Prospettivi collegamenti associati all'assistenza sanitaria nella trasmissione di micobatteri non tubercolari (pHALT NTM)

Questo è uno studio prospettico, multicentrico, non randomizzato per indagare su potenziali focolai di NTM nei sei centri di cura della FC attualmente arruolati nello studio HALT NTM. Indagherà su potenziali episodi di trasmissione e/o acquisizione di NTM associata all'assistenza sanitaria all'interno dei centri di assistenza statunitensi partecipanti, insieme al campionamento ambientale sanitario e all'analisi dello spartiacque della casa di residenza.

PARTE A / Indagini epidemiologiche:

Il Colorado NTM Outcome Measure Advancement Core National Resource Centers (CO-NRC) fornisce un laboratorio di riferimento nazionale per CF NTM. Gli isolati respiratori NTM ricevuti dai CF Care Center negli Stati Uniti vengono sottoposti a coltura, identificazione molecolare, suscettibilità antimicrobica e sequenziamento dell'intero genoma (WGS). Usando questo approccio, il CO-NRC ha identificato gruppi di isolati NTM, definiti come ceppi altamente simili a livello genomico, ospitati da due o più persone con CF (pwCF) che sono curate presso lo stesso CF Care Center. Queste identificazioni hanno accresciuto la nostra preoccupazione per la potenziale acquisizione di NTM associata all'assistenza sanitaria originata dalla trasmissione da paziente a paziente o da una fonte ambientale comune all'interno dei Centri.

Utilizzando metodi di ricerca clinica ed epidemiologica integrati, lo studio principale HALT NTM ha sviluppato e convalidato un toolkit di indagine epidemiologica associata all'assistenza sanitaria in grado di identificare sovrapposizioni nelle fonti di cura tra pazienti con isolati NTM altamente simili in un Centro. Il toolkit genitore HALT NTM facilita un processo graduale mediante il quale i singoli centri eseguono la valutazione epidemiologica dei pazienti identificati dal CO-NRC come infetti da isolati NTM raggruppati.

Lo studio retrospettivo dei genitori HALT NTM sui potenziali focolai di NTM è stato completato presso sei centri di assistenza CF partecipanti. Nello studio pHALT NTM, i siti partecipanti invieranno prospetticamente tutti gli isolati NTM respiratori da tutte le PwCF che ricevono cure di routine per un periodo di due anni ai NJH Advanced Diagnostic Laboratories. Tutti gli isolati di NTM saranno conservati nella Biobanca all'interno del NTM Culture, Biorepository and Coordinating Core (ID progetto: HS3149) e utilizzati per scopi di ricerca. Il CO-NRC utilizzerà un intermediario onesto per de-identificare gli isolati NTM e coltiverà, accumulerà ed estrarrà il DNA. Gli isolati CO-NRC de-identificati saranno quindi analizzati come precedentemente descritto.

Quando vengono identificati cluster altamente correlati, il toolkit di indagine epidemiologica HALT NTM sarà utilizzato in modo indipendente da ciascun Centro partecipante per identificare sovrapposizioni nelle fonti di assistenza tra pazienti con isolati NTM altamente simili. Inoltre, alle PwCF identificate come infette da isolati NTM altamente simili verrà chiesto di completare un sondaggio online. Il sondaggio chiederà le informazioni demografiche di base del soggetto, interrogherà le loro interazioni con altre PwCF e documenterà dove ricevono cure per la FC.

PARTE B / Raccolta di biofilm di polvere e acqua:

Gli isolati NTM raggruppati potrebbero provenire da una fonte d'acqua sanitaria condivisa. I biofilm provenienti da polvere e acqua sanitaria saranno raccolti e l'NTM recuperato, identificato e sequenziato per determinare se il genotipo del ceppo respiratorio CF NTM è simile a quelli recuperati dalla polvere e dall'acqua sanitaria.

Parte C/Mappatura dei bacini idrici della casa di residenza: gli isolati NTM raggruppati potrebbero provenire da una fornitura idrica condivisa della casa di residenza. A PwCF con isolati NTM raggruppati verrà chiesto di completare un sondaggio online. Il sondaggio chiederà ai soggetti il ​​loro indirizzo di casa attuale e degli ultimi 2 anni. La casa di residenza per PwCF identificata nei cluster verrà estratta e geocodificata in base alle coordinate di latitudine e longitudine e mappata ai bacini idrografici a livello di codice dell'unità idrologica per determinare se le PwCF raggruppate condividono una comune fonte di approvvigionamento idrico della casa di residenza.