Role nádorového mikroprostředí u agresivních meningiomů (MEME)

Cílem této studie je charakterizovat různé buněčné populace mikroprostředí meningeomu, zejména populace imunitních a vaskulárních buněk, za účelem lepšího pochopení jejich role v iniciaci a progresi tohoto nádoru. K tomuto účelu využijeme zobrazení magnetickou rezonancí a chirurgické biopsie dura mater a meningeomu k charakterizaci buněčných fenotypů a jejich interakcí v tkáňovém mikroprostředí. Výzkum bude proveden na kohortě pacientů léčených pro meningeom v neurochirurgických službách. Vzorky potřebné pro studii budou získány z chirurgického odpadu pacientů, kteří podstoupili resekci meningeomu. Data nezbytná pro studii budou shromážděna ze zdravotních záznamů pacienta, vyšetření MRI a dat specifických pro charakteristiky chirurgického odpadu. Potenciální pacienti budou o studii informováni prostřednictvím informační poznámky. Pacienti, kteří nebudou namítat svou účast, podstoupí neurochirurgický zákrok v souladu s obvyklým servisním protokolem. Během zákroku bude produkován chirurgický odpad, včetně meningeomu a přilehlé pleny mozkové, který bude shromažďován pod odpovědností neuropatologa, který také odebere fragmenty pro rutinní diagnostickou histologickou analýzu. Poté provedeme cílenou mutační analýzu spojenou s neuropatologickým hodnocením grade tumoru s cílem vybrat 10 případů meningeomu I. stupně a 10 případů meningeomu II. a III. stupně nesoucích mutaci NF2. Poté bude na těchto vzorcích provedena hloubková analýza pomocí technologie sekvenování jednobuněčné RNA (scRNA-seq) společnosti 10x Genomic. Tato analýza pomůže pochopit heterogenitu nádoru a stanovit fenotyp a dráhu diferenciace nádorových buněk, buněk tvrdé pleny a přidružených imunitních buněk. Kromě analýzy RNA bude exprese genetických signatur ověřována testy RNAscope, zatímco zobrazování Hyperion umožní vizualizaci vzájemných vztahů mezi různými typy buněk a jejich prostorovou distribuci. Imunooznačení iDISCO+ v kombinaci s trojrozměrným zobrazováním fluorescenční mikroskopií umožní vizualizaci specifických profilů proteinové exprese typů buněk meningeomu a pleny dura mater ve 3D. Jakmile jsou analýzy dokončeny, vzorky meningeomu a tvrdé pleny budou zničeny. Budou také získány a analyzovány předoperační snímky MRI.