Awaryjne PWAS w chorobach zakaźnych układu oddechowego
7 maja 2026 zaktualizowane przez: Prof. Timothy Hudson RAINER, The University of Hong Kong
Awaryjne Panoromiczne Szerokie Stowarzyszenie Badania Choroby Zakaźnej Układu Oddechowego (ePWAS-RID)
Opracowanie szeroko zakrojonego badania asocjacyjnego (ePWAS) w nagłych wypadkach w celu wczesnej, szybkiej charakterystyki biologicznej i patofizjologicznej znanych i nowych chorób zakaźnych u dorosłych pacjentów zgłaszających się na oddziały ratunkowe z podejrzeniem ostrej pozaszpitalnej choroby zakaźnej układu oddechowego (scaRID).
Faza 1
- Opracuj biobank ED-ID (o nazwie ePWAS-RID). Faza 2
- Ukierunkowane badania mające na celu odkrycie nowych metod diagnostycznych, prognostycznych i terapeutycznych
Przegląd badań
Status
Rekrutacyjny
Warunki
Interwencja / Leczenie
Szczegółowy opis
Wstęp
Gotowość na pandemię
Pandemia COVID-19 dotknęła ponad 220 milionów ludzi, pochłonęła życie ponad 450 000 osób i wywołała różne reakcje na całym świecie. Opóźnienia w pozyskiwaniu wysokiej jakości materiałów klinicznych i naukowych dotyczących przenoszenia, charakteru klinicznego, skutków i śmiertelności nowych i znanych chorób zakaźnych (ID) przekładają się na nieefektywność opieki zdrowotnej, stres społeczny i ekonomiczny oraz zwiększoną zachorowalność i śmiertelność. Regiony, które odniosły większy sukces w walce z COVID-19, były dobrze przygotowane przed pandemią.
Patogeny
Patogenami, które najczęściej powodują coroczne epidemie i pandemie, są wirusy układu oddechowego. W Azji infekcje wirusowe stanowią 30-40% przypadków sepsy. Każdego roku występuje 100 milionów przypadków wirusowego pozaszpitalnego zapalenia płuc (PZP), z czego 60% przechodzi w sepsę. Wirusy te powodują zależne od gospodarza, zapalne, reakcje immunologiczne, które postępują przez trzy fazy: wstępnie uregulowany stan zapalny; pośrednia rozregulowana prozapalna; i późny rozregulowany stan zapalny.
Widmo kliniczne
RID to heterogenna populacja pacjentów. To złożone spektrum heterogeniczności rozciąga się na leżącą u podstaw biologii molekularnej i patofizjologii od genomu do fenomu. Obejmuje znaczące indywidualne zróżnicowanie regulowanych i rozregulowanych ogólnoustrojowych odpowiedzi zapalnych gospodarza na infekcję w obecności i braku dysfunkcji narządu. Choroba krytyczna z dowolnego ID obejmuje zarówno podatność gospodarza na patogen, jak i skłonność gospodarza do rozwoju rozregulowanego stanu zapalnego i niewydolności narządów (np. zapalenie płuc i/lub ostra niewydolność nerek).
Panoromiczne badania asocjacyjne
W ciągu pięciu lat poprzedzających pandemię COVID-19 w brytyjskim badaniu Genetics of Mortality In Critical Care (GenOMICC) rekrutowano pacjentów ze spektrum krytycznych zespołów chorobowych (np. grypa, posocznica i pojawiające się infekcje), aby lepiej zrozumieć mechanizmy gospodarza, które prowadzą do zagrażających życiu wyników. W rezultacie badacze GenOMICC, wraz ze współpracownikami z Hiszpanii i Włoch, byli dobrze przygotowani do przeprowadzenia badań asocjacji genomowych u krytycznie chorych pacjentów z COVID-19 i sformułowania zaleceń dotyczących przyszłych badań.
Zintegrowane podejście panoromiczne może odkryć związki przyczynowe i powiązania w całym spektrum biologii gospodarza, w tym genomice, epigenomice, transkryptomice, proteomice, metabolomice i lipidomice, aż po fenotyp kliniczny. Jednak panoromika jako dyscyplina stoi przed tymi samymi wyzwaniami, co badania asocjacyjne całego genomu (GWAS), tylko w większym stopniu. Chociaż GWAS koreluje loci genomowe ze złożonymi sygnaturami i cechami, skuteczne wykrywanie jest utrudnione przez fałszywe alarmy, brak równowagi sprzężeń i wysokie koszty. Prawdziwe wariacje przyczynowe i rzeczywiste powiązania leżące u ich podstaw wymagają wielu filtrów, jeśli mają zostać wykryte.
Badacze proponują opracowanie opartego na ED systemu dynamicznych badań próbek krwi i śliny pobranych od pacjentów na wczesnym etapie ID. Wczesny etap odnosi się do procesu w ścieżce pacjenta, który poprzedza większość rekrutacji pacjentów w innych badaniach, np. na oddziałach lub OIT. Dwa główne cele to: a) opracowanie biobanku ED-ID; oraz b) podjęcie wstępnych odkryć i ukierunkowanych badań w celu odkrycia nowych metod diagnostycznych, prognostycznych i terapeutycznych.
Badacze zdefiniują wczesne sygnatury multiOmics RID i zidentyfikują powiązania ze znanym i nowym identyfikatorem. Opublikowano niewiele badań na temat zintegrowanej panoramy COVID-19, a niewiele, jeśli w ogóle, dotyczy wczesnych faz choroby lub cech różnicujących w porównaniu z innymi chorobami układu oddechowego.
