Emergency PWAS bij respiratoire infectieziekte
Emergency PanorOmic Wide Association Study in Respiratory Infectious Disease (ePWAS-RID)
Een PanorOmics Wide Association Study (ePWAS) voor noodgevallen ontwikkelen voor de vroege, snelle biologische en pathofysiologische karakterisering van bekende en nieuwe infectieziekten bij volwassen patiënten die zich op de spoedeisende hulp presenteren met vermoedelijke, acute, buiten het ziekenhuis opgelopen respiratoire infectieziekte (scaRID).
Fase 1
- Ontwikkel een ED-ID biobank (genaamd ePWAS-RID). Fase 2
- Gericht onderzoek voor de ontdekking van nieuwe diagnostiek, prognostiek en therapieën
Studie Overzicht
Toestand
Conditie
Interventie / Behandeling
Gedetailleerde beschrijving
Invoering
Pandemische paraatheid
De COVID-19-pandemie heeft meer dan 220 miljoen mensen getroffen, meer dan 450.000 levens geëist en over de hele wereld tot wisselende reacties geleid. Vertragingen bij het verkrijgen van hoogwaardig klinisch en wetenschappelijk materiaal over de overdraagbaarheid, klinische aard, uitkomsten en dodelijkheid van nieuwe en bekende infectieziekten (ID) vertalen zich in inefficiëntie van de gezondheidszorg, maatschappelijke en economische stress en verhoogde morbiditeit en mortaliteit. Regio's met meer succes in de strijd tegen COVID-19 waren vóór de pandemie goed voorbereid.
Ziekteverwekkers
De ziekteverwekkers die het meest waarschijnlijk jaarlijkse epidemieën en pandemieën veroorzaken, zijn respiratoire virussen. In Azië zijn virale infecties verantwoordelijk voor 30-40% van de gevallen van sepsis. Elk jaar zijn er 100 miljoen gevallen van virale community-acquired pneumonie (CAP), waarvan 60% verergert tot sepsis. Deze virussen veroorzaken door de gastheer gemedieerde, inflammatoire immuunresponsen die door drie fasen verlopen: vooraf gereguleerde ontsteking; intermediaire ontregelde pro-ontsteking; en late ontregelde hypo-inflammatie.
Klinisch spectrum
RID is een heterogene patiëntenpopulatie. Dit complexe spectrum van heterogeniteit strekt zich uit over de onderliggende moleculaire biologie en pathofysiologie van genoom tot fenome. Het omvat significante individuele variatie in gereguleerde en ontregelde systemische inflammatoire gastheerreacties op infectie in aanwezigheid en afwezigheid van orgaandisfunctie. Kritieke ziekte van welke ID dan ook omvat zowel de gevoeligheid van de gastheer voor de ziekteverwekker als de neiging van de gastheer om ontregelde ontsteking en orgaanfalen te ontwikkelen (bijv. longontsteking en/of acuut nierletsel).
PanorOmics-brede associatiestudies
In de vijf jaar voorafgaand aan de COVID-19-pandemie rekruteerde de Genetics Of Mortality In Critical Care (GenOMICC)-studie in het Verenigd Koninkrijk patiënten met een spectrum van kritieke ziektesyndromen (bijv. griep, sepsis en opkomende infecties) om de gastheermechanismen die tot levensbedreigende uitkomsten leiden beter te begrijpen. Als gevolg hiervan waren de GenOMICC-onderzoekers, samen met medewerkers uit Spanje en Italië, goed geplaatst om genomische associatiestudies uit te voeren bij ernstig zieke COVID-19-patiënten en om aanbevelingen te doen voor toekomstige studies.
Een geïntegreerde panorOmics-benadering heeft het potentieel om causale associaties en verbanden bloot te leggen over het hele spectrum van gastheerbiologie, waaronder genomica, epigenomica, transcriptomics, proteomics, metabolomics en lipidomics, tot en met klinisch fenotype. PanorOmics als discipline staat echter voor dezelfde uitdagingen als genoombrede associatiestudies (GWAS), alleen meer. Hoewel GWAS genomische loci correleren met complexe handtekeningen en eigenschappen, wordt efficiënte detectie gehinderd door valse positieven, onevenwichtigheid in de koppeling en hoge kosten. Echte causale variaties en echte onderliggende associaties vereisen meerdere filters om ze te kunnen detecteren.
De onderzoekers stellen voor om een op ED gebaseerd systeem te ontwikkelen van dynamische studies op bloed- en speekselmonsters die zijn afgenomen bij patiënten in een vroeg stadium van ID. Vroeg stadium verwijst naar een proces in het patiëntentraject dat voorafgaat aan de meeste rekrutering van patiënten in andere onderzoeken, d.w.z. op afdelingen of op de IC. De twee hoofddoelstellingen zijn a) het ontwikkelen van een ED-ID biobank; en b) het uitvoeren van voorlopige ontdekkingen en gericht onderzoek voor de ontdekking van nieuwe diagnostiek, prognostiek en therapieën.
