非結核性マイコバクテリアの伝染における医療関連の見込みのあるリンク (pHALT NTM)

これは、現在 HALT NTM 研究に登録されている 6 つの CF ケア センターにおける潜在的な NTM 発生を調査するための前向き多施設非無作為化研究です。 参加している米国のケアセンター内での医療関連のNTMの伝達および/または取得の潜在的なエピソードを、医療環境のサンプリングおよび居住地の流域分析と組み合わせて調査します。

パート A / 疫学調査:

Colorado NTM Outcome Measure Advancement Core National Resource Centers (CO-NRC) は、CF NTM の国立リファレンス ラボを提供します。 米国中の CF ケア センターから受け取った NTM 呼吸器分離株は、培養、分子同定、抗菌薬感受性、および全ゲノム配列決定 (WGS) を受けます。 このアプローチを使用して、CO-NRC は、同じ CF ケア センターで治療を受けている 2 人以上の CF (pwCF) 患者が保有する、ゲノム レベルで非常に類似した株として定義される NTM 分離株のクラスターを特定しました。 これらの特定により、患者から患者への感染またはセンター内の共通の環境源に起因する潜在的な医療関連の NTM 取得に対する懸念が高まっています。

統合された臨床および疫学研究方法を使用して、親の HALT NTM 研究は、センターで非常に類似した NTM 分離株を持つ患者間のケアのソースの重複を特定できる医療関連疫学調査ツールキットを開発および検証しました。 親 HALT NTM ツールキットは、クラスター化された NTM 分離株に感染していると CO-NRC によって特定された患者の疫学的評価を個々のセンターが実行する段階的なプロセスを促進します。

NTM アウトブレイクの可能性に関する遡及的親 HALT NTM 研究が、参加している 6 つの CF ケア センターで完了しました。 pHALT NTM研究では、参加施設は、NJH Advanced Diagnostic Laboratoriesに2年間にわたって定期的なケアを受けているすべてのPwCFからのすべての呼吸器NTM分離株を前向きに提出します。 すべての NTM 分離株は、NTM 培養、バイオリポジトリ、および調整コア (プロジェクト ID: HS3149) 内のバイオバンクに保存され、研究目的で使用されます。 CO-NRC は、誠実なブローカーを利用して NTM 分離株を匿名化し、培養、保存、および DNA の抽出を行います。 CO-NRC の匿名化された分離株は、前述のように分析されます。

関連性の高いクラスターが特定されると、HALT NTM 疫学調査ツールキットが各参加センターによって個別に使用され、非常に類似した NTM 分離株を持つ患者間の治療源の重複が特定されます。 さらに、非常に類似した NTM 分離株に感染していると特定された PwCF は、オンライン調査を完了するよう求められます。 この調査では、対象者の基本的な人口統計情報を尋ね、他の PwCF とのやり取りについて質問し、対象者が CF ケアを受けている場所を文書化します。

パート B / ほこりと水のバイオフィルム コレクション:

クラスター化された NTM 分離株は、共有の医療用水源に由来する可能性があります。 ヘルスケアの粉塵と給水からバイオ フィルムが収集され、NTM が回収、識別、配列決定され、呼吸器 CF NTM 株の遺伝子型がヘルスケアの粉塵と給水から回収されたものと類似しているかどうかが判断されます。

パート C/住宅流域マッピング: クラスタ化された NTM 分離株は、住宅の水供給の共有住宅に由来する可能性があります。 クラスター化されたNTM分離株を持つPwCFは、オンライン調査を完了するよう求められます。 この調査では、被験者に現在および過去 2 年間の自宅住所を尋ねます。 クラスターで特定された PwCF の居住地が抽出され、緯度と経度の座標にジオコーディングされ、水文単位コード レベルの流域にマッピングされて、クラスター化された PwCF が居住地の水供給源の共通の家を共有しているかどうかが判断されます。