Deze pagina is automatisch vertaald en de nauwkeurigheid van de vertaling kan niet worden gegarandeerd. Raadpleeg de Engelse versie voor een brontekst.

Bern Human Organoid-studie om gastheer-microbe-interactie te bestuderen (humorg)

5 december 2024 bijgewerkt door: Insel Gruppe AG, University Hospital Bern

Vaststelling van menselijke organoïde lijnen als hulpmiddel om moleculaire paden van gastheer-microbiota-interacties te ontleden

Het menselijk lichaam bewoont een complex consortium van verschillende microben die samen de microbiota vormen. Vrijwel elk oppervlak van het menselijk lichaam wordt gekoloniseerd door een afzonderlijke microbiota, die complexe gemeenschappen vormt. Een toenemend aantal onderzoeksresultaten geeft aan dat veranderingen in de microbiota grote gevolgen kunnen hebben voor de gezondheid van de gastheer.

De meeste onderzoeken naar de microbiota zijn uitgevoerd op dieren, aangezien veel interventies en onderzoeken om ethische overwegingen niet op mensen kunnen worden uitgevoerd. Dit roept de vraag op of bevindingen uit experimentele studies translationeel zijn en patiënten ten goede kunnen komen. Dat wordt vooral duidelijk wanneer we proberen de moleculaire mechanismen te ontleden die betrokken zijn bij dit verfijnde samenspel tussen voedingsstoffen, de microbiota en zijn gastheer.

Door het opzetten van menselijke organoïdeculturen uit de dikke en dunne darm die kunnen worden blootgesteld aan microben en/of microbiële producten met daaropvolgende transcriptomische, epigenetische en immunologische analyse, streven de onderzoekers ernaar bevindingen met een hoog translationeel potentieel te genereren met nieuwe inzichten in de complexe interactie van de microbiota, de gastheer en zijn immuunsysteem.

Studie Overzicht

Toestand

Werving

Conditie

Gedetailleerde beschrijving

Gegevens verkregen van deelnemers worden vastgelegd in de database Redcap om een hoogwaardige gegevensregistratie te garanderen
Het opzetten van menselijke organoïde culturen wordt gestandaardiseerd door gepubliceerde protocollen (Pleguezuelos-Manzano et al. 2020)

Studietype

Observationeel

Inschrijving (Geschat)

100

Contacten en locaties

In dit gedeelte vindt u de contactgegevens van degenen die het onderzoek uitvoeren en informatie over waar dit onderzoek wordt uitgevoerd.

Studiecontact

Naam: Stephanie Ganal-Vonarburg, Prof. Dr.
Telefoonnummer: +41 31 632 59 00
E-mail: bauchzentrum@insel.ch

Studie Contact Back-up

Naam: Sandro Christensen
Telefoonnummer: +41 31 684 16 47
E-mail: sandro.christensen@unibe.ch

Studie Locaties

Zwitserland
- - Bern, Zwitserland, 3010
    - Werving
    - Inselspital, University Hospital Bern
    - Contact:
      
      Bauchzentrum
      
      Telefoonnummer: +41 31 632 59 00
      
      E-mail: bauchzentrum@insel.ch
    - Hoofdonderzoeker:
      
      Stephanie Ganal-Vonarburg, Prof
    - Onderonderzoeker:
      
      Sandro Christensen, MD

Deelname Criteria

Onderzoekers zoeken naar mensen die aan een bepaalde beschrijving voldoen, de zogenaamde geschiktheidscriteria. Enkele voorbeelden van deze criteria zijn iemands algemene gezondheidstoestand of eerdere behandelingen.

Geschiktheidscriteria

Leeftijden die in aanmerking komen voor studie

18 jaar tot 80 jaar (Volwassen, Oudere volwassene)

Accepteert gezonde vrijwilligers

Nee

Bemonsteringsmethode

Niet-waarschijnlijkheidssteekproef

Studie Bevolking

Patiënten die routinematige ileocolonoscopie ondergaan zonder tekenen van ontsteking, dysplasie of neoplasie in de histologie
Patiënten die routinematige gastro-duodenoscopie ondergaan zonder tekenen van ontsteking, dysplasie of neoplasie in de histologie

Beschrijving

Inclusiecriteria:

Ondertekende geïnformeerde toestemming
Indicatie voor bovenste of onderste endoscopische procedure
Mogelijkheid om studieprocedures te begrijpen en te volgen en geïnformeerde toestemming te begrijpen
Leeftijd 18-80 jaar
Negatief zwangerschapstestresultaat voorafgaand aan inschrijving van vrouwelijke studiedeelnemers (test zal voorafgaand aan inschrijving worden uitgevoerd)
BMI tussen 18,5 en 30 kg/m2

Uitsluitingscriteria:

Ziekte waarvan bekend is dat deze de darmmicrobiota, het darmepitheel of het met de darm geassocieerde immuunsysteem chronisch aantast, namelijk inflammatoire darmziekte, diverticulitis, microscopische colitis, levercirrose, maligniteit in het spijsverteringskanaal, systemische sclerose, coeliakie, gewone variabele immunodeficiëntie, diabetes mellitus
Medicatie met immunosuppressiva (bijv. corticoïden, biologische therapie)
Actuele diagnose van een hematologische aandoening (bijv. anemie met hemoglobine <7 g/dl, leukemie) of een andere absolute contra-indicatie voor bloedafname
Vrouwen die zwanger zijn
Ernstige stollingsstoornis, relevante trombocytopenie (<50.000/ul), dubbele plaatjesremming, orale antistolling (ASS-therapie is mogelijk)
Bekende of vermoede niet-naleving, drugs- of alcoholmisbruik
Onvermogen om de procedures van het onderzoek te volgen, bijvoorbeeld door taalproblemen, psychische stoornissen, dementie, etc. van de deelnemer
Eerdere inschrijving voor de huidige studie
Inschrijving van de onderzoeker, zijn/haar gezinsleden, werknemers en andere afhankelijke personen
Onvermogen of onwil om bloedmonsters en weefselmonsters (biopten) te verstrekken
Deelnemers die orale anticoagulantia gebruiken of met bloedingsstoornissen die een veel hoger risico op bloedingen zouden hebben na biopsiemonsters of die gecontra-indiceerd zijn voor een endoscopisch onderzoek
Patiënten die geen geïnformeerde toestemming kunnen geven
Patiënten die de afgelopen 4 weken antibiotica hebben gekregen
Deelname aan een andere klinische studie die de studieprocedures verstoort
Potentiële studiedeelnemers die niet geïnformeerd willen worden over willekeurige resultaten die tijdens de studie zijn verkregen (bijv. tijdens endoscopie of genetische analyse) die relevant zijn voor hun gezondheid en voor het voorkomen van ziekten

Studie plan

Dit gedeelte bevat details van het studieplan, inclusief hoe de studie is opgezet en wat de studie meet.

Hoe is de studie opgezet?

Ontwerpdetails

Wat meet het onderzoek?

Primaire uitkomstmaten

Uitkomstmaat	Maatregel Beschrijving	Tijdsspanne
Beoordeling van veranderingen in het transcriptomische profiel van epitheelcellen voor en na organoïdecultuur Tijdsspanne: 3 jaar	Beoordeling van veranderingen in het transcriptomische profiel van epitheelcellen voor en nadat de organoïdecultuur tot stand is gebracht door RNA-sequencing en kwantitatieve polymerasekettingreactie (qPCR)	3 jaar
Beoordeling van veranderingen in het epigenoom van epitheelcellen voor en na organoïdecultuur Tijdsspanne: 3 jaar	Beoordeling van veranderingen in het epigenoom van epitheelcellen voor en nadat de organoïdecultuur tot stand is gebracht door bisulfiet-sequencing van het hele genoom en chromatine-immunoprecipitatie-sequencing	3 jaar
Transcriptomisch en epigenomisch landschap van gastheer-microbiota-interactie Tijdsspanne: 3 jaar	Bepaling van effecten van microbieel afgeleide metabolieten op het transcriptomische en epigenomische landschap van menselijke organoïden behandeld met de respectieve metaboliet	3 jaar
Gastheer-microbiota-interactie - Stamcelonderhoud en celdifferentiatie Tijdsspanne: 3 jaar	Bepaling van effecten van microbieel afgeleide metabolieten op epitheelceldifferentiatie en stamcelonderhoud	3 jaar

Secundaire uitkomstmaten

Uitkomstmaat	Maatregel Beschrijving	Tijdsspanne
3D-naar-2D Transwell-systeem Tijdsspanne: 3 jaar	Een methode opzetten om de menselijke organoïde cultuur om te zetten in een tweedimensionaal trans-well-systeem dat transportstudies, karakterisering van epitheliale integriteit en andere stroomafwaartse analyses mogelijk maakt	3 jaar
Gut-op-een-chip Tijdsspanne: 3 jaar	Toepassing van een tweedimensionaal trans-well-systeem op een gut-on-a-chip-opstelling in samenwerking met het Artorg Center van de Universiteit van Bern	3 jaar

Medewerkers en onderzoekers

Hier vindt u mensen en organisaties die betrokken zijn bij dit onderzoek.

Sponsor

Insel Gruppe AG, University Hospital Bern

Medewerkers

University of Bern

Onderzoekers

Hoofdonderzoeker: Stephanie Ganal-Vonarburg, Prof, Inselspital, University Hospital Bern

Publicaties en nuttige links

De persoon die verantwoordelijk is voor het invoeren van informatie over het onderzoek stelt deze publicaties vrijwillig ter beschikking. Dit kan gaan over alles wat met het onderzoek te maken heeft.

Algemene publicaties

Pleguezuelos-Manzano C, Puschhof J, van den Brink S, Geurts V, Beumer J, Clevers H. Establishment and Culture of Human Intestinal Organoids Derived from Adult Stem Cells. Curr Protoc Immunol. 2020 Sep;130(1):e106. doi: 10.1002/cpim.106.

Nuttige links

Pleguezuelos-Manzano C et al. 2020

Studie record data

Deze datums volgen de voortgang van het onderzoeksdossier en de samenvatting van de ingediende resultaten bij ClinicalTrials.gov. Studieverslagen en gerapporteerde resultaten worden beoordeeld door de National Library of Medicine (NLM) om er zeker van te zijn dat ze voldoen aan specifieke kwaliteitscontrolenormen voordat ze op de openbare website worden geplaatst.

Bestudeer belangrijke data

Studie start (Werkelijk)

31 maart 2022

Primaire voltooiing (Geschat)

30 maart 2025

Studie voltooiing (Geschat)

30 maart 2026

Studieregistratiedata

Eerst ingediend

4 april 2022

Eerst ingediend dat voldeed aan de QC-criteria