De onderzoekers zullen vroege multiOmics-handtekeningen van RID definiëren en relaties met bekende en nieuwe ID identificeren. Er zijn maar weinig studies gepubliceerd over de geïntegreerde panorOmics van COVID-19, en weinig of geen onderzoeken gaan in op de vroege fasen van ziekte of onderscheidende kenmerken in vergelijking met andere aandoeningen van de luchtwegen.
In ziektegestratificeerde, case-control gematchte vergelijkingen van volwassen patiënten met scaRID die naar SEH's gaan, welke panorOmische handtekeningen onderscheiden een laag risico van een hoog risico over een 30-daagse WHO-Clinical Progression Scale (WHO-CPS)?
Voor het doel van deze studie wordt scaRID gedefinieerd als:
- Koorts of koorts >37,5°C; EN
Een of meer relevante symptomen:
- ademhalingssymptomen (bijv. hoesten, kortademigheid), OF
- systemische symptomen (bijv. koude rillingen, stijfheid, myalgie), OF
- gastro-intestinale symptomen (bijv. misselijkheid, braken, diarree); EN
- Geen duidelijke alternatieve oorzaak (zie uitsluitingscriteria).
PanorOmic-associaties zullen worden afgeleid van vloeibare biopsiemonsters, waaronder volbloed, plasma, serum, witte-celpellet, erytrocyteneffluent, speekselsupernatant en speekselcellen. Biomarkers voor vloeibare biopsie omvatten genomische, transcriptomische, proteomische, metabolomische, lipidomische en hematologische inhoud.
Hypothese De onderzoekers veronderstellen dat bij propensity-matched, volwassen patiënten met pathogeenspecifieke en ziektespecifieke RID (bijv. SARS-CoV-2, Influenza A) zijn er significante verschillen in panorOmische handtekeningen die de gevoeligheid van de gastheer en de respons van de gastheer voor milde tot ernstige ziekte afbakenen.
Doelstellingen
Het doel van dit voorstel is om een PanorOmics Wide Association Study (ePWAS) biobank voor noodgevallen te ontwikkelen voor de vroege, snelle biologische en pathofysiologische karakterisatie van scaRID. Meer specifiek, bij volwassen patiënten die zich presenteren op SEH's met scaRID en binnen 10 dagen na het begin van de symptomen, streven we naar:
- Ontwikkeling van een ED-ePWAS-RID biobank van bloed- en speekselmonsters
- Deze databank gebruiken voor verkennend en gericht onderzoek in de zoektocht naar diagnostische en prognostische markers en om onderliggende ziektemechanismen te begrijpen
De doelstellingen van de biobank en de ePWAS-RID repository zijn:
- om de infrastructuur te ontwikkelen voor een duurzame op ED gebaseerde biobank van bloed- en speekselmonsters die zijn afgestemd op klinische fenotypes en kritische uitkomsten.
- om de repository te ontwikkelen volgens internationale normen, waardoor heterogeniteit wordt geminimaliseerd en het materiaal geschikt wordt gemaakt voor internationale onderzoekskaders die tot doel hebben de toegang tot menselijk biologisch materiaal te vergemakkelijken.
- een repository voorbereiden voor voorlopige ontdekking van nieuwe diagnostische, prognostische en therapeutische markers.
- om gericht onderzoek naar de pathogenese van luchtweginfecties, de gevoeligheid van de gastheer en de reactie van de gastheer te vergemakkelijken.
- afleiden van biomarkerplatforms van trainingssetmodellen voor vroege RID-detectie, pathogeendifferentiatie, monitoring, risicostratificatie en prognose; en om die modellen te valideren met behulp van onafhankelijke en externe datasets.
Studietype
Inschrijving (Verwacht)
Contacten en locaties
Studiecontact
- Naam: Timothy H Rainer, MD
- Telefoonnummer: +852 39176846
- E-mail: thrainer@hku.hk
Studie Locaties
-
-
-
Hong Kong, China
- Werving
- Hong Kong University
-
Contact:
- Timothy H Rainer, MD
- Telefoonnummer: 852 39176846
- E-mail: thrainer@hku.hk
-
-
Deelname Criteria
Geschiktheidscriteria
Leeftijden die in aanmerking komen voor studie
Accepteert gezonde vrijwilligers
Bemonsteringsmethode
Studie Bevolking
Beschrijving
Inclusiecriteria:
Patiënten die in aanmerking komen voor inschrijving zijn onder meer:
Met verwijzing naar eerdere opnamecriteria zijn:
- Volwassenen ≥18 jaar; EN
- Vermoedelijke, acute, buiten het ziekenhuis opgelopen infectieziekte van de luchtwegen (scaRID)*; EN
- Geïnformeerde toestemming.
Opmerking: scarID wordt gedefinieerd volgens ALLE drie criteria:
- Community verworven (niet in het ziekenhuis opgenomen gedurende <28 dagen); EN
- Acute infectie (gedefinieerd als aanvang van symptomen <8 dagen en een van de gemelde koorts of koude rillingen of gehoortemperatuur >37,5°C of hypothermie of leukocytose of leukopenie of een nieuwe veranderde mentale toestand); EN
Waarschijnlijke luchtweginfectie - Volgens een van de volgende:
- nieuwe hoest of nieuwe sputumproductie of
- pijn op de borst of
- dyspnoe of
- tachypneu of
- abnormaal longonderzoek of
- ademhalingsfalen; of
- oordeel van de arts (met systemische of gastro-intestinale symptomen).
