GeoHealth: Sistema informativo geografico per la gestione della salute e la ricerca clinica, epidemiologica e traslazionale

Il sistema GeoHealth sarà progettato come una piattaforma modulare che consentirà la comunicazione per importare i dati dei pazienti dai sistemi EHR e dalle piattaforme di ricerca attraverso gli standard ISO13606 e CDISC ODM. Inoltre, verranno effettuate integrazioni con i sistemi HCE andaluso (Diraya) e i sistemi di gestione delle sperimentazioni cliniche REDCap e OpenClinica.

GeoHealth integra un insieme di fonti di dati aperti eterogenei, consentendo una visualizzazione, sulla stessa mappa, dei dati clinici e contestuali di ciascun paziente in base alla loro posizione abituale (regione censita della loro abitazione) e alla data desiderata dello studio. I dati integrati nel sistema forniscono informazioni demografiche e le condizioni ambientali associate alla localizzazione del paziente.

Il sistema dispone di un modulo che esegue analisi che possono spaziare da semplici correlazioni tra variabili ad altre analisi più complesse come clustering analysis, regressioni lineari e logistiche ed altre.

Una volta individuati i modelli che verranno applicati nel processo decisionale, verrà condotto uno studio sul grado di allineamento tra le raccomandazioni stabilite dai modelli e la decisione clinica adottata dai professionisti. Lo studio sarà condotto durante un periodo di 12 mesi in pazienti trattati nei centri clinici che partecipano a questo progetto.

I dati provengono da fonti diverse e sono stati tutti integrati nello stesso sistema di rappresentazione. Utilizzando il sistema di mappatura gratuito "OpenStreetMap" e la libreria Python "Plotly", sia i dati demografici dei pazienti che le loro variabili contestuali sono rappresentati in una Dashboard, contenente un'unica mappa.

Il sistema offre la possibilità di implementare diverse mappe di calore utilizzando diverse regioni (Regioni censuarie, Regioni CAP e Distretti sanitari) e diverse variabili demografiche per ogni tipo di regione (Densità di popolazione, percentuale di maschi e femmine, redditi medi…ecc.) . Inoltre, è possibile scegliere tra le diverse regioni dell'Andalusia e una serie di date per i dati ambientali (Inquinamento, pollini e meteorologici) e dei pazienti. Altri luoghi sono posizionati sulla mappa come ospedali, cliniche, strade e parchi.

Il sistema fornisce un progresso nella distribuzione, osservazione e analisi per il settore sanitario. Consente ai ricercatori clinici di comprendere meglio in che modo il paziente è influenzato dal suo ambiente ed eseguire analisi per scoprire modelli nei dati.

Altri sistemi come Transmart o i2b2 consentono la condivisione, l'integrazione, la standardizzazione e l'analisi di dati eterogenei provenienti dalla ricerca sanitaria e traslazionale. GeoHealth è stato presentato come una possibile estensione di queste due piattaforme aiutandole a incorporare la possibilità di includere dati geospaziali nell'analisi.

Inoltre, il sistema sarà utilizzato e testato in due progetti che mirano ad analizzare la prevalenza di pazienti asmatici nell'area dell'ospedale Macarena (Siviglia, Spagna) e un altro nella regione dell'Andalusia (Spagna) dove saranno trattati più di 800.000 pazienti analizzato.

È stato dimostrato quanto sia decisivo l'ambiente del paziente nello sviluppo di molte malattie. GeoHealth è stato presentato come una piattaforma che consente ai ricercatori clinici nel compito di osservazione e analisi di comprendere meglio come l'ambiente li influenza.

Inoltre, l'estrazione, l'elaborazione e l'integrazione eseguite degli open-data nel sistema e la distribuzione intuitiva su un'unica mappa consentono ai ricercatori di risparmiare tempo e accedere a tecniche di analisi avanzate che possono essere eseguite senza le conoscenze necessarie per sviluppare gli algoritmi che li formano .

Tutti questi aspetti rendono GeoHealth una piattaforma innovativa con un potenziale impatto sullo sviluppo di studi clinici legati alla posizione e all'ambiente dei pazienti.