Jakie panoromiczne sygnatury odróżniają niskie ryzyko od wysokiego ryzyka w 30-dniowej Skali Postępu Klinicznego WHO (WHO-CPS) w stratyfikowanych chorobach, dopasowanych do przypadków kontrolnych porównaniach dorosłych pacjentów z scaRID uczęszczających na SOR?
Na potrzeby tego badania scaRID definiuje się jako:
- Gorączka lub temperatura >37,5°C; I
Jeden lub więcej istotnych objawów:
- objawy ze strony układu oddechowego (np. kaszel, duszność), LUB
- objawy ogólnoustrojowe (np. dreszcze, dreszcze, bóle mięśni), LUB
- objawy żołądkowo-jelitowe (np. nudności, wymioty, biegunka); I
- Brak oczywistej alternatywnej przyczyny (patrz kryteria wykluczenia).
Asocjacje panoromiczne zostaną uzyskane z płynnych próbek biopsyjnych, w tym krwi pełnej, osocza, surowicy, osadu krwinek białych, wycieku krwinek czerwonych, supernatantu śliny i komórek śliny. Płynne biomarkery biopsyjne obejmują zawartość genomową, transkryptomiczną, proteomiczną, metabolomiczną, lipidomiczną i hematologiczną.
Hipoteza Badacze postawili hipotezę, że u dobranych pod względem skłonności dorosłych pacjentów z RID specyficznym dla patogenu i choroby (np. SARS-CoV-2, grypa A) istnieją znaczące różnice w sygnaturach panoromicznych, które określają podatność gospodarza i odpowiedź gospodarza na łagodną do ciężkiej chorobę.
Cele
Celem tej propozycji jest opracowanie awaryjnego biobanku PanorOmics Wide Association Study (ePWAS) do wczesnej, szybkiej charakterystyki biologicznej i patofizjologicznej scaRID. Dokładniej, u dorosłych pacjentów zgłaszających się na SOR ze scaRID i w ciągu 10 dni od wystąpienia objawów, dążymy do:
- Opracowanie biobanku próbek krwi i śliny ED-ePWAS-RID
- Aby korzystać z tego banku danych do eksploracyjnych i ukierunkowanych badań w poszukiwaniu markerów diagnostycznych i prognostycznych oraz do zrozumienia podstawowych mechanizmów choroby
Celami biobanku i repozytorium ePWAS-RID są:
- rozwój infrastruktury dla trwałego biobanku próbek krwi i śliny opartego na ED, dopasowanego do fenotypów klinicznych i krytycznych wyników.
- rozwój repozytorium zgodnie z międzynarodowymi standardami, minimalizując w ten sposób heterogeniczność i czyniąc materiał odpowiednim dla międzynarodowych ram badawczych, których celem jest ułatwienie dostępu do ludzkiego materiału biologicznego.
- przygotowanie repozytorium do wstępnego odkrycia nowych markerów diagnostycznych, prognostycznych i terapeutycznych.
- ułatwienie ukierunkowanych badań nad patogenezą infekcji dróg oddechowych, podatnością gospodarza i odpowiedzią gospodarza.
- wyprowadzenie platform biomarkerów modeli zestawów treningowych do wczesnego wykrywania RID, różnicowania patogenów, monitorowania, stratyfikacji ryzyka i prognozowania; oraz zweryfikować te modele przy użyciu niezależnych i zewnętrznych zestawów danych.
Typ studiów
Obserwacyjny
Zapisy (Szacowany)
2000
Kontakty i lokalizacje
Ta sekcja zawiera dane kontaktowe osób prowadzących badanie oraz informacje o tym, gdzie badanie jest przeprowadzane.
Kontakt w sprawie studiów
- Nazwa: Timothy H Rainer, MD
- Numer telefonu: +852 39176846
- E-mail: thrainer@hku.hk
Lokalizacje studiów
-
-
-
Hong Kong, Chiny
- Rekrutacyjny
- Hong Kong University
-
Kontakt:
- Timothy H Rainer, MD
- Numer telefonu: 852 39176846
- E-mail: thrainer@hku.hk
-
-
Kryteria uczestnictwa
Badacze szukają osób, które pasują do określonego opisu, zwanego kryteriami kwalifikacyjnymi. Niektóre przykłady tych kryteriów to ogólny stan zdrowia danej osoby lub wcześniejsze leczenie.
Kryteria kwalifikacji
Wiek uprawniający do nauki
18 lat do 100 lat (Dorosły, Starszy dorosły)
Akceptuje zdrowych ochotników
Tak
Metoda próbkowania
Próbka bez prawdopodobieństwa
Badana populacja
Podejrzewana, ostra, pozaszpitalna choroba zakaźna układu oddechowego zgłaszająca się na oddział ratunkowy z początkiem objawów <8 dni i zgłoszoną gorączką lub dreszczami lub temperaturą ucha >37,5°C
Opis
Kryteria przyjęcia:
Pacjenci kwalifikujący się do rejestracji to:
W odniesieniu do poprzednich kryteriów włączenia są to:
- Dorośli ≥18 lat; I
- Podejrzana, ostra pozaszpitalna choroba zakaźna układu oddechowego (scaRID)*; I
- Świadoma zgoda.
