Mahdolliset terveydenhuoltoon liittyvät linkit ei-tuberkuloosien mykobakteerien leviämiseen (pHALT NTM)

Tämä on prospektiivinen, monikeskustutkimus, ei-satunnaistettu tutkimus, jossa tutkitaan mahdollisia NTM-epidemiaa kuudessa CF-hoitokeskuksessa, jotka ovat tällä hetkellä mukana HALT NTM -tutkimuksessa. Se tutkii mahdollisia terveydenhuoltoon liittyviä NTM-siirtoja ja/tai -hankintoja osallistuvissa Yhdysvaltain hoitokeskuksissa, yhdistettynä terveydenhuollon ympäristönäytteisiin ja kotipaikan vesistöanalyysiin.

OSA A / Epidemiologinen tutkimus:

Colorado NTM Outcome Measure Advancement Core National Resource Centers (CO-NRC) tarjoaa kansallisen vertailulaboratorion CF NTM:lle. Yhdysvalloista CF-hoitokeskuksista saaduille NTM-hengitystiolaateille suoritetaan viljely, molekyylitunnistus, antimikrobinen herkkyys ja koko genomisekvenssi (WGS). Tätä lähestymistapaa käyttämällä CO-NRC on tunnistanut NTM-isolaattiklustereita, jotka määritellään genomisella tasolla hyvin samanlaisiksi kantoiksi ja joita kantavat kaksi tai useampia CF-potilaita (pwCF), joita hoidetaan samassa CF-hoitokeskuksessa. Nämä tunnistukset ovat lisänneet huolemme mahdollisista terveydenhuoltoon liittyvistä NTM-hankinnoista, jotka ovat peräisin potilaasta potilaalle siirtymisestä tai yhteisestä ympäristön lähteestä keskuksissa.

Integroitujen kliinisten ja epidemiologisten tutkimusmenetelmien avulla HALT NTM -emotutkimus kehitti ja validoi terveydenhuoltoon liittyvän epidemiologisen tutkimuksen työkalupakin, joka voi tunnistaa hoidon lähteiden päällekkäisyydet potilaiden välillä, joilla on hyvin samankaltaisia ​​NTM-isolaatteja keskuksessa. Ylempi HALT NTM -työkalupaketti mahdollistaa vaiheittaisen prosessin, jossa yksittäiset keskukset suorittavat epidemiologisen arvioinnin potilaista, jotka CO-NRC on tunnistanut klusteroitujen NTM-isolaattien tartunnan saaneiksi.

Retrospektiivinen HALT NTM -emätutkimus mahdollisista NTM-epidemioista on saatu päätökseen kuudessa osallistuvassa CF Care Centerissä. pHALT NTM -tutkimuksessa osallistuvat toimipaikat toimittavat NJH Advanced Diagnostic Laboratoriesille kaikki hengitysteiden NTM-isolaatit kaikista rutiinihoitoa saavista PwCF:istä kahden vuoden aikana. Kaikki NTM-isolaatit tallennetaan Biopankkiin NTM:n kulttuuri-, biovarasto- ja koordinointiytimessä (projektitunnus: HS3149) ja niitä käytetään tutkimustarkoituksiin. CO-NRC käyttää rehellistä välittäjää NTM-isolaattien tunnistamiseen ja viljelee, tallentaa ja erottaa DNA:ta. Sen jälkeen CO-NRC:n tunnistamattomat isolaatit analysoidaan kuten aiemmin on kuvattu.

Kun hyvin toisiinsa liittyviä klustereita tunnistetaan, kukin osallistuva keskus käyttää itsenäisesti HALT NTM -epidemiologisen tutkimuksen työkalupakkia tunnistaakseen päällekkäisyydet hoidon lähteissä potilailla, joilla on hyvin samanlaisia ​​NTM-isolaatteja. Lisäksi PwCF:tä, jonka on tunnistettu olevan erittäin samankaltaisten NTM-isolaattien tartuttama, pyydetään täyttämään verkkokysely. Kyselyssä kysytään koehenkilön demografisia perustietoja, kysytään heidän vuorovaikutustaan ​​muiden PwCF:ien kanssa ja dokumentoidaan, missä he saavat CF-hoitoa.

OSA B / Pölyn ja veden biofilmikokoelma:

Klusteroidut NTM-isolaatit voivat olla peräisin yhteisestä terveydenhuollon vesilähteestä. Terveydenhuollon pöly- ja vesivarastoista peräisin olevat biofilmit kerätään ja NTM otetaan talteen, tunnistetaan ja sekvensoidaan sen määrittämiseksi, onko hengitysteiden CF NTM-kannan genotyyppi samanlainen kuin terveydenhuollon pöly- ja vesivarastosta talteen saadut genotyypit.

Osa C / Asuinkodin vesistöalueen kartoitus: Klusteriin muodostuneet NTM-isolaatit voivat olla peräisin jaetun kodin vesihuollosta. PwCF:ää, jolla on klusteroituja NTM-isolaatteja, pyydetään täyttämään online-kysely. Kyselyssä koehenkilöiltä kysytään heidän nykyinen ja viimeisen 2 vuoden kotiosoite. Klustereissa tunnistettu PwCF:n asuinpaikka poimitaan ja geokoodataan leveys- ja pituuskoordinaatteihin ja kartoitetaan hydrologisen yksikön koodin tason vesistöihin sen määrittämiseksi, jakaako klusteroidulla PwCF:llä yhteinen kodin vesihuoltolähde.