- ICH GCP
- Registr klinických studií v USA
- Klinická studie NCT07450612
Kapalná biopsie a strojové učení pro včasnou detekci kolorektálního karcinomu, adenomů, Lynchových nádorů a reziduálního onemocnění (BEACON)
Liquid Biopsy a Strojové Učení pro Včasnou Detekci Kolorektálního Karcinomu, Adenomů, Lynchových Karcinomů a Reziduálního Onemocnění
Přehled studie
Postavení
Podmínky
- Kolorektální karcinom
- Lynchův syndrom
- Kolorektální rakovina
- Adenom tlustého střeva
- Onemocnění tlustého střeva
- Mutace genu MLH1
- Adenom tlustého střeva
- Novotvar tlustého střeva
- Nedostatek opravy nesouladu
- Lynchův syndrom I (místně specifická rakovina tlustého střeva)
- Mutace genu MSH2
- Mutace genu MSH6
- Genová mutace PMS2
- Genová mutace EPCAM
- Lynchův syndrom II
- Mismatch Repair Gene Mutation
- Polyp adenomu tlustého střeva
- Lynchův syndrom I
- Mutace genu LYN
Intervence / Léčba
Detailní popis
Kolorektální karcinom (CRC) zůstává významnou zátěží pro veřejné zdraví jako třetí nejčastěji diagnostikovaný a druhý nejvíce smrtící maligní nádor. Ačkoli je CRC potenciálně preventabilní odstraněním prekurzorových lézí známých jako pokročilé adenomy (AAs), současné screeningové modality mají omezení. Fekální imunochemický test (FIT) vykazuje sníženou senzitivitu pro časná stadia CRC a AAs, primárně snižuje mortalitu spíše než incidenci. Kolonoskopie, ačkoli účinná, je invazivní, nákladná a trpí suboptimální adherencí. Navíc jedinci s Lynchovým syndromem (LS), kteří nesou patogenní germinální variantu v genech mismatch repair (MMR), postrádají účinné a spolehlivé metody pro časnou detekci ne-CRC nádorů spojených s tímto syndromem.
Rationale této studie, BEACON/2026, je vyvinout a validovat dva krevní testy k řešení těchto klinických mezer. Prvním je screeningový test senzitivní jak pro CRC, tak pro AAs, aby doplnil stávající screeningové možnosti; druhým je multi-karcinomový test časné detekce (MCED) přizpůsobený spektru LS. Hlavní hypotézou je, že přístup kapalné biopsie kombinující buněčně volné mikroRNA (cf-miRNA, které jsou senzitivní) a exozomálně vázané mikroRNA (exo-miRNA, které jsou specifické) může účinně odlišit pacienty s AAs, CRC a LS-asociovanými karcinomy od kontrol.
Tato studie následuje doporučení Early Detection Research Network (EDRN) pro vývoj biomarkerů, včetně objevování biomarkerů, jejich prioritizace, tréninku a nezávislé validace (fáze I až III). Experimentální design vyhovuje doporučením PROBE pro prospektivně sbírané biospecimény, které jsou slepě hodnoceny. Procedura zahrnuje odběr periferní krve k izolaci RNA z plazmy nebo séra pro reverzní transkripci, kvantitativní polymerázovou řetězovou reakci (RT-qPCR) analýzu a modelování strojového učení. Tento neinvazivní přístup si klade za cíl poskytnout nákladově efektivní, pacientům přívětivou alternativu ke zlepšení účasti na screeningu a monitorování onemocnění.
