GeoHealth: Geografický informační systém pro management zdraví a klinický, epidemiologický a translační výzkum

Systém GeoHealth bude navržen jako modulární platforma, která umožní komunikaci pro import dat pacientů ze systémů EHR a výzkumných platforem prostřednictvím standardů ISO13606 a CDISC ODM. Dále budou provedeny integrace s andaluskými systémy HCE (Diraya) a systémy řízení klinických studií REDCap a OpenClinica.

GeoHealth integruje sadu heterogenních otevřených datových zdrojů, což umožňuje vizualizaci klinických a kontextových dat každého pacienta na stejné mapě na základě jeho obvyklého umístění (oblast sčítání lidu v jeho domově) a požadovaného data studie. Data integrovaná do systému poskytují demografické informace a podmínky prostředí spojené s polohou pacienta.

Systém má modul, který provádí analýzu, která se může pohybovat od jednoduchých korelací mezi proměnnými až po další složitější analýzy, jako je shluková analýza, lineární a logistické regrese a další.

Jakmile budou určeny modely, které budou použity při rozhodování, bude provedena studie o míře souladu mezi doporučeními stanovenými modely a klinickým rozhodnutím přijatým odborníky. Studie bude probíhat po dobu 12 měsíců u pacientů léčených v klinických centrech, která se účastní tohoto projektu.

Údaje pocházejí z různých zdrojů a všechny byly integrovány do stejného reprezentačního systému. Pomocí bezplatného mapovacího systému "OpenStreetMap" a knihovny "Plotly" Python jsou demografická data pacientů a jejich kontextové proměnné reprezentovány v Dashboardu, který obsahuje jedinou mapu.

Systém nabízí možnost nasazení různých teplotních map pomocí různých regionů (regiony sčítání, regiony PSČ a zdravotní obvody) a různé demografické proměnné pro každý typ regionu (hustota obyvatelstva, procento mužů a žen, průměrné příjmy… atd.) . Navíc je možné si vybrat mezi různými regiony Andalusie a řadou dat pro údaje o životním prostředí (údaje o znečištění, pylu a meteorologické údaje) a údaje o pacientech. Další místa jsou na mapě rozmístěna jako nemocnice, kliniky, silnice a parky.

Systém poskytuje pokrok v nasazení, pozorování a analýze pro sektor zdravotnictví. Umožňuje klinickým výzkumníkům lépe porozumět tomu, jak je pacient ovlivněn jeho prostředím, a provádět analýzu k odhalení vzorců v datech.

Jiné systémy jako Transmart nebo i2b2 umožňují sdílení, integraci, standardizaci a analýzu heterogenních dat ze zdravotnictví a translačního výzkumu. GeoHealth byl prezentován jako možné rozšíření těchto dvou platforem, které jim pomáhá začlenit možnost zahrnout geoprostorová data do analýzy.

Kromě toho bude systém použit a testován ve dvou projektech, jejichž cílem je analyzovat prevalenci astmatických pacientů v oblasti nemocnice Macarena (Sevilla, Španělsko) a další v regionu Andalucía (Španělsko), kde bude více než 800 000 pacientů. analyzovány.

Bylo prokázáno, jak rozhodující je prostředí pacienta při vzniku mnoha onemocnění. GeoHealth byl prezentován jako platforma, která umožňuje klinickým výzkumníkům v úloze pozorování a analýzy lépe porozumět tomu, jak je prostředí ovlivňuje.

Kromě toho provedená extrakce, zpracování a integrace otevřených dat v systému a intuitivní nasazení na jediné mapě umožňují výzkumníkům ušetřit čas a získat přístup k pokročilým analytickým technikám, které lze provádět bez znalostí nezbytných k vývoji algoritmů, které je tvoří. .

Všechny tyto aspekty činí z GeoHealth inovativní platformu s potenciálním dopadem na rozvoj klinických studií souvisejících s lokalizací a prostředím pacientů.