GeoHealth: system informacji geograficznej do zarządzania zdrowiem oraz badań klinicznych, epidemiologicznych i translacyjnych

System GeoHealth zostanie zaprojektowany jako platforma modułowa, która umożliwi komunikację w celu importu danych pacjentów z systemów EHR i platform badawczych poprzez standardy ISO13606 i CDISC ODM. Ponadto zostaną przeprowadzone integracje z andaluzyjskimi systemami HCE (Diraya) oraz systemami zarządzania badaniami klinicznymi REDCap i OpenClinica.

GeoHealth integruje zestaw heterogenicznych otwartych źródeł danych, umożliwiając wizualizację na tej samej mapie danych klinicznych i kontekstowych każdego pacjenta w oparciu o jego zwykłą lokalizację (region spisu ludności jego domu) i żądaną datę badania. Zintegrowane w systemie dane dostarczają informacji demograficznych oraz warunków środowiskowych związanych z lokalizacją pacjenta.

System posiada moduł, który wykonuje analizy, które mogą obejmować zarówno proste korelacje między zmiennymi, jak i bardziej złożone analizy, takie jak analiza skupień, regresje liniowe i logistyczne i inne.

Po określeniu modeli, które będą stosowane w podejmowaniu decyzji, przeprowadzone zostanie badanie stopnia zgodności między zaleceniami ustalonymi przez modele a decyzją kliniczną podjętą przez profesjonalistów. Badanie będzie prowadzone przez okres 12 miesięcy u pacjentów leczonych w ośrodkach klinicznych biorących udział w tym projekcie.

Dane pochodzą z różnych źródeł i wszystkie zostały zintegrowane w ten sam system reprezentacji. Korzystając z bezpłatnego systemu mapowania „OpenStreetMap” i biblioteki „Plotly” w języku Python, zarówno dane demograficzne pacjentów, jak i ich zmienne kontekstowe są reprezentowane na pulpicie zawierającym pojedynczą mapę.

System oferuje możliwość wdrażania różnych map cieplnych przy użyciu różnych regionów (Regiony spisowe, Regiony kodów pocztowych i Okręgi zdrowotne) oraz różne zmienne demograficzne dla każdego typu regionu (Gęstość zaludnienia, odsetek mężczyzn i kobiet, średnie dochody… itd.) . Ponadto istnieje możliwość wyboru pomiędzy różnymi regionami Andaluzji oraz zakresem dat dla danych środowiskowych (zanieczyszczenie, pyłki i dane meteorologiczne) oraz danych pacjenta. Na mapie rozmieszczone są inne lokalizacje, takie jak szpitale, kliniki, drogi i parki.

System zapewnia postęp we wdrażaniu, obserwacji i analizie dla sektora zdrowia. Pozwala naukowcom klinicznym lepiej zrozumieć, w jaki sposób środowisko wpływa na pacjenta i przeprowadzić analizę w celu odkrycia wzorców w danych.

Inne systemy, takie jak Transmart czy i2b2, umożliwiają udostępnianie, integrację, standaryzację i analizę heterogenicznych danych z badań medycznych i translacyjnych. GeoHealth został przedstawiony jako możliwe rozszerzenie tych dwóch platform, pomagając im uwzględnić możliwość uwzględnienia danych geoprzestrzennych w analizie.

Ponadto system będzie używany i testowany w dwóch projektach, których celem będzie analiza częstości występowania pacjentów z astmą na terenie szpitala Macarena (Sewilla, Hiszpania) oraz inny w regionie Andaluzja (Hiszpania), gdzie ponad 800 000 pacjentów będzie analizowane.

Wykazano, jak decydujące znaczenie dla rozwoju wielu chorób ma otoczenie pacjenta. GeoHealth został przedstawiony jako platforma, która pozwala badaczom klinicznym zajmującym się obserwacją i analizą lepiej zrozumieć, w jaki sposób środowisko wpływa na nich.

Ponadto dokonana ekstrakcja, przetwarzanie i integracja otwartych danych w systemie oraz intuicyjne rozmieszczenie na jednej mapie pozwalają naukowcom zaoszczędzić czas i uzyskać dostęp do zaawansowanych technik analizy, które można wykonać bez wiedzy niezbędnej do opracowania tworzących je algorytmów .

Wszystkie te aspekty sprawiają, że GeoHealth jest innowacyjną platformą mającą potencjalny wpływ na rozwój badań klinicznych związanych z lokalizacją i środowiskiem pacjentów.