Potentielle sundhedsrelaterede links i transmission af ikke-tuberkuløse mykobakterier (pHALT NTM)

Dette er en prospektiv, multicenter, ikke-randomiseret undersøgelse for at undersøge potentielle NTM-udbrud i de seks CF-plejecentre, der i øjeblikket er tilmeldt HALT NTM-studiet. Det vil undersøge potentielle episoder af sundheds-associeret NTM-transmission og/eller erhvervelse inden for deltagende amerikanske plejecentre, kombineret med sundhedsvæsenets miljøprøver og analyse af hjemstedsvandskel.

DEL A / Epidemiologisk undersøgelse:

Colorado NTM Outcome Measure Advancement Core National Resource Centres (CO-NRC) udgør et nationalt referencelaboratorium for CF NTM. NTM respiratoriske isolater modtaget fra CF Care Centres rundt om i USA gennemgår dyrkning, molekylær identifikation, antimikrobiel modtagelighed og helgenomsekventering (WGS). Ved at bruge denne tilgang har CO-NRC identificeret klynger af NTM-isolater, defineret som meget lignende stammer på genomisk niveau, som huses af to eller flere personer med CF (pwCF), som behandles på det samme CF Care Center. Disse identifikationer har øget vores bekymring for potentiel sundhedsrelateret NTM-opkøb, der stammer fra patient-til-patient-transmission eller en fælles miljøkilde i centrene.

Ved hjælp af integrerede kliniske og epidemiologiske forskningsmetoder udviklede og validerede moderstudiet HALT NTM et sundhedsassocieret epidemiologisk undersøgelsesværktøj, der kan identificere overlapninger i kilde(r) til behandling mellem patienter med meget lignende NTM-isolater i et center. Det overordnede HALT NTM-værktøjssæt letter en trinvis proces, hvorved individuelle centre udfører epidemiologisk evaluering af patienter identificeret af CO-NRC som værende inficeret med klyngede NTM-isolater.

Det retrospektive forældre HALT NTM-studie af potentielle NTM-udbrud er blevet afsluttet på seks deltagende CF-plejecentre. I pHALT NTM-studiet vil deltagende steder prospektivt indsende alle respiratoriske NTM-isolater fra alle PwCF, der modtager rutinepleje over en toårig periode til NJH Advanced Diagnostic Laboratories. Alle NTM-isolater vil blive opbevaret i biobanken i NTM-kulturen, biodepotet og koordinerende kerne (projekt-id: HS3149) og brugt til forskningsformål. CO-NRC vil bruge en ærlig mægler til at afidentificere NTM-isolater og vil dyrke, banke og udvinde DNA. De CO-NRC de-identificerede isolater vil derefter blive analyseret som tidligere beskrevet.

Når stærkt beslægtede klynger identificeres, vil HALT NTM epidemiologiske undersøgelsesværktøjssættet blive brugt uafhængigt af hvert deltagende center til at identificere overlapninger i kilde(r) til behandling mellem patienter med meget lignende NTM-isolater. Derudover vil PwCF identificeret som værende inficeret med meget lignende NTM-isolater blive bedt om at udfylde en online-undersøgelse. Undersøgelsen vil spørge emnets grundlæggende demografiske oplysninger, forespørge på deres interaktioner med andre PwCF og dokumentere, hvor de modtager CF-behandling.

DEL B / Støv- og vandbiofilmsamling:

Klynger af NTM-isolater kan stamme fra en fælles sundhedsvandkilde. Biofilm fra sundhedsplejestøv og vandforsyninger vil blive indsamlet og NTM genvundet, identificeret og sekventeret for at bestemme, om den respiratoriske CF NTM-stamme-genotype svarer til dem, der genvindes fra sundhedsplejens støv- og vandforsyning.

Del C/Bopælsbolig kortlægning af vandskel: Klynger af NTM-isolater kunne stamme fra en delt bolig for vandforsyning. PwCF, der har grupperet NTM-isolater, vil blive bedt om at udfylde en online-undersøgelse. Undersøgelsen vil bede forsøgspersoner om deres nuværende og sidste 2 års hjemmeadresse. Hjemstedet for PwCF identificeret i klynger vil blive udtrukket og geokodet til bredde- og længdegradskoordinater og kortlagt til vandskel på niveau med hydrologisk enhedskode for at bestemme, om klyngede PwCF deler en fælles hjemsted for vandforsyningskilde.