Uwaga: scaRID jest zdefiniowany zgodnie z WSZYSTKIMI trzema kryteriami:
- Nabyte pozaszpitalnie (nie hospitalizowane przez <28 dni); I
- Ostra infekcja (zdefiniowana jako początek objawów <8 dni i JEDEN ze zgłoszonych przypadków gorączki lub dreszczy lub temperatury w uszach >37,5°C lub hipotermii lub leukocytozy lub leukopenii lub nowych zmian stanu psychicznego); I
Prawdopodobna infekcja dróg oddechowych - według JEDNEGO z:
- nowy kaszel lub nowa produkcja plwociny lub
- ból w klatce piersiowej lub
- duszność lub
- tachypnoe lub
- nieprawidłowe badanie płuc lub
- niewydolność oddechowa; Lub
- oceny lekarza (z objawami ogólnoustrojowymi lub żołądkowo-jelitowymi).
Osoby kontrolne zostaną wylosowane z dwóch grup:
- Martwią się dobrze - dorośli pacjenci z National Early Warning Score (NEWS) <3 i temperaturą <37,5°C.
- Krewni lub towarzyszący im przyjaciele bez ostrej choroby.
Kryteria wyłączenia:
- Odmowa zgody;
- Niedawna hospitalizacja (<28 dni);
- Zgłoszony do innego badania klinicznego
- cellulitis;
- Infekcje skórne lub ortopedyczne;
- Zakażenie dróg moczowych;
- Ostra posocznica brzuszna;
- Choroba przenoszona drogą płciową;
- Zakażenie ludzkim wirusem upośledzenia odporności (HIV);
- Obniżona odporność/potencjalna gorączka neutropeniczna;
- przeszczep narządu miąższowego lub krwiotwórczych komórek macierzystych w ciągu ostatnich 90 dni;
- Aktywna choroba przeszczep przeciwko gospodarzowi lub zarostowe zapalenie oskrzelików;
- Ciężka choroba podróżnych wymagająca pilnej hospitalizacji i leczenia, w tym malaria, denga, dur brzuszny i inne riketsje;
- Udar mózgu;
- Toksydrom;
- Nieorganiczna ostra psychoza.
Plan studiów
Ta sekcja zawiera szczegółowe informacje na temat planu badania, w tym sposób zaprojektowania badania i jego pomiary.
Jak projektuje się badanie?
Szczegóły projektu
Kohorty i interwencje
Grupa / Kohorta |
Interwencja / Leczenie |
|---|---|
|
Infekcja wirusowa
Pacjenci z infekcją wirusową, którzy zgłoszą się w ciągu 8 dni od wystąpienia objawów, zostaną poddani co najmniej jednemu pobraniu pełnej krwi i śliny a) na oddziale ratunkowym (jeśli jest dostępny) lub w szpitalu w ciągu 8 dni od wystąpienia objawów; i czy się zgodzą
|
Trzy próbki krwi obwodowej o objętości 10–20 ml (jeśli są dostępne) Trzy próbki śliny o objętości 1–5 ml (jeśli są dostępne)
|
|
Infekcja bakteryjna
Pacjenci z zakażeniem bakteryjnym, którzy zgłoszą się w ciągu 8 dni od wystąpienia objawów, zostaną poddani co najmniej jednemu pobraniu pełnej krwi i śliny a) na oddziale ratunkowym (jeśli jest dostępny) lub w szpitalu w ciągu 8 dni od wystąpienia objawów; i jeśli się zgodzą, kolejne dwie próbki w b) 24 godziny +/- 6 godzin od początku objawów (jeśli są dostępne); oraz c) 48 godzin +/- 6 godzin od wystąpienia objawów (jeśli są dostępne).
|
Trzy próbki krwi obwodowej o objętości 10–20 ml (jeśli są dostępne) Trzy próbki śliny o objętości 1–5 ml (jeśli są dostępne)
|
|
Koinfekcja wirusowo-wirusowa
Pacjenci z koinfekcją wirusowo-wirusową, którzy zgłoszą się w ciągu 8 dni od wystąpienia objawów, będą mieli co najmniej jedno pobranie pełnej krwi i śliny a) na oddziale ratunkowym (jeśli jest dostępny) lub w szpitalu w ciągu 8 dni od wystąpienia objawów; i jeśli się zgodzą, kolejne dwie próbki w b) 24 godziny +/- 6 godzin od początku objawów (jeśli są dostępne); oraz c) 48 godzin +/- 6 godzin od wystąpienia objawów (jeśli są dostępne).
|
Trzy próbki krwi obwodowej o objętości 10–20 ml (jeśli są dostępne) Trzy próbki śliny o objętości 1–5 ml (jeśli są dostępne)
|
|
Współzakażenie bakteryjne i wirusowe
Pacjenci z koinfekcją bakteryjną i wirusową, którzy zgłoszą się w ciągu 8 dni od wystąpienia objawów, będą mieli co najmniej jedno pobranie pełnej krwi i śliny a) na oddziale ratunkowym (jeśli jest dostępny) lub w szpitalu w ciągu 8 dni od wystąpienia objawów; i jeśli się zgodzą, kolejne dwie próbki w b) 24 godziny +/- 6 godzin od początku objawów (jeśli są dostępne); oraz c) 48 godzin +/- 6 godzin od wystąpienia objawów (jeśli są dostępne).