Controlepersonen worden uit twee groepen getrokken:
- De bezorgde goed volwassen patiënten met een National Early Warning Score (NEWS) <3 en een temperatuur <37,5°C.
- Familieleden of begeleidende vrienden zonder acute ziekte.
Uitsluitingscriteria:
- Weigering van toestemming;
- Recente ziekenhuisopname (<28 dagen);
- Ingeschreven in een ander klinisch onderzoek
- Cellulitis;
- Huid- of orthopedische infecties;
- Urineweginfectie;
- Acute abdominale sepsis;
- Seksueel overdraagbare aandoening;
- Infectie met het humaan immunodeficiëntievirus (hiv);
- Immuungecompromitteerde/potentiële neutropenische koorts;
- Vaste-orgaan- of hematopoëtische stamceltransplantatie in de afgelopen 90 dagen;
- Actieve graft-versus-hostziekte of bronchiolitis obliterans;
- Ernstige reizigersziekte die dringende ziekenhuisopname en behandeling vereist, waaronder malaria, knokkelkoorts, tyfus en andere rickettsia-ziekten;
- Hartinfarct;
- Toxidroom;
- Niet-organische acute psychose.
Studie plan
Hoe is de studie opgezet?
Ontwerpdetails
Cohorten en interventies
Groep / Cohort |
Interventie / Behandeling |
|---|---|
|
Virale infectie
Personen met een virale infectie die zich binnen 8 dagen na het begin van de symptomen presenteren, zullen ten minste één volbloed en speeksel laten afnemen a) op de afdeling spoedeisende hulp (indien beschikbaar) of in het ziekenhuis binnen 8 dagen na het begin van de symptomen; en of ze het eens zijn
|
Drie perifere bloedmonsters van 10 - 20 ml (indien beschikbaar) Drie speekselmonsters van 1 - 5 ml (indien beschikbaar)
|
|
Bacteriële infectie
Patiënten met een bacteriële infectie die zich binnen 8 dagen na het begin van de symptomen presenteren, zullen ten minste één volbloed en speeksel laten afnemen a) op de afdeling spoedeisende hulp (indien beschikbaar) of in het ziekenhuis binnen 8 dagen na het begin van de symptomen; en als ze akkoord gaan, nog eens twee monsters bij b) 24 uur +/- 6 uur vanaf het begin van de symptomen (indien beschikbaar); en c) 48 uur +/- 6 uur vanaf het begin van de symptomen (indien beschikbaar).
|
Drie perifere bloedmonsters van 10 - 20 ml (indien beschikbaar) Drie speekselmonsters van 1 - 5 ml (indien beschikbaar)
|
|
Viraal-virale co-infectie
Viraal-virale co-infectie bij proefpersonen die zich binnen 8 dagen na het begin van de symptomen presenteren, zal ten minste één volbloed en speeksel worden afgenomen a) op de afdeling spoedeisende hulp (indien beschikbaar) of in het ziekenhuis binnen 8 dagen na het begin van de symptomen; en als ze akkoord gaan, nog eens twee monsters bij b) 24 uur +/- 6 uur vanaf het begin van de symptomen (indien beschikbaar); en c) 48 uur +/- 6 uur vanaf het begin van de symptomen (indien beschikbaar).
|
Drie perifere bloedmonsters van 10 - 20 ml (indien beschikbaar) Drie speekselmonsters van 1 - 5 ml (indien beschikbaar)
|
|
Bacterieel-virale co-infectie
Patiënten met een co-infectie met bacteriën en virussen die zich binnen 8 dagen na het begin van de symptomen presenteren, zullen ten minste één volbloed en speeksel laten afnemen a) op de afdeling spoedeisende hulp (indien beschikbaar) of in het ziekenhuis binnen 8 dagen na het begin van de symptomen; en als ze akkoord gaan, nog eens twee monsters bij b) 24 uur +/- 6 uur vanaf het begin van de symptomen (indien beschikbaar); en c) 48 uur +/- 6 uur vanaf het begin van de symptomen (indien beschikbaar).
|
Drie perifere bloedmonsters van 10 - 20 ml (indien beschikbaar) Drie speekselmonsters van 1 - 5 ml (indien beschikbaar)
|
|
Schimmel-Mycobacterium co-infectie
Patiënten met een co-infectie met bacteriën en virussen die zich binnen 8 dagen na het begin van de symptomen presenteren, zullen ten minste één volbloed en speeksel laten afnemen a) op de afdeling spoedeisende hulp (indien beschikbaar) of in het ziekenhuis binnen 8 dagen na het begin van de symptomen; en als ze akkoord gaan, nog eens twee monsters bij b) 24 uur +/- 6 uur vanaf het begin van de symptomen (indien beschikbaar); en c) 48 uur +/- 6 uur vanaf het begin van de symptomen (indien beschikbaar).
