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Bern Human Organoid-Study pour étudier l'interaction hôte-microbe (humorg)

5 décembre 2024 mis à jour par: Insel Gruppe AG, University Hospital Bern

Établissement de lignées organoïdes humaines comme outil pour disséquer les voies moléculaires des interactions hôte-microbiote

Le corps humain habite un consortium complexe de différents microbes qui forment ensemble le microbiote. Pratiquement toutes les surfaces du corps humain sont colonisées par un microbiote distinct, formant des communautés complexes. Un nombre croissant de résultats de recherche indique que les changements dans le microbiote peuvent avoir de vastes effets sur la santé de son hôte.

La plupart des études portant sur le microbiote ont été menées sur des animaux, car de nombreuses interventions et investigations ne peuvent être réalisées sur l'homme pour des raisons éthiques. Cela soulève la question de savoir si les résultats des études expérimentales sont translationnels et peuvent bénéficier aux patients. Cela devient particulièrement évident lorsque l'on tente de disséquer les mécanismes moléculaires impliqués dans cette interaction fine entre les nutriments, le microbiote et son hôte.

En établissant des cultures organoïdes humaines du gros et de l'intestin grêle qui peuvent être exposées à des microbes et/ou à des produits microbiens avec une analyse transcriptomique, épigénétique et immunologique ultérieure, les chercheurs visent à générer des résultats à fort potentiel de traduction avec de nouvelles connaissances sur l'interaction complexe de la microbiote, l'hôte et son système immunitaire.

Aperçu de l'étude

Statut

Recrutement

Les conditions

Description détaillée

Les données obtenues des participants seront enregistrées dans la base de données Redcap pour assurer un enregistrement de données de haute qualité
L'établissement de cultures d'organoïdes humains est normalisé par des protocoles publiés (Pleguezuelos-Manzano et al. 2020)

Type d'étude

Observationnel

Inscription (Estimé)

100

Contacts et emplacements

Cette section fournit les coordonnées de ceux qui mènent l'étude et des informations sur le lieu où cette étude est menée.

Coordonnées de l'étude

Nom: Stephanie Ganal-Vonarburg, Prof. Dr.
Numéro de téléphone: +41 31 632 59 00
E-mail: bauchzentrum@insel.ch

Sauvegarde des contacts de l'étude

Nom: Sandro Christensen
Numéro de téléphone: +41 31 684 16 47
E-mail: sandro.christensen@unibe.ch

Lieux d'étude

Suisse
- - Bern, Suisse, 3010
    - Recrutement
    - Inselspital, University Hospital Bern
    - Contact:
      
      Bauchzentrum
      
      Numéro de téléphone: +41 31 632 59 00
      
      E-mail: bauchzentrum@insel.ch
    - Chercheur principal:
      
      Stephanie Ganal-Vonarburg, Prof
    - Sous-enquêteur:
      
      Sandro Christensen, MD

Critères de participation

Les chercheurs recherchent des personnes qui correspondent à une certaine description, appelée critères d'éligibilité. Certains exemples de ces critères sont l'état de santé général d'une personne ou des traitements antérieurs.

Critère d'éligibilité

Âges éligibles pour étudier

18 ans à 80 ans (Adulte, Adulte plus âgé)

Accepte les volontaires sains

Non

Méthode d'échantillonnage

Échantillon non probabiliste

Population étudiée

Patients subissant une iléo-coloscopie de routine sans signe d'inflammation, de dysplasie ou de néoplasie en histologie
Patients subissant une gastro-duodénoscopie de routine sans signe d'inflammation, de dysplasie ou de néoplasie en histologie

La description

Critère d'intégration:

Consentement éclairé signé
Indication pour la procédure endoscopique supérieure ou inférieure
Capacité à comprendre et à suivre les procédures d'étude et à comprendre le consentement éclairé
Âge 18-80 ans
Résultat de test de grossesse négatif avant l'inscription à l'étude des participantes à l'étude (le test sera effectué avant l'inscription)
IMC entre 18,5 et 30 kg/m2

Critère d'exclusion:

Maladie connue pour affecter de manière chronique le microbiote intestinal, l'épithélium intestinal ou le système immunitaire associé à l'intestin, à savoir la maladie intestinale inflammatoire, la diverticulite, la colite microscopique, la cirrhose du foie, la malignité dans le tube digestif, la sclérodermie systémique, la maladie cœliaque, l'immunodéficience à variable commune, le diabète sucré
Médicaments contenant des immunosuppresseurs (par ex. corticoïdes, thérapie biologique)
Diagnostic actuel d'un trouble hématologique (par ex. anémie avec hémoglobine <7 g/dl, leucémie) ou toute autre contre-indication absolue à la prise de sang
Les femmes enceintes
Trouble grave de la coagulation, thrombocytopénie pertinente (<50'000/ul), double inhibition plaquettaire, anticoagulation orale (la thérapie ASS est possible)
Non-conformité connue ou suspectée, abus de drogue ou d'alcool
Incapacité à suivre les procédures de l'étude, par exemple en raison de problèmes de langage, de troubles psychologiques, de démence, etc. du participant
Inscription précédente dans l'étude en cours
Inscription de l'enquêteur, des membres de sa famille, des employés et d'autres personnes à charge
Incapacité ou refus de fournir des échantillons de sang et des échantillons de tissus (biopsies)
Participants prenant des anticoagulants oraux ou souffrant de troubles hémorragiques qui courraient un risque beaucoup plus élevé de saignement après des échantillons de biopsie ou qui sont contre-indiqués pour un examen endoscopique
Patients incapables de donner un consentement éclairé
Patients ayant été sous antibiothérapie au cours des 4 dernières semaines
Participation à d'autres études cliniques interférant avec les procédures d'étude
Participants potentiels à l'étude qui souhaitent ne pas être informés des résultats aléatoires acquis au cours de l'étude (par exemple, lors d'une endoscopie ou d'une analyse génétique) pertinents pour leur santé et pour la prévention de maladies

Plan d'étude

Cette section fournit des détails sur le plan d'étude, y compris la façon dont l'étude est conçue et ce que l'étude mesure.

Comment l'étude est-elle conçue ?

Détails de conception

Que mesure l'étude ?

Principaux critères de jugement

Mesure des résultats	Description de la mesure	Délai
Évaluation des modifications du profil transcriptomique des cellules épithéliales avant et après culture organoïde Délai: 3 années	Évaluation des changements dans le profil transcriptomique des cellules épithéliales avant et après l'établissement de la culture organoïde par séquençage d'ARN et réaction en chaîne par polymérase quantitative (qPCR)	3 années
Évaluation des modifications de l'épigénome des cellules épithéliales avant et après culture organoïde Délai: 3 années	Évaluation des changements dans l'épigénome des cellules épithéliales avant et après l'établissement de la culture organoïde par séquençage au bisulfite du génome entier et séquençage par immunoprécipitation de la chromatine	3 années
Paysage transcriptomique et épigénomique de l'interaction hôte-microbiote Délai: 3 années	Détermination des effets des métabolites d'origine microbienne sur le paysage transcriptomique et épigénomique des organoïdes humains traités avec le métabolite respectif	3 années
Interaction hôte-microbiote - Maintien des cellules souches et différenciation cellulaire Délai: 3 années	Détermination des effets des métabolites d'origine microbienne sur la différenciation des cellules épithéliales et le maintien des cellules souches	3 années

Mesures de résultats secondaires

Mesure des résultats	Description de la mesure	Délai
Système Transwell 3D à 2D Délai: 3 années	Établir une méthode pour transformer la culture organoïde humaine en un système trans-puits bidimensionnel qui permet des études de transport, la caractérisation de l'intégrité épithéliale et d'autres analyses en aval	3 années
Gut-on-a-chip Délai: 3 années	Application du système trans-puits bidimensionnel à une configuration gut-on-a-chip en collaboration avec le Centre Artorg de l'Université de Berne	3 années

Collaborateurs et enquêteurs

C'est ici que vous trouverez les personnes et les organisations impliquées dans cette étude.

Parrainer

Insel Gruppe AG, University Hospital Bern

Collaborateurs

University of Bern

Les enquêteurs

Chercheur principal: Stephanie Ganal-Vonarburg, Prof, Inselspital, University Hospital Bern

Publications et liens utiles

La personne responsable de la saisie des informations sur l'étude fournit volontairement ces publications. Il peut s'agir de tout ce qui concerne l'étude.

Publications générales

Pleguezuelos-Manzano C, Puschhof J, van den Brink S, Geurts V, Beumer J, Clevers H. Establishment and Culture of Human Intestinal Organoids Derived from Adult Stem Cells. Curr Protoc Immunol. 2020 Sep;130(1):e106. doi: 10.1002/cpim.106.

Liens utiles

Pleguezuelos-Manzano C et al. 2020

Dates d'enregistrement des études

Ces dates suivent la progression des dossiers d'étude et des soumissions de résultats sommaires à ClinicalTrials.gov. Les dossiers d'étude et les résultats rapportés sont examinés par la Bibliothèque nationale de médecine (NLM) pour s'assurer qu'ils répondent à des normes de contrôle de qualité spécifiques avant d'être publiés sur le site Web public.

Dates principales de l'étude

Début de l'étude (Réel)

31 mars 2022

Achèvement primaire (Estimé)

30 mars 2025

Achèvement de l'étude (Estimé)

30 mars 2026

Dates d'inscription aux études

Première soumission

4 avril 2022

Première soumission répondant aux critères de contrôle qualité