Typ studie
Zápis (Odhadovaný)
Kontakty a umístění
Studijní kontakt
- Jméno: Giulia Martina Cavestro, MD, PhD
- Telefonní číslo: 0226437217
- E-mail: cavestro.giuliamartina@hsr.it
Studijní záloha kontaktů
- Jméno: Giulia Martina Cavestro
- Telefonní číslo: 0226437217
- E-mail: cavestro.giuliamartina@hsr.it
Studijní místa
-
-
Lombardy
-
Milan, Lombardy, Itálie, 20132
- Zatím nenabíráme
- Gastronterology and Gastrointestinal Endoscopy Unit, IRCCS San Raffaele Hospital
-
Vrchní vyšetřovatel:
- Alessandro Mannucci, MD
-
Kontakt:
- Giulia Martina Cavestro, MD, PhD
- E-mail: cavestro.giuliamartina@hsr.it
-
Vrchní vyšetřovatel:
- Marta Puzzono, MD, PhD
-
Vrchní vyšetřovatel:
- Clelia Di Serio, PhD
-
Dílčí vyšetřovatel:
- Chiara Brombin, PhD
-
Dílčí vyšetřovatel:
- Paola MV Rancoita, PhD
-
Milan, Lombardy, Itálie, 20132
- Zatím nenabíráme
- Prof Giulia Martina Cavestro, MD PhD
-
Kontakt:
- Giulia Martina Cavestro, MD, PhD
- Telefonní číslo: +39 0226435508
- E-mail: cavestro.giuliamartina@hsr.it
-
Vrchní vyšetřovatel:
- Alessandro Mannucci, MD
-
Vrchní vyšetřovatel:
- Marta Puzzono, MD, PhD
-
Milan, Lombardy, Itálie, 20132
- Nábor
- San Raffaele Scientific Institute, Gastroenterology and Gastrointestinal Endoscopy Unit
-
Kontakt:
- Giulia Martina Cavestro, MD PhD
- E-mail: cavestro.giuliamartina@hsr.it
-
-
MI
-
Milan, MI, Itálie
- Zatím nenabíráme
- Dipartimento di Chirurgia Oncologica e Dipartimento di Oncologia Sperimentale Istituto Nazionale Tumori
-
Kontakt:
- Marco Vitellaro, MD
-
-
Kritéria účasti
Kritéria způsobilosti
Věk způsobilý ke studiu
- Dospělý
- Starší dospělý
Přijímá zdravé dobrovolníky
Metoda odběru vzorků
Studijní populace
Sedm nezávislých kohort jednotlivců, kteří patří do jedné z následujících sedmi skupin:
- Lynchův syndrom, bez jakéhokoli nádoru spojeného s Lynchovým syndromem
- Lynchův syndrom, s jedním nebo více nádory spojenými s Lynchovým syndromem
- Sporadický kolorektální karcinom
- Sporadický pokročilý adenom (nejvýše)
- Kontrolní skupiny s negativním výsledkem kolonoskopie
- Léčebně naivní vzorky krve
- Po léčbě odebrané vzorky krve
Popis
Kritéria pro zařazení:
- Všichni jedinci zařazení do studie musí mít v době odběru krve absolvovanou kolonoskopii.
- Podstoupili standardní diagnostické a stagingové (podle potřeby) postupy podle místních směrnic a alespoň jeden vzorek byl odebrán před zahájením jakékoli léčby s léčebným záměrem.
- Podstoupili standardní patologickou a endoskopickou diagnostiku a hodnocení pro zařazení do kohorty
Kritéria pro vyloučení:
- Nedostatek informovaného souhlasu
- Zánětlivé onemocnění střev
Studijní plán
Jak je studie koncipována?