|
Trzy próbki krwi obwodowej o objętości 10–20 ml (jeśli są dostępne) Trzy próbki śliny o objętości 1–5 ml (jeśli są dostępne)
|
|
Koinfekcja grzybiczo-mykobakteryjna
Pacjenci z koinfekcją bakteryjną i wirusową, którzy zgłoszą się w ciągu 8 dni od wystąpienia objawów, będą mieli co najmniej jedno pobranie pełnej krwi i śliny a) na oddziale ratunkowym (jeśli jest dostępny) lub w szpitalu w ciągu 8 dni od wystąpienia objawów; i jeśli się zgodzą, kolejne dwie próbki w b) 24 godziny +/- 6 godzin od początku objawów (jeśli są dostępne); oraz c) 48 godzin +/- 6 godzin od wystąpienia objawów (jeśli są dostępne).
|
Trzy próbki krwi obwodowej o objętości 10–20 ml (jeśli są dostępne) Trzy próbki śliny o objętości 1–5 ml (jeśli są dostępne)
|
|
Infekcja niewiadomego pochodzenia
Osoby z zakażeniem niepewnego pochodzenia zgłaszające się w ciągu 8 dni od wystąpienia objawów będą miały co najmniej jedno pobranie pełnej krwi i śliny a) na oddziale ratunkowym (jeśli jest dostępny) lub w szpitalu w ciągu 8 dni od wystąpienia objawów; i jeśli się zgodzą, kolejne dwie próbki w b) 24 godziny +/- 6 godzin od początku objawów (jeśli są dostępne); oraz c) 48 godzin +/- 6 godzin od wystąpienia objawów (jeśli są dostępne).
|
Trzy próbki krwi obwodowej o objętości 10–20 ml (jeśli są dostępne) Trzy próbki śliny o objętości 1–5 ml (jeśli są dostępne)
|
|
Przedmioty kontrolne
Pacjenci z grupy kontrolnej, jeśli wyrażą na to zgodę, zostaną pobrani co najmniej raz z krwi pełnej i śliny a) na oddziale ratunkowym (jeśli jest dostępny) lub w szpitalu w ciągu 8 dni od wystąpienia objawów (jeśli dotyczy); i jeśli się zgodzą, kolejne dwie próbki w b) 24 godziny +/- 6 godzin od początku objawów (jeśli dotyczy); oraz c) 48 godzin +/- 6 godzin od wystąpienia objawów (jeśli dotyczy).
|
Trzy próbki krwi obwodowej o objętości 10–20 ml (jeśli są dostępne) Trzy próbki śliny o objętości 1–5 ml (jeśli są dostępne)
|
Co mierzy badanie?
Podstawowe miary wyniku
Miara wyniku |
Opis środka |
Ramy czasowe |
|---|---|---|
|
WHO-CPS
Ramy czasowe: Do 30 dni
|
Zróżnicowanie WHO-CPS >6 od WHO-CPS ≤6
|
Do 30 dni
|
Miary wyników drugorzędnych
Miara wyniku |
Opis środka |
Ramy czasowe |
|---|---|---|
|
Śmiertelność
Ramy czasowe: Do 30 dni
|
Śmiertelność jest zdefiniowana jako wszechprzyczynowa, binarna: tak lub nie
|
Do 30 dni
|
|
Śmiertelność
Ramy czasowe: rok
|
Śmiertelność jest zdefiniowana jako wszechprzyczynowa, binarna: tak lub nie
|
rok
|
Współpracownicy i badacze
Tutaj znajdziesz osoby i organizacje zaangażowane w to badanie.
Sponsor
Śledczy
- Główny śledczy: Timothy H Rainer, MD, The University of Hong Kong
Publikacje i pomocne linki
Osoba odpowiedzialna za wprowadzenie informacji o badaniu dobrowolnie udostępnia te publikacje. Mogą one dotyczyć wszystkiego, co jest związane z badaniem.
Publikacje ogólne
- Singer M, Deutschman CS, Seymour CW, Shankar-Hari M, Annane D, Bauer M, Bellomo R, Bernard GR, Chiche JD, Coopersmith CM, Hotchkiss RS, Levy MM, Marshall JC, Martin GS, Opal SM, Rubenfeld GD, van der Poll T, Vincent JL, Angus DC. The Third International Consensus Definitions for Sepsis and Septic Shock (Sepsis-3). JAMA. 2016 Feb 23;315(8):801-10. doi: 10.1001/jama.2016.0287.
- Li Q, Guan X, Wu P, Wang X, Zhou L, Tong Y, Ren R, Leung KSM, Lau EHY, Wong JY, Xing X, Xiang N, Wu Y, Li C, Chen Q, Li D, Liu T, Zhao J, Liu M, Tu W, Chen C, Jin L, Yang R, Wang Q, Zhou S, Wang R, Liu H, Luo Y, Liu Y, Shao G, Li H, Tao Z, Yang Y, Deng Z, Liu B, Ma Z, Zhang Y, Shi G, Lam TTY, Wu JT, Gao GF, Cowling BJ, Yang B, Leung GM, Feng Z. Early Transmission Dynamics in Wuhan, China, of Novel Coronavirus-Infected Pneumonia. N Engl J Med. 2020 Mar 26;382(13):1199-1207. doi: 10.1056/NEJMoa2001316. Epub 2020 Jan 29.
