GeoHealth: Geografisches Informationssystem für Gesundheitsmanagement und klinische, epidemiologische und translationale Forschung

Das GeoHealth-System wird als modulare Plattform konzipiert, die die Kommunikation ermöglicht, um Patientendaten aus EHR-Systemen und Forschungsplattformen über die ISO13606- und CDISC-ODM-Standards zu importieren. Darüber hinaus werden Integrationen mit den andalusischen HCE (Diraya)-Systemen und den klinischen Studienverwaltungssystemen REDCap und OpenClinica vorgenommen.

GeoHealth integriert eine Reihe heterogener offener Datenquellen, die eine Visualisierung der klinischen und kontextuellen Daten jedes Patienten auf derselben Karte ermöglichen, basierend auf seinem üblichen Aufenthaltsort (Zensusregion seines Wohnorts) und dem gewünschten Studiendatum. Die in das System integrierten Daten liefern demografische Informationen und die mit dem Aufenthaltsort des Patienten verbundenen Umgebungsbedingungen.

Das System verfügt über ein Modul, das Analysen durchführt, die von einfachen Korrelationen zwischen Variablen bis zu anderen komplexeren Analysen wie Clustering-Analysen, linearen und logistischen Regressionen und anderen reichen können.

Sobald die Modelle festgelegt sind, die bei der Entscheidungsfindung angewendet werden, wird eine Studie zum Grad der Übereinstimmung zwischen den von den Modellen aufgestellten Empfehlungen und der von den Fachleuten getroffenen klinischen Entscheidung durchgeführt. Die Studie wird über einen Zeitraum von 12 Monaten an Patienten durchgeführt, die in den an diesem Projekt teilnehmenden klinischen Zentren behandelt werden.

Die Daten stammen aus unterschiedlichen Quellen und wurden alle in dasselbe Darstellungssystem integriert. Unter Verwendung des freien Kartensystems „OpenStreetMap“ und der Python-Bibliothek „Plotly“ werden sowohl die demografischen Daten der Patienten als auch ihre kontextuellen Variablen in einem Dashboard dargestellt, das eine einzige Karte enthält.

Das System bietet die Möglichkeit, verschiedene Heatmaps mit unterschiedlichen Regionen (Zensusregionen, Postleitzahlenregionen und Gesundheitsbezirken) und unterschiedlichen demografischen Variablen für jede Art von Region (Bevölkerungsdichte, Prozentsatz von Männern und Frauen, Durchschnittseinkommen usw.) bereitzustellen. . Darüber hinaus ist es möglich, zwischen den verschiedenen Regionen Andalusiens und einer Reihe von Daten für die Umwelt- (Verschmutzungs-, Pollen- und Wetterdaten) und Patientendaten zu wählen. Andere Orte werden auf der Karte als Krankenhäuser, Kliniken, Straßen und Parks eingesetzt.

Das System bietet einen Fortschritt in der Bereitstellung, Beobachtung und Analyse für den Gesundheitssektor. Es ermöglicht klinischen Forschern, besser zu verstehen, wie der Patient von seiner Umgebung beeinflusst wird, und Analysen durchzuführen, um Muster in den Daten zu entdecken.

Andere Systeme wie Transmart oder i2b2 ermöglichen die gemeinsame Nutzung, Integration, Standardisierung und Analyse heterogener Daten aus dem Gesundheitswesen und der translationalen Forschung. GeoHealth wurde als mögliche Erweiterung dieser beiden Plattformen vorgestellt, die ihnen hilft, die Möglichkeit zu integrieren, Geodaten in die Analyse einzubeziehen.

Darüber hinaus wird das System in zwei Projekten eingesetzt und getestet, die darauf abzielen, die Prävalenz von Asthmapatienten im Bereich des Macarena-Krankenhauses (Sevilla, Spanien) zu analysieren, und in einem weiteren in der Region Andalusien (Spanien), wo mehr als 800.000 Patienten leben werden analysiert.

Es hat sich gezeigt, wie entscheidend das Umfeld des Patienten für die Entstehung vieler Krankheiten ist. GeoHealth wurde als eine Plattform präsentiert, die es klinischen Forschern bei der Beobachtungs- und Analyseaufgabe ermöglicht, besser zu verstehen, wie sich die Umwelt auf sie auswirkt.

Darüber hinaus ermöglichen die durchgeführte Extraktion, Verarbeitung und Integration der offenen Daten im System und die intuitive Bereitstellung auf einer einzigen Karte den Forschern, Zeit zu sparen und auf fortschrittliche Analysetechniken zuzugreifen, die ohne das Wissen durchgeführt werden können, das für die Entwicklung der sie bildenden Algorithmen erforderlich ist .

All diese Aspekte machen GeoHealth zu einer innovativen Plattform mit potenziellen Auswirkungen auf die Entwicklung klinischer Studien in Bezug auf den Standort und die Umgebung der Patienten.