Intestinal mikrobiom, oral mikrobiom og helblods transkriptomanalyser i gastrointestinale maligniteter

Det primære formålet med denne prospektive observasjonsstudien er å karakterisere tarm- og oralmikrobiomet samt fullblodstranskriptomet hos gastrointestinale kreftpasienter og korrelere disse funnene med krefttype, behandlingseffekt og toksisitet.

Denne studien vil gi bioprøver fra et mangfoldig utvalg av gastrointestinale kreftpasienter for å tillate foreløpig karakterisering av mangfoldet og sammensetningen av GIM-mikrobiomet og pilotanalyse av endringer i mikrobiomet som en funksjon av både behandling og sykdomsprogresjon.

Dette er en prospektiv kohortstudie som skal karakterisere og evaluere mikrobiomet til GIM-pasienter, med ulike histologier. Etterforskerne planlegger å rekruttere 200 pasienter med en diagnose av gastrointestinal kreft, inkludert kreft i bukspyttkjertelen, spiserøret, mage, tykktarm, rektal, lever og galleveier med (i) nylig diagnostisert tilbakevendende eller metastatisk sykdom som starter behandling eller (ii) med progressiv sykdom ved andre eller senere linjebehandlinger, eller (iii) med lokalt avansert, inoperabel sykdom som mottar palliativ terapi. Avførings-, blod- og spyttprøver vil bli tatt ved baseline, tidlig i behandlingen (3-6 uker), og deretter med 3 måneders mellomrom inntil progresjon eller utålelig toksisitet eller opptil 36 måneder.

Resultatene av denne studien forventes å gi grunnlag for større, mer fokuserte studier av mikrobiomet i distinkte GIM og forhold til spesifikk behandlingseffekt og toksisitet. Til syvende og sist kan denne klassifiseringen av gastrointestinal kreftmikrobiomet føre til nye risikostratifiseringsparadigmer, nye behandlinger og vedlikeholdsstrategier. Videre kan denne studien føre til forbedret diagnostikk, ledsagerdiagnostikk og ernæringsintervensjoner for kreftforebygging og terapi.