- Hung IF, Lung KC, Tso EY, Liu R, Chung TW, Chu MY, Ng YY, Lo J, Chan J, Tam AR, Shum HP, Chan V, Wu AK, Sin KM, Leung WS, Law WL, Lung DC, Sin S, Yeung P, Yip CC, Zhang RR, Fung AY, Yan EY, Leung KH, Ip JD, Chu AW, Chan WM, Ng AC, Lee R, Fung K, Yeung A, Wu TC, Chan JW, Yan WW, Chan WM, Chan JF, Lie AK, Tsang OT, Cheng VC, Que TL, Lau CS, Chan KH, To KK, Yuen KY. Triple combination of interferon beta-1b, lopinavir-ritonavir, and ribavirin in the treatment of patients admitted to hospital with COVID-19: an open-label, randomised, phase 2 trial. Lancet. 2020 May 30;395(10238):1695-1704. doi: 10.1016/S0140-6736(20)31042-4. Epub 2020 May 10.
- Cohen JF, Korevaar DA, Altman DG, Bruns DE, Gatsonis CA, Hooft L, Irwig L, Levine D, Reitsma JB, de Vet HC, Bossuyt PM. STARD 2015 guidelines for reporting diagnostic accuracy studies: explanation and elaboration. BMJ Open. 2016 Nov 14;6(11):e012799. doi: 10.1136/bmjopen-2016-012799.
- Taylor JC, Martin HC, Lise S, Broxholme J, Cazier JB, Rimmer A, Kanapin A, Lunter G, Fiddy S, Allan C, Aricescu AR, Attar M, Babbs C, Becq J, Beeson D, Bento C, Bignell P, Blair E, Buckle VJ, Bull K, Cais O, Cario H, Chapel H, Copley RR, Cornall R, Craft J, Dahan K, Davenport EE, Dendrou C, Devuyst O, Fenwick AL, Flint J, Fugger L, Gilbert RD, Goriely A, Green A, Greger IH, Grocock R, Gruszczyk AV, Hastings R, Hatton E, Higgs D, Hill A, Holmes C, Howard M, Hughes L, Humburg P, Johnson D, Karpe F, Kingsbury Z, Kini U, Knight JC, Krohn J, Lamble S, Langman C, Lonie L, Luck J, McCarthy D, McGowan SJ, McMullin MF, Miller KA, Murray L, Nemeth AH, Nesbit MA, Nutt D, Ormondroyd E, Oturai AB, Pagnamenta A, Patel SY, Percy M, Petousi N, Piazza P, Piret SE, Polanco-Echeverry G, Popitsch N, Powrie F, Pugh C, Quek L, Robbins PA, Robson K, Russo A, Sahgal N, van Schouwenburg PA, Schuh A, Silverman E, Simmons A, Sorensen PS, Sweeney E, Taylor J, Thakker RV, Tomlinson I, Trebes A, Twigg SR, Uhlig HH, Vyas P, Vyse T, Wall SA, Watkins H, Whyte MP, Witty L, Wright B, Yau C, Buck D, Humphray S, Ratcliffe PJ, Bell JI, Wilkie AO, Bentley D, Donnelly P, McVean G. Factors influencing success of clinical genome sequencing across a broad spectrum of disorders. Nat Genet. 2015 Jul;47(7):717-726. doi: 10.1038/ng.3304. Epub 2015 May 18.
- Niederman MS, Mandell LA, Anzueto A, Bass JB, Broughton WA, Campbell GD, Dean N, File T, Fine MJ, Gross PA, Martinez F, Marrie TJ, Plouffe JF, Ramirez J, Sarosi GA, Torres A, Wilson R, Yu VL; American Thoracic Society. Guidelines for the management of adults with community-acquired pneumonia. Diagnosis, assessment of severity, antimicrobial therapy, and prevention. Am J Respir Crit Care Med. 2001 Jun;163(7):1730-54. doi: 10.1164/ajrccm.163.7.at1010. No abstract available.
- Jain S, Self WH, Wunderink RG, Fakhran S, Balk R, Bramley AM, Reed C, Grijalva CG, Anderson EJ, Courtney DM, Chappell JD, Qi C, Hart EM, Carroll F, Trabue C, Donnelly HK, Williams DJ, Zhu Y, Arnold SR, Ampofo K, Waterer GW, Levine M, Lindstrom S, Winchell JM, Katz JM, Erdman D, Schneider E, Hicks LA, McCullers JA, Pavia AT, Edwards KM, Finelli L; CDC EPIC Study Team. Community-Acquired Pneumonia Requiring Hospitalization among U.S. Adults. N Engl J Med. 2015 Jul 30;373(5):415-27. doi: 10.1056/NEJMoa1500245. Epub 2015 Jul 14.
- Davenport EE, Burnham KL, Radhakrishnan J, Humburg P, Hutton P, Mills TC, Rautanen A, Gordon AC, Garrard C, Hill AV, Hinds CJ, Knight JC. Genomic landscape of the individual host response and outcomes in sepsis: a prospective cohort study. Lancet Respir Med. 2016 Apr;4(4):259-71. doi: 10.1016/S2213-2600(16)00046-1. Epub 2016 Feb 23.
- Williamson EJ, Walker AJ, Bhaskaran K, Bacon S, Bates C, Morton CE, Curtis HJ, Mehrkar A, Evans D, Inglesby P, Cockburn J, McDonald HI, MacKenna B, Tomlinson L, Douglas IJ, Rentsch CT, Mathur R, Wong AYS, Grieve R, Harrison D, Forbes H, Schultze A, Croker R, Parry J, Hester F, Harper S, Perera R, Evans SJW, Smeeth L, Goldacre B. Factors associated with COVID-19-related death using OpenSAFELY. Nature. 2020 Aug;584(7821):430-436. doi: 10.1038/s41586-020-2521-4. Epub 2020 Jul 8.