Detaily designu
Kohorty a intervence
Skupina / kohorta |
Intervence / Léčba |
|---|---|
|
Lynchův syndrom, bez Lynchova syndromu asociovaných nádorů
Jedinci s Lynchovým syndromem, kteří jsou v době odběru krve bez nádorových onemocnění spojených s Lynchovým syndromem
|
Panel cirkulujících mikroRNA, jejichž expresní hladina je testována v buněk prostých a exozomově odvozených vzorcích
|
|
Lynchův syndrom, s Lynch-syndromem asociovanými nádory
Jedinci s Lynchovým syndromem, kteří mají v době odběru krve jeden (nebo více) nádorů spojených s Lynchovým syndromem
|
Panel cirkulujících mikroRNA, jejichž expresní hladina je testována v buněk prostých a exozomově odvozených vzorcích
|
|
Kolorektální karcinom
Jedinci se sporadickým kolorektálním karcinomem potvrzeným biopsií, identifikovaným během rutinní kolonoskopie a diagnostikovaným patologickým přezkoumáním
|
Panel cirkulujících mikroRNA, jejichž expresní hladina je testována v buněk prostých a exozomově odvozených vzorcích
|
|
Pokročilý adenom
Jedinci se sporadickými pokročilými adenomy, definovanými jako (i) více než 3 kolorektální polypy, (ii) přítomnost vysokého stupně dysplazie v jednom nebo více polypech, nebo (iii) polyp(y) >10 mm
|
Panel cirkulujících mikroRNA, jejichž expresní hladina je testována v buněk prostých a exozomově odvozených vzorcích
|
|
Kontroly s negativním nálezem při kolonoskopii
Jedinci, u kterých byla kolonoskopie negativní na kolorektální karcinom a pokročilé kolorektální adenomy
|
Panel cirkulujících mikroRNA, jejichž expresní hladina je testována v buněk prostých a exozomově odvozených vzorcích
|
|
Vzorky před léčbou
Jedinci s (i) kolorektálním karcinomem, nebo (ii) pokročilými adenomy, nebo (iii) Lynchovým syndromem spojeným s rakovinou budou mít možnost zúčastnit se subanalýzy této studie, kde budou jejich cirkulující plazmatické hladiny biomarkerů vyhodnoceny před resekcí (bez předchozí léčby) a po resekci (pro měření molekulární perzistence onemocnění po resekci).
|
Panel cirkulujících mikroRNA, jejichž expresní hladina je testována v buněk prostých a exozomově odvozených vzorcích
|
|
Vzorky po léčbě
Jedinci s (i) kolorektálním karcinomem, nebo (ii) pokročilými adenomy, nebo (iii) Lynchovým syndromem asociovaným karcinomem (karcinomy) budou mít možnost účastnit se subanalýzy této studie, kde budou jejich cirkulující hladiny biomarkerů v plazmě hodnoceny před resekcí (léčebně naivní) a po resekci (pro měření molekulární perzistence onemocnění po resekci).
|
Panel cirkulujících mikroRNA, jejichž expresní hladina je testována v buněk prostých a exozomově odvozených vzorcích
|
Co je měření studie?
Primární výstupní opatření
Měření výsledku |
Popis opatření |
Časové okno |
|---|---|---|
|
Citlivost
Časové okno: Po ukončení studia v průměru 1 rok
|
Skutečná pozitivní míra: pravděpodobnost pozitivního výsledku testu, podmíněná tím, že jedinec je skutečně pozitivní
|
Po ukončení studia v průměru 1 rok
|
Sekundární výstupní opatření
Měření výsledku |
Popis opatření |
Časové okno |
|---|---|---|
|
Specifičnost
Časové okno: Po ukončení studia v průměru 1 rok
|
Skutečná negativní míra: pravděpodobnost negativního výsledku testu, podmíněná tím, že jedinec je skutečně negativní
|
Po ukončení studia v průměru 1 rok
|
|
Podíl správných předpovědí (skutečně pozitivní a pravdivé negativní) na celkovém počtu případů (tj. přesnost)
Časové okno: Po ukončení studia v průměru 1 rok
|
Míra pravdivosti: podíl správných předpovědí (skutečně pozitivních i skutečných negativních) na celkovém počtu zkoumaných případů
|
Po ukončení studia v průměru 1 rok
|
Spolupracovníci a vyšetřovatelé
Sponzor
Vyšetřovatelé
- Vrchní vyšetřovatel: Giulia Martina Cavestro, MD, PhD, IRCCS San Raffaele Hospital
Publikace a užitečné odkazy
Obecné publikace
- Bettegowda C, Sausen M, Leary RJ, Kinde I, Wang Y, Agrawal N, Bartlett BR, Wang H, Luber B, Alani RM, Antonarakis ES, Azad NS, Bardelli A, Brem H, Cameron JL, Lee CC, Fecher LA, Gallia GL, Gibbs P, Le D, Giuntoli RL, Goggins M, Hogarty MD, Holdhoff M, Hong SM, Jiao Y, Juhl HH, Kim JJ, Siravegna G, Laheru DA, Lauricella C, Lim M, Lipson EJ, Marie SK, Netto GJ, Oliner KS, Olivi A, Olsson L, Riggins GJ, Sartore-Bianchi A, Schmidt K, Shih lM, Oba-Shinjo SM, Siena S, Theodorescu D, Tie J, Harkins TT, Veronese S, Wang TL, Weingart JD, Wolfgang CL, Wood LD, Xing D, Hruban RH, Wu J, Allen PJ, Schmidt CM, Choti MA, Velculescu VE, Kinzler KW, Vogelstein B, Papadopoulos N, Diaz LA Jr. Detection of circulating tumor DNA in early- and late-stage human malignancies. Sci Transl Med. 2014 Feb 19;6(224):224ra24. doi: 10.1126/scitranslmed.3007094.
