GeoHealth: географическая информационная система для управления здравоохранением и клинических, эпидемиологических и трансляционных исследований

Система GeoHealth будет спроектирована как модульная платформа, которая позволит обмениваться данными для импорта данных пациентов из систем EHR и исследовательских платформ через стандарты ISO13606 и CDISC ODM. Кроме того, будет произведена интеграция с андалузскими системами HCE (Diraya) и системами управления клиническими испытаниями REDCap и OpenClinica.

GeoHealth объединяет набор разнородных открытых источников данных, позволяя визуализировать на одной карте клинические и контекстуальные данные каждого пациента на основе их обычного местоположения (регион переписи их дома) и желаемой даты исследования. Данные, интегрированные в систему, предоставляют демографическую информацию и информацию об условиях окружающей среды, связанных с местонахождением пациента.

В системе есть модуль, который выполняет анализ, который может варьироваться от простых корреляций между переменными до других более сложных анализов, таких как кластерный анализ, линейная и логистическая регрессии и другие.

После того, как модели, которые будут применяться при принятии решений, будут определены, будет проведено исследование степени соответствия между рекомендациями, установленными моделями, и клиническим решением, принятым профессионалами. Исследование будет проводиться в течение 12 месяцев у пациентов, находящихся на лечении в клинических центрах, участвующих в этом проекте.

Данные поступают из разных источников, и все они были интегрированы в одну и ту же систему представления. Используя бесплатную картографическую систему «OpenStreetMap» и библиотеку Python «Plotly», как демографические данные пациентов, так и их контекстуальные переменные представлены на панели инструментов, содержащей одну карту.

Система предлагает возможность развертывания различных тепловых карт с использованием разных регионов (регионов переписи, регионов с почтовыми индексами и медицинских округов) и различных демографических переменных для каждого типа региона (плотность населения, процентное соотношение мужчин и женщин, средний доход и т. д.). . Кроме того, можно выбирать между различными регионами Андалусии и рядом дат для данных об окружающей среде (загрязнение, пыльца и метеорологические данные) и данных пациента. Другие локации развернуты на карте в виде больниц, поликлиник, дорог и парков.

Система обеспечивает продвижение в развертывании, наблюдении и анализе для сектора здравоохранения. Это позволяет клиническим исследователям лучше понять, как окружающая среда влияет на пациента, и проводить анализ для выявления закономерностей в данных.

Другие системы, такие как Transmart или i2b2, позволяют обмениваться, интегрировать, стандартизировать и анализировать разнородные данные из здравоохранения и трансляционных исследований. GeoHealth был представлен как возможное расширение этих двух платформ, помогающее им включить возможность включения геопространственных данных в анализ.

Кроме того, система будет использоваться и тестироваться в двух проектах, целью которых является анализ распространенности пациентов с астмой в районе больницы Макарена (Севилья, Испания) и еще один в регионе Андалусия (Испания), где будет находиться более 800 000 пациентов. проанализировано.

Было продемонстрировано, какое решающее значение имеет среда больного в развитии многих заболеваний. GeoHealth был представлен как платформа, которая позволяет клиническим исследователям в задачах наблюдения и анализа лучше понять, как окружающая среда влияет на них.

Более того, выполненное извлечение, обработка и интеграция открытых данных в систему, а также интуитивно понятное развертывание на единой карте позволяют исследователям сэкономить время и получить доступ к передовым методам анализа, которые можно выполнять без знаний, необходимых для разработки формирующих их алгоритмов. .

Все эти аспекты делают GeoHealth инновационной платформой с потенциальным влиянием на развитие клинических исследований, связанных с местоположением и окружающей средой пациентов.