- Sharfstein JM, Becker SJ, Mello MM. Diagnostic Testing for the Novel Coronavirus. JAMA. 2020 Apr 21;323(15):1437-1438. doi: 10.1001/jama.2020.3864. No abstract available.
- Leung K, Wu JT, Liu D, Leung GM. First-wave COVID-19 transmissibility and severity in China outside Hubei after control measures, and second-wave scenario planning: a modelling impact assessment. Lancet. 2020 Apr 25;395(10233):1382-1393. doi: 10.1016/S0140-6736(20)30746-7. Epub 2020 Apr 8.
- Pairo-Castineira E, Clohisey S, Klaric L, Bretherick AD, Rawlik K, Pasko D, Walker S, Parkinson N, Fourman MH, Russell CD, Furniss J, Richmond A, Gountouna E, Wrobel N, Harrison D, Wang B, Wu Y, Meynert A, Griffiths F, Oosthuyzen W, Kousathanas A, Moutsianas L, Yang Z, Zhai R, Zheng C, Grimes G, Beale R, Millar J, Shih B, Keating S, Zechner M, Haley C, Porteous DJ, Hayward C, Yang J, Knight J, Summers C, Shankar-Hari M, Klenerman P, Turtle L, Ho A, Moore SC, Hinds C, Horby P, Nichol A, Maslove D, Ling L, McAuley D, Montgomery H, Walsh T, Pereira AC, Renieri A; GenOMICC Investigators; ISARIC4C Investigators; COVID-19 Human Genetics Initiative; 23andMe Investigators; BRACOVID Investigators; Gen-COVID Investigators; Shen X, Ponting CP, Fawkes A, Tenesa A, Caulfield M, Scott R, Rowan K, Murphy L, Openshaw PJM, Semple MG, Law A, Vitart V, Wilson JF, Baillie JK. Genetic mechanisms of critical illness in COVID-19. Nature. 2021 Mar;591(7848):92-98. doi: 10.1038/s41586-020-03065-y. Epub 2020 Dec 11.
- Legido-Quigley H, Asgari N, Teo YY, Leung GM, Oshitani H, Fukuda K, Cook AR, Hsu LY, Shibuya K, Heymann D. Are high-performing health systems resilient against the COVID-19 epidemic? Lancet. 2020 Mar 14;395(10227):848-850. doi: 10.1016/S0140-6736(20)30551-1. Epub 2020 Mar 6. No abstract available.
- Lam TT, Jia N, Zhang YW, Shum MH, Jiang JF, Zhu HC, Tong YG, Shi YX, Ni XB, Liao YS, Li WJ, Jiang BG, Wei W, Yuan TT, Zheng K, Cui XM, Li J, Pei GQ, Qiang X, Cheung WY, Li LF, Sun FF, Qin S, Huang JC, Leung GM, Holmes EC, Hu YL, Guan Y, Cao WC. Identifying SARS-CoV-2-related coronaviruses in Malayan pangolins. Nature. 2020 Jul;583(7815):282-285. doi: 10.1038/s41586-020-2169-0. Epub 2020 Mar 26.
- Tsang KW, Ho PL, Ooi GC, Yee WK, Wang T, Chan-Yeung M, Lam WK, Seto WH, Yam LY, Cheung TM, Wong PC, Lam B, Ip MS, Chan J, Yuen KY, Lai KN. A cluster of cases of severe acute respiratory syndrome in Hong Kong. N Engl J Med. 2003 May 15;348(20):1977-85. doi: 10.1056/NEJMoa030666. Epub 2003 Mar 31.
- Wai AKC, Wong CKH, Wong JYH, Xiong X, Chu OCK, Wong MS, Tsui MSH, Rainer TH. Changes in Emergency Department Visits, Diagnostic Groups, and 28-Day Mortality Associated With the COVID-19 Pandemic: A Territory-Wide, Retrospective, Cohort Study. Ann Emerg Med. 2022 Feb;79(2):148-157. doi: 10.1016/j.annemergmed.2021.09.424. Epub 2021 Sep 24.
- Southeast Asia Infectious Disease Clinical Research Network. Causes and outcomes of sepsis in southeast Asia: a multinational multicentre cross-sectional study. Lancet Glob Health. 2017 Feb;5(2):e157-e167. doi: 10.1016/S2214-109X(17)30007-4.
- Gu X, Zhou F, Wang Y, Fan G, Cao B. Respiratory viral sepsis: epidemiology, pathophysiology, diagnosis and treatment. Eur Respir Rev. 2020 Jul 21;29(157):200038. doi: 10.1183/16000617.0038-2020. Print 2020 Sep 30.
- Su Y, Chen D, Yuan D, Lausted C, Choi J, Dai CL, Voillet V, Duvvuri VR, Scherler K, Troisch P, Baloni P, Qin G, Smith B, Kornilov SA, Rostomily C, Xu A, Li J, Dong S, Rothchild A, Zhou J, Murray K, Edmark R, Hong S, Heath JE, Earls J, Zhang R, Xie J, Li S, Roper R, Jones L, Zhou Y, Rowen L, Liu R, Mackay S, O'Mahony DS, Dale CR, Wallick JA, Algren HA, Zager MA; ISB-Swedish COVID19 Biobanking Unit; Wei W, Price ND, Huang S, Subramanian N, Wang K, Magis AT, Hadlock JJ, Hood L, Aderem A, Bluestone JA, Lanier LL, Greenberg PD, Gottardo R, Davis MM, Goldman JD, Heath JR. Multi-Omics Resolves a Sharp Disease-State Shift between Mild and Moderate COVID-19. Cell. 2020 Dec 10;183(6):1479-1495.e20. doi: 10.1016/j.cell.2020.10.037. Epub 2020 Oct 28.