|
Drie perifere bloedmonsters van 10 - 20 ml (indien beschikbaar) Drie speekselmonsters van 1 - 5 ml (indien beschikbaar)
|
|
Infectie van onzekere oorsprong
Infectie van onbekende oorsprong Bij proefpersonen die zich binnen 8 dagen na het begin van de symptomen presenteren, wordt ten minste één volbloed en speeksel afgenomen a) op de afdeling spoedeisende hulp (indien beschikbaar) of in het ziekenhuis binnen 8 dagen na het begin van de symptomen; en als ze akkoord gaan, nog eens twee monsters bij b) 24 uur +/- 6 uur vanaf het begin van de symptomen (indien beschikbaar); en c) 48 uur +/- 6 uur vanaf het begin van de symptomen (indien beschikbaar).
|
Drie perifere bloedmonsters van 10 - 20 ml (indien beschikbaar) Drie speekselmonsters van 1 - 5 ml (indien beschikbaar)
|
|
Onderwerpen controleren
Proefpersonen uit de controlegroep zullen, als ze ermee instemmen, ten minste één volbloed en speeksel laten afnemen a) op de afdeling spoedeisende hulp (indien beschikbaar) of in het ziekenhuis binnen 8 dagen na het begin van de symptomen (indien van toepassing); en als ze akkoord gaan, nog eens twee monsters bij b) 24 uur +/- 6 uur vanaf het begin van de symptomen (indien van toepassing); en c) 48 uur +/- 6 uur vanaf het begin van de symptomen (indien van toepassing).
|
Drie perifere bloedmonsters van 10 - 20 ml (indien beschikbaar) Drie speekselmonsters van 1 - 5 ml (indien beschikbaar)
|
Wat meet het onderzoek?
Primaire uitkomstmaten
Uitkomstmaat |
Maatregel Beschrijving |
Tijdsspanne |
|---|---|---|
|
WIE-CPS
Tijdsspanne: Tot 30 dagen
|
Differentiatie van WHO-CPS >6 van WHO-CPS ≤6
|
Tot 30 dagen
|
Secundaire uitkomstmaten
Uitkomstmaat |
Maatregel Beschrijving |
Tijdsspanne |
|---|---|---|
|
Sterfte
Tijdsspanne: Tot 30 dagen
|
Sterfte wordt gedefinieerd als alle oorzaken, binair: ja of nee
|
Tot 30 dagen
|
|
Sterfte
Tijdsspanne: een jaar
|
Sterfte wordt gedefinieerd als alle oorzaken, binair: ja of nee
|
een jaar
|
Medewerkers en onderzoekers
Sponsor
Onderzoekers
- Hoofdonderzoeker: Timothy H Rainer, MD, The University of Hong Kong
Publicaties en nuttige links
Algemene publicaties
- Singer M, Deutschman CS, Seymour CW, Shankar-Hari M, Annane D, Bauer M, Bellomo R, Bernard GR, Chiche JD, Coopersmith CM, Hotchkiss RS, Levy MM, Marshall JC, Martin GS, Opal SM, Rubenfeld GD, van der Poll T, Vincent JL, Angus DC. The Third International Consensus Definitions for Sepsis and Septic Shock (Sepsis-3). JAMA. 2016 Feb 23;315(8):801-10. doi: 10.1001/jama.2016.0287.
- Li Q, Guan X, Wu P, Wang X, Zhou L, Tong Y, Ren R, Leung KSM, Lau EHY, Wong JY, Xing X, Xiang N, Wu Y, Li C, Chen Q, Li D, Liu T, Zhao J, Liu M, Tu W, Chen C, Jin L, Yang R, Wang Q, Zhou S, Wang R, Liu H, Luo Y, Liu Y, Shao G, Li H, Tao Z, Yang Y, Deng Z, Liu B, Ma Z, Zhang Y, Shi G, Lam TTY, Wu JT, Gao GF, Cowling BJ, Yang B, Leung GM, Feng Z. Early Transmission Dynamics in Wuhan, China, of Novel Coronavirus-Infected Pneumonia. N Engl J Med. 2020 Mar 26;382(13):1199-1207. doi: 10.1056/NEJMoa2001316. Epub 2020 Jan 29.
- Hung IF, Lung KC, Tso EY, Liu R, Chung TW, Chu MY, Ng YY, Lo J, Chan J, Tam AR, Shum HP, Chan V, Wu AK, Sin KM, Leung WS, Law WL, Lung DC, Sin S, Yeung P, Yip CC, Zhang RR, Fung AY, Yan EY, Leung KH, Ip JD, Chu AW, Chan WM, Ng AC, Lee R, Fung K, Yeung A, Wu TC, Chan JW, Yan WW, Chan WM, Chan JF, Lie AK, Tsang OT, Cheng VC, Que TL, Lau CS, Chan KH, To KK, Yuen KY. Triple combination of interferon beta-1b, lopinavir-ritonavir, and ribavirin in the treatment of patients admitted to hospital with COVID-19: an open-label, randomised, phase 2 trial. Lancet. 2020 May 30;395(10238):1695-1704. doi: 10.1016/S0140-6736(20)31042-4. Epub 2020 May 10.
