Pohotovostní PWAS u respiračních infekčních nemocí
7. května 2026 aktualizováno: Prof. Timothy Hudson RAINER, The University of Hong Kong
Nouzová PanorOmic Wide Association Study in Respiratory Infectious Disease (ePWAS-RID)
Vypracujte nouzovou studii PanorOmics Wide Association Study (ePWAS) pro časnou, rychlou biologickou a patofyziologickou charakterizaci známých a nových infekčních onemocnění u dospělých pacientů přicházejících na pohotovostní oddělení s podezřením na akutní, komunitně získané respirační infekční onemocnění (scaRID).
Fáze 1
- Vyvinout biobanku ED-ID (pojmenovanou ePWAS-RID). Fáze 2
- Cílený výzkum pro objev nové diagnostiky, prognostiky a terapeutik
Přehled studie
Postavení
Nábor
Podmínky
Intervence / Léčba
Detailní popis
Úvod
Pandemická připravenost
Pandemie COVID-19 zasáhla přes 220 milionů lidí, vyžádala si přes 450 000 životů a vyvolala různé reakce po celém světě. Zpoždění při získávání kvalitního klinického a vědeckého materiálu o přenositelnosti, klinické povaze, výsledcích a úmrtnosti nových a známých infekčních nemocí (ID) se promítá do neefektivnosti zdravotní péče, společenského a ekonomického stresu a zvýšené nemocnosti a úmrtnosti. Regiony s větší úspěšností v boji proti COVID-19 byly před pandemií dobře připraveny.
Patogeny
Patogeny, které s největší pravděpodobností způsobí každoroční epidemie a pandemie, jsou respirační viry. V Asii tvoří virové infekce 30–40 % případů sepse. Každý rok je 100 milionů případů virové komunitní pneumonie (CAP), z nichž 60 % progreduje do sepse. Tyto viry způsobují hostitelem zprostředkované zánětlivé imunitní reakce, které probíhají třemi fázemi: předběžně regulovaný zánět; střední dysregulovaný prozánět; a pozdní dysregulovaný hypozánět.
Klinické spektrum
RID je heterogenní populace pacientů. Toto komplexní spektrum heterogenity se rozprostírá v základní molekulární biologii a patofyziologii od genomu k fenomu. Zahrnuje významné individuální variace v regulovaných a dysregulovaných systémových zánětlivých reakcích hostitele na infekci v přítomnosti a nepřítomnosti orgánové dysfunkce. Kritické onemocnění z jakéhokoli ID zahrnuje jak vnímavost hostitele k patogenu, tak sklon hostitele k rozvoji dysregulovaného zánětu a selhání orgánů (např. zánět plic a/nebo akutní poškození ledvin).
PanorOmics-Wide Association Association
Během pěti let před pandemií COVID-19 britská studie Genetics Of Mortality In Critical Care (GenOMICC) rekrutovala pacienty se spektrem syndromů kritických onemocnění (např. chřipka, sepse a nově se objevující infekce), abychom lépe porozuměli mechanismům hostitele, které vedou k život ohrožujícím výsledkům. Výsledkem bylo, že vyšetřovatelé GenOMICC spolu se spolupracovníky ze Španělska a Itálie měli dobrou pozici k provádění studií genomické asociace na kriticky nemocných pacientech s COVID-19 a k vydávání doporučení pro budoucí studie.
Integrovaný panorOmics přístup má potenciál odhalit kauzální asociace a vazby napříč celým spektrem hostitelské biologie včetně genomiky, epigenomiky, transkriptomiky, proteomiky, metabolomiky a lipidomiky až po klinický fenotyp. PanorOmics jako disciplína však čelí stejným výzvám jako celogenomové asociační studie (GWAS), jen více. Ačkoli GWAS korelují genomové lokusy s komplexními podpisy a znaky, účinné detekci brání falešné pozitivity, nerovnováha ve vazbě a vysoké náklady. Skutečné kauzální variace a skutečné základní asociace vyžadují více filtrů, pokud mají být detekovány.
Výzkumníci navrhují vyvinout systém dynamických studií založených na ED na vzorcích krve a slin odebraných pacientům v rané fázi ID. Rané stadium označuje proces v cestě pacienta, který předchází většině náboru pacientů v jiných studiích, např. na odděleních nebo na JIP. Dva primární cíle jsou a) vyvinout biobanku ED-ID; a b) provést předběžný objev a cílený výzkum pro objev nové diagnostiky, prognostiky a terapeutik.
Vyšetřovatelé definují rané multiOmics signatury RID a identifikují vztahy se známými a novými ID. Bylo publikováno jen málo studií o integrované panoromice COVID-19 a jen málo, pokud vůbec nějaké, se zabývá ranými fázemi onemocnění nebo odlišujícími rysy ve srovnání s jinými respiračními onemocněními.
Jaké panoramatické znaky odlišují nízké riziko od vysokého rizika ve srovnání s porovnáním dospělých pacientů se scaRID, kteří navštěvují ED, ve stratifikovaných případech a kontrolách u dospělých pacientů se scaRID v rámci 30denní škály klinické progrese WHO (WHO-CPS)?