- Cavestro GM, Mannucci A, Balaguer F, Hampel H, Kupfer SS, Repici A, Sartore-Bianchi A, Seppala TT, Valentini V, Boland CR, Brand RE, Buffart TE, Burke CA, Caccialanza R, Cannizzaro R, Cascinu S, Cercek A, Crosbie EJ, Danese S, Dekker E, Daca-Alvarez M, Deni F, Dominguez-Valentin M, Eng C, Goel A, Guillem JG, Houwen BBSL, Kahi C, Kalady MF, Kastrinos F, Kuhn F, Laghi L, Latchford A, Liska D, Lynch P, Malesci A, Mauri G, Meldolesi E, Moller P, Monahan KJ, Moslein G, Murphy CC, Nass K, Ng K, Oliani C, Papaleo E, Patel SG, Puzzono M, Remo A, Ricciardiello L, Ripamonti CI, Siena S, Singh SK, Stadler ZK, Stanich PP, Syngal S, Turi S, Urso ED, Valle L, Vanni VS, Vilar E, Vitellaro M, You YN, Yurgelun MB, Zuppardo RA, Stoffel EM; Associazione Italiana Familiarita Ereditarieta Tumori; Collaborative Group of the Americas on Inherited Gastrointestinal Cancer; European Hereditary Tumour Group, and the International Society for Gastrointestinal Hereditary Tumours. Delphi Initiative for Early-Onset Colorectal Cancer (DIRECt) International Management Guidelines. Clin Gastroenterol Hepatol. 2023 Mar;21(3):581-603.e33. doi: 10.1016/j.cgh.2022.12.006. Epub 2022 Dec 20.
- Ahlquist DA, Sargent DJ, Loprinzi CL, Levin TR, Rex DK, Ahnen DJ, Knigge K, Lance MP, Burgart LJ, Hamilton SR, Allison JE, Lawson MJ, Devens ME, Harrington JJ, Hillman SL. Stool DNA and occult blood testing for screen detection of colorectal neoplasia. Ann Intern Med. 2008 Oct 7;149(7):441-50, W81. doi: 10.7326/0003-4819-149-7-200810070-00004.
- Aziz Z, Wagner S, Agyekum A, Pumpalova YS, Prest M, Lim F, Rustgi S, Kastrinos F, Grady WM, Hur C. Cost-Effectiveness of Liquid Biopsy for Colorectal Cancer Screening in Patients Who Are Unscreened. JAMA Netw Open. 2023 Nov 1;6(11):e2343392. doi: 10.1001/jamanetworkopen.2023.43392.
- Barnell EK, Kang Y, Wurtzler EM, Griffith M, Chaudhuri AA, Griffith OL; Geneoscopy Scientists. Noninvasive Detection of High-Risk Adenomas Using Stool-Derived Eukaryotic RNA Sequences as Biomarkers. Gastroenterology. 2019 Sep;157(3):884-887.e3. doi: 10.1053/j.gastro.2019.05.058. Epub 2019 May 30. No abstract available.
- Carethers JM. Stool-Based Screening Tests for Colorectal Cancer. JAMA. 2023 Mar 14;329(10):839-840. doi: 10.1001/jama.2023.0547.
- Chung DC, Gray DM 2nd, Singh H, Issaka RB, Raymond VM, Eagle C, Hu S, Chudova DI, Talasaz A, Greenson JK, Sinicrope FA, Gupta S, Grady WM. A Cell-free DNA Blood-Based Test for Colorectal Cancer Screening. N Engl J Med. 2024 Mar 14;390(11):973-983. doi: 10.1056/NEJMoa2304714.