- Rautanen A, Mills TC, Gordon AC, Hutton P, Steffens M, Nuamah R, Chiche JD, Parks T, Chapman SJ, Davenport EE, Elliott KS, Bion J, Lichtner P, Meitinger T, Wienker TF, Caulfield MJ, Mein C, Bloos F, Bobek I, Cotogni P, Sramek V, Sarapuu S, Kobilay M, Ranieri VM, Rello J, Sirgo G, Weiss YG, Russwurm S, Schneider EM, Reinhart K, Holloway PA, Knight JC, Garrard CS, Russell JA, Walley KR, Stuber F, Hill AV, Hinds CJ; ESICM/ECCRN GenOSept Investigators. Genome-wide association study of survival from sepsis due to pneumonia: an observational cohort study. Lancet Respir Med. 2015 Jan;3(1):53-60. doi: 10.1016/S2213-2600(14)70290-5. Epub 2014 Dec 18.
- Davenport EE, Antrobus RD, Lillie PJ, Gilbert S, Knight JC. Transcriptomic profiling facilitates classification of response to influenza challenge. J Mol Med (Berl). 2015 Jan;93(1):105-14. doi: 10.1007/s00109-014-1212-8. Epub 2014 Oct 28.
- To KKW, Lu L, Fong CHY, Wu AKL, Mok KY, Yip CCY, Ke YH, Sze KH, Lau SKP, Hung IFN, Yuen KY. Rhinovirus respiratory tract infection in hospitalized adult patients is associated with TH2 response irrespective of asthma. J Infect. 2018 May;76(5):465-474. doi: 10.1016/j.jinf.2018.02.005. Epub 2018 Feb 15.
- Khaliq W, Grossmann P, Neugebauer S, Kleyman A, Domizi R, Calcinaro S, Brealey D, Graler M, Kiehntopf M, Schauble S, Singer M, Panagiotou G, Bauer M. Lipid metabolic signatures deviate in sepsis survivors compared to non-survivors. Comput Struct Biotechnol J. 2020 Nov 21;18:3678-3691. doi: 10.1016/j.csbj.2020.11.009. eCollection 2020.
- Wainberg M, Sinnott-Armstrong N, Mancuso N, Barbeira AN, Knowles DA, Golan D, Ermel R, Ruusalepp A, Quertermous T, Hao K, Bjorkegren JLM, Im HK, Pasaniuc B, Rivas MA, Kundaje A. Opportunities and challenges for transcriptome-wide association studies. Nat Genet. 2019 Apr;51(4):592-599. doi: 10.1038/s41588-019-0385-z. Epub 2019 Mar 29.
- GTEx Consortium. Human genomics. The Genotype-Tissue Expression (GTEx) pilot analysis: multitissue gene regulation in humans. Science. 2015 May 8;348(6235):648-60. doi: 10.1126/science.1262110. Epub 2015 May 7.
- Tam V, Patel N, Turcotte M, Bosse Y, Pare G, Meyre D. Benefits and limitations of genome-wide association studies. Nat Rev Genet. 2019 Aug;20(8):467-484. doi: 10.1038/s41576-019-0127-1.
- Howey R, Shin SY, Relton C, Davey Smith G, Cordell HJ. Bayesian network analysis incorporating genetic anchors complements conventional Mendelian randomization approaches for exploratory analysis of causal relationships in complex data. PLoS Genet. 2020 Mar 2;16(3):e1008198. doi: 10.1371/journal.pgen.1008198. eCollection 2020 Mar.
- Davies NM, Holmes MV, Davey Smith G. Reading Mendelian randomisation studies: a guide, glossary, and checklist for clinicians. BMJ. 2018 Jul 12;362:k601. doi: 10.1136/bmj.k601.
- Roadmap Epigenomics Consortium; Kundaje A, Meuleman W, Ernst J, Bilenky M, Yen A, Heravi-Moussavi A, Kheradpour P, Zhang Z, Wang J, Ziller MJ, Amin V, Whitaker JW, Schultz MD, Ward LD, Sarkar A, Quon G, Sandstrom RS, Eaton ML, Wu YC, Pfenning AR, Wang X, Claussnitzer M, Liu Y, Coarfa C, Harris RA, Shoresh N, Epstein CB, Gjoneska E, Leung D, Xie W, Hawkins RD, Lister R, Hong C, Gascard P, Mungall AJ, Moore R, Chuah E, Tam A, Canfield TK, Hansen RS, Kaul R, Sabo PJ, Bansal MS, Carles A, Dixon JR, Farh KH, Feizi S, Karlic R, Kim AR, Kulkarni A, Li D, Lowdon R, Elliott G, Mercer TR, Neph SJ, Onuchic V, Polak P, Rajagopal N, Ray P, Sallari RC, Siebenthall KT, Sinnott-Armstrong NA, Stevens M, Thurman RE, Wu J, Zhang B, Zhou X, Beaudet AE, Boyer LA, De Jager PL, Farnham PJ, Fisher SJ, Haussler D, Jones SJ, Li W, Marra MA, McManus MT, Sunyaev S, Thomson JA, Tlsty TD, Tsai LH, Wang W, Waterland RA, Zhang MQ, Chadwick LH, Bernstein BE, Costello JF, Ecker JR, Hirst M, Meissner A, Milosavljevic A, Ren B, Stamatoyannopoulos JA, Wang T, Kellis M. Integrative analysis of 111 reference human epigenomes. Nature. 2015 Feb 19;518(7539):317-30. doi: 10.1038/nature14248.
