Bern Human Organoid-undersøgelse til undersøgelse af vært-mikrobe-interaktion (humorg)
5. december 2024 opdateret af: Insel Gruppe AG, University Hospital Bern
Etablering af menneskelige organoide linjer som et værktøj til at dissekere molekylære veje for vært-mikrobiota-interaktioner
Den menneskelige krop lever i et komplekst konsortium af forskellige mikrober, som tilsammen danner mikrobiotaen. Stort set alle overflader af den menneskelige krop er koloniseret af en særskilt mikrobiota, der danner komplekse samfund. Et stigende antal forskningsresultater indikerer, at ændringer i mikrobiotaen kan have enorme virkninger på værtens helbred.
De fleste undersøgelser af mikrobiotaen blev udført på dyr, da mange indgreb og undersøgelser ikke kan udføres på mennesker på grund af etiske overvejelser. Dette rejser spørgsmålet, om resultaterne fra eksperimentelle undersøgelser er translationelle og kan gavne patienterne. Det bliver især tydeligt, når man forsøger at dissekere molekylære mekanismer involveret i dette finjusterede samspil mellem næringsstoffer, mikrobiotaen og dens vært.
Ved at etablere humane organoide kulturer fra tyktarmen og tyndtarmen, der kan udsættes for mikrober og/eller mikrobielle produkter med efterfølgende transkriptomiske, epigenetiske og immunologiske analyser, sigter efterforskerne på at generere fund med højt translationel potentiale med ny indsigt i den komplekse interaktion mellem mikrobiota, værten og dens immunsystem.
Studieoversigt
Status
Rekruttering
Betingelser
Detaljeret beskrivelse
- Data indhentet fra deltagere vil blive registreret i databasen Redcap for at sikre dataoptagelse af høj kvalitet
- Etablering af menneskelige organoide kulturer er standardiseret af offentliggjorte protokoller (Pleguezuelos-Manzano et al. 2020)
Undersøgelsestype
Observationel
Tilmelding (Anslået)
100
Kontakter og lokationer
Dette afsnit indeholder kontaktoplysninger for dem, der udfører undersøgelsen, og oplysninger om, hvor denne undersøgelse udføres.
Studiekontakt
- Navn: Stephanie Ganal-Vonarburg, Prof. Dr.
- Telefonnummer: +41 31 632 59 00
- E-mail: bauchzentrum@insel.ch
Undersøgelse Kontakt Backup
- Navn: Sandro Christensen
- Telefonnummer: +41 31 684 16 47
- E-mail: sandro.christensen@unibe.ch
Studiesteder
-
-
-
Bern, Schweiz, 3010
- Rekruttering
- Inselspital, University Hospital Bern
-
Kontakt:
- Bauchzentrum
- Telefonnummer: +41 31 632 59 00
- E-mail: bauchzentrum@insel.ch
-
Ledende efterforsker:
- Stephanie Ganal-Vonarburg, Prof
-
Underforsker:
- Sandro Christensen, MD
-
-
Deltagelseskriterier
Forskere leder efter personer, der passer til en bestemt beskrivelse, kaldet berettigelseskriterier. Nogle eksempler på disse kriterier er en persons generelle helbredstilstand eller tidligere behandlinger.
Berettigelseskriterier
Aldre berettiget til at studere
18 år til 80 år (Voksen, Ældre voksen)
Tager imod sunde frivillige
Ingen
Prøveudtagningsmetode
Ikke-sandsynlighedsprøve
Studiebefolkning
- Patienter, der gennemgår rutinemæssig ileo-koloskopi uden tegn på inflammation, dysplasi eller neoplasi i histologi
- Patienter, der gennemgår rutinemæssig gastroduodenoskopi uden tegn på inflammation, dysplasi eller neoplasi i histologi
Beskrivelse
Inklusionskriterier:
- Underskrevet informeret samtykke
- Indikation for øvre eller nedre endoskopisk procedure
- Evne til at forstå og følge undersøgelsesprocedurer og forstå informeret samtykke
- Alder 18-80 år
- Negativt resultat af graviditetstest før studietilmelding af kvindelige undersøgelsesdeltagere (test vil blive udført før tilmelding)
- BMI mellem 18,5 og 30 kg/m2
Ekskluderingskriterier:
- Sygdom kendt for kronisk at påvirke tarmmikrobiota, tarmepitel eller tarm-associeret immunsystem, nemlig inflammatorisk tarmsygdom, diverticulitis, mikroskopisk colitis, levercirrhose, malignitet i fordøjelseskanalen, systemisk sklerose, cøliaki, almindeligt variabel immundefekt, diabetes mellitus
- Medicin med immunsuppressiva (f. kortikoider, biologisk terapi)
- Nuværende diagnose af en hæmatologisk lidelse (f. anæmi med hæmoglobin <7 g/dl, leukæmi) eller enhver anden absolut kontraindikation for blodprøvetagning
- Kvinder, der er gravide
- Alvorlig koagulationsforstyrrelse, relevant trombocytopeni (<50'000/ul), dobbelt blodpladehæmning, oral antikoagulering (ASS-behandling er mulig)
- Kendt eller formodet manglende overholdelse, stof- eller alkoholmisbrug
- Manglende evne til at følge undersøgelsens procedurer, fx på grund af sprogproblemer, psykiske lidelser, demens osv. hos deltageren
- Tidligere tilmelding til det nuværende studie
- Tilmelding af efterforskeren, hans/hendes familiemedlemmer, ansatte og andre afhængige personer
- Manglende evne eller vilje til at give blodprøver og vævsprøver (biopsier)
- Deltagere, der tager oralt antikoagulant eller med blødningsforstyrrelser, som ville have meget højere risiko for blødning efter biopsiprøver, eller som er kontraindiceret til en endoskopisk undersøgelse
- Patienter, der ikke kan give informeret samtykke
- Patienter, der har været under antibiotikabehandling inden for de sidste 4 uger
- Deltagelse i andre kliniske undersøgelser, der forstyrrer undersøgelsesprocedurer
- Potentielle undersøgelsesdeltagere, der ikke ønsker at blive informeret om tilfældige resultater opnået under undersøgelsen (f.eks. under endoskopi eller genetisk analyse), der er relevante for deres helbred og for forebyggelse af sygdomme
Studieplan
Dette afsnit indeholder detaljer om studieplanen, herunder hvordan undersøgelsen er designet, og hvad undersøgelsen måler.
