GeoHealth: Geografisk informationssystem til sundhedsledelse og klinisk, epidemiologisk og translationel forskning

GeoHealth-systemet vil blive designet som en modulær platform, der vil tillade kommunikation at importere patientdata fra EPJ-systemer og forskningsplatforme gennem ISO13606 og CDISC ODM-standarderne. Desuden vil der blive lavet integrationer med de andalusiske HCE (Diraya) systemer og de kliniske forsøgsstyringssystemer REDCap og OpenClinica.

GeoHealth integrerer et sæt af heterogene åbne datakilder, hvilket muliggør en visualisering på det samme kort af de kliniske og kontekstuelle data for hver patient baseret på deres sædvanlige placering (folketællingsregion i deres hjem) og den ønskede dato for undersøgelsen. Dataene integreret i systemet giver demografiske oplysninger og de miljømæssige forhold, der er forbundet med patientens placering.

Systemet har et modul, der udfører analyser, der kan spænde fra simple korrelationer mellem variabler til andre mere komplekse analyser såsom klyngeanalyse, lineære og logistiske regressioner og andre.

Når de modeller, der skal anvendes i beslutningstagningen, er fastlagt, vil der blive gennemført en undersøgelse af graden af ​​tilpasning mellem anbefalingerne fastsat af modellerne og den kliniske beslutning vedtaget af de professionelle. Undersøgelsen vil blive udført i en periode på 12 måneder hos patienter behandlet i de kliniske centre, der deltager i dette projekt.

Dataene kommer fra forskellige kilder og er alle integreret i det samme repræsentationssystem. Ved at bruge det gratis kortlægningssystem "OpenStreetMap" og "Plotly" Python-biblioteket er både de demografiske data for patienterne og deres kontekstuelle variabler repræsenteret i et Dashboard, der indeholder et enkelt kort.

Systemet giver mulighed for at implementere forskellige varmekort ved hjælp af forskellige regioner (folketællingsregioner, postnummerregioner og sundhedsdistrikter) og forskellige demografiske variabler for hver type region (befolkningstæthed, procentdel af mænd og kvinder, gennemsnitsindkomster ... osv.) . Desuden er det muligt at vælge mellem de forskellige regioner i Andalusien og en række datoer for miljødata (forurening, pollen og meteorologiske data) og patientdata. Andre steder er placeringer indsat på kortet som hospitaler, klinikker, veje og parker.

Systemet giver et fremskridt inden for udbredelse, observation og analyse for sundhedssektoren. Det giver kliniske forskere mulighed for bedre at forstå, hvordan patienten påvirkes af sit miljø og udføre analyser for at opdage mønstre i dataene.

Andre systemer som Transmart eller i2b2 muliggør deling, integration, standardisering og analyse af heterogene data fra sundhedsvæsen og translationel forskning. GeoHealth er blevet præsenteret som en mulig udvidelse af disse to platforme, der hjælper dem med at inkorporere muligheden for at inkludere geospatiale data i analysen.

Desuden vil systemet blive brugt og testet i to projekter, der sigter mod at analysere forekomsten af ​​astmatiske patienter i Macarena Hospitals område (Sevilla, Spanien) og et andet i regionen Andalusien (Spanien), hvor mere end 800.000 patienter vil være analyseret.

Det er blevet påvist, hvor afgørende patientens omgivelser er for udviklingen af ​​mange sygdomme. GeoHealth er blevet præsenteret som en platform, der giver kliniske forskere i observations- og analyseopgaven mulighed for bedre at forstå, hvordan miljøet påvirker dem.

Desuden giver den udførte udtræk, bearbejdning og integration af de åbne data i systemet og den intuitive udrulning på et enkelt kort forskerne mulighed for at spare tid og få adgang til avancerede analyseteknikker, der kan udføres uden den nødvendige viden til at udvikle de algoritmer, der danner dem. .

Alle disse aspekter gør GeoHealth til en innovativ platform med potentiel indflydelse på udviklingen af ​​kliniske studier relateret til patienternes placering og miljø.