Intestinal mikrobiom, oral mikrobiom og fuldblods transkriptomanalyser i gastrointestinale maligniteter

Det primære formål med denne prospektive observationsundersøgelse er at karakterisere tarm- og oralmikrobiomet samt fuldblodstranskriptomet hos patienter med mave-tarmkræft og korrelere disse fund med cancertype, behandlingseffektivitet og toksicitet.

Denne undersøgelse vil give bioprøver fra en bred vifte af mave-tarmkræftpatienter for at muliggøre foreløbig karakterisering af mangfoldigheden og sammensætningen af ​​GIM-mikrobiomet og pilotanalyse af ændringer i mikrobiomet som funktion af både behandling og sygdomsprogression.

Dette er et prospektivt kohortestudie, der vil karakterisere og evaluere mikrobiomet hos GIM-patienter med forskellige histologier. Efterforskerne planlægger at indskrive 200 patienter med en diagnose af mave-tarmkræft, herunder pancreas-, spiserørs-, mave-, tyktarms-, rektal-, lever- og galdekræft med (i) nyligt diagnosticeret tilbagevendende eller metastatisk sygdom, der starter behandling eller (ii) med progressiv sygdom efter anden eller senere linjebehandlinger, eller (iii) med lokalt fremskreden, inoperabel sygdom, der modtager palliativ terapi. Afførings-, blod- og spytprøver vil blive indsamlet ved baseline, tidligt i behandlingen (3-6 uger) og derefter med 3 måneders intervaller indtil progression eller utålelig toksicitet eller op til 36 måneder.

Resultaterne af denne undersøgelse forventes at danne grundlag for større, mere fokuserede undersøgelser af mikrobiomet i forskellige GIM'er og forhold til specifik behandlingseffektivitet og toksicitet. I sidste ende kan denne klassificering af det gastrointestinale cancermikrobiom føre til nye risikostratificeringsparadigmer, nye behandlinger og vedligeholdelsesstrategier. Desuden kan denne undersøgelse føre til forbedret diagnostik, ledsagende diagnostik og ernæringsmæssige interventioner til forebyggelse og behandling af kræft.