu)

Maanantai 30. maaliskuuta 2026

Opintoihin ilmoittautumispäivät

Ensimmäinen lähetetty

Maanantai 4. huhtikuuta 2022

Ensimmäinen toimitettu, joka täytti QC-kriteerit