- Imperiale TF, Porter K, Zella J, Gagrat ZD, Olson MC, Statz S, Garces J, Lavin PT, Aguilar H, Brinberg D, Berkelhammer C, Kisiel JB, Limburg PJ; BLUE-C Study Investigators. Next-Generation Multitarget Stool DNA Test for Colorectal Cancer Screening. N Engl J Med. 2024 Mar 14;390(11):984-993. doi: 10.1056/NEJMoa2310336.
- Barnell EK, Wurtzler EM, La Rocca J, Fitzgerald T, Petrone J, Hao Y, Kang Y, Holmes FL, Lieberman DA. Multitarget Stool RNA Test for Colorectal Cancer Screening. JAMA. 2023 Nov 14;330(18):1760-1768. doi: 10.1001/jama.2023.22231.
- Xu C, Mannucci A, Esposito F, Oliveres H, Alonso-Orduna V, Yubero A, Fernandez-Martos C, Salud A, Gallego J, Martin-Richard M, Fernandez-Plana J, Guillot M, Aparicio J, Fakih M, Kopetz S, Feliu J, Maurel J, Goel A. An Exosome-Based Liquid Biopsy Predicts Depth of Response and Survival Outcomes to Cetuximab and Panitumumab in Metastatic Colorectal Cancer: The EXONERATE Study. Clin Cancer Res. 2025 Mar 17;31(6):1002-1015. doi: 10.1158/1078-0432.CCR-24-1934.
- Mannucci A, Balaguer F, Yamada Y, Nagasaka T, Toiyama Y, Okugawa Y, Marti-Gallostra M, Jimenez-Toscano M, Vidal-Tocino R, Jimenez F, Perea J, Quintero E, Boland CR, Cavestro GM, Goel A; SECOC-ENCODER Collaborators. An Exosome-Based Liquid Biopsy for the Detection of Early-Onset Colorectal Cancer: The ENCODER Multicenter Study. Gastroenterology. 2026 Feb;170(2):330-343. doi: 10.1053/j.gastro.2025.08.013. Epub 2025 Dec 9.
- Mannucci A, Goel A. Circulating Tumor DNA-Based Blood Test for Colorectal Cancer Screening. JAMA. 2025 Nov 11;334(18):1680-1681. doi: 10.1001/jama.2025.14109. No abstract available.
- Mannucci A, Hernandez G, Uetake H, Yamada Y, Balaguer F, Baba H, Chen T, Chen J, Boland CR, Cavestro GM, Quintero E, Goel A. Prediction of long-term recurrence-free and overall survival in early-onset colorectal cancer: the ENCORE multi-centre study. NPJ Precis Oncol. 2025 Jun 21;9(1):202. doi: 10.1038/s41698-025-00978-7.
- Negro S, Perissinotto E, Mammi I, Crivellari G, Schiavi F, Cappello F, Spolverato G, Ferrari D, Rausa E, Vitellaro M, Fassan M, Cavestro GM, Mannucci A, Lonardi S, Bergamo F, Urso EDL. Emerging therapeutic strategies in Lynch syndrome-associated colorectal cancer and the role of MMR testing. Tumori. 2025 Jan 30:3008916241310706. doi: 10.1177/03008916241310706. Online ahead of print.
- Mannucci A, Goel A. Stool and blood biomarkers for colorectal cancer management: an update on screening and disease monitoring. Mol Cancer. 2024 Nov 19;23(1):259. doi: 10.1186/s12943-024-02174-w.
- Mannucci A, Goel A. Stool and Blood DNA Tests for Colorectal Cancer Screening. N Engl J Med. 2024 Jun 20;390(23):2224. doi: 10.1056/NEJMc2404924. No abstract available.
- Shiu PKT, DiStefano JK, Alahari SK, Enguita FJ, Feinberg MW, Sideris N, Bayraktar S, Castellano L, Buitrago DL, Caporali A, Mannucci A, Goel A. The Non-Coding RNA Journal Club: Highlights on Recent Papers-13. Noncoding RNA. 2023 Dec 14;9(6):76. doi: 10.3390/ncrna9060076.