- WHO Working Group on the Clinical Characterisation and Management of COVID-19 infection. A minimal common outcome measure set for COVID-19 clinical research. Lancet Infect Dis. 2020 Aug;20(8):e192-e197. doi: 10.1016/S1473-3099(20)30483-7. Epub 2020 Jun 12. Erratum In: Lancet Infect Dis. 2020 Oct;20(10):e250.
- Cohen JF, Korevaar DA, Altman DG, Bruns DE, Gatsonis CA, Hooft L, Irwig L, Levine D, Reitsma JB, de Vet HC, Bossuyt PM. STARD 2015 guidelines for reporting diagnostic accuracy studies: explanation and elaboration. BMJ Open. 2016 Nov 14;6(11):e012799. doi: 10.1136/bmjopen-2016-012799.
- Taylor JC, Martin HC, Lise S, Broxholme J, Cazier JB, Rimmer A, Kanapin A, Lunter G, Fiddy S, Allan C, Aricescu AR, Attar M, Babbs C, Becq J, Beeson D, Bento C, Bignell P, Blair E, Buckle VJ, Bull K, Cais O, Cario H, Chapel H, Copley RR, Cornall R, Craft J, Dahan K, Davenport EE, Dendrou C, Devuyst O, Fenwick AL, Flint J, Fugger L, Gilbert RD, Goriely A, Green A, Greger IH, Grocock R, Gruszczyk AV, Hastings R, Hatton E, Higgs D, Hill A, Holmes C, Howard M, Hughes L, Humburg P, Johnson D, Karpe F, Kingsbury Z, Kini U, Knight JC, Krohn J, Lamble S, Langman C, Lonie L, Luck J, McCarthy D, McGowan SJ, McMullin MF, Miller KA, Murray L, Nemeth AH, Nesbit MA, Nutt D, Ormondroyd E, Oturai AB, Pagnamenta A, Patel SY, Percy M, Petousi N, Piazza P, Piret SE, Polanco-Echeverry G, Popitsch N, Powrie F, Pugh C, Quek L, Robbins PA, Robson K, Russo A, Sahgal N, van Schouwenburg PA, Schuh A, Silverman E, Simmons A, Sorensen PS, Sweeney E, Taylor J, Thakker RV, Tomlinson I, Trebes A, Twigg SR, Uhlig HH, Vyas P, Vyse T, Wall SA, Watkins H, Whyte MP, Witty L, Wright B, Yau C, Buck D, Humphray S, Ratcliffe PJ, Bell JI, Wilkie AO, Bentley D, Donnelly P, McVean G. Factors influencing success of clinical genome sequencing across a broad spectrum of disorders. Nat Genet. 2015 Jul;47(7):717-726. doi: 10.1038/ng.3304. Epub 2015 May 18.
- Niederman MS, Mandell LA, Anzueto A, Bass JB, Broughton WA, Campbell GD, Dean N, File T, Fine MJ, Gross PA, Martinez F, Marrie TJ, Plouffe JF, Ramirez J, Sarosi GA, Torres A, Wilson R, Yu VL; American Thoracic Society. Guidelines for the management of adults with community-acquired pneumonia. Diagnosis, assessment of severity, antimicrobial therapy, and prevention. Am J Respir Crit Care Med. 2001 Jun;163(7):1730-54. doi: 10.1164/ajrccm.163.7.at1010. No abstract available.
- Jain S, Self WH, Wunderink RG, Fakhran S, Balk R, Bramley AM, Reed C, Grijalva CG, Anderson EJ, Courtney DM, Chappell JD, Qi C, Hart EM, Carroll F, Trabue C, Donnelly HK, Williams DJ, Zhu Y, Arnold SR, Ampofo K, Waterer GW, Levine M, Lindstrom S, Winchell JM, Katz JM, Erdman D, Schneider E, Hicks LA, McCullers JA, Pavia AT, Edwards KM, Finelli L; CDC EPIC Study Team. Community-Acquired Pneumonia Requiring Hospitalization among U.S. Adults. N Engl J Med. 2015 Jul 30;373(5):415-27. doi: 10.1056/NEJMoa1500245. Epub 2015 Jul 14.
- Davenport EE, Burnham KL, Radhakrishnan J, Humburg P, Hutton P, Mills TC, Rautanen A, Gordon AC, Garrard C, Hill AV, Hinds CJ, Knight JC. Genomic landscape of the individual host response and outcomes in sepsis: a prospective cohort study. Lancet Respir Med. 2016 Apr;4(4):259-71. doi: 10.1016/S2213-2600(16)00046-1. Epub 2016 Feb 23.
- He X, Lau EHY, Wu P, Deng X, Wang J, Hao X, Lau YC, Wong JY, Guan Y, Tan X, Mo X, Chen Y, Liao B, Chen W, Hu F, Zhang Q, Zhong M, Wu Y, Zhao L, Zhang F, Cowling BJ, Li F, Leung GM. Temporal dynamics in viral shedding and transmissibility of COVID-19. Nat Med. 2020 May;26(5):672-675. doi: 10.1038/s41591-020-0869-5. Epub 2020 Apr 15. Erratum In: Nat Med. 2020 Sep;26(9):1491-1493.
