Tumormikromiljøets rolle i aggressive meningiomer (MEME)

Formålet med denne undersøgelse er at karakterisere de forskellige cellulære populationer i mikromiljøet af meningiom, især immun- og vaskulære cellepopulationer, for bedre at forstå deres rolle i initieringen og progressionen af ​​denne tumor. Til dette formål vil vi bruge MR-billeddannelse og kirurgiske biopsier af dura mater og meningiom til at karakterisere cellulære fænotyper og deres interaktioner i vævsmikromiljøet. Forskningen vil blive udført på en kohorte af patienter, der behandles for meningeom i neurokirurgiske tjenester. De nødvendige prøver til undersøgelsen vil blive opnået fra kirurgisk affald fra patienter, der har gennemgået meningeomresektion. De nødvendige data til undersøgelsen vil blive indsamlet fra patientens journaler, MR-undersøgelser og data, der er specifikke for operationsaffaldets karakteristika. Potentielle patienter vil blive informeret om undersøgelsen gennem en informationsnote. Patienter, der ikke gør indsigelse mod deres deltagelse, vil gennemgå neurokirurgisk indgreb i overensstemmelse med den sædvanlige serviceprotokol. Under indgrebet vil der blive produceret kirurgisk affald, herunder meningeom og tilstødende dura mater, som vil blive indsamlet under ansvar af neuropatologen, som også vil tage fragmenter til rutinediagnostisk histologisk analyse. Vi vil derefter udføre en målrettet mutationsanalyse forbundet med neuropatologisk evaluering af tumorgraden for at udvælge 10 tilfælde af grad I meningeom og 10 tilfælde af grad II og III meningeom, der bærer NF2-mutationen. En dybdegående analyse vil derefter blive udført på disse prøver ved hjælp af 10x Genomics enkeltcellede RNA-sekventeringsteknologi (scRNA-seq). Denne analyse vil hjælpe med at forstå tumorens heterogenitet og etablere fænotypen og differentieringsbanen for tumorceller, dura mater-celler og associerede immunceller. Ud over RNA-analyse vil ekspressionen af ​​genetiske signaturer blive valideret af RNAscope-tests, mens Hyperion-billeddannelse vil muliggøre visualisering af indbyrdes sammenhænge mellem forskellige typer celler og deres rumlige fordeling. iDISCO+-immunmærkningen kombineret med tredimensionel fluorescensmikroskopi-billeddannelse vil muliggøre visualisering af specifikke proteinekspressionsprofiler for meningeom- og dura mater-celletyper i 3D. Når analyserne er færdige, vil meningeom- og dura mater-prøver blive ødelagt. Præoperative MR-billeder vil også blive hentet og analyseret.