Genomekspression i lymfom, leukæmi og multipelt myelom

Denne undersøgelse vil bruge genomik-baseret teknologi, såsom DNA-mikroarrays, til mere præcist at diagnosticere undergrupper af lymfom-, leukæmi- og myelomatosepatienter. Der har været mange forsøg på at klassificere lymfoide kræftformer på måder, der vil være nyttige til klinisk diagnose og behandling. Selvom brede diagnostiske kategorier er blevet defineret pålideligt, har patienter inden for hver kategori forskellige kliniske forløb, hvilket tyder på, at disse klassifikationer kunne opdeles yderligere i molekylære (genetiske) subtyper. For eksempel opnår 40 procent af patienterne med diffust storcellet B-celle lymfom langvarige sygdomsremissioner efter kombinationskemoterapi og bliver tilsyneladende helbredt, mens de resterende 60 procent dør af sygdommen. Tilsvarende udvikler nogle patienter med follikulært lymfom aggressiv sygdom inden for få år efter diagnosen, mens andre har stabil sygdom over 10 til 20 år. Selvom forskellene i det kliniske forløb af disse sygdomme er anerkendt, er der ingen undersøgelser til at bestemme det molekylære (genetiske) grundlag for denne variabilitet. Denne undersøgelse vil forsøge at definere nye molekylære diagnostiske kategorier i disse sygdomme og korrelere dem med kliniske træk, herunder behandlingsrespons, sygdomsremission og overordnet overlevelse efter kemoterapi.

Denne retrospektive undersøgelse vil bruge kliniske data og vævsprøver fra deltagende centre i Lymphoma/Leukemia Molecular Profiling Project LLMPP). Nye patienter vil ikke blive rekrutteret til denne undersøgelse.

Biopsimaterialer, herunder frisk frosset eller OTC-indlejret lymfombiopsimateriale, levedygtigt frosne prøver af perifere blodceller fra leukæmipatienter og levedygtigt frosne prøver af knoglemarvsaspirater fra myelomatosepatienter vil blive indsamlet fra patologer, der deltager i LLMPP. RNA og genomisk DNA vil blive ekstraheret fra tumorprøverne. En række forskellige teknologier vil blive brugt til at karakterisere kræftcellernes genom, herunder lymfochip-mikroarrays til array-baseret komparativ genomisk hybridisering; Southern blotting og PCR til translokation af gener, der tidligere var impliceret i disse maligniteter; og PCR- og DNA-sekventeringsmetoder til analyse af baseændringer i cancercellernes genom. Klinisk information fra den indledende diagnose til sygdomstilbagefald vil blive taget fra eksisterende databaser og/eller patientdiagrammer. Genekspression vil være korreleret med de kliniske data. Hvis et lille antal gener viser sig kraftigt at forudsige kliniske resultater, kan kvantitative RT-PCR-assays ved hjælp af Taqman-teknologien udvikles som et alternativ til DNA-mikroarray-analyse.

...