Časná sepse translační biologická informatika u lidí (ESTABLISH)

Pozadí:

Sepse je nejčastější diagnózou u pacientů přijatých na JIP. Klíčovým faktorem tohoto syndromu je nekontrolovaná lokální infekce, která vede k diseminovaným změnám v imunitním systému. Sepse je spojena s obrovskou heterogenitou u pacientů s predisponujícími rizikovými faktory, mechanismy akutního poškození přispívajících k infekci, projevujícími se symptomy, odpovědí na terapie a také krátkodobými a dlouhodobými výsledky. Od první standardizace definic sepse před 30 lety byl učiněn významný pohled na biologické mechanismy přispívající k sepsi. Existuje však mnoho důležitých nezodpovězených otázek, které brání přesné diagnóze, léčbě a prognóze pacientů přicházejících na JIP s časnou sepsí.

Z mnoha mezer v biologii sepse, které zůstávají nezodpovězeny, jsou zvláště důležité následující: (1) co představuje dysregulaci imunitního systému; (2) jak reakce imunitního systému závisí na interakci s infikujícími patogeny; a (3) jaké jsou biologické znaky, které odlišují jiné diagnózy napodobující tento syndrom. K vyřešení těchto otázek a ke zlepšení našeho porozumění tomuto složitému a heterogennímu syndromu je zapotřebí mnohostranný přístup založený na spolupráci. Tato studie bude zkoumat biologii časné sepse u kriticky nemocných pacientů vytvořením longitudinální prospektivní observační kohorty nazvané Early Sepsis TrAnslational BioLogy InformaticS in Humans (ESTABLISH).

Konkrétní cíle:

Cíl 1: Studium biologických mechanismů regulace imunitního systému během časné sepse. Tři hlavní otázky, které budou řešeny, zahrnují: (1) jak imunitní funkce v době přijetí a v průběhu pobytu na JIP souvisí s klinickými komplikacemi; (2) jak je anatomická kompartmentalizace imunitních odpovědí spojena s klinickými komplikacemi; (3) jak imunitní reakce v různých anatomických místech přispívají k poškození endoteliálních buněk

Cíl 2: Charakterizovat interakci hostitel-patogen během časné sepse. Hlavní otázka, která bude řešena, zahrnuje: (1) jak mikrobiální složení v době přijetí na JIP ovlivňuje imunitní odpověď; (2) jak změna interakcí hostitel-patogen v průběhu času ovlivňuje klinické komplikace.

Cíl 3: Identifikovat biologické znaky, které odlišují pacienty s časnou sepsí od ostatních kriticky nemocných pacientů. Hlavní otázky, které budou řešeny, zahrnují: (1) jsou biologické vlaky jedinečné pro sepsi nebo jsou sdíleny jinými klinickými diagnózami, které napodobují sepsi?; (2) může přesně předpovídat klinicky důležité krátkodobé a dlouhodobé výsledky pacientů?; (3) Jsou biologické rysy spojeny s rozdílnými reakcemi na terapie?

Metody:

Kohorta ESTABLISH zařadí pacienty do 48 hodin od přijetí na JIP, kteří se dostaví na pohotovost do 72 hodin od přijetí na JIP. Pacienti budou zařazováni s odloženým souhlasem, aby bylo možné co nejdříve odebrat biologické vzorky. Biologický vzorek bude obsahovat antikoagulovanou krev, zkumavku s genem PAX a vzorek tekutiny z bronchioalveolární laváže (BALF) (u mechanicky ventilovaných pacientů, kdy je bronchoskopie klinicky indikována) odebrané v době přijetí na JIP (den 0) a 4. časové body během příjmu na JIP (1., 3., 7., 14. den).

Data generovaná během ESTABLISH budou analyzována v dávkách průběžně, pravidelně a budou cíleně specifická. Příprava šaržových vzorků a analýza dat minimalizují biologický test a metodologickou heterogenitu. Data cíle 1 a 2 budou analyzována po zařazení prvních 50 pacientů a poté každých 50 pacientů. Data cíle 3 budou analyzována po zařazení prvních 200 pacientů a poté každých 200 pacientů.