Analýzy střevních mikrobiomů, orálních mikrobiomů a transkriptomů plné krve u gastrointestinálních malignit

Primárním cílem této prospektivní observační studie je charakterizovat střevní a orální mikrobiom a také transkriptom plné krve u pacientů s rakovinou gastrointestinálního traktu a korelovat tato zjištění s typem rakoviny, účinností léčby a toxicitou.

Tato studie poskytne biovzorky od různého spektra pacientů s rakovinou gastrointestinálního traktu, aby umožnila předběžnou charakterizaci rozmanitosti a složení mikrobiomu GIM a pilotní analýzu změn v mikrobiomu jako funkce léčby i progrese onemocnění.

Toto je prospektivní kohortová studie, která bude charakterizovat a hodnotit mikrobiom pacientů s GIM s různými histologiemi. Vyšetřovatelé plánují zařadit 200 pacientů s diagnózou rakoviny trávicího traktu včetně rakoviny slinivky břišní, jícnu, žaludku, tlustého střeva, konečníku, jater a žlučových cest s (i) nově diagnostikovaným rekurentním nebo metastatickým onemocněním zahajujícím léčbu nebo (ii) s progresivním onemocněním na druhém, resp. pozdější liniové terapie nebo (iii) s lokálně pokročilým, inoperabilním onemocněním, které dostává paliativní terapii. Vzorky stolice, krve a slin budou odebírány na začátku léčby (3-6 týdnů) a poté v 3měsíčních intervalech až do progrese nebo netolerovatelné toxicity nebo až do 36 měsíců.

Očekává se, že výsledky této studie poskytnou základ pro větší, více zaměřené studie mikrobiomu v různých GIM a vztahu ke specifické účinnosti léčby a toxicitě. V konečném důsledku může tato klasifikace mikrobiomu gastrointestinálního karcinomu vést k novým paradigmatům stratifikace rizika, novým léčebným a udržovacím strategiím. Kromě toho může tato studie vést ke zlepšení diagnostiky, doprovodné diagnostiky a nutričních intervencí pro prevenci a terapii rakoviny.