Hvordan er undersøgelsen tilrettelagt?
Design detaljer
Hvad måler undersøgelsen?
Primære resultatmål
Resultatmål |
Foranstaltningsbeskrivelse |
Tidsramme |
|---|---|---|
|
Vurdering af ændringer i den transkriptomiske profil af epitelceller før og efter organoid kultur
Tidsramme: 3 år
|
Vurdering af ændringer i epitelcellers transkriptomiske profil før og efter organoidkultur etableres ved RNA-sekventering og kvantitativ polymerasekædereaktion (qPCR)
|
3 år
|
|
Vurdering af ændringer i epigenomet af epitelceller før og efter organoid kultur
Tidsramme: 3 år
|
Vurdering af ændringer i epigenomet af epitelceller før og efter organoidkultur etableres ved helgenom-bisulfit-sekventering og kromatin-immunpræcipitations-sekventering
|
3 år
|
|
Transkriptomisk og epigenomisk landskab af vært-mikrobiota-interaktion
Tidsramme: 3 år
|
Bestemmelse af virkninger af mikrobielt afledte metabolitter på det transkriptomiske og epigenomiske landskab af menneskelige organoider behandlet med den respektive metabolit
|
3 år
|
|
Vært-mikrobiota interaktion - Vedligeholdelse af stamceller og celledifferentiering
Tidsramme: 3 år
|
Bestemmelse af virkninger af mikrobielt afledte metabolitter på epitelcelledifferentiering og stamcellevedligeholdelse
|
3 år
|
Sekundære resultatmål
Resultatmål |
Foranstaltningsbeskrivelse |
Tidsramme |
|---|---|---|
|
3D-til-2D Transwell System
Tidsramme: 3 år
|
Etablering af en metode til at transformere menneskelig organoid kultur til et 2-dimensionelt trans-brønd-system, som muliggør transportundersøgelser, karakterisering af epithelial integritet og anden downstream-analyse
|
3 år
|
|
Tarm-på-en-chip
Tidsramme: 3 år
|
Anvendelse af 2-dimensionelt trans-brønd-system til en tarm-på-en-chip opsætning i samarbejde med Artorg Center ved Universitetet i Bern
|
3 år
|
Samarbejdspartnere og efterforskere
Det er her, du vil finde personer og organisationer, der er involveret i denne undersøgelse.
Samarbejdspartnere
Efterforskere
- Ledende efterforsker: Stephanie Ganal-Vonarburg, Prof, Inselspital, University Hospital Bern
Publikationer og nyttige links
Den person, der er ansvarlig for at indtaste oplysninger om undersøgelsen, leverer frivilligt disse publikationer. Disse kan handle om alt relateret til undersøgelsen.
Hjælpsomme links
Datoer for undersøgelser
Disse datoer sporer fremskridtene for indsendelser af undersøgelsesrekord og resumeresultater til ClinicalTrials.gov. Studieregistreringer og rapporterede resultater gennemgås af National Library of Medicine (NLM) for at sikre, at de opfylder specifikke kvalitetskontrolstandarder, før de offentliggøres på den offentlige hjemmeside.
Studer store datoer
Studiestart (Faktiske)
31. marts 2022
Primær færdiggørelse (Anslået)
30. marts 2025
Studieafslutning (Anslået)
30. marts 2026
Datoer for studieregistrering
Først indsendt
4. april 2022
Først indsendt, der opfyldte QC-kriterier
4. april 2022
Først opslået (Faktiske)
12. april 2022
Opdateringer af undersøgelsesjournaler
Sidste opdatering sendt (Anslået)
11. december 2024
Sidste opdatering indsendt, der opfyldte kvalitetskontrolkriterier
5. december 2024
Sidst verificeret
1. december 2024
Mere information
Begreber relateret til denne undersøgelse
Nøgleord
Andre undersøgelses-id-numre
- 2021-01865
Lægemiddel- og udstyrsoplysninger, undersøgelsesdokumenter
Studerer et amerikansk FDA-reguleret lægemiddelprodukt
Ingen
Studerer et amerikansk FDA-reguleret enhedsprodukt
Ingen
Disse oplysninger blev hentet direkte fra webstedet clinicaltrials.gov uden ændringer. Hvis du har nogen anmodninger om at ændre, fjerne eller opdatere dine undersøgelsesoplysninger, bedes du kontakte register@clinicaltrials.gov. Så snart en ændring er implementeret på clinicaltrials.gov, vil denne også blive opdateret automatisk på vores hjemmeside .