Pro účely této studie je scaRID definován jako:
- horečka nebo teplota > 37,5 °C; A
Jeden nebo více relevantních příznaků:
- respirační příznaky (např. kašel, dušnost), NEBO
- systémové příznaky (např. zimnice, ztuhlost, myalgie), NEBO
- gastrointestinální příznaky (např. nevolnost, zvracení, průjem); A
- Žádná zjevná alternativní příčina (viz kritéria vyloučení).
PanorOmic asociace budou odvozeny z tekutých bioptických vzorků, včetně plné krve, plazmy, séra, pelety bílých krvinek, odtoku červených krvinek, slinného supernatantu a slinných buněk. Biomarkery tekuté biopsie zahrnují genomický, transkriptomický, proteomický, metabolomický, lipidomický a hematologický obsah.
Hypotéza Vyšetřovatelé předpokládají, že u dospělých pacientů s odpovídajícím sklonem s RID specifickou pro patogen a onemocnění (např. SARS-CoV-2, chřipka A) existují významné rozdíly v panoramatických signaturách, které vymezují vnímavost hostitele a reakci hostitele na mírné až závažné onemocnění.
Cíle
Účelem tohoto návrhu je vyvinout nouzovou biobanku PanorOmics Wide Association Study (ePWAS) pro časnou, rychlou biologickou a patofyziologickou charakterizaci scaRID. Přesněji řečeno, u dospělých pacientů s ED se scaRID a do 10 dnů od nástupu příznaků se zaměřujeme na:
- Vyvinout biobanku ED-ePWAS-RID vzorků krve a slin
- Využít tuto databanku pro explorativní a cílený výzkum při hledání diagnostických a prognostických markerů a porozumět základním mechanismům onemocnění
Cíle biobanky a úložiště ePWAS-RID jsou:
- vyvinout infrastrukturu pro udržitelnou biobanku založenou na ED vzorků krve a slin odpovídajících klinickým fenotypům a kritickým výsledkům.
- vyvinout úložiště podle mezinárodních standardů, čímž se minimalizuje heterogenita a materiál bude vhodný pro mezinárodní výzkumné rámce, jejichž cílem je usnadnit přístup k lidským biologickým materiálům.
- připravit úložiště pro předběžný objev nových diagnostických, prognostických a terapeutických markerů.
- usnadnit cílený výzkum patogeneze respiračních infekcí, citlivosti hostitele a reakce hostitele.
- odvodit platformy biomarkerů modelů tréninkových sad pro včasnou detekci RID, diferenciaci patogenů, monitorování, stratifikaci rizika a prognózu; a ověřit tyto modely pomocí nezávislých a externích souborů dat.
Typ studie
Pozorovací
Zápis (Odhadovaný)
2000
Kontakty a umístění
Tato část poskytuje kontaktní údaje pro ty, kteří studii provádějí, a informace o tom, kde se tato studie provádí.
Studijní kontakt
- Jméno: Timothy H Rainer, MD
- Telefonní číslo: +852 39176846
- E-mail: thrainer@hku.hk
Studijní místa
-
-
-
Hong Kong, Čína
- Nábor
- Hong Kong University
-
Kontakt:
- Timothy H Rainer, MD
- Telefonní číslo: 852 39176846
- E-mail: thrainer@hku.hk
-
-
Kritéria účasti
Výzkumníci hledají lidi, kteří odpovídají určitému popisu, kterému se říká kritéria způsobilosti. Některé příklady těchto kritérií jsou celkový zdravotní stav osoby nebo předchozí léčba.
Kritéria způsobilosti
Věk způsobilý ke studiu
18 let až 100 let (Dospělý, Starší dospělý)
Přijímá zdravé dobrovolníky
Ano
Metoda odběru vzorků
Vzorek nepravděpodobnosti
Studijní populace
Podezření na akutní, komunitně získané, respirační, infekční onemocnění projevující se na pohotovosti s nástupem symptomů < 8 dní a hlášenou horečkou nebo zimnicí nebo ušní teplotou > 37,5 °C
Popis
Kritéria pro zařazení:
Mezi pacienty způsobilé k zápisu patří:
S odkazem na předchozí kritéria pro zařazení jsou:
- Dospělí ≥18 let; A
- Podezření na akutní, komunitní, respirační, infekční onemocnění (scaRID)*; A
- Informovaný souhlas.
Poznámka: scaRID je definován podle VŠECH tří kritérií:
- Získaná komunita (není hospitalizována po dobu <28 dnů); A
- Akutní infekce (definovaná jako nástup příznaků < 8 dní a jakákoliv JEDNA hlášená horečka nebo zimnice nebo ušní teplota > 37,5 °C nebo hypotermie nebo leukocytóza nebo leukopenie nebo nový změněný duševní stav); A
Pravděpodobná infekce dýchacích cest – podle kteréhokoli z:
- nový kašel nebo nová tvorba sputa popř
- bolest na hrudi popř
- dyspnoe nebo
- tachypnoe nebo
- abnormální vyšetření plic popř
- respirační selhání; nebo
- úsudek lékaře (s projevy systémových nebo gastrointestinálních symptomů).
