Liens potentiels associés aux soins de santé dans la transmission des mycobactéries non tuberculeuses (pHALT NTM)

Il s'agit d'une étude prospective, multicentrique et non randomisée pour enquêter sur les épidémies potentielles de MNT dans les six centres de soins de la mucoviscidose actuellement inscrits à l'étude HALT NTM. Il étudiera les épisodes potentiels de transmission et/ou d'acquisition de MNT associées aux soins de santé dans les centres de soins américains participants, associés à un échantillonnage de l'environnement de soins de santé et à une analyse du bassin versant du domicile.

PARTIE A / Enquête épidémiologique :

Le Colorado NTM Outcome Measure Advancement Core National Resource Centers (CO-NRC) fournit un laboratoire national de référence pour les MNT des FC. Les isolats respiratoires de MNT reçus des centres de soins FK aux États-Unis sont soumis à une culture, une identification moléculaire, une sensibilité aux antimicrobiens et un séquençage du génome entier (WGS). En utilisant cette approche, le CO-NRC a identifié des grappes d'isolats de MNT, définis comme des souches hautement similaires au niveau génomique, hébergées par deux ou plusieurs personnes atteintes de mucoviscidose (pwCF) qui sont soignées dans le même centre de soins de mucoviscidose. Ces identifications ont accru notre inquiétude quant à l'acquisition potentielle de MNT associées aux soins de santé provenant d'une transmission de patient à patient ou d'une source environnementale commune au sein des centres.

À l'aide de méthodes de recherche clinique et épidémiologique intégrées, l'étude parente HALT NTM a développé et validé une boîte à outils d'investigation épidémiologique associée aux soins de santé qui peut identifier les chevauchements dans les sources de soins entre les patients présentant des isolats de MNT très similaires dans un centre. La boîte à outils mère HALT NTM facilite un processus par étapes par lequel les centres individuels effectuent une évaluation épidémiologique des patients identifiés par le CO-NRC comme étant infectés par des isolats de NTM en cluster.

L'étude rétrospective parentale HALT NTM sur les éclosions potentielles de MNT a été achevée dans six centres de soins des FC participants. Dans l'étude pHALT NTM, les sites participants soumettront de manière prospective tous les isolats de MNT respiratoires de tous les PwCF recevant des soins de routine sur une période de deux ans aux NJH Advanced Diagnostic Laboratories. Tous les isolats de MNT seront stockés dans la biobanque au sein du noyau de culture, de biodépôt et de coordination de MNT (ID de projet : HS3149) et utilisés à des fins de recherche. Le CO-NRC utilisera un courtier honnête pour anonymiser les isolats de MNT et cultivera, conservera et extraira l'ADN. Les isolats anonymisés du CO-NRC seront ensuite analysés comme décrit précédemment.

Lorsque des grappes hautement liées sont identifiées, la trousse d'outils d'investigation épidémiologique HALT NTM sera utilisée indépendamment par chaque centre participant pour identifier les chevauchements dans les sources de soins entre les patients présentant des isolats de MNT très similaires. De plus, les PwCF identifiés comme étant infectés par des isolats de MNT hautement similaires seront invités à répondre à une enquête en ligne. L'enquête demandera des informations démographiques de base au sujet, interrogera ses interactions avec d'autres PwCF et documentera où il reçoit des soins de mucoviscidose.

PARTIE B / Collecte du biofilm de poussière et d'eau :

Les isolats de MNT groupés pourraient provenir d'une source d'eau sanitaire partagée. Les biofilms provenant de la poussière et de l'eau des soins de santé seront collectés et les MNT récupérées, identifiées et séquencées pour déterminer si le génotype de la souche respiratoire CF NTM est similaire à ceux récupérés de la poussière et de l'eau des soins de santé.

Partie C/Cartographie du bassin versant du domicile de la résidence : les isolats de MNT regroupés peuvent provenir d'un approvisionnement en eau du domicile partagé. Les PwCF ayant des isolats de MNT regroupés seront invités à répondre à une enquête en ligne. L'enquête demandera aux sujets leur adresse personnelle actuelle et celle des 2 dernières années. La maison de résidence des PwCF identifiées dans les grappes sera extraite et géocodée selon les coordonnées de latitude et de longitude et cartographiée aux bassins versants au niveau du code d'unité hydrologique pour déterminer si les PwCF regroupées partagent une source d'approvisionnement en eau commune.