- Williamson EJ, Walker AJ, Bhaskaran K, Bacon S, Bates C, Morton CE, Curtis HJ, Mehrkar A, Evans D, Inglesby P, Cockburn J, McDonald HI, MacKenna B, Tomlinson L, Douglas IJ, Rentsch CT, Mathur R, Wong AYS, Grieve R, Harrison D, Forbes H, Schultze A, Croker R, Parry J, Hester F, Harper S, Perera R, Evans SJW, Smeeth L, Goldacre B. Factors associated with COVID-19-related death using OpenSAFELY. Nature. 2020 Aug;584(7821):430-436. doi: 10.1038/s41586-020-2521-4. Epub 2020 Jul 8.
- Sharfstein JM, Becker SJ, Mello MM. Diagnostic Testing for the Novel Coronavirus. JAMA. 2020 Apr 21;323(15):1437-1438. doi: 10.1001/jama.2020.3864. No abstract available.
- Leung K, Wu JT, Liu D, Leung GM. First-wave COVID-19 transmissibility and severity in China outside Hubei after control measures, and second-wave scenario planning: a modelling impact assessment. Lancet. 2020 Apr 25;395(10233):1382-1393. doi: 10.1016/S0140-6736(20)30746-7. Epub 2020 Apr 8.
- Pairo-Castineira E, Clohisey S, Klaric L, Bretherick AD, Rawlik K, Pasko D, Walker S, Parkinson N, Fourman MH, Russell CD, Furniss J, Richmond A, Gountouna E, Wrobel N, Harrison D, Wang B, Wu Y, Meynert A, Griffiths F, Oosthuyzen W, Kousathanas A, Moutsianas L, Yang Z, Zhai R, Zheng C, Grimes G, Beale R, Millar J, Shih B, Keating S, Zechner M, Haley C, Porteous DJ, Hayward C, Yang J, Knight J, Summers C, Shankar-Hari M, Klenerman P, Turtle L, Ho A, Moore SC, Hinds C, Horby P, Nichol A, Maslove D, Ling L, McAuley D, Montgomery H, Walsh T, Pereira AC, Renieri A; GenOMICC Investigators; ISARIC4C Investigators; COVID-19 Human Genetics Initiative; 23andMe Investigators; BRACOVID Investigators; Gen-COVID Investigators; Shen X, Ponting CP, Fawkes A, Tenesa A, Caulfield M, Scott R, Rowan K, Murphy L, Openshaw PJM, Semple MG, Law A, Vitart V, Wilson JF, Baillie JK. Genetic mechanisms of critical illness in COVID-19. Nature. 2021 Mar;591(7848):92-98. doi: 10.1038/s41586-020-03065-y. Epub 2020 Dec 11.
- Legido-Quigley H, Asgari N, Teo YY, Leung GM, Oshitani H, Fukuda K, Cook AR, Hsu LY, Shibuya K, Heymann D. Are high-performing health systems resilient against the COVID-19 epidemic? Lancet. 2020 Mar 14;395(10227):848-850. doi: 10.1016/S0140-6736(20)30551-1. Epub 2020 Mar 6. No abstract available.
- Lam TT, Jia N, Zhang YW, Shum MH, Jiang JF, Zhu HC, Tong YG, Shi YX, Ni XB, Liao YS, Li WJ, Jiang BG, Wei W, Yuan TT, Zheng K, Cui XM, Li J, Pei GQ, Qiang X, Cheung WY, Li LF, Sun FF, Qin S, Huang JC, Leung GM, Holmes EC, Hu YL, Guan Y, Cao WC. Identifying SARS-CoV-2-related coronaviruses in Malayan pangolins. Nature. 2020 Jul;583(7815):282-285. doi: 10.1038/s41586-020-2169-0. Epub 2020 Mar 26.
- Tsang KW, Ho PL, Ooi GC, Yee WK, Wang T, Chan-Yeung M, Lam WK, Seto WH, Yam LY, Cheung TM, Wong PC, Lam B, Ip MS, Chan J, Yuen KY, Lai KN. A cluster of cases of severe acute respiratory syndrome in Hong Kong. N Engl J Med. 2003 May 15;348(20):1977-85. doi: 10.1056/NEJMoa030666. Epub 2003 Mar 31.
- Wai AKC, Wong CKH, Wong JYH, Xiong X, Chu OCK, Wong MS, Tsui MSH, Rainer TH. Changes in Emergency Department Visits, Diagnostic Groups, and 28-Day Mortality Associated With the COVID-19 Pandemic: A Territory-Wide, Retrospective, Cohort Study. Ann Emerg Med. 2022 Feb;79(2):148-157. doi: 10.1016/j.annemergmed.2021.09.424. Epub 2021 Sep 24.
- Southeast Asia Infectious Disease Clinical Research Network. Causes and outcomes of sepsis in southeast Asia: a multinational multicentre cross-sectional study. Lancet Glob Health. 2017 Feb;5(2):e157-e167. doi: 10.1016/S2214-109X(17)30007-4.
- Gu X, Zhou F, Wang Y, Fan G, Cao B. Respiratory viral sepsis: epidemiology, pathophysiology, diagnosis and treatment. Eur Respir Rev. 2020 Jul 21;29(157):200038. doi: 10.1183/16000617.0038-2020. Print 2020 Sep 30.
- Su Y, Chen D, Yuan D, Lausted C, Choi J, Dai CL, Voillet V, Duvvuri VR, Scherler K, Troisch P, Baloni P, Qin G, Smith B, Kornilov SA, Rostomily C, Xu A, Li J, Dong S, Rothchild A, Zhou J, Murray K, Edmark R, Hong S, Heath JE, Earls J, Zhang R, Xie J, Li S, Roper R, Jones L, Zhou Y, Rowen L, Liu R, Mackay S, O'Mahony DS, Dale CR, Wallick JA, Algren HA, Zager MA; ISB-Swedish COVID19 Biobanking Unit; Wei W, Price ND, Huang S, Subramanian N, Wang K, Magis AT, Hadlock JJ, Hood L, Aderem A, Bluestone JA, Lanier LL, Greenberg PD, Gottardo R, Davis MM, Goldman JD, Heath JR. Multi-Omics Resolves a Sharp Disease-State Shift between Mild and Moderate COVID-19. Cell. 2020 Dec 10;183(6):1479-1495.e20. doi: 10.1016/j.cell.2020.10.037. Epub 2020 Oct 28.
- Rautanen A, Mills TC, Gordon AC, Hutton P, Steffens M, Nuamah R, Chiche JD, Parks T, Chapman SJ, Davenport EE, Elliott KS, Bion J, Lichtner P, Meitinger T, Wienker TF, Caulfield MJ, Mein C, Bloos F, Bobek I, Cotogni P, Sramek V, Sarapuu S, Kobilay M, Ranieri VM, Rello J, Sirgo G, Weiss YG, Russwurm S, Schneider EM, Reinhart K, Holloway PA, Knight JC, Garrard CS, Russell JA, Walley KR, Stuber F, Hill AV, Hinds CJ; ESICM/ECCRN GenOSept Investigators. Genome-wide association study of survival from sepsis due to pneumonia: an observational cohort study. Lancet Respir Med. 2015 Jan;3(1):53-60. doi: 10.1016/S2213-2600(14)70290-5. Epub 2014 Dec 18.
- Davenport EE, Antrobus RD, Lillie PJ, Gilbert S, Knight JC. Transcriptomic profiling facilitates classification of response to influenza challenge. J Mol Med (Berl). 2015 Jan;93(1):105-14. doi: 10.1007/s00109-014-1212-8. Epub 2014 Oct 28.
- Dissanayake TK, Schauble S, Mirhakkak MH, Wu WL, Ng AC, Yip CCY, Lopez AG, Wolf T, Yeung ML, Chan KH, Yuen KY, Panagiotou G, To KK. Comparative Transcriptomic Analysis of Rhinovirus and Influenza Virus Infection. Front Microbiol. 2020 Jul 21;11:1580. doi: 10.3389/fmicb.2020.01580. eCollection 2020. Erratum In: Front Microbiol. 2020 Oct 29;11:602854.
- To KKW, Lu L, Fong CHY, Wu AKL, Mok KY, Yip CCY, Ke YH, Sze KH, Lau SKP, Hung IFN, Yuen KY. Rhinovirus respiratory tract infection in hospitalized adult patients is associated with TH2 response irrespective of asthma. J Infect. 2018 May;76(5):465-474. doi: 10.1016/j.jinf.2018.02.005. Epub 2018 Feb 15.
- Khaliq W, Grossmann P, Neugebauer S, Kleyman A, Domizi R, Calcinaro S, Brealey D, Graler M, Kiehntopf M, Schauble S, Singer M, Panagiotou G, Bauer M. Lipid metabolic signatures deviate in sepsis survivors compared to non-survivors. Comput Struct Biotechnol J. 2020 Nov 21;18:3678-3691. doi: 10.1016/j.csbj.2020.11.009. eCollection 2020.
- Wainberg M, Sinnott-Armstrong N, Mancuso N, Barbeira AN, Knowles DA, Golan D, Ermel R, Ruusalepp A, Quertermous T, Hao K, Bjorkegren JLM, Im HK, Pasaniuc B, Rivas MA, Kundaje A. Opportunities and challenges for transcriptome-wide association studies. Nat Genet. 2019 Apr;51(4):592-599. doi: 10.1038/s41588-019-0385-z. Epub 2019 Mar 29.
- GTEx Consortium. Human genomics. The Genotype-Tissue Expression (GTEx) pilot analysis: multitissue gene regulation in humans. Science. 2015 May 8;348(6235):648-60. doi: 10.1126/science.1262110. Epub 2015 May 7.
- Tam V, Patel N, Turcotte M, Bosse Y, Pare G, Meyre D. Benefits and limitations of genome-wide association studies. Nat Rev Genet. 2019 Aug;20(8):467-484. doi: 10.1038/s41576-019-0127-1.
- Howey R, Shin SY, Relton C, Davey Smith G, Cordell HJ. Bayesian network analysis incorporating genetic anchors complements conventional Mendelian randomization approaches for exploratory analysis of causal relationships in complex data. PLoS Genet. 2020 Mar 2;16(3):e1008198. doi: 10.1371/journal.pgen.1008198. eCollection 2020 Mar.
- Davies NM, Holmes MV, Davey Smith G. Reading Mendelian randomisation studies: a guide, glossary, and checklist for clinicians. BMJ. 2018 Jul 12;362:k601. doi: 10.1136/bmj.k601.
- Roadmap Epigenomics Consortium; Kundaje A, Meuleman W, Ernst J, Bilenky M, Yen A, Heravi-Moussavi A, Kheradpour P, Zhang Z, Wang J, Ziller MJ, Amin V, Whitaker JW, Schultz MD, Ward LD, Sarkar A, Quon G, Sandstrom RS, Eaton ML, Wu YC, Pfenning AR, Wang X, Claussnitzer M, Liu Y, Coarfa C, Harris RA, Shoresh N, Epstein CB, Gjoneska E, Leung D, Xie W, Hawkins RD, Lister R, Hong C, Gascard P, Mungall AJ, Moore R, Chuah E, Tam A, Canfield TK, Hansen RS, Kaul R, Sabo PJ, Bansal MS, Carles A, Dixon JR, Farh KH, Feizi S, Karlic R, Kim AR, Kulkarni A, Li D, Lowdon R, Elliott G, Mercer TR, Neph SJ, Onuchic V, Polak P, Rajagopal N, Ray P, Sallari RC, Siebenthall KT, Sinnott-Armstrong NA, Stevens M, Thurman RE, Wu J, Zhang B, Zhou X, Beaudet AE, Boyer LA, De Jager PL, Farnham PJ, Fisher SJ, Haussler D, Jones SJ, Li W, Marra MA, McManus MT, Sunyaev S, Thomson JA, Tlsty TD, Tsai LH, Wang W, Waterland RA, Zhang MQ, Chadwick LH, Bernstein BE, Costello JF, Ecker JR, Hirst M, Meissner A, Milosavljevic A, Ren B, Stamatoyannopoulos JA, Wang T, Kellis M. Integrative analysis of 111 reference human epigenomes. Nature. 2015 Feb 19;518(7539):317-30. doi: 10.1038/nature14248.
- Yang JK, Wang YY, Liu C, Shi TT, Lu J, Cao X, Yang FY, Feng JP, Chen C, Ji LN, Xu A. Urine Proteome Specific for Eye Damage Can Predict Kidney Damage in Patients With Type 2 Diabetes: A Case-Control and a 5.3-Year Prospective Cohort Study. Diabetes Care. 2017 Feb;40(2):253-260. doi: 10.2337/dc16-1529. Epub 2016 Nov 30.
- Harati MD, Williams RR, Movassaghi M, Hojat A, Lucey GM, Yong WH. An Introduction to Starting a Biobank. Methods Mol Biol. 2019;1897:7-16. doi: 10.1007/978-1-4939-8935-5_2.
- Field N, Cohen T, Struelens MJ, Palm D, Cookson B, Glynn JR, Gallo V, Ramsay M, Sonnenberg P, Maccannell D, Charlett A, Egger M, Green J, Vineis P, Abubakar I. Strengthening the Reporting of Molecular Epidemiology for Infectious Diseases (STROME-ID): an extension of the STROBE statement. Lancet Infect Dis. 2014 Apr;14(4):341-52. doi: 10.1016/S1473-3099(13)70324-4. Epub 2014 Mar 14.
Nuttige links
Studie record data
Bestudeer belangrijke data
Studie start (Werkelijk)
Primaire voltooiing (Verwacht)
Studie voltooiing (Verwacht)
Studieregistratiedata
Eerst ingediend
Eerst ingediend dat voldeed aan de QC-criteria
Eerst geplaatst (Werkelijk)
Updates van studierecords
Laatste update geplaatst (Werkelijk)
Laatste update ingediend die voldeed aan QC-criteria
Laatst geverifieerd
Meer informatie
Termen gerelateerd aan deze studie
Trefwoorden
Aanvullende relevante MeSH-voorwaarden
Andere studie-ID-nummers
- ePWAS-RID/Rainer/2021
Plan Individuele Deelnemersgegevens (IPD)
Bent u van plan om gegevens van individuele deelnemers (IPD) te delen?
Informatie over medicijnen en apparaten, studiedocumenten
Bestudeert een door de Amerikaanse FDA gereguleerd geneesmiddel
Bestudeert een door de Amerikaanse FDA gereguleerd apparaatproduct
Deze informatie is zonder wijzigingen rechtstreeks van de website clinicaltrials.gov gehaald. Als u verzoeken heeft om uw onderzoeksgegevens te wijzigen, te verwijderen of bij te werken, neem dan contact op met register@clinicaltrials.gov. Zodra er een wijziging wordt doorgevoerd op clinicaltrials.gov, wordt deze ook automatisch bijgewerkt op onze website .