Kontrolní předměty budou losovány ze dvou skupin:
- Znepokojení dobře dospělí pacienti s národním skóre včasného varování (NEWS) <3 a teplotou <37,5 °C.
- Příbuzní nebo doprovázející přátelé bez akutního onemocnění.
Kritéria vyloučení:
- Odmítnutí souhlasu;
- Nedávná hospitalizace (<28 dní);
- Zařazen do jiné klinické studie
- celulitida;
- Kožní nebo ortopedické infekce;
- Infekce močových cest;
- Akutní břišní sepse;
- Pohlavně přenosná nemoc;
- infekce virem lidské imunodeficience (HIV);
- Imunokompromitovaná/potenciální neutropenická horečka;
- Transplantace pevných orgánů nebo hematopoetických kmenových buněk během předchozích 90 dnů;
- aktivní reakce štěpu proti hostiteli nebo bronchiolitis obliterans;
- Závažná cestovatelská nemoc vyžadující naléhavou hospitalizaci a léčbu, včetně malárie, horečky dengue, tyfu a dalších rickettsiových chorob;
- Mrtvice;
- tooxidrom;
- Neorganická akutní psychóza.
Studijní plán
Tato část poskytuje podrobnosti o studijním plánu, včetně toho, jak je studie navržena a co studie měří.
Jak je studie koncipována?
Detaily designu
Kohorty a intervence
Skupina / kohorta |
Intervence / Léčba |
|---|---|
|
Virová infekce
Subjektům s virovou infekcí projevující se do 8 dnů od nástupu příznaků bude odebrána alespoň jedna plná krev a sliny a) na pohotovosti (pokud je k dispozici) nebo v nemocnici do 8 dnů od nástupu příznaků; a pokud souhlasí
|
Tři vzorky periferní krve 10 - 20 ml (pokud jsou k dispozici) Tři vzorky slin o objemu 1 - 5 ml (pokud jsou k dispozici)
|
|
Bakteriální infekce
Subjektům s bakteriální infekcí, která se objeví do 8 dnů od nástupu příznaků, bude odebrána alespoň jedna plná krev a sliny a) na pohotovosti (pokud je k dispozici) nebo v nemocnici do 8 dnů od nástupu příznaků; a pokud souhlasí, další dva vzorky v b) 24 hodin +/- 6 hodin od nástupu příznaků (pokud jsou k dispozici); a c) 48 hodin +/- 6 hodin od nástupu příznaků (pokud jsou k dispozici).
|
Tři vzorky periferní krve 10 - 20 ml (pokud jsou k dispozici) Tři vzorky slin o objemu 1 - 5 ml (pokud jsou k dispozici)
|
|
Virová-virová koinfekce
Pacientům s virovou koinfekcí, která se objeví do 8 dnů od nástupu příznaků, bude odebrána alespoň jedna plná krev a sliny a) na pohotovosti (pokud je k dispozici) nebo v nemocnici do 8 dnů od nástupu příznaků; a pokud souhlasí, další dva vzorky v b) 24 hodin +/- 6 hodin od nástupu příznaků (pokud jsou k dispozici); a c) 48 hodin +/- 6 hodin od nástupu příznaků (pokud jsou k dispozici).
|
Tři vzorky periferní krve 10 - 20 ml (pokud jsou k dispozici) Tři vzorky slin o objemu 1 - 5 ml (pokud jsou k dispozici)
|
|
Bakteriálně-virová koinfekce
Subjektům s bakteriální a virovou koinfekcí, která se objeví do 8 dnů od nástupu příznaků, bude odebrána alespoň jedna plná krev a sliny a) na pohotovosti (pokud je k dispozici) nebo v nemocnici do 8 dnů od nástupu příznaků; a pokud souhlasí, další dva vzorky v b) 24 hodin +/- 6 hodin od nástupu příznaků (pokud jsou k dispozici); a c) 48 hodin +/- 6 hodin od nástupu příznaků (pokud jsou k dispozici).
|
Tři vzorky periferní krve 10 - 20 ml (pokud jsou k dispozici) Tři vzorky slin o objemu 1 - 5 ml (pokud jsou k dispozici)
|
|
Koinfekce plísní a Mycobacterium
Subjektům s bakteriální a virovou koinfekcí, která se objeví do 8 dnů od nástupu příznaků, bude odebrána alespoň jedna plná krev a sliny a) na pohotovosti (pokud je k dispozici) nebo v nemocnici do 8 dnů od nástupu příznaků; a pokud souhlasí, další dva vzorky v b) 24 hodin +/- 6 hodin od nástupu příznaků (pokud jsou k dispozici); a c) 48 hodin +/- 6 hodin od nástupu příznaků (pokud jsou k dispozici).
|
Tři vzorky periferní krve 10 - 20 ml (pokud jsou k dispozici) Tři vzorky slin o objemu 1 - 5 ml (pokud jsou k dispozici)
|
|
Infekce nejistého původu
Subjektům s infekcí nejistého původu, která se objeví do 8 dnů od nástupu příznaků, bude odebrána alespoň jedna plná krev a sliny a) na pohotovosti (pokud je k dispozici) nebo v nemocnici do 8 dnů od nástupu příznaků; a pokud souhlasí, další dva vzorky v b) 24 hodin +/- 6 hodin od nástupu příznaků (pokud jsou k dispozici); a c) 48 hodin +/- 6 hodin od nástupu příznaků (pokud jsou k dispozici).
|
Tři vzorky periferní krve 10 - 20 ml (pokud jsou k dispozici) Tři vzorky slin o objemu 1 - 5 ml (pokud jsou k dispozici)
|
|
Kontrolní předměty
Subjektům kontrolní skupiny, pokud souhlasí, bude odebrána alespoň jedna plná krev a sliny a) na pohotovostním oddělení (pokud je k dispozici) nebo v nemocnici do 8 dnů od nástupu příznaků (pokud je to vhodné); a pokud souhlasí, další dva vzorky v b) 24 hodin +/- 6 hodin od nástupu příznaků (pokud je to vhodné); a c) 48 hodin +/- 6 hodin od nástupu příznaků (pokud jsou použitelné).
|
Tři vzorky periferní krve 10 - 20 ml (pokud jsou k dispozici) Tři vzorky slin o objemu 1 - 5 ml (pokud jsou k dispozici)
|
Co je měření studie?
Primární výstupní opatření
Měření výsledku |
Popis opatření |
Časové okno |
|---|---|---|
|
WHO-CPS
Časové okno: Až 30 dní
|
Odlišení WHO-CPS >6 od WHO-CPS ≤6
|
Až 30 dní
|
Sekundární výstupní opatření
Měření výsledku |
Popis opatření |
Časové okno |
|---|---|---|
|
Úmrtnost
Časové okno: Až 30 dní
|
Úmrtnost je definována jako všechny příčiny, binární: Ano nebo Ne
|
Až 30 dní
|
|
Úmrtnost
Časové okno: jeden rok
|
Úmrtnost je definována jako všechny příčiny, binární: Ano nebo Ne
|
jeden rok
|
Spolupracovníci a vyšetřovatelé
Zde najdete lidi a organizace zapojené do této studie.
Sponzor
Vyšetřovatelé
- Vrchní vyšetřovatel: Timothy H Rainer, MD, The University of Hong Kong
Publikace a užitečné odkazy
Osoba odpovědná za zadávání informací o studiu tyto publikace poskytuje dobrovolně. Mohou se týkat čehokoli, co souvisí se studiem.
Obecné publikace
- Singer M, Deutschman CS, Seymour CW, Shankar-Hari M, Annane D, Bauer M, Bellomo R, Bernard GR, Chiche JD, Coopersmith CM, Hotchkiss RS, Levy MM, Marshall JC, Martin GS, Opal SM, Rubenfeld GD, van der Poll T, Vincent JL, Angus DC. The Third International Consensus Definitions for Sepsis and Septic Shock (Sepsis-3). JAMA. 2016 Feb 23;315(8):801-10. doi: 10.1001/jama.2016.0287.
- Li Q, Guan X, Wu P, Wang X, Zhou L, Tong Y, Ren R, Leung KSM, Lau EHY, Wong JY, Xing X, Xiang N, Wu Y, Li C, Chen Q, Li D, Liu T, Zhao J, Liu M, Tu W, Chen C, Jin L, Yang R, Wang Q, Zhou S, Wang R, Liu H, Luo Y, Liu Y, Shao G, Li H, Tao Z, Yang Y, Deng Z, Liu B, Ma Z, Zhang Y, Shi G, Lam TTY, Wu JT, Gao GF, Cowling BJ, Yang B, Leung GM, Feng Z. Early Transmission Dynamics in Wuhan, China, of Novel Coronavirus-Infected Pneumonia. N Engl J Med. 2020 Mar 26;382(13):1199-1207. doi: 10.1056/NEJMoa2001316. Epub 2020 Jan 29.
- Hung IF, Lung KC, Tso EY, Liu R, Chung TW, Chu MY, Ng YY, Lo J, Chan J, Tam AR, Shum HP, Chan V, Wu AK, Sin KM, Leung WS, Law WL, Lung DC, Sin S, Yeung P, Yip CC, Zhang RR, Fung AY, Yan EY, Leung KH, Ip JD, Chu AW, Chan WM, Ng AC, Lee R, Fung K, Yeung A, Wu TC, Chan JW, Yan WW, Chan WM, Chan JF, Lie AK, Tsang OT, Cheng VC, Que TL, Lau CS, Chan KH, To KK, Yuen KY. Triple combination of interferon beta-1b, lopinavir-ritonavir, and ribavirin in the treatment of patients admitted to hospital with COVID-19: an open-label, randomised, phase 2 trial. Lancet. 2020 May 30;395(10238):1695-1704. doi: 10.1016/S0140-6736(20)31042-4. Epub 2020 May 10.
- Cohen JF, Korevaar DA, Altman DG, Bruns DE, Gatsonis CA, Hooft L, Irwig L, Levine D, Reitsma JB, de Vet HC, Bossuyt PM. STARD 2015 guidelines for reporting diagnostic accuracy studies: explanation and elaboration. BMJ Open. 2016 Nov 14;6(11):e012799. doi: 10.1136/bmjopen-2016-012799.
- Taylor JC, Martin HC, Lise S, Broxholme J, Cazier JB, Rimmer A, Kanapin A, Lunter G, Fiddy S, Allan C, Aricescu AR, Attar M, Babbs C, Becq J, Beeson D, Bento C, Bignell P, Blair E, Buckle VJ, Bull K, Cais O, Cario H, Chapel H, Copley RR, Cornall R, Craft J, Dahan K, Davenport EE, Dendrou C, Devuyst O, Fenwick AL, Flint J, Fugger L, Gilbert RD, Goriely A, Green A, Greger IH, Grocock R, Gruszczyk AV, Hastings R, Hatton E, Higgs D, Hill A, Holmes C, Howard M, Hughes L, Humburg P, Johnson D, Karpe F, Kingsbury Z, Kini U, Knight JC, Krohn J, Lamble S, Langman C, Lonie L, Luck J, McCarthy D, McGowan SJ, McMullin MF, Miller KA, Murray L, Nemeth AH, Nesbit MA, Nutt D, Ormondroyd E, Oturai AB, Pagnamenta A, Patel SY, Percy M, Petousi N, Piazza P, Piret SE, Polanco-Echeverry G, Popitsch N, Powrie F, Pugh C, Quek L, Robbins PA, Robson K, Russo A, Sahgal N, van Schouwenburg PA, Schuh A, Silverman E, Simmons A, Sorensen PS, Sweeney E, Taylor J, Thakker RV, Tomlinson I, Trebes A, Twigg SR, Uhlig HH, Vyas P, Vyse T, Wall SA, Watkins H, Whyte MP, Witty L, Wright B, Yau C, Buck D, Humphray S, Ratcliffe PJ, Bell JI, Wilkie AO, Bentley D, Donnelly P, McVean G. Factors influencing success of clinical genome sequencing across a broad spectrum of disorders. Nat Genet. 2015 Jul;47(7):717-726. doi: 10.1038/ng.3304. Epub 2015 May 18.
- Niederman MS, Mandell LA, Anzueto A, Bass JB, Broughton WA, Campbell GD, Dean N, File T, Fine MJ, Gross PA, Martinez F, Marrie TJ, Plouffe JF, Ramirez J, Sarosi GA, Torres A, Wilson R, Yu VL; American Thoracic Society. Guidelines for the management of adults with community-acquired pneumonia. Diagnosis, assessment of severity, antimicrobial therapy, and prevention. Am J Respir Crit Care Med. 2001 Jun;163(7):1730-54. doi: 10.1164/ajrccm.163.7.at1010. No abstract available.
- Jain S, Self WH, Wunderink RG, Fakhran S, Balk R, Bramley AM, Reed C, Grijalva CG, Anderson EJ, Courtney DM, Chappell JD, Qi C, Hart EM, Carroll F, Trabue C, Donnelly HK, Williams DJ, Zhu Y, Arnold SR, Ampofo K, Waterer GW, Levine M, Lindstrom S, Winchell JM, Katz JM, Erdman D, Schneider E, Hicks LA, McCullers JA, Pavia AT, Edwards KM, Finelli L; CDC EPIC Study Team. Community-Acquired Pneumonia Requiring Hospitalization among U.S. Adults. N Engl J Med. 2015 Jul 30;373(5):415-27. doi: 10.1056/NEJMoa1500245. Epub 2015 Jul 14.
- Davenport EE, Burnham KL, Radhakrishnan J, Humburg P, Hutton P, Mills TC, Rautanen A, Gordon AC, Garrard C, Hill AV, Hinds CJ, Knight JC. Genomic landscape of the individual host response and outcomes in sepsis: a prospective cohort study. Lancet Respir Med. 2016 Apr;4(4):259-71. doi: 10.1016/S2213-2600(16)00046-1. Epub 2016 Feb 23.
- Williamson EJ, Walker AJ, Bhaskaran K, Bacon S, Bates C, Morton CE, Curtis HJ, Mehrkar A, Evans D, Inglesby P, Cockburn J, McDonald HI, MacKenna B, Tomlinson L, Douglas IJ, Rentsch CT, Mathur R, Wong AYS, Grieve R, Harrison D, Forbes H, Schultze A, Croker R, Parry J, Hester F, Harper S, Perera R, Evans SJW, Smeeth L, Goldacre B. Factors associated with COVID-19-related death using OpenSAFELY. Nature. 2020 Aug;584(7821):430-436. doi: 10.1038/s41586-020-2521-4. Epub 2020 Jul 8.
- Sharfstein JM, Becker SJ, Mello MM. Diagnostic Testing for the Novel Coronavirus. JAMA. 2020 Apr 21;323(15):1437-1438. doi: 10.1001/jama.2020.3864. No abstract available.
- Leung K, Wu JT, Liu D, Leung GM. First-wave COVID-19 transmissibility and severity in China outside Hubei after control measures, and second-wave scenario planning: a modelling impact assessment. Lancet. 2020 Apr 25;395(10233):1382-1393. doi: 10.1016/S0140-6736(20)30746-7. Epub 2020 Apr 8.
- Pairo-Castineira E, Clohisey S, Klaric L, Bretherick AD, Rawlik K, Pasko D, Walker S, Parkinson N, Fourman MH, Russell CD, Furniss J, Richmond A, Gountouna E, Wrobel N, Harrison D, Wang B, Wu Y, Meynert A, Griffiths F, Oosthuyzen W, Kousathanas A, Moutsianas L, Yang Z, Zhai R, Zheng C, Grimes G, Beale R, Millar J, Shih B, Keating S, Zechner M, Haley C, Porteous DJ, Hayward C, Yang J, Knight J, Summers C, Shankar-Hari M, Klenerman P, Turtle L, Ho A, Moore SC, Hinds C, Horby P, Nichol A, Maslove D, Ling L, McAuley D, Montgomery H, Walsh T, Pereira AC, Renieri A; GenOMICC Investigators; ISARIC4C Investigators; COVID-19 Human Genetics Initiative; 23andMe Investigators; BRACOVID Investigators; Gen-COVID Investigators; Shen X, Ponting CP, Fawkes A, Tenesa A, Caulfield M, Scott R, Rowan K, Murphy L, Openshaw PJM, Semple MG, Law A, Vitart V, Wilson JF, Baillie JK. Genetic mechanisms of critical illness in COVID-19. Nature. 2021 Mar;591(7848):92-98. doi: 10.1038/s41586-020-03065-y. Epub 2020 Dec 11.
- Legido-Quigley H, Asgari N, Teo YY, Leung GM, Oshitani H, Fukuda K, Cook AR, Hsu LY, Shibuya K, Heymann D. Are high-performing health systems resilient against the COVID-19 epidemic? Lancet. 2020 Mar 14;395(10227):848-850. doi: 10.1016/S0140-6736(20)30551-1. Epub 2020 Mar 6. No abstract available.
- Lam TT, Jia N, Zhang YW, Shum MH, Jiang JF, Zhu HC, Tong YG, Shi YX, Ni XB, Liao YS, Li WJ, Jiang BG, Wei W, Yuan TT, Zheng K, Cui XM, Li J, Pei GQ, Qiang X, Cheung WY, Li LF, Sun FF, Qin S, Huang JC, Leung GM, Holmes EC, Hu YL, Guan Y, Cao WC. Identifying SARS-CoV-2-related coronaviruses in Malayan pangolins. Nature. 2020 Jul;583(7815):282-285. doi: 10.1038/s41586-020-2169-0. Epub 2020 Mar 26.
- Tsang KW, Ho PL, Ooi GC, Yee WK, Wang T, Chan-Yeung M, Lam WK, Seto WH, Yam LY, Cheung TM, Wong PC, Lam B, Ip MS, Chan J, Yuen KY, Lai KN. A cluster of cases of severe acute respiratory syndrome in Hong Kong. N Engl J Med. 2003 May 15;348(20):1977-85. doi: 10.1056/NEJMoa030666. Epub 2003 Mar 31.
- Wai AKC, Wong CKH, Wong JYH, Xiong X, Chu OCK, Wong MS, Tsui MSH, Rainer TH. Changes in Emergency Department Visits, Diagnostic Groups, and 28-Day Mortality Associated With the COVID-19 Pandemic: A Territory-Wide, Retrospective, Cohort Study. Ann Emerg Med. 2022 Feb;79(2):148-157. doi: 10.1016/j.annemergmed.2021.09.424. Epub 2021 Sep 24.
- Southeast Asia Infectious Disease Clinical Research Network. Causes and outcomes of sepsis in southeast Asia: a multinational multicentre cross-sectional study. Lancet Glob Health. 2017 Feb;5(2):e157-e167. doi: 10.1016/S2214-109X(17)30007-4.
- Gu X, Zhou F, Wang Y, Fan G, Cao B. Respiratory viral sepsis: epidemiology, pathophysiology, diagnosis and treatment. Eur Respir Rev. 2020 Jul 21;29(157):200038. doi: 10.1183/16000617.0038-2020. Print 2020 Sep 30.
- Su Y, Chen D, Yuan D, Lausted C, Choi J, Dai CL, Voillet V, Duvvuri VR, Scherler K, Troisch P, Baloni P, Qin G, Smith B, Kornilov SA, Rostomily C, Xu A, Li J, Dong S, Rothchild A, Zhou J, Murray K, Edmark R, Hong S, Heath JE, Earls J, Zhang R, Xie J, Li S, Roper R, Jones L, Zhou Y, Rowen L, Liu R, Mackay S, O'Mahony DS, Dale CR, Wallick JA, Algren HA, Zager MA; ISB-Swedish COVID19 Biobanking Unit; Wei W, Price ND, Huang S, Subramanian N, Wang K, Magis AT, Hadlock JJ, Hood L, Aderem A, Bluestone JA, Lanier LL, Greenberg PD, Gottardo R, Davis MM, Goldman JD, Heath JR. Multi-Omics Resolves a Sharp Disease-State Shift between Mild and Moderate COVID-19. Cell. 2020 Dec 10;183(6):1479-1495.e20. doi: 10.1016/j.cell.2020.10.037. Epub 2020 Oct 28.
- Rautanen A, Mills TC, Gordon AC, Hutton P, Steffens M, Nuamah R, Chiche JD, Parks T, Chapman SJ, Davenport EE, Elliott KS, Bion J, Lichtner P, Meitinger T, Wienker TF, Caulfield MJ, Mein C, Bloos F, Bobek I, Cotogni P, Sramek V, Sarapuu S, Kobilay M, Ranieri VM, Rello J, Sirgo G, Weiss YG, Russwurm S, Schneider EM, Reinhart K, Holloway PA, Knight JC, Garrard CS, Russell JA, Walley KR, Stuber F, Hill AV, Hinds CJ; ESICM/ECCRN GenOSept Investigators. Genome-wide association study of survival from sepsis due to pneumonia: an observational cohort study. Lancet Respir Med. 2015 Jan;3(1):53-60. doi: 10.1016/S2213-2600(14)70290-5. Epub 2014 Dec 18.
- Davenport EE, Antrobus RD, Lillie PJ, Gilbert S, Knight JC. Transcriptomic profiling facilitates classification of response to influenza challenge. J Mol Med (Berl). 2015 Jan;93(1):105-14. doi: 10.1007/s00109-014-1212-8. Epub 2014 Oct 28.
- To KKW, Lu L, Fong CHY, Wu AKL, Mok KY, Yip CCY, Ke YH, Sze KH, Lau SKP, Hung IFN, Yuen KY. Rhinovirus respiratory tract infection in hospitalized adult patients is associated with TH2 response irrespective of asthma. J Infect. 2018 May;76(5):465-474. doi: 10.1016/j.jinf.2018.02.005. Epub 2018 Feb 15.
- Khaliq W, Grossmann P, Neugebauer S, Kleyman A, Domizi R, Calcinaro S, Brealey D, Graler M, Kiehntopf M, Schauble S, Singer M, Panagiotou G, Bauer M. Lipid metabolic signatures deviate in sepsis survivors compared to non-survivors. Comput Struct Biotechnol J. 2020 Nov 21;18:3678-3691. doi: 10.1016/j.csbj.2020.11.009. eCollection 2020.
- Wainberg M, Sinnott-Armstrong N, Mancuso N, Barbeira AN, Knowles DA, Golan D, Ermel R, Ruusalepp A, Quertermous T, Hao K, Bjorkegren JLM, Im HK, Pasaniuc B, Rivas MA, Kundaje A. Opportunities and challenges for transcriptome-wide association studies. Nat Genet. 2019 Apr;51(4):592-599. doi: 10.1038/s41588-019-0385-z. Epub 2019 Mar 29.
- GTEx Consortium. Human genomics. The Genotype-Tissue Expression (GTEx) pilot analysis: multitissue gene regulation in humans. Science. 2015 May 8;348(6235):648-60. doi: 10.1126/science.1262110. Epub 2015 May 7.
- Tam V, Patel N, Turcotte M, Bosse Y, Pare G, Meyre D. Benefits and limitations of genome-wide association studies. Nat Rev Genet. 2019 Aug;20(8):467-484. doi: 10.1038/s41576-019-0127-1.
- Howey R, Shin SY, Relton C, Davey Smith G, Cordell HJ. Bayesian network analysis incorporating genetic anchors complements conventional Mendelian randomization approaches for exploratory analysis of causal relationships in complex data. PLoS Genet. 2020 Mar 2;16(3):e1008198. doi: 10.1371/journal.pgen.1008198. eCollection 2020 Mar.
- Davies NM, Holmes MV, Davey Smith G. Reading Mendelian randomisation studies: a guide, glossary, and checklist for clinicians. BMJ. 2018 Jul 12;362:k601. doi: 10.1136/bmj.k601.
- Roadmap Epigenomics Consortium; Kundaje A, Meuleman W, Ernst J, Bilenky M, Yen A, Heravi-Moussavi A, Kheradpour P, Zhang Z, Wang J, Ziller MJ, Amin V, Whitaker JW, Schultz MD, Ward LD, Sarkar A, Quon G, Sandstrom RS, Eaton ML, Wu YC, Pfenning AR, Wang X, Claussnitzer M, Liu Y, Coarfa C, Harris RA, Shoresh N, Epstein CB, Gjoneska E, Leung D, Xie W, Hawkins RD, Lister R, Hong C, Gascard P, Mungall AJ, Moore R, Chuah E, Tam A, Canfield TK, Hansen RS, Kaul R, Sabo PJ, Bansal MS, Carles A, Dixon JR, Farh KH, Feizi S, Karlic R, Kim AR, Kulkarni A, Li D, Lowdon R, Elliott G, Mercer TR, Neph SJ, Onuchic V, Polak P, Rajagopal N, Ray P, Sallari RC, Siebenthall KT, Sinnott-Armstrong NA, Stevens M, Thurman RE, Wu J, Zhang B, Zhou X, Beaudet AE, Boyer LA, De Jager PL, Farnham PJ, Fisher SJ, Haussler D, Jones SJ, Li W, Marra MA, McManus MT, Sunyaev S, Thomson JA, Tlsty TD, Tsai LH, Wang W, Waterland RA, Zhang MQ, Chadwick LH, Bernstein BE, Costello JF, Ecker JR, Hirst M, Meissner A, Milosavljevic A, Ren B, Stamatoyannopoulos JA, Wang T, Kellis M. Integrative analysis of 111 reference human epigenomes. Nature. 2015 Feb 19;518(7539):317-30. doi: 10.1038/nature14248.
- Yang JK, Wang YY, Liu C, Shi TT, Lu J, Cao X, Yang FY, Feng JP, Chen C, Ji LN, Xu A. Urine Proteome Specific for Eye Damage Can Predict Kidney Damage in Patients With Type 2 Diabetes: A Case-Control and a 5.3-Year Prospective Cohort Study. Diabetes Care. 2017 Feb;40(2):253-260. doi: 10.2337/dc16-1529. Epub 2016 Nov 30.
- Harati MD, Williams RR, Movassaghi M, Hojat A, Lucey GM, Yong WH. An Introduction to Starting a Biobank. Methods Mol Biol. 2019;1897:7-16. doi: 10.1007/978-1-4939-8935-5_2.
- Field N, Cohen T, Struelens MJ, Palm D, Cookson B, Glynn JR, Gallo V, Ramsay M, Sonnenberg P, Maccannell D, Charlett A, Egger M, Green J, Vineis P, Abubakar I. Strengthening the Reporting of Molecular Epidemiology for Infectious Diseases (STROME-ID): an extension of the STROBE statement. Lancet Infect Dis. 2014 Apr;14(4):341-52. doi: 10.1016/S1473-3099(13)70324-4. Epub 2014 Mar 14.
- He X, Lau EHY, Wu P, Deng X, Wang J, Hao X, Lau YC, Wong JY, Guan Y, Tan X, Mo X, Chen Y, Liao B, Chen W, Hu F, Zhang Q, Zhong M, Wu Y, Zhao L, Zhang F, Cowling BJ, Li F, Leung GM. Temporal dynamics in viral shedding and transmissibility of COVID-19. Nat Med. 2020 May;26(5):672-675. doi: 10.1038/s41591-020-0869-5. Epub 2020 Apr 15.
- Dissanayake TK, Schauble S, Mirhakkak MH, Wu WL, Ng AC, Yip CCY, Lopez AG, Wolf T, Yeung ML, Chan KH, Yuen KY, Panagiotou G, To KK. Comparative Transcriptomic Analysis of Rhinovirus and Influenza Virus Infection. Front Microbiol. 2020 Jul 21;11:1580. doi: 10.3389/fmicb.2020.01580. eCollection 2020.
- WHO Working Group on the Clinical Characterisation and Management of COVID-19 infection. A minimal common outcome measure set for COVID-19 clinical research. Lancet Infect Dis. 2020 Aug;20(8):e192-e197. doi: 10.1016/S1473-3099(20)30483-7. Epub 2020 Jun 12.
Užitečné odkazy
Termíny studijních záznamů
Tato data sledují průběh záznamů studie a předkládání souhrnných výsledků na ClinicalTrials.gov. Záznamy ze studií a hlášené výsledky jsou před zveřejněním na veřejné webové stránce přezkoumány Národní lékařskou knihovnou (NLM), aby se ujistily, že splňují specifické standardy kontroly kvality.
Hlavní termíny studia
Začátek studia (Aktuální)
11. dubna 2023
Primární dokončení (Odhadovaný)
1. května 2028
Dokončení studie (Odhadovaný)
1. května 2028
Termíny zápisu do studia
První předloženo
13. dubna 2022
První předloženo, které splnilo kritéria kontroly kvality
13. dubna 2022
První zveřejněno (Aktuální)
20. dubna 2022
Aktualizace studijních záznamů
Poslední zveřejněná aktualizace (Aktuální)
12. května 2026
Odeslaná poslední aktualizace, která splnila kritéria kontroly kvality
7. května 2026
Naposledy ověřeno
1. května 2026
Více informací
Termíny související s touto studií
Klíčová slova
Další relevantní podmínky MeSH
- Patologické procesy
- Infekce dýchacích cest
- Infekce
- Nemoci dýchacích cest
- Syndrom systémové zánětlivé odpovědi
- Zánět
- Plicní onemocnění
- Gram-pozitivní bakteriální infekce
- Bakteriální infekce a mykózy
- Infekce Actinomycetales
- Patologické stavy, příznaky a symptomy
- Zápal plic
- Sepse
- Virová onemocnění
- Mykózy
- Infekce Mycobacterium
- Bakteriální infekce
- Koinfekce
Další identifikační čísla studie
- ePWAS-RID/Rainer/2021
Plán pro data jednotlivých účastníků (IPD)
Plánujete sdílet data jednotlivých účastníků (IPD)?
NE
Informace o lécích a zařízeních, studijní dokumenty
Studuje lékový produkt regulovaný americkým FDA
Ne
Studuje produkt zařízení regulovaný americkým úřadem FDA
Ne
Tyto informace byly beze změn načteny přímo z webu clinicaltrials.gov. Máte-li jakékoli požadavky na změnu, odstranění nebo aktualizaci podrobností studie, kontaktujte prosím register@clinicaltrials.gov. Jakmile bude změna implementována na clinicaltrials.gov, bude automaticky aktualizována i na našem webu .