- Russo M, Barchi A, Mannucci A, Puzzono M, Zuppardo RA, Biamonte P, Bencardino S, Leandro G, Cannizzaro R, Monica F, Zagari RM, Pasquale L, Goni E, Di Leo M, Ricciardiello L, Cavestro GM; Italian Society of Gastroenterology (AIGO), Italian Society of Digestive Endoscopy (SIED) and Italian Society of Gastroenterology and Digestive Endoscopy (SIGE). Increased Number of Colorectal Interval Cancers in Lynch Syndrome after the SARS-CoV-2 Pandemic: A Survey-Based Study. Dig Dis. 2023;41(2):227-232. doi: 10.1159/000524393. Epub 2022 Apr 25.
- Puzzono M, Mannucci A, Di Leo M, Zuppardo RA, Russo M, Ditonno I, Goni E, Notaristefano C, Azzolini F, Fanti L, Viale E, Elmore U, Pantaleo G, Cascinu S, Rosati R, Cavestro GM. Diet and Lifestyle Habits in Early-Onset Colorectal Cancer: A Pilot Case-Control Study. Dig Dis. 2022;40(6):710-718. doi: 10.1159/000521932. Epub 2022 Jan 27.
- Mannucci A, Zuppardo RA, Crippa S, Carrera P, Patricelli MG, Russo Raucci A, Calabrese F, Lazarevic D, Giannese F, Tonon G, Ferrari M, Testoni PA, Cavestro GM. MSH6 gene pathogenic variant identified in familial pancreatic cancer in the absence of colon cancer. Eur J Gastroenterol Hepatol. 2020 Mar;32(3):345-349. doi: 10.1097/MEG.0000000000001617.
- Cavestro GM, Zuppardo RA, Mannucci A. Early-onset colorectal cancer: trends and challenges. Lancet Gastroenterol Hepatol. 2019 Jul;4(7):491-492. doi: 10.1016/S2468-1253(19)30146-3. Epub 2019 May 16. No abstract available.
Termíny studijních záznamů
Hlavní termíny studia
Začátek studia (Aktuální)
Primární dokončení (Odhadovaný)
Dokončení studie (Odhadovaný)
Termíny zápisu do studia
První předloženo
První předloženo, které splnilo kritéria kontroly kvality
První zveřejněno (Aktuální)
Aktualizace studijních záznamů
Poslední zveřejněná aktualizace (Aktuální)
Odeslaná poslední aktualizace, která splnila kritéria kontroly kvality
Naposledy ověřeno
Více informací
Termíny související s touto studií
Další relevantní podmínky MeSH
- Novotvary podle místa
- Novotvary
- Genetické choroby, vrozené
- Metabolické choroby
- Střevní nemoci
- Gastrointestinální novotvary
- Novotvary trávicího systému
- Nemoci trávicího systému
- Gastrointestinální onemocnění
- Střevní novotvary
- Rektální onemocnění
- Neoplastické syndromy, dědičné
- Poruchy opravy DNA-nedostatek
- Vrozené, dědičné a neonatální nemoci a abnormality
- Nutriční a metabolické nemoci
- Onemocnění tlustého střeva
- Kolorektální novotvary
- Novotvary tlustého střeva
- Kolorektální novotvary, dědičná nepolypóza
- Lynchův syndrom II
- Turcotův syndrom
- Lynchův syndrom I (lokálně specifický karcinom tlustého střeva)
Další identifikační čísla studie
- BEACON/2026
Plán pro data jednotlivých účastníků (IPD)
Plánujete sdílet data jednotlivých účastníků (IPD)?
Popis plánu IPD
Informace o lécích a zařízeních, studijní dokumenty
Studuje lékový produkt regulovaný americkým FDA
Studuje produkt zařízení regulovaný americkým úřadem FDA
Tyto informace byly beze změn načteny přímo z webu clinicaltrials.gov. Máte-li jakékoli požadavky na změnu, odstranění nebo aktualizaci podrobností studie, kontaktujte prosím register@clinicaltrials.gov. Jakmile bude změna implementována na clinicaltrials.gov, bude automaticky aktualizována i na našem webu .