Denne siden ble automatisk oversatt og nøyaktigheten av oversettelsen er ikke garantert. Vennligst referer til engelsk versjon for en kildetekst.

Bern menneskelig organoid-studie for å studere vert-mikrobe interaksjon (humorg)

5. desember 2024 oppdatert av: Insel Gruppe AG, University Hospital Bern

Etablering av menneskelige organoide linjer som et verktøy for å dissekere molekylære veier for vert-mikrobiota-interaksjoner

Menneskekroppen bor i et komplekst konsortium av forskjellige mikrober som sammen danner mikrobiotaen. Praktisk talt hver overflate av menneskekroppen er kolonisert av en distinkt mikrobiota, og danner komplekse samfunn. Et økende antall forskningsresultater indikerer at endringer i mikrobiotaen kan ha enorme effekter på helsen til verten.

De fleste studier som undersøkte mikrobiotaen ble utført på dyr, da mange intervensjoner og undersøkelser ikke kan utføres på mennesker på grunn av etiske hensyn. Dette reiser spørsmålet om funn fra eksperimentelle studier er translasjonelle og kan være til nytte for pasienter. Det blir spesielt tydelig når man prøver å dissekere molekylære mekanismer som er involvert i dette finjusterte samspillet mellom næringsstoffer, mikrobiotaen og dens vert.

Ved å etablere menneskelige organoide kulturer fra tykktarmen og tynntarmen som kan eksponeres for mikrober og/eller mikrobielle produkter med påfølgende transkriptomisk, epigenetisk og immunologisk analyse, tar etterforskerne sikte på å generere funn med høyt translasjonspotensial med ny innsikt i den komplekse interaksjonen mellom mikrobiota, verten og dens immunsystem.

Studieoversikt

Status

Rekruttering

Forhold

Detaljert beskrivelse

Data innhentet fra deltakere vil bli registrert i databasen Redcap for å sikre dataregistrering av høy kvalitet
Etablering av menneskelige organoide kulturer er standardisert av publiserte protokoller (Pleguezuelos-Manzano et al. 2020)

Studietype

Observasjonsmessig

Registrering (Antatt)

100

Kontakter og plasseringer

Denne delen inneholder kontaktinformasjon for de som utfører studien, og informasjon om hvor denne studien blir utført.

Studiekontakt

Navn: Stephanie Ganal-Vonarburg, Prof. Dr.
Telefonnummer: +41 31 632 59 00
E-post: bauchzentrum@insel.ch

Studer Kontakt Backup

Navn: Sandro Christensen
Telefonnummer: +41 31 684 16 47
E-post: sandro.christensen@unibe.ch

Studiesteder

Sveits
- - Bern, Sveits, 3010
    - Rekruttering
    - Inselspital, University Hospital Bern
    - Ta kontakt med:
      
      Bauchzentrum
      
      Telefonnummer: +41 31 632 59 00
      
      E-post: bauchzentrum@insel.ch
    - Hovedetterforsker:
      
      Stephanie Ganal-Vonarburg, Prof
    - Underetterforsker:
      
      Sandro Christensen, MD

Deltakelseskriterier

Forskere ser etter personer som passer til en bestemt beskrivelse, kalt kvalifikasjonskriterier. Noen eksempler på disse kriteriene er en persons generelle helsetilstand eller tidligere behandlinger.

Kvalifikasjonskriterier

Alder som er kvalifisert for studier

18 år til 80 år (Voksen, Eldre voksen)

Tar imot friske frivillige

Nei

Prøvetakingsmetode

Ikke-sannsynlighetsprøve

Studiepopulasjon

Pasienter som gjennomgår rutinemessig ileo-koloskopi uten tegn til betennelse, dysplasi eller neoplasi i histologi
Pasienter som gjennomgår rutinemessig gastroduodenoskopi uten tegn på betennelse, dysplasi eller neoplasi i histologi

Beskrivelse

Inklusjonskriterier:

Signert informert samtykke
Indikasjon for øvre eller nedre endoskopisk prosedyre
Evne til å forstå og følge studieprosedyrer og forstå informert samtykke
Alder 18-80 år
Negativt resultat av graviditetstest før studieregistrering av kvinnelige studiedeltakere (test vil bli utført før registrering)
BMI mellom 18,5 og 30 kg/m2

Ekskluderingskriterier:

Sykdom som er kjent for å kronisk påvirke tarmmikrobiota, tarmepitel eller tarmassosiert immunsystem, nemlig inflammatorisk tarmsykdom, divertikulitt, mikroskopisk kolitt, levercirrhose, malignitet i fordøyelseskanalen, systemisk sklerose, cøliaki, vanlig-variabel immunsvikt, diabetes mellitus
Medisinering med immundempende midler (f. kortikoider, biologisk terapi)
Nåværende diagnose av en hematologisk lidelse (f. anemi med hemoglobin <7 g/dl, leukemi) eller enhver annen absolutt kontraindikasjon for blodprøvetaking
Kvinner som er gravide
Alvorlig koagulasjonsforstyrrelse, relevant trombocytopeni (<50'000/ul), dobbel blodplatehemming, oral antikoagulasjon (ASS-behandling er mulig)
Kjent eller mistenkt manglende overholdelse, narkotika- eller alkoholmisbruk
Manglende evne til å følge studiens prosedyrer, for eksempel på grunn av språkproblemer, psykiske lidelser, demens osv. hos deltakeren
Tidligere påmelding til nåværende studie
Registrering av etterforskeren, hans/hennes familiemedlemmer, ansatte og andre avhengige personer
Manglende evne eller vilje til å gi blodprøver og vevsprøver (biopsier)
Deltakere som tar oralt antikoagulant eller med blødningsforstyrrelser som vil ha mye høyere risiko for blødning etter biopsiprøver eller som er kontraindisert for en endoskopisk undersøkelse
Pasienter som ikke kan gi informert samtykke
Pasienter som har vært under antibiotikabehandling de siste 4 ukene
Deltakelse i andre kliniske studier som forstyrrer studieprosedyrer
Potensielle studiedeltakere som ikke ønsker å bli informert om tilfeldige resultater oppnådd under studien (f.eks. under endoskopi eller genetisk analyse) som er relevante for deres helse og for forebygging av sykdommer

Studieplan

Denne delen gir detaljer om studieplanen, inkludert hvordan studien er utformet og hva studien måler.

Hvordan er studiet utformet?

Designdetaljer

Hva måler studien?

Primære resultatmål

Resultatmål	Tiltaksbeskrivelse	Tidsramme
Vurdering av endringer i den transkriptomiske profilen til epitelceller før og etter organoid kultur Tidsramme: 3 år	Vurdering av endringer i den transkriptomiske profilen til epitelceller før og etter organoidkultur er etablert ved RNA-sekvensering og kvantitativ polymerasekjedereaksjon (qPCR)	3 år
Vurdering av endringer i epigenomet til epitelceller før og etter organoid kultur Tidsramme: 3 år	Vurdering av endringer i epigenomet til epitelceller før og etter organoidkultur er etablert ved helgenombisulfittsekvensering og kromatinimmunutfellingssekvensering	3 år
Transkriptomisk og epigenomisk landskap av vert-mikrobiota-interaksjon Tidsramme: 3 år	Bestemme effekter av mikrobielt avledede metabolitter på det transkriptomiske og epigenomiske landskapet til menneskelige organoider behandlet med den respektive metabolitten	3 år
Vert-mikrobiota interaksjon - Vedlikehold av stamceller og celledifferensiering Tidsramme: 3 år	Bestemme effekter av mikrobiell-avledede metabolitter på epitelcelledifferensiering og stamcellevedlikehold	3 år

Sekundære resultatmål

Resultatmål	Tiltaksbeskrivelse	Tidsramme
3D-til-2D Transwell System Tidsramme: 3 år	Etablere en metode for å transformere menneskelig organoidkultur til et 2-dimensjonalt trans-brønnsystem som tillater transportstudier, karakterisering av epitelial integritet og annen nedstrømsanalyse	3 år
Gut-on-a-chip Tidsramme: 3 år	Bruk av 2-dimensjonalt trans-brønnsystem på et tarm-på-en-brikke-oppsett i samarbeid med Artorg-senteret ved Universitetet i Bern	3 år

Samarbeidspartnere og etterforskere

Det er her du vil finne personer og organisasjoner som er involvert i denne studien.

Sponsor

Insel Gruppe AG, University Hospital Bern

Samarbeidspartnere

University of Bern

Etterforskere

Hovedetterforsker: Stephanie Ganal-Vonarburg, Prof, Inselspital, University Hospital Bern

Publikasjoner og nyttige lenker

Den som er ansvarlig for å legge inn informasjon om studien leverer frivillig disse publikasjonene. Disse kan handle om alt relatert til studiet.

Generelle publikasjoner

Pleguezuelos-Manzano C, Puschhof J, van den Brink S, Geurts V, Beumer J, Clevers H. Establishment and Culture of Human Intestinal Organoids Derived from Adult Stem Cells. Curr Protoc Immunol. 2020 Sep;130(1):e106. doi: 10.1002/cpim.106.

Hjelpsomme linker

Pleguezuelos-Manzano C et al. 2020

Studierekorddatoer

Disse datoene sporer fremdriften for innsending av studieposter og sammendragsresultater til ClinicalTrials.gov. Studieposter og rapporterte resultater gjennomgås av National Library of Medicine (NLM) for å sikre at de oppfyller spesifikke kvalitetskontrollstandarder før de legges ut på det offentlige nettstedet.

Studer hoveddatoer

Studiestart (Faktiske)

31. mars 2022

Primær fullføring (Antatt)

30. mars 2025

Studiet fullført (Antatt)

30. mars 2026

Datoer for studieregistrering

Først innsendt

4. april 2022

Først innsendt som oppfylte QC-kriteriene