Prospektivní odkazy související se zdravotní péčí při přenosu netuberkulózních mykobakterií (pHALT NTM)

Jedná se o prospektivní, multicentrickou, nerandomizovanou studii ke zkoumání potenciálních ohnisek NTM v šesti centrech péče o CF, která jsou v současnosti zařazena do studie HALT NTM. Bude zkoumat potenciální epizody přenosu a/nebo akvizice NTM související se zdravotní péčí v rámci zúčastněných středisek péče v USA, ve spojení s odběrem vzorků z prostředí zdravotní péče a analýzou povodí domova bydliště.

ČÁST A / Epidemiologické vyšetřování:

Colorado NTM Outcome Measure Advancement Core National Resource Centers (CO-NRC) poskytuje národní referenční laboratoř pro CF NTM. Respirační izoláty NTM obdržené z center péče o CF po celých USA podléhají kultivaci, molekulární identifikaci, antimikrobiální citlivosti a sekvenování celého genomu (WGS). Pomocí tohoto přístupu CO-NRC identifikovala shluky izolátů NTM, které jsou definovány jako vysoce podobné kmeny na genomické úrovni, které přechovávají dva nebo více lidí s CF (pwCF), o které se pečuje ve stejném centru péče o CF. Tyto identifikace zvýšily naše obavy o potenciální akvizici NTM související se zdravotní péčí pocházející z přenosu z pacienta na pacienta nebo z běžného environmentálního zdroje v rámci center.

Pomocí integrovaných metod klinického a epidemiologického výzkumu vyvinula mateřská studie HALT NTM a validovala sadu nástrojů epidemiologického vyšetřování související se zdravotní péčí, která dokáže identifikovat překrývání zdrojů péče mezi pacienty s vysoce podobnými izoláty NTM v centru. Mateřská sada nástrojů HALT NTM usnadňuje postupný proces, při kterém jednotlivá centra provádějí epidemiologické hodnocení pacientů, kteří byli podle CO-NRC infikováni seskupenými izoláty NTM.

V šesti zúčastněných centrech péče o CF byla dokončena retrospektivní rodičovská studie HALT NTM o potenciálních vzplanutích NTM. Ve studii pHALT NTM budou zúčastněná pracoviště prospektivně předkládat všechny respirační izoláty NTM ze všech PwCF, kterým se dostává rutinní péče po dobu dvou let, do laboratoří NJH Advanced Diagnostic Laboratories. Všechny izoláty NTM budou uloženy v Biobance v rámci NTM Culture, Biorepository and Coordinating Core (ID projektu: HS3149) a použity pro výzkumné účely. CO-NRC využije poctivého makléře k deidentifikaci NTM izolátů a bude kultivovat, ukládat a extrahovat DNA. CO-NRC deidentifikované izoláty pak budou analyzovány, jak bylo popsáno výše.

Když budou identifikovány vysoce příbuzné shluky, každé zúčastněné centrum bude nezávisle používat sadu nástrojů epidemiologického vyšetřování HALT NTM k identifikaci překrývání zdrojů péče mezi pacienty s vysoce podobnými izoláty NTM. Kromě toho bude PwCF identifikovaná jako infikovaná vysoce podobnými izoláty NTM požádána o vyplnění online průzkumu. Průzkum se zeptá na základní demografické informace subjektu, bude se dotazovat na jejich interakce s ostatními PwCF a zdokumentuje, kde se jim dostává péče o CF.

ČÁST B / Kolekce biofilmů prachu a vody:

Shlukované izoláty NTM by mohly pocházet ze sdíleného zdravotnického vodního zdroje. Biofilmy ze zdrojů zdravotnického prachu a vody budou shromážděny a NTM obnoveny, identifikovány a sekvenovány, aby se určilo, zda je genotyp respiračního kmene CF NTM podobný těm, které byly získány ze zdravotnického prachu a vody.

Část C/Mapování povodí domova bydliště: Shlukované izoláty NTM by mohly pocházet ze sdíleného domovního zdroje vody. PwCF, která má klastrované izoláty NTM, bude požádána o vyplnění online průzkumu. Průzkum se zeptá subjektů na jejich aktuální a poslední 2 roky bydliště. Domov bydliště pro PwCF identifikovaný v klastrech bude extrahován a geokódován na souřadnice zeměpisné šířky a délky a zmapován do povodí na úrovni kódu hydrologické jednotky, aby se určilo, zda seskupené PwCF sdílejí společný domov rezidenčního zdroje vody.