GeoHealth: Geografiskt informationssystem för hälsoledning och klinisk, epidemiologisk och translationell forskning

GeoHealth-systemet kommer att utformas som en modulär plattform som gör det möjligt för kommunikation att importera patientdata från EHR-system och forskningsplattformar genom ISO13606 och CDISC ODM-standarderna. Dessutom kommer integrationer att göras med de andalusiska HCE-systemen (Diraya) och de kliniska prövningssystemen REDCap och OpenClinica.

GeoHealth integrerar en uppsättning heterogena öppna datakällor, vilket möjliggör en visualisering, på samma karta, av kliniska och kontextuella data för varje patient baserat på deras vanliga plats (Census-regionen i deras hem) och önskat datum för studien. Data som är integrerade i systemet ger demografisk information och de miljöförhållanden som är förknippade med patientens plats.

Systemet har en modul som utför analyser som kan sträcka sig från enkla korrelationer mellan variabler till andra mer komplexa analyser som klustringsanalys, linjära och logistiska regressioner och annat.

När modellerna som kommer att tillämpas i beslutsfattandet har fastställts, kommer en studie att genomföras på graden av anpassning mellan rekommendationerna som fastställts av modellerna och det kliniska beslut som antagits av professionella. Studien kommer att utföras under en period av 12 månader på patienter som behandlas i de kliniska centra som deltar i detta projekt.

Uppgifterna kommer från olika källor och alla har integrerats i samma representationssystem. Genom att använda det fria kartsystemet "OpenStreetMap" och "Plotly" Python-biblioteket, representeras både patienternas demografiska data och deras kontextuella variabler i en Dashboard, som innehåller en enda karta.

Systemet erbjuder möjligheten att distribuera olika värmekartor med olika regioner (folkräkningsregioner, postnummerregioner och hälsodistrikt) och olika demografiska variabler för varje typ av region (befolkningstäthet, procentandel män och kvinnor, medelinkomster ... etc.) . Dessutom är det möjligt att välja mellan de olika regionerna i Andalusien och ett antal datum för miljödata (föroreningar, pollen och meteorologiska data) och patientdata. Andra platser finns utplacerade på kartan som sjukhus, kliniker, vägar och parker.

Systemet ger ett framsteg i utbyggnad, observation och analys för hälsosektorn. Det gör det möjligt för kliniska forskare att bättre förstå hur patienten påverkas av sin omgivning och utföra analyser för att upptäcka mönster i data.

Andra system som Transmart eller i2b2 möjliggör delning, integration, standardisering och analys av heterogen data från sjukvård och translationell forskning. GeoHealth har presenterats som en möjlig förlängning av dessa två plattformar som hjälper dem att införliva möjligheten att inkludera geospatial data i analysen.

Dessutom kommer systemet att användas och testas i två projekt som syftar till att analysera förekomsten av astmatiska patienter i Macarena-sjukhusets område (Sevilla, Spanien) och ett annat i regionen Andalusien (Spanien) där mer än 800 000 patienter kommer att finnas. analyseras.

Det har visat sig hur avgörande patientens omgivning är för utvecklingen av många sjukdomar. GeoHealth har presenterats som en plattform som låter kliniska forskare i observations- och analysuppgiften bättre förstå hur miljön påverkar dem.

Dessutom gör den utförda extraheringen, bearbetningen och integrationen av öppna data i systemet och den intuitiva distributionen på en enda karta forskare att spara tid och få tillgång till avancerade analystekniker som kan utföras utan den kunskap som krävs för att utveckla de algoritmer som bildar dem .

Alla dessa aspekter gör GeoHealth till en innovativ plattform med potentiell inverkan på utvecklingen av kliniska studier relaterade till patienternas plats och miljö.