Wczesna Sepsa Translacyjna Biologia Informatyczna u ludzi (ESTABLISH)

Tło:

Sepsa jest najczęstszym rozpoznaniem u pacjentów przyjmowanych na OIT. Niekontrolowana lokalna infekcja, która powoduje rozsiane zmiany w układzie odpornościowym, jest kluczowym czynnikiem wywołującym ten zespół. Sepsa wiąże się z ogromną heterogenicznością pacjentów predysponujących do czynników ryzyka, mechanizmów ostrego urazu przyczyniających się do zakażenia, prezentowanych objawów, odpowiedzi na terapie, a także krótko- i długoterminowych wyników. Od czasu pierwszej standaryzacji definicji sepsy 30 lat temu dokonano znaczącego wglądu w mechanizmy biologiczne przyczyniające się do sepsy. Istnieje jednak wiele ważnych pytań bez odpowiedzi, które uniemożliwiają dokładne rozpoznanie, leczenie i rokowanie pacjentów zgłaszających się na OIOM z wczesną sepsą.

Spośród wielu luk w biologii sepsy, które pozostają bez odpowiedzi, szczególnie ważne są następujące: (1) co stanowi dysregulację układu odpornościowego; (2) w jaki sposób odpowiedź układu odpornościowego zależy od interakcji z infekującymi patogenami; oraz (3) jakie cechy biologiczne wyróżniają inne rozpoznania naśladujące ten zespół. Aby odpowiedzieć na te pytania i poprawić nasze zrozumienie tego złożonego i heterogenicznego zespołu, potrzebne jest wielopłaszczyznowe i oparte na współpracy podejście. W tym badaniu zbadana zostanie biologia wczesnej sepsy u pacjentów w stanie krytycznym poprzez opracowanie długoterminowej prospektywnej kohorty obserwacyjnej o nazwie Early Sepsis TrAnslational BioLogy InformaticS in Humans (ESTABLISH).

Konkretne cele:

Cel 1: Zbadanie biologicznych mechanizmów regulacji układu odpornościowego podczas wczesnej sepsy. Trzy główne pytania, które zostaną poruszone, obejmują: (1) w jaki sposób funkcja odpornościowa w momencie przyjęcia iw trakcie pobytu na OIOM-ie jest związana z powikłaniami klinicznymi; (2) w jaki sposób anatomiczna kompartmentalizacja odpowiedzi immunologicznych jest związana z powikłaniami klinicznymi; (3) w jaki sposób odpowiedzi immunologiczne w różnych lokalizacjach anatomicznych przyczyniają się do uszkodzenia komórek śródbłonka

Cel 2: Scharakteryzowanie interakcji żywiciel-patogen podczas wczesnej sepsy. Główne pytania, które zostaną poruszone, obejmują: (1) jak skład drobnoustrojów w momencie przyjęcia na OIOM wpływa na odpowiedź immunologiczną; (2) w jaki sposób zmiana interakcji żywiciel-patogen w czasie wpływa na powikłania kliniczne.

Cel 3: Identyfikacja cech biologicznych, które odróżniają pacjentów z wczesną sepsą od innych pacjentów w stanie krytycznym. Główne pytania, które zostaną poruszone, obejmują: (1) czy pociągi biologiczne są unikalne dla sepsy, czy też są wspólne dla innych diagnoz klinicznych naśladujących sepsę?; (2) potrafi dokładnie prognozować krótko- i długoterminowe wyniki pacjentów o znaczeniu klinicznym?; (3) czy cechy biologiczne są związane z różnymi odpowiedziami na terapie?

Metody:

Kohorta ESTABLISH zapisze pacjentów w ciągu 48 godzin od przyjęcia na OIOM, którzy zgłosili się na oddział ratunkowy w ciągu 72 godzin od przyjęcia na OIOM. Pacjenci będą przyjmowani z odroczoną zgodą, aby umożliwić jak najwcześniejsze pobranie materiału biologicznego. Próbka biologiczna będzie obejmować krew z antykoagulantem, probówkę z genem PAX i próbkę płynu z płukania oskrzelikowo-pęcherzykowego (BALF) (u pacjentów wentylowanych mechanicznie, gdy bronchoskopia jest klinicznie wskazana) pobranych w momencie przyjęcia na OIT (dzień 0) oraz w 4 kolejnych punkty czasowe podczas przyjęcia na OIOM (dni 1,3,7,14).

Dane generowane podczas ESTABLISH będą analizowane partiami na bieżąco, regularnie i będą ukierunkowane na konkretny cel. Przygotowanie próbek wsadowych i analiza danych zminimalizują różnorodność testów biologicznych i metodologicznych. Dane Celu 1 i 2 zostaną przeanalizowane po włączeniu pierwszych 50 pacjentów, a następnie co 50 pacjentów. Dane Celu 3 zostaną przeanalizowane po włączeniu pierwszych 200 pacjentów, a następnie co 200 pacjentów.