- Yang JK, Wang YY, Liu C, Shi TT, Lu J, Cao X, Yang FY, Feng JP, Chen C, Ji LN, Xu A. Urine Proteome Specific for Eye Damage Can Predict Kidney Damage in Patients With Type 2 Diabetes: A Case-Control and a 5.3-Year Prospective Cohort Study. Diabetes Care. 2017 Feb;40(2):253-260. doi: 10.2337/dc16-1529. Epub 2016 Nov 30.
- Harati MD, Williams RR, Movassaghi M, Hojat A, Lucey GM, Yong WH. An Introduction to Starting a Biobank. Methods Mol Biol. 2019;1897:7-16. doi: 10.1007/978-1-4939-8935-5_2.
- Field N, Cohen T, Struelens MJ, Palm D, Cookson B, Glynn JR, Gallo V, Ramsay M, Sonnenberg P, Maccannell D, Charlett A, Egger M, Green J, Vineis P, Abubakar I. Strengthening the Reporting of Molecular Epidemiology for Infectious Diseases (STROME-ID): an extension of the STROBE statement. Lancet Infect Dis. 2014 Apr;14(4):341-52. doi: 10.1016/S1473-3099(13)70324-4. Epub 2014 Mar 14.
- He X, Lau EHY, Wu P, Deng X, Wang J, Hao X, Lau YC, Wong JY, Guan Y, Tan X, Mo X, Chen Y, Liao B, Chen W, Hu F, Zhang Q, Zhong M, Wu Y, Zhao L, Zhang F, Cowling BJ, Li F, Leung GM. Temporal dynamics in viral shedding and transmissibility of COVID-19. Nat Med. 2020 May;26(5):672-675. doi: 10.1038/s41591-020-0869-5. Epub 2020 Apr 15.
- Dissanayake TK, Schauble S, Mirhakkak MH, Wu WL, Ng AC, Yip CCY, Lopez AG, Wolf T, Yeung ML, Chan KH, Yuen KY, Panagiotou G, To KK. Comparative Transcriptomic Analysis of Rhinovirus and Influenza Virus Infection. Front Microbiol. 2020 Jul 21;11:1580. doi: 10.3389/fmicb.2020.01580. eCollection 2020.
- WHO Working Group on the Clinical Characterisation and Management of COVID-19 infection. A minimal common outcome measure set for COVID-19 clinical research. Lancet Infect Dis. 2020 Aug;20(8):e192-e197. doi: 10.1016/S1473-3099(20)30483-7. Epub 2020 Jun 12.
Przydatne linki
Daty zapisu na studia
Daty te śledzą postęp w przesyłaniu rekordów badań i podsumowań wyników do ClinicalTrials.gov. Zapisy badań i zgłoszone wyniki są przeglądane przez National Library of Medicine (NLM), aby upewnić się, że spełniają określone standardy kontroli jakości, zanim zostaną opublikowane na publicznej stronie internetowej.
Główne daty studiów
Rozpoczęcie studiów (Rzeczywisty)
11 kwietnia 2023
Zakończenie podstawowe (Szacowany)
1 maja 2028
Ukończenie studiów (Szacowany)
1 maja 2028
Daty rejestracji na studia
Pierwszy przesłany
13 kwietnia 2022
Pierwszy przesłany, który spełnia kryteria kontroli jakości
13 kwietnia 2022
Pierwszy wysłany (Rzeczywisty)
20 kwietnia 2022
Aktualizacje rekordów badań
Ostatnia wysłana aktualizacja (Rzeczywisty)
12 maja 2026
Ostatnia przesłana aktualizacja, która spełniała kryteria kontroli jakości
7 maja 2026
Ostatnia weryfikacja
1 maja 2026
Więcej informacji
Terminy związane z tym badaniem
Słowa kluczowe
Dodatkowe istotne warunki MeSH
- Procesy patologiczne
- Infekcje dróg oddechowych
- Infekcje
- Choroby Układu Oddechowego
- Zespół ogólnoustrojowej reakcji zapalnej
- Zapalenie
- Choroby płuc
- Zakażenia bakteriami Gram-dodatnimi
- Infekcje bakteryjne i grzybice
- Infekcje Actinomycetales
- Stany patologiczne, oznaki i objawy
- Zapalenie płuc
- Posocznica
- Choroby wirusowe
- Grzybice
- Zakażenia Mykobakterii
- Infekcje bakteryjne
- Koinfekcja
Inne numery identyfikacyjne badania
- ePWAS-RID/Rainer/2021
Plan dla danych uczestnika indywidualnego (IPD)
Planujesz udostępniać dane poszczególnych uczestników (IPD)?
NIE
Informacje o lekach i urządzeniach, dokumenty badawcze
Bada produkt leczniczy regulowany przez amerykańską FDA
Nie
Bada produkt urządzenia regulowany przez amerykańską FDA
Nie
Te informacje zostały pobrane bezpośrednio ze strony internetowej clinicaltrials.gov bez żadnych zmian. Jeśli chcesz zmienić, usunąć lub zaktualizować dane swojego badania, skontaktuj się z register@clinicaltrials.gov. Gdy tylko zmiana zostanie wprowadzona na stronie clinicaltrials.gov, zostanie ona automatycznie zaktualizowana